MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021151	TTAT	2	8	22971	22978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021151	A	7	7	23044	23050	100 %	0 %	0 %	0 %	482902568
503	NC_021151	TGA	2	6	23051	23056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902568
504	NC_021151	ACG	2	6	23057	23062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902568
505	NC_021151	ATA	2	6	23075	23080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902568
506	NC_021151	CTTTT	2	10	23099	23108	0 %	80 %	0 %	20 %	482902568
507	NC_021151	T	6	6	23105	23110	0 %	100 %	0 %	0 %	482902568
508	NC_021151	CAG	2	6	23113	23118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902568
509	NC_021151	TTG	2	6	23158	23163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902568
510	NC_021151	TTTA	2	8	23204	23211	25 %	75 %	0 %	0 %	482902568
511	NC_021151	GTT	2	6	23254	23259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902568
512	NC_021151	ATG	2	6	23270	23275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902568
513	NC_021151	AT	3	6	23288	23293	50 %	50 %	0 %	0 %	482902568
514	NC_021151	CG	3	6	23358	23363	0 %	0 %	50 %	50 %	482902568
515	NC_021151	ACG	2	6	23459	23464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902568
516	NC_021151	TGA	2	6	23495	23500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902568
517	NC_021151	GC	4	8	23501	23508	0 %	0 %	50 %	50 %	482902568
518	NC_021151	GCT	2	6	23553	23558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902568
519	NC_021151	TCTG	2	8	23661	23668	0 %	50 %	25 %	25 %	482902568
520	NC_021151	A	7	7	23673	23679	100 %	0 %	0 %	0 %	482902568
521	NC_021151	GGC	2	6	23705	23710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902568
522	NC_021151	AT	3	6	23762	23767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021151	GTT	2	6	23822	23827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021151	ACA	2	6	23901	23906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021151	GAT	2	6	23938	23943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021151	TAA	2	6	23965	23970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021151	TAA	2	6	23972	23977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021151	ACG	2	6	24012	24017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_021151	AAG	2	6	24059	24064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021151	T	7	7	24069	24075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021151	GAA	2	6	24105	24110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021151	CAG	2	6	24115	24120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021151	A	6	6	24131	24136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021151	TGAA	2	8	24172	24179	50 %	25 %	25 %	0 %	482902569
535	NC_021151	TGT	2	6	24227	24232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902569
536	NC_021151	TAC	2	6	24249	24254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902569
537	NC_021151	CGGTA	2	10	24267	24276	20 %	20 %	40 %	20 %	482902569
538	NC_021151	CGC	2	6	24300	24305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902569
539	NC_021151	CTGTT	2	10	24306	24315	0 %	60 %	20 %	20 %	482902569
540	NC_021151	TGG	2	6	24386	24391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902569
541	NC_021151	AGA	2	6	24402	24407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902569
542	NC_021151	CCAG	2	8	24443	24450	25 %	0 %	25 %	50 %	482902569
543	NC_021151	GCG	2	6	24454	24459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902569
544	NC_021151	CGA	2	6	24530	24535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902569
545	NC_021151	ATG	2	6	24611	24616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902569
546	NC_021151	T	7	7	24731	24737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021151	CG	3	6	24770	24775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_021151	A	8	8	24821	24828	100 %	0 %	0 %	0 %	482902570
549	NC_021151	ATT	2	6	24847	24852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902570
550	NC_021151	CTG	2	6	24857	24862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902570
551	NC_021151	CGG	2	6	24864	24869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902570
552	NC_021151	CCT	2	6	24951	24956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902570
553	NC_021151	ATT	2	6	24962	24967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902570
554	NC_021151	TTC	2	6	24970	24975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902570
555	NC_021151	T	7	7	24987	24993	0 %	100 %	0 %	0 %	482902570
556	NC_021151	CGC	2	6	25050	25055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902570
557	NC_021151	CT	3	6	25056	25061	0 %	50 %	0 %	50 %	482902570
558	NC_021151	A	6	6	25076	25081	100 %	0 %	0 %	0 %	482902570
559	NC_021151	AT	3	6	25086	25091	50 %	50 %	0 %	0 %	482902570
560	NC_021151	TAT	2	6	25096	25101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902570
561	NC_021151	ACCG	2	8	25120	25127	25 %	0 %	25 %	50 %	482902570
562	NC_021151	TATTT	2	10	25140	25149	20 %	80 %	0 %	0 %	482902570
563	NC_021151	AAAT	2	8	25180	25187	75 %	25 %	0 %	0 %	482902570
564	NC_021151	TAC	2	6	25337	25342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902570
565	NC_021151	A	6	6	25373	25378	100 %	0 %	0 %	0 %	482902570
566	NC_021151	CCG	2	6	25397	25402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902570
567	NC_021151	ACG	2	6	25472	25477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902570
568	NC_021151	ATG	2	6	25501	25506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902570
569	NC_021151	TCTG	2	8	25637	25644	0 %	50 %	25 %	25 %	482902571
570	NC_021151	GGC	2	6	25694	25699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
571	NC_021151	ACG	2	6	25776	25781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
572	NC_021151	GC	3	6	25789	25794	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
573	NC_021151	GCCT	2	8	25818	25825	0 %	25 %	25 %	50 %	482902571
574	NC_021151	GGC	3	9	25886	25894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
575	NC_021151	GCC	2	6	25929	25934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902571
576	NC_021151	GCA	2	6	25955	25960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
577	NC_021151	GGC	2	6	25985	25990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
578	NC_021151	GGC	2	6	26103	26108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
579	NC_021151	ACT	2	6	26176	26181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902571
580	NC_021151	GCG	2	6	26200	26205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
581	NC_021151	AGCGAC	2	12	26214	26225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
582	NC_021151	GCA	2	6	26228	26233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
583	NC_021151	ATT	2	6	26312	26317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902571
584	NC_021151	CCTT	2	8	26324	26331	0 %	50 %	0 %	50 %	482902571
585	NC_021151	GAC	2	6	26355	26360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
586	NC_021151	CAT	2	6	26453	26458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902571
587	NC_021151	GCC	2	6	26474	26479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902571
588	NC_021151	CCG	2	6	26512	26517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902571
589	NC_021151	GCG	2	6	26521	26526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
590	NC_021151	CCG	2	6	26587	26592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902571
591	NC_021151	GGC	2	6	26614	26619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
592	NC_021151	GCG	2	6	26628	26633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
593	NC_021151	TAG	2	6	26657	26662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
594	NC_021151	TCAG	2	8	26683	26690	25 %	25 %	25 %	25 %	482902571
595	NC_021151	GCG	2	6	26779	26784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
596	NC_021151	ATA	2	6	26848	26853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902571
597	NC_021151	GAT	2	6	26967	26972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
598	NC_021151	ATT	2	6	27049	27054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902571
599	NC_021151	TTA	2	6	27062	27067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902571
600	NC_021151	AGG	2	6	27072	27077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902571
601	NC_021151	ATCA	2	8	27096	27103	50 %	25 %	0 %	25 %	482902571
602	NC_021151	TTA	2	6	27130	27135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902571
603	NC_021151	CAGC	2	8	27140	27147	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
604	NC_021151	TGA	2	6	27164	27169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
605	NC_021151	TTG	2	6	27180	27185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902571
606	NC_021151	ACA	2	6	27235	27240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902571
607	NC_021151	TGA	2	6	27326	27331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
608	NC_021151	CTG	2	6	27423	27428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902571
609	NC_021151	ACA	2	6	27448	27453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902571
610	NC_021151	GCG	2	6	27490	27495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
611	NC_021151	CAG	2	6	27570	27575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
612	NC_021151	GGC	2	6	27594	27599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
613	NC_021151	TGG	2	6	27601	27606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902571
614	NC_021151	AGCC	2	8	27630	27637	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
615	NC_021151	CG	3	6	27719	27724	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
616	NC_021151	GGT	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902571
617	NC_021151	ACA	2	6	27750	27755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902571
618	NC_021151	GAT	2	6	27798	27803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
619	NC_021151	TGA	2	6	27812	27817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
620	NC_021151	CCGA	2	8	27837	27844	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
621	NC_021151	GC	3	6	27847	27852	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
622	NC_021151	GC	3	6	27883	27888	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
623	NC_021151	ACGGTG	2	12	27939	27950	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482902571
624	NC_021151	TTG	2	6	27973	27978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902571
625	NC_021151	GCGTC	2	10	28063	28072	0 %	20 %	40 %	40 %	482902571
626	NC_021151	ATC	2	6	28075	28080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902571
627	NC_021151	TC	3	6	28079	28084	0 %	50 %	0 %	50 %	482902571
628	NC_021151	TCC	2	6	28086	28091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902571
629	NC_021151	ACA	2	6	28109	28114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902571
630	NC_021151	CTG	2	6	28155	28160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902572
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796	NC_021151	TAG	2	6	34858	34863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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886	NC_021151	AT	3	6	39795	39800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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