MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021151	GGCA	2	8	69439	69446	25 %	0 %	50 %	25 %	482902608
1502	NC_021151	TGA	2	6	69465	69470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902608
1503	NC_021151	TCCA	2	8	69481	69488	25 %	25 %	0 %	50 %	482902608
1504	NC_021151	AG	3	6	69514	69519	50 %	0 %	50 %	0 %	482902608
1505	NC_021151	AGC	2	6	69528	69533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902608
1506	NC_021151	GCG	2	6	69542	69547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902608
1507	NC_021151	GGT	2	6	69556	69561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902608
1508	NC_021151	CG	3	6	69593	69598	0 %	0 %	50 %	50 %	482902608
1509	NC_021151	GC	3	6	69621	69626	0 %	0 %	50 %	50 %	482902608
1510	NC_021151	GGC	3	9	69655	69663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902608
1511	NC_021151	TGT	2	6	69725	69730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902609
1512	NC_021151	AGA	2	6	69804	69809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902609
1513	NC_021151	GTG	2	6	69895	69900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902609
1514	NC_021151	CGT	2	6	69948	69953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902609
1515	NC_021151	GTG	2	6	69956	69961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902609
1516	NC_021151	GCTGGA	2	12	70008	70019	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482902609
1517	NC_021151	GGC	2	6	70080	70085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902609
1518	NC_021151	TGG	2	6	70145	70150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902609
1519	NC_021151	GGC	2	6	70161	70166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902609
1520	NC_021151	TGC	2	6	70238	70243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902609
1521	NC_021151	GCG	2	6	70246	70251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902609
1522	NC_021151	CG	3	6	70250	70255	0 %	0 %	50 %	50 %	482902609
1523	NC_021151	GCC	2	6	70267	70272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902609
1524	NC_021151	ATG	2	6	70274	70279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902609
1525	NC_021151	AAT	2	6	70297	70302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902609
1526	NC_021151	GAA	2	6	70303	70308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902609
1527	NC_021151	GAAG	2	8	70317	70324	50 %	0 %	50 %	0 %	482902609
1528	NC_021151	AAG	2	6	70418	70423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902609
1529	NC_021151	GCC	2	6	70447	70452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902609
1530	NC_021151	CGT	2	6	70482	70487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902609
1531	NC_021151	CG	3	6	70530	70535	0 %	0 %	50 %	50 %	482902609
1532	NC_021151	GTG	2	6	70540	70545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902609
1533	NC_021151	AAGG	2	8	70574	70581	50 %	0 %	50 %	0 %	482902609
1534	NC_021151	CGT	2	6	70736	70741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902610
1535	NC_021151	CCA	2	6	70774	70779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902610
1536	NC_021151	GTG	2	6	70788	70793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902610
1537	NC_021151	GTC	2	6	70802	70807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902610
1538	NC_021151	GTG	2	6	70916	70921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902610
1539	NC_021151	CGG	2	6	71011	71016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902610
1540	NC_021151	CGTGC	2	10	71071	71080	0 %	20 %	40 %	40 %	482902610
1541	NC_021151	TG	3	6	71171	71176	0 %	50 %	50 %	0 %	482902610
1542	NC_021151	CTGA	2	8	71183	71190	25 %	25 %	25 %	25 %	482902610
1543	NC_021151	TTGAT	2	10	71241	71250	20 %	60 %	20 %	0 %	482902610
1544	NC_021151	A	6	6	71280	71285	100 %	0 %	0 %	0 %	482902610
1545	NC_021151	GGC	2	6	71344	71349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902610
1546	NC_021151	TGGG	2	8	71484	71491	0 %	25 %	75 %	0 %	482902610
1547	NC_021151	TGG	2	6	71505	71510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902610
1548	NC_021151	GCT	2	6	71539	71544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902610
1549	NC_021151	CAT	2	6	71597	71602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902610
1550	NC_021151	CAAT	2	8	71617	71624	50 %	25 %	0 %	25 %	482902610
1551	NC_021151	GTG	2	6	71669	71674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902610
1552	NC_021151	GC	3	6	71682	71687	0 %	0 %	50 %	50 %	482902610
1553	NC_021151	TAACGT	2	12	71707	71718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482902610
1554	NC_021151	GGC	2	6	71756	71761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902610
1555	NC_021151	GCA	2	6	71774	71779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902610
1556	NC_021151	ATT	2	6	71795	71800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902610
1557	NC_021151	ACCGC	2	10	71801	71810	20 %	0 %	20 %	60 %	482902610
1558	NC_021151	GTG	2	6	71834	71839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902610
1559	NC_021151	CG	3	6	71917	71922	0 %	0 %	50 %	50 %	482902610
1560	NC_021151	TGC	2	6	71947	71952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902610
1561	NC_021151	TGA	2	6	71964	71969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902610
1562	NC_021151	AAC	2	6	71976	71981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902610
1563	NC_021151	GC	3	6	71989	71994	0 %	0 %	50 %	50 %	482902610
1564	NC_021151	GTG	2	6	72041	72046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902610
1565	NC_021151	TGA	2	6	72104	72109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902610
1566	NC_021151	TGT	2	6	72122	72127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902611
1567	NC_021151	GGA	2	6	72150	72155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902611
1568	NC_021151	GC	3	6	72166	72171	0 %	0 %	50 %	50 %	482902611
1569	NC_021151	GGC	2	6	72275	72280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902611
1570	NC_021151	ATGG	2	8	72381	72388	25 %	25 %	50 %	0 %	482902611
1571	NC_021151	GGC	2	6	72458	72463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902611
1572	NC_021151	ATT	2	6	72478	72483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902611
1573	NC_021151	CAG	2	6	72550	72555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902611
1574	NC_021151	TTG	2	6	72601	72606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902611
1575	NC_021151	GGC	2	6	72685	72690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902612
1576	NC_021151	GTTG	2	8	72706	72713	0 %	50 %	50 %	0 %	482902612
1577	NC_021151	GCT	2	6	72721	72726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902612
1578	NC_021151	GGC	2	6	72802	72807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902612
1579	NC_021151	TGGA	2	8	72839	72846	25 %	25 %	50 %	0 %	482902612
1580	NC_021151	T	6	6	72851	72856	0 %	100 %	0 %	0 %	482902612
1581	NC_021151	CAA	2	6	72865	72870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902612
1582	NC_021151	CGG	2	6	72873	72878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902612
1583	NC_021151	GGC	2	6	72883	72888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902612
1584	NC_021151	TGC	2	6	72906	72911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902612
1585	NC_021151	CTG	2	6	72998	73003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902612
1586	NC_021151	CG	3	6	73027	73032	0 %	0 %	50 %	50 %	482902612
1587	NC_021151	TTG	2	6	73092	73097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902612
1588	NC_021151	A	7	7	73114	73120	100 %	0 %	0 %	0 %	482902612
1589	NC_021151	GC	3	6	73173	73178	0 %	0 %	50 %	50 %	482902612
1590	NC_021151	TTG	2	6	73286	73291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902612
1591	NC_021151	ATG	2	6	73308	73313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902612
1592	NC_021151	TAC	2	6	73352	73357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902612
1593	NC_021151	GCA	3	9	73360	73368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902612
1594	NC_021151	TTG	2	6	73379	73384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902612
1595	NC_021151	G	6	6	73408	73413	0 %	0 %	100 %	0 %	482902612
1596	NC_021151	GAT	2	6	73436	73441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902612
1597	NC_021151	TCT	2	6	73549	73554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_021151	TC	3	6	73560	73565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_021151	GGC	2	6	73657	73662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_021151	GC	3	6	73669	73674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_021151	GCC	2	6	73792	73797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902613
1602	NC_021151	AGC	2	6	73912	73917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902613
1603	NC_021151	GAT	2	6	73933	73938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902613
1604	NC_021151	GCC	2	6	73997	74002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902613
1605	NC_021151	TAC	2	6	74028	74033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902613
1606	NC_021151	GAC	2	6	74041	74046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902613
1607	NC_021151	CGC	2	6	74097	74102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902613
1608	NC_021151	GCT	2	6	74136	74141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902613
1609	NC_021151	ATT	2	6	74185	74190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902613
1610	NC_021151	CAC	2	6	74197	74202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902613
1611	NC_021151	CGGG	2	8	74356	74363	0 %	0 %	75 %	25 %	482902613
1612	NC_021151	TCG	2	6	74369	74374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902613
1613	NC_021151	GAA	2	6	74490	74495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902613
1614	NC_021151	TAT	2	6	74537	74542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902613
1615	NC_021151	TGTGGT	2	12	74564	74575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021151	AT	3	6	74604	74609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021151	C	6	6	74629	74634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1618	NC_021151	ATAA	2	8	74649	74656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021151	TTC	2	6	74685	74690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902614
1620	NC_021151	GTT	2	6	74710	74715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902614
1621	NC_021151	A	6	6	74848	74853	100 %	0 %	0 %	0 %	482902614
1622	NC_021151	G	7	7	74968	74974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021151	T	6	6	75006	75011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021151	AAAGAA	2	12	75058	75069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021151	TTA	2	6	75099	75104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021151	T	6	6	75123	75128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021151	ATG	2	6	75138	75143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021151	ATTTG	2	10	75145	75154	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1756	NC_021151	CCA	2	6	80920	80925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902618
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1764	NC_021151	CAC	2	6	81284	81289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902618
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1785	NC_021151	CGG	2	6	82243	82248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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