MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus LAL14/1

Total Repeats: 981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021058	ATGAGG	2	12	1092	1103	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479324433
2	NC_021058	GTATTG	2	12	1986	1997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479324433
3	NC_021058	AATTGC	2	12	3086	3097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324435
4	NC_021058	CCTCTG	2	12	4504	4515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479324438
5	NC_021058	ATTGAT	2	12	5012	5023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479324439
6	NC_021058	TAGTCT	2	12	5323	5334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324439
7	NC_021058	TACAAA	2	12	5743	5754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021058	CAATGG	2	12	8395	8406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324443
9	NC_021058	TATTCG	2	12	13531	13542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324447
10	NC_021058	TGGTAT	2	12	17808	17819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021058	GTATTT	2	12	18080	18091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479324451
12	NC_021058	CTATTC	2	12	18259	18270	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324451
13	NC_021058	GTCACT	2	12	25967	25978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324459
14	NC_021058	TCCTCT	2	12	29565	29576	0 %	50 %	0 %	50 %	479324463
15	NC_021058	AGTGCA	2	12	31702	31713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324465
16	NC_021058	CTTTTC	2	12	32726	32737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021058	ACGTCT	2	12	34877	34888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324469
18	NC_021058	TTTATC	2	12	36558	36569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324472
19	NC_021058	TCAGCT	2	12	38192	38203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324474
20	NC_021058	TATTTA	2	12	38254	38265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021058	AAGAAA	2	12	39889	39900	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479324476
22	NC_021058	CATTGG	2	12	40207	40218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324477
23	NC_021058	CTTAAA	2	12	44060	44071	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479324482
24	NC_021058	ATATTC	2	12	44110	44121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324482
25	NC_021058	ATAAGA	2	12	44781	44792	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021058	GGTGAG	2	12	45302	45313	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	479324484
27	NC_021058	CTTTCT	2	12	47528	47539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479324486
28	NC_021058	TCTAGT	2	12	48124	48135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021058	GTTTTC	2	12	50038	50049	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479324489
30	NC_021058	TAAAAT	2	12	50113	50124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479324489
31	NC_021058	TCTAAT	2	12	54159	54170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324493
32	NC_021058	TCTTTT	2	12	54344	54355	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479324493
33	NC_021058	CCTCGT	2	12	55608	55619	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479324494
34	NC_021058	TATTTC	2	12	56296	56307	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324494
35	NC_021058	CTTAAT	2	12	59335	59346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324497
36	NC_021058	GAGCTG	2	12	59837	59848	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324497
37	NC_021058	TGATGC	2	12	60093	60104	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324497
38	NC_021058	AAATGT	2	12	60244	60255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479324497
39	NC_021058	ATAGTC	2	12	65022	65033	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324502
40	NC_021058	CTAGTA	2	12	65830	65841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324503
41	NC_021058	AATAAA	2	12	72041	72052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021058	CCGATA	2	12	76143	76154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479324518
43	NC_021058	TTTCAT	2	12	78701	78712	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324521
44	NC_021058	TAGCAT	2	12	82550	82561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324525
45	NC_021058	ACTTTT	2	12	90241	90252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324532
46	NC_021058	AATGTA	2	12	90619	90630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479324532
47	NC_021058	AGTTAA	2	12	90803	90814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021058	CTCATT	2	12	96335	96346	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324539
49	NC_021058	AAAGCC	2	12	97049	97060	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479324540
50	NC_021058	TTATGA	2	12	102806	102817	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479324546
51	NC_021058	GTTATA	2	12	105515	105526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479324549
52	NC_021058	GTATGA	2	12	106336	106347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021058	TAAACA	2	12	107449	107460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479324551
54	NC_021058	TAGAGA	2	12	107599	107610	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324551
55	NC_021058	CACATC	2	12	114606	114617	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	479324559
56	NC_021058	CTATCC	2	12	115954	115965	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479324561
57	NC_021058	GTAATT	2	12	117822	117833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479324563
58	NC_021058	TGGTAT	2	12	119470	119481	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479324565
59	NC_021058	AAAATA	2	12	120186	120197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021058	GCTAAA	2	12	122779	122790	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324571
61	NC_021058	TTAGCT	2	12	127381	127392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324575
62	NC_021058	TAGGAA	2	12	129914	129925	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324577
63	NC_021058	TGGTAA	2	12	131608	131619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324579
64	NC_021058	GGTAGT	2	12	139613	139624	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479324590
65	NC_021058	CTAGAG	2	12	140205	140216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021058	CATCTT	2	12	143941	143952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324596
67	NC_021058	ATAAGG	2	12	149521	149532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324602
68	NC_021058	ACTTTT	2	12	156386	156397	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324609
69	NC_021058	TAAGGA	2	12	162267	162278	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324615
70	NC_021058	TTCCTC	2	12	164637	164648	0 %	50 %	0 %	50 %	479324618
71	NC_021058	AATATT	2	12	164939	164950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021058	TTAGTT	2	12	168030	168041	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479324624
73	NC_021058	CAAATA	2	12	169841	169852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479324628
74	NC_021058	GGAGAA	2	12	175590	175601	50 %	0 %	50 %	0 %	479324633
75	NC_021058	TTGCCA	2	12	175765	175776	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324633
76	NC_021058	ATTCTC	2	12	178700	178711	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324637
77	NC_021058	CAAAGG	2	12	180938	180949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479324639
78	NC_021058	GGCTAA	2	12	181271	181282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324639
79	NC_021058	TTCTAT	2	12	181605	181616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324640
80	NC_021058	TGAGGA	2	12	182836	182847	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479324641
81	NC_021058	AATGGT	2	12	183244	183255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324641
82	NC_021058	ACTTTT	2	12	185392	185403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324645
83	NC_021058	GAATAA	2	12	188545	188556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479324650
84	NC_021058	TAATTC	2	12	194335	194346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324656
85	NC_021058	TCTATA	2	12	194418	194429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324656
86	NC_021058	CACTGC	2	12	196883	196894	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324659
87	NC_021058	AGGTTT	2	12	197364	197375	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479324660
88	NC_021058	CCAAAT	2	12	199566	199577	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324662
89	NC_021058	TTCCAG	2	12	199993	200004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324662
90	NC_021058	AATTAA	2	12	204961	204972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479324669
91	NC_021058	AGTTTT	2	12	207568	207579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479324672
92	NC_021058	TTTACC	2	12	210543	210554	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324673
93	NC_021058	TATTTT	2	12	211107	211118	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479324674
94	NC_021058	CAGAAG	2	12	212398	212409	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479324675
95	NC_021058	GCTGGA	2	12	213667	213678	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324676
96	NC_021058	GCTATT	2	12	215096	215107	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324677
97	NC_021058	GTAAGC	2	12	215485	215496	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021058	TTACAT	2	12	217660	217671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021058	GTAATC	2	12	223531	223542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324687
100	NC_021058	GAAGAG	2	12	225282	225293	50 %	0 %	50 %	0 %	479324689
101	NC_021058	AATTAA	2	12	225295	225306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479324689
102	NC_021058	AACAAT	2	12	227071	227082	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479324691
103	NC_021058	TACCCA	2	12	228807	228818	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	479324694
104	NC_021058	CCTATA	2	12	229046	229057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324694
105	NC_021058	TTCTTT	2	12	230836	230847	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479324696
106	NC_021058	GTTATA	2	12	234870	234881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479324700
107	NC_021058	CTTCAA	2	12	235564	235575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324700
108	NC_021058	AAGTTG	2	12	238864	238875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324705
109	NC_021058	TTCTAT	2	12	250539	250550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324715
110	NC_021058	AATAGG	2	12	250865	250876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324715
111	NC_021058	AGTTAC	2	12	253890	253901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324719
112	NC_021058	TTTTTA	2	12	259527	259538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479324723
113	NC_021058	TTCATG	2	12	262159	262170	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324725
114	NC_021058	CTAATG	2	12	262520	262531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324726
115	NC_021058	AAGAGA	2	12	267012	267023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479324729
116	NC_021058	TACCGT	2	12	267293	267304	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324730
117	NC_021058	TTACTG	2	12	268817	268828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324731
118	NC_021058	ATAAGT	2	12	270202	270213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021058	TTAATC	2	12	273748	273759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324738
120	NC_021058	TTATGT	2	12	275036	275047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021058	GAGTAG	2	12	278235	278246	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479324743
122	NC_021058	AGGTTA	2	12	282376	282387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324747
123	NC_021058	CTCATA	2	12	293020	293031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021058	TAATTC	2	12	293653	293664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324756
125	NC_021058	CTCATT	2	12	296766	296777	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021058	GCAATT	2	12	300596	300607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324764
127	NC_021058	ATGAAA	2	12	301153	301164	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479324764
128	NC_021058	TTTCTT	2	12	303585	303596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021058	TTTCTC	2	12	307994	308005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479324770
130	NC_021058	AAAAGA	2	12	312176	312187	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021058	GTTGTC	2	12	312639	312650	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479324776
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134	NC_021058	GCATTA	2	12	321519	321530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_021058	CTTTTT	2	12	338804	338815	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479324810
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146	NC_021058	GCCTTA	2	12	355932	355943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021058	TAAAAA	2	12	361980	361991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021058	AGCCAA	2	12	363563	363574	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479324827
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151	NC_021058	AGGATG	2	12	371693	371704	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479324834
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159	NC_021058	ACTTAT	2	12	393842	393853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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222	NC_021058	TTACTG	2	12	561232	561243	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479325006
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229	NC_021058	TAGTTT	2	12	574635	574646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
230	NC_021058	TAGTTT	2	12	575165	575176	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_021058	AGTTCT	2	12	576159	576170	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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238	NC_021058	TTTAGT	2	12	585132	585143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
239	NC_021058	TTAGTT	2	12	586027	586038	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
240	NC_021058	TGATAA	2	12	586331	586342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
241	NC_021058	ACCAAA	2	12	594127	594138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479325026
242	NC_021058	TTATCA	2	12	597216	597227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
243	NC_021058	AAACTA	2	12	597585	597596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_021058	AAACTA	2	12	597944	597955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
245	NC_021058	AAACTA	2	12	598124	598135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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247	NC_021058	AAACTA	2	12	598901	598912	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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252	NC_021058	ACTCCT	2	12	615358	615369	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
253	NC_021058	CCTCTT	2	12	618291	618302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
254	NC_021058	TTGGCT	2	12	624159	624170	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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340	NC_021058	GCTAAG	2	12	875708	875719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479325318
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343	NC_021058	AAGAGG	2	12	882508	882519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
344	NC_021058	AAATGG	2	12	885865	885876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479325324
345	NC_021058	AGCCAT	2	12	890627	890638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479325329
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350	NC_021058	TGGAGT	2	12	902910	902921	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479325338
351	NC_021058	TACCAA	2	12	907149	907160	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479325342
352	NC_021058	TATAAT	2	12	908827	908838	50 %	50 %	0 %	0 %	479325342
353	NC_021058	CTAATG	2	12	909036	909047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479325343
354	NC_021058	TAATAC	2	12	910779	910790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
355	NC_021058	CCCTAG	2	12	913118	913129	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479325347
356	NC_021058	AATTGT	2	12	915783	915794	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
357	NC_021058	TCAATA	2	12	916393	916404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479325353
358	NC_021058	GAAGTT	2	12	924794	924805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479325363
359	NC_021058	AGAAGG	2	12	927197	927208	50 %	0 %	50 %	0 %	479325365
360	NC_021058	AGTGTA	2	12	927431	927442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479325365
361	NC_021058	TATTCT	2	12	927731	927742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479325365
362	NC_021058	TACCAT	2	12	929202	929213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479325367
363	NC_021058	AGTAAT	2	12	931155	931166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479325369
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365	NC_021058	GCTCAA	2	12	946813	946824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479325384
366	NC_021058	AAAGGG	2	12	948604	948615	50 %	0 %	50 %	0 %	479325386
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372	NC_021058	TGTATA	2	12	957863	957874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479325401
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383	NC_021058	ATTCTT	2	12	981678	981689	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479325431
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385	NC_021058	TTCAAA	2	12	986713	986724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479325436
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437	NC_021058	AGTGGA	2	12	1133540	1133551	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479325585
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452	NC_021058	TATCTA	2	12	1167346	1167357	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479325624
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455	NC_021058	CATAAA	2	12	1174261	1174272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479325632
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459	NC_021058	TGATAT	2	12	1188141	1188152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479325646
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467	NC_021058	GAAGAT	2	12	1218442	1218453	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479325686
468	NC_021058	AAGGAG	2	12	1218585	1218596	50 %	0 %	50 %	0 %	479325686
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472	NC_021058	TTAGGA	2	12	1229263	1229274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479325706
473	NC_021058	TTCCAT	2	12	1229303	1229314	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479325706
474	NC_021058	ACAGTA	2	12	1245262	1245273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479325729
475	NC_021058	ACATTC	2	12	1245447	1245458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479325729
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