MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021151	ACA	2	6	279325	279330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902787
6003	NC_021151	ACG	2	6	279335	279340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902787
6004	NC_021151	CTGC	2	8	279374	279381	0 %	25 %	25 %	50 %	482902787
6005	NC_021151	TGG	2	6	279409	279414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902787
6006	NC_021151	GAA	2	6	279437	279442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902787
6007	NC_021151	CGA	2	6	279548	279553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902787
6008	NC_021151	CGC	2	6	279561	279566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902787
6009	NC_021151	TGT	2	6	279567	279572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902787
6010	NC_021151	AGC	2	6	279625	279630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902787
6011	NC_021151	AGA	2	6	279631	279636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902787
6012	NC_021151	AAG	2	6	279639	279644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902787
6013	NC_021151	GCGCT	2	10	279673	279682	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6014	NC_021151	CAC	2	6	279730	279735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_021151	CAA	2	6	279743	279748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_021151	ATG	2	6	279940	279945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902788
6017	NC_021151	TCAT	2	8	280001	280008	25 %	50 %	0 %	25 %	482902788
6018	NC_021151	GCA	2	6	280038	280043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902789
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6020	NC_021151	CCT	2	6	280206	280211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_021151	CGT	2	6	280428	280433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902790
6022	NC_021151	ATG	2	6	280516	280521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902790
6023	NC_021151	TGA	2	6	280551	280556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902790
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6029	NC_021151	GC	3	6	280766	280771	0 %	0 %	50 %	50 %	482902790
6030	NC_021151	CGA	2	6	280859	280864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902790
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6033	NC_021151	TAT	2	6	281091	281096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902791
6034	NC_021151	GCCA	2	8	281115	281122	25 %	0 %	25 %	50 %	482902791
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6036	NC_021151	TCATTA	2	12	281146	281157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482902791
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6040	NC_021151	GGC	2	6	281496	281501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_021151	GCA	2	6	281517	281522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_021151	GCG	2	6	281531	281536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_021151	TGC	2	6	281537	281542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_021151	TGA	2	6	281603	281608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_021151	GAA	2	6	281632	281637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021151	CGG	2	6	281675	281680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_021151	TAT	2	6	281719	281724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_021151	CG	3	6	281725	281730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_021151	GTAT	4	16	281846	281861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021151	GCG	2	6	281873	281878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_021151	GGC	2	6	281950	281955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_021151	TGC	2	6	281979	281984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_021151	CACT	2	8	282091	282098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_021151	CAA	2	6	282160	282165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_021151	ACG	2	6	282243	282248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902792
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6057	NC_021151	GTC	2	6	282360	282365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902792
6058	NC_021151	GC	4	8	282386	282393	0 %	0 %	50 %	50 %	482902792
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6065	NC_021151	ATTA	2	8	282897	282904	50 %	50 %	0 %	0 %	482902792
6066	NC_021151	TCT	2	6	282916	282921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902792
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6071	NC_021151	CAG	2	6	283047	283052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902792
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6082	NC_021151	TCA	2	6	283468	283473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902792
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6090	NC_021151	T	6	6	283737	283742	0 %	100 %	0 %	0 %	482902792
6091	NC_021151	TA	3	6	283772	283777	50 %	50 %	0 %	0 %	482902792
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6094	NC_021151	TGG	2	6	283822	283827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902792
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6096	NC_021151	A	7	7	283945	283951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021151	AAAT	2	8	284149	284156	75 %	25 %	0 %	0 %	482902793
6098	NC_021151	CGT	2	6	284186	284191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902793
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6102	NC_021151	CT	3	6	284364	284369	0 %	50 %	0 %	50 %	482902793
6103	NC_021151	GCC	2	6	284494	284499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902793
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6106	NC_021151	CGC	2	6	284608	284613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902793
6107	NC_021151	GACCA	2	10	284624	284633	40 %	0 %	20 %	40 %	482902793
6108	NC_021151	GCT	2	6	284702	284707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902793
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6110	NC_021151	GCA	2	6	284793	284798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902794
6111	NC_021151	GC	3	6	284845	284850	0 %	0 %	50 %	50 %	482902794
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6115	NC_021151	AATG	2	8	285123	285130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_021151	AAT	2	6	285196	285201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_021151	T	6	6	285311	285316	0 %	100 %	0 %	0 %	482902795
6120	NC_021151	CAA	2	6	285385	285390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902795
6121	NC_021151	CTGG	2	8	285422	285429	0 %	25 %	50 %	25 %	482902795
6122	NC_021151	TGA	2	6	285442	285447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902795
6123	NC_021151	GCG	2	6	285490	285495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902795
6124	NC_021151	CAA	2	6	285505	285510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902795
6125	NC_021151	GCA	4	12	285598	285609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902795
6126	NC_021151	GGTCG	2	10	285626	285635	0 %	20 %	60 %	20 %	482902795
6127	NC_021151	GATTT	2	10	285678	285687	20 %	60 %	20 %	0 %	482902795
6128	NC_021151	T	7	7	285685	285691	0 %	100 %	0 %	0 %	482902795
6129	NC_021151	TTTC	2	8	285880	285887	0 %	75 %	0 %	25 %	482902795
6130	NC_021151	TGC	2	6	285915	285920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902795
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6132	NC_021151	TGTGT	2	10	286068	286077	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_021151	TAAA	2	8	286132	286139	75 %	25 %	0 %	0 %	482902796
6134	NC_021151	TCA	2	6	286170	286175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902796
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6175	NC_021151	CTG	2	6	287898	287903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6239	NC_021151	GC	3	6	291253	291258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6240	NC_021151	G	6	6	291346	291351	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6241	NC_021151	TCC	2	6	291356	291361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6242	NC_021151	CTGA	2	8	291376	291383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6243	NC_021151	GTAC	2	8	291460	291467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6244	NC_021151	CAC	2	6	291483	291488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6245	NC_021151	GTG	2	6	291496	291501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6247	NC_021151	GGA	2	6	291765	291770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_021151	AC	3	6	291983	291988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6249	NC_021151	CGTC	2	8	292001	292008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6250	NC_021151	AAC	2	6	292020	292025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_021151	AGC	2	6	292110	292115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6252	NC_021151	CAT	2	6	292116	292121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_021151	AAAG	2	8	292124	292131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_021151	AGCGA	2	10	292252	292261	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6255	NC_021151	CGTT	2	8	292301	292308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6256	NC_021151	GT	3	6	292340	292345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_021151	G	6	6	292545	292550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_021151	GT	4	8	292603	292610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_021151	GAC	2	6	292647	292652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6261	NC_021151	GGT	2	6	292745	292750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_021151	GA	3	6	292775	292780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_021151	AGTC	2	8	292871	292878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6264	NC_021151	GCTG	2	8	292889	292896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6265	NC_021151	TTA	2	6	292904	292909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6267	NC_021151	ATG	2	6	293104	293109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6268	NC_021151	ACC	2	6	293299	293304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6274	NC_021151	CGG	2	6	293609	293614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6283	NC_021151	TGAC	2	8	294160	294167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6284	NC_021151	GCA	2	6	294186	294191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6286	NC_021151	GGT	2	6	294245	294250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6287	NC_021151	TTTTGT	2	12	294382	294393	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6288	NC_021151	GGC	2	6	294409	294414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6378	NC_021151	CGA	2	6	299059	299064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902803
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6494	NC_021151	TCA	2	6	304345	304350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6495	NC_021151	TGTGG	2	10	304358	304367	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6496	NC_021151	TA	4	8	304410	304417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_021151	CAA	2	6	304426	304431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_021151	CCGA	2	8	304459	304466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6499	NC_021151	AAT	2	6	304472	304477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6500	NC_021151	ACG	2	6	304532	304537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902808

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