MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021151	AAGCG	2	10	254231	254240	40 %	0 %	40 %	20 %	482902767
5502	NC_021151	GCT	2	6	254250	254255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902767
5503	NC_021151	TTC	2	6	254271	254276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902767
5504	NC_021151	GCTG	2	8	254287	254294	0 %	25 %	50 %	25 %	482902767
5505	NC_021151	AAGA	2	8	254394	254401	75 %	0 %	25 %	0 %	482902767
5506	NC_021151	AAC	2	6	254532	254537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902767
5507	NC_021151	GAA	2	6	254703	254708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902767
5508	NC_021151	TAA	2	6	254727	254732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902767
5509	NC_021151	GGC	2	6	254771	254776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_021151	GTA	2	6	254884	254889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_021151	ATG	2	6	255044	255049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902768
5512	NC_021151	A	6	6	255056	255061	100 %	0 %	0 %	0 %	482902768
5513	NC_021151	CTGA	2	8	255065	255072	25 %	25 %	25 %	25 %	482902768
5514	NC_021151	GCG	2	6	255131	255136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902768
5515	NC_021151	A	6	6	255137	255142	100 %	0 %	0 %	0 %	482902768
5516	NC_021151	GCT	2	6	255155	255160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902768
5517	NC_021151	GACT	2	8	255223	255230	25 %	25 %	25 %	25 %	482902768
5518	NC_021151	CGC	2	6	255280	255285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902768
5519	NC_021151	GAA	2	6	255332	255337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902768
5520	NC_021151	TCG	2	6	255382	255387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902768
5521	NC_021151	GC	3	6	255434	255439	0 %	0 %	50 %	50 %	482902768
5522	NC_021151	GCAA	2	8	255509	255516	50 %	0 %	25 %	25 %	482902768
5523	NC_021151	CTG	2	6	255546	255551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902768
5524	NC_021151	GAAA	2	8	255610	255617	75 %	0 %	25 %	0 %	482902768
5525	NC_021151	GAA	2	6	255646	255651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902768
5526	NC_021151	CTG	2	6	255719	255724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902768
5527	NC_021151	GACT	2	8	255793	255800	25 %	25 %	25 %	25 %	482902768
5528	NC_021151	GCA	2	6	255803	255808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902768
5529	NC_021151	TGC	2	6	255814	255819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902768
5530	NC_021151	GAG	2	6	255846	255851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021151	CTT	2	6	255866	255871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_021151	CT	3	6	255879	255884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_021151	GAAA	2	8	255974	255981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021151	GCG	2	6	256032	256037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902769
5535	NC_021151	TGGTG	2	10	256135	256144	0 %	40 %	60 %	0 %	482902769
5536	NC_021151	GGT	2	6	256151	256156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902769
5537	NC_021151	CGCC	2	8	256285	256292	0 %	0 %	25 %	75 %	482902769
5538	NC_021151	CTG	2	6	256355	256360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902769
5539	NC_021151	TAA	2	6	256363	256368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902769
5540	NC_021151	TCTG	2	8	256381	256388	0 %	50 %	25 %	25 %	482902769
5541	NC_021151	TTC	2	6	256406	256411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902769
5542	NC_021151	GGC	2	6	256588	256593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902769
5543	NC_021151	GC	3	6	256653	256658	0 %	0 %	50 %	50 %	482902769
5544	NC_021151	CGT	2	6	256661	256666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902769
5545	NC_021151	GTG	2	6	256667	256672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902769
5546	NC_021151	AAG	2	6	256683	256688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902769
5547	NC_021151	AAT	2	6	256704	256709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902769
5548	NC_021151	TTA	2	6	256757	256762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021151	TG	3	6	256807	256812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021151	GTCTG	2	10	256816	256825	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5551	NC_021151	CTG	2	6	256960	256965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902770
5552	NC_021151	AGA	2	6	257031	257036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902770
5553	NC_021151	GCC	2	6	257160	257165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902770
5554	NC_021151	GAA	2	6	257173	257178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902770
5555	NC_021151	CGT	2	6	257179	257184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902770
5556	NC_021151	CGTC	2	8	257244	257251	0 %	25 %	25 %	50 %	482902770
5557	NC_021151	CTG	2	6	257278	257283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902770
5558	NC_021151	TCG	2	6	257313	257318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902770
5559	NC_021151	GAA	2	6	257326	257331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902770
5560	NC_021151	GCG	2	6	257371	257376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902770
5561	NC_021151	AAG	2	6	257387	257392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902770
5562	NC_021151	TGAT	2	8	257410	257417	25 %	50 %	25 %	0 %	482902770
5563	NC_021151	GTG	2	6	257463	257468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021151	AGA	2	6	257484	257489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021151	GCG	2	6	257508	257513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_021151	GCA	2	6	257596	257601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902771
5567	NC_021151	GTG	2	6	257610	257615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902771
5568	NC_021151	TGG	2	6	257650	257655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902771
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5570	NC_021151	AAT	2	6	257750	257755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902771
5571	NC_021151	CAG	2	6	257760	257765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902771
5572	NC_021151	CAG	2	6	257796	257801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902771
5573	NC_021151	GGC	2	6	257816	257821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902771
5574	NC_021151	TGA	2	6	257825	257830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902771
5575	NC_021151	GGC	2	6	257846	257851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902771
5576	NC_021151	GGC	2	6	257885	257890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902771
5577	NC_021151	CTG	2	6	257913	257918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902771
5578	NC_021151	GCGG	2	8	257944	257951	0 %	0 %	75 %	25 %	482902771
5579	NC_021151	GCA	2	6	257974	257979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902771
5580	NC_021151	TGG	2	6	258110	258115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902771
5581	NC_021151	GTC	2	6	258172	258177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902771
5582	NC_021151	CCA	2	6	258220	258225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902771
5583	NC_021151	TGA	2	6	258226	258231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902771
5584	NC_021151	ATCC	2	8	258300	258307	25 %	25 %	0 %	50 %	482902771
5585	NC_021151	TCAT	2	8	258316	258323	25 %	50 %	0 %	25 %	482902771
5586	NC_021151	ATGGC	2	10	258402	258411	20 %	20 %	40 %	20 %	482902771
5587	NC_021151	GC	3	6	258430	258435	0 %	0 %	50 %	50 %	482902771
5588	NC_021151	GC	3	6	258460	258465	0 %	0 %	50 %	50 %	482902771
5589	NC_021151	GC	3	6	258475	258480	0 %	0 %	50 %	50 %	482902771
5590	NC_021151	GGC	2	6	258539	258544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902771
5591	NC_021151	ACG	2	6	258546	258551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902771
5592	NC_021151	GGAT	2	8	258649	258656	25 %	25 %	50 %	0 %	482902771
5593	NC_021151	CG	3	6	258704	258709	0 %	0 %	50 %	50 %	482902771
5594	NC_021151	AGA	2	6	258765	258770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021151	T	6	6	258837	258842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_021151	T	6	6	258872	258877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_021151	CG	3	6	258966	258971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_021151	A	6	6	259050	259055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021151	TGT	2	6	259063	259068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902772
5600	NC_021151	AAT	2	6	259124	259129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902772
5601	NC_021151	ATGG	2	8	259131	259138	25 %	25 %	50 %	0 %	482902772
5602	NC_021151	GTCC	2	8	259202	259209	0 %	25 %	25 %	50 %	482902772
5603	NC_021151	TGC	2	6	259226	259231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902772
5604	NC_021151	TAG	2	6	259268	259273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902772
5605	NC_021151	ACCG	2	8	259285	259292	25 %	0 %	25 %	50 %	482902772
5606	NC_021151	TG	3	6	259325	259330	0 %	50 %	50 %	0 %	482902772
5607	NC_021151	TAT	2	6	259382	259387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902772
5608	NC_021151	ATA	2	6	259456	259461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902772
5609	NC_021151	CGG	2	6	259493	259498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902772
5610	NC_021151	TGC	2	6	259555	259560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902772
5611	NC_021151	TGA	2	6	259574	259579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902772
5612	NC_021151	AG	3	6	259580	259585	50 %	0 %	50 %	0 %	482902772
5613	NC_021151	ACTTT	2	10	259697	259706	20 %	60 %	0 %	20 %	482902772
5614	NC_021151	CGT	2	6	259779	259784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902772
5615	NC_021151	CGG	2	6	259787	259792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902772
5616	NC_021151	TGA	2	6	259805	259810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902772
5617	NC_021151	T	7	7	259891	259897	0 %	100 %	0 %	0 %	482902773
5618	NC_021151	GCC	2	6	259901	259906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902773
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5620	NC_021151	CGC	2	6	259979	259984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902773
5621	NC_021151	TGGC	2	8	260001	260008	0 %	25 %	50 %	25 %	482902773
5622	NC_021151	TG	3	6	260014	260019	0 %	50 %	50 %	0 %	482902773
5623	NC_021151	TTG	2	6	260046	260051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902773
5624	NC_021151	ATC	2	6	260059	260064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902773
5625	NC_021151	ACA	2	6	260065	260070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902773
5626	NC_021151	TGG	2	6	260115	260120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902773
5627	NC_021151	CTG	2	6	260133	260138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902773
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5633	NC_021151	GGC	2	6	260604	260609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902773
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5659	NC_021151	AG	3	6	262054	262059	50 %	0 %	50 %	0 %	482902774
5660	NC_021151	TTAG	2	8	262060	262067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5661	NC_021151	GAA	2	6	262068	262073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5662	NC_021151	ATA	2	6	262077	262082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5663	NC_021151	GCT	2	6	262115	262120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902775
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5688	NC_021151	TACGG	2	10	263610	263619	20 %	20 %	40 %	20 %	482902775
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5726	NC_021151	TCCAG	2	10	265626	265635	20 %	20 %	20 %	40 %	482902777
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5731	NC_021151	CGT	2	6	265831	265836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902777
5732	NC_021151	GGC	2	6	265913	265918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902777
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5737	NC_021151	TGA	2	6	266080	266085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902777
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5739	NC_021151	TTA	2	6	266203	266208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_021151	ACT	2	6	266246	266251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902778
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5742	NC_021151	TGCG	2	8	266355	266362	0 %	25 %	50 %	25 %	482902778
5743	NC_021151	TAT	2	6	266513	266518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902778
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5867	NC_021151	TGA	2	6	272422	272427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902782
5868	NC_021151	G	6	6	272435	272440	0 %	0 %	100 %	0 %	482902782
5869	NC_021151	CCGC	2	8	272451	272458	0 %	0 %	25 %	75 %	482902782
5870	NC_021151	TGA	2	6	272533	272538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902782
5871	NC_021151	CTA	2	6	272605	272610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902782
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5887	NC_021151	TCG	2	6	273133	273138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902783
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5894	NC_021151	CAT	2	6	273547	273552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902783
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5903	NC_021151	GCAG	2	8	273857	273864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5988	NC_021151	GC	4	8	278956	278963	0 %	0 %	50 %	50 %	482902787
5989	NC_021151	CAG	2	6	278975	278980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902787
5990	NC_021151	GCG	2	6	278999	279004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902787
5991	NC_021151	GCT	2	6	279043	279048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902787
5992	NC_021151	ACTG	2	8	279074	279081	25 %	25 %	25 %	25 %	482902787
5993	NC_021151	CGG	2	6	279087	279092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902787
5994	NC_021151	CT	3	6	279107	279112	0 %	50 %	0 %	50 %	482902787
5995	NC_021151	CGG	2	6	279137	279142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902787
5996	NC_021151	GCG	2	6	279143	279148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902787
5997	NC_021151	GCTG	2	8	279159	279166	0 %	25 %	50 %	25 %	482902787
5998	NC_021151	AGG	2	6	279219	279224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902787
5999	NC_021151	TGGCGC	2	12	279225	279236	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482902787
6000	NC_021151	CGA	2	6	279238	279243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902787

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