MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021056	TCCC	2	8	330	337	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_021056	CACC	2	8	1004	1011	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_021056	CGGG	2	8	1853	1860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021056	ACGC	2	8	2192	2199	25 %	0 %	25 %	50 %	479323916
5	NC_021056	CGGC	2	8	2522	2529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021056	CGTA	2	8	2894	2901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021056	GACT	2	8	3127	3134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021056	TGGC	2	8	3390	3397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021056	GGCA	2	8	3399	3406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021056	AGCC	2	8	3853	3860	25 %	0 %	25 %	50 %	479323917
11	NC_021056	CGGC	2	8	4086	4093	0 %	0 %	50 %	50 %	479323917
12	NC_021056	CCGA	2	8	4706	4713	25 %	0 %	25 %	50 %	479323918
13	NC_021056	GCCG	2	8	5801	5808	0 %	0 %	50 %	50 %	479323918
14	NC_021056	CGTC	2	8	5905	5912	0 %	25 %	25 %	50 %	479323918
15	NC_021056	GACG	2	8	6216	6223	25 %	0 %	50 %	25 %	479323919
16	NC_021056	GACG	2	8	6618	6625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021056	CGAC	2	8	6637	6644	25 %	0 %	25 %	50 %	479323920
18	NC_021056	CTCG	2	8	7159	7166	0 %	25 %	25 %	50 %	479323921
19	NC_021056	CGAC	2	8	7181	7188	25 %	0 %	25 %	50 %	479323921
20	NC_021056	CGTC	2	8	7478	7485	0 %	25 %	25 %	50 %	479323921
21	NC_021056	TCCC	2	8	7526	7533	0 %	25 %	0 %	75 %	479323921
22	NC_021056	GTCC	2	8	7604	7611	0 %	25 %	25 %	50 %	479323921
23	NC_021056	GGCT	2	8	7844	7851	0 %	25 %	50 %	25 %	479323921
24	NC_021056	CCCG	2	8	8411	8418	0 %	0 %	25 %	75 %	479323921
25	NC_021056	GCAC	2	8	8974	8981	25 %	0 %	25 %	50 %	479323921
26	NC_021056	CCAG	2	8	9143	9150	25 %	0 %	25 %	50 %	479323921
27	NC_021056	CGCC	2	8	9251	9258	0 %	0 %	25 %	75 %	479323921
28	NC_021056	CCTC	2	8	9563	9570	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_021056	GCCC	2	8	9691	9698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_021056	CGTC	2	8	9805	9812	0 %	25 %	25 %	50 %	479323922
31	NC_021056	GGTG	2	8	9967	9974	0 %	25 %	75 %	0 %	479323922
32	NC_021056	GGCG	2	8	10197	10204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021056	GTCG	2	8	10216	10223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021056	GGCC	2	8	10738	10745	0 %	0 %	50 %	50 %	479323923
35	NC_021056	AGGT	2	8	11024	11031	25 %	25 %	50 %	0 %	479323923
36	NC_021056	AGTC	2	8	11131	11138	25 %	25 %	25 %	25 %	479323923
37	NC_021056	CAAC	2	8	12000	12007	50 %	0 %	0 %	50 %	479323924
38	NC_021056	CCCG	2	8	12055	12062	0 %	0 %	25 %	75 %	479323924
39	NC_021056	CCGT	2	8	12306	12313	0 %	25 %	25 %	50 %	479323925
40	NC_021056	CGGC	2	8	12693	12700	0 %	0 %	50 %	50 %	479323926
41	NC_021056	GTCG	2	8	12764	12771	0 %	25 %	50 %	25 %	479323926
42	NC_021056	CCAC	2	8	12781	12788	25 %	0 %	0 %	75 %	479323926
43	NC_021056	CTTC	2	8	12940	12947	0 %	50 %	0 %	50 %	479323926
44	NC_021056	CCCG	2	8	13369	13376	0 %	0 %	25 %	75 %	479323926
45	NC_021056	ACCG	2	8	13519	13526	25 %	0 %	25 %	50 %	479323926
46	NC_021056	GGAC	2	8	13813	13820	25 %	0 %	50 %	25 %	479323926
47	NC_021056	CGTA	2	8	14009	14016	25 %	25 %	25 %	25 %	479323926
48	NC_021056	TACG	2	8	14035	14042	25 %	25 %	25 %	25 %	479323926
49	NC_021056	CCAG	2	8	15076	15083	25 %	0 %	25 %	50 %	479323926
50	NC_021056	GCCG	2	8	15280	15287	0 %	0 %	50 %	50 %	479323926
51	NC_021056	CGCA	2	8	15498	15505	25 %	0 %	25 %	50 %	479323926
52	NC_021056	GCCA	2	8	16230	16237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021056	TGAC	2	8	16535	16542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021056	CGCC	2	8	16960	16967	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_021056	AGCG	3	12	17340	17351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021056	GGGC	2	8	17486	17493	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021056	ACCC	2	8	17525	17532	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_021056	GATG	2	8	17649	17656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021056	CACC	2	8	18393	18400	25 %	0 %	0 %	75 %	479323929
60	NC_021056	TGAG	2	8	18975	18982	25 %	25 %	50 %	0 %	479323929
61	NC_021056	ACAG	2	8	19391	19398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021056	CGGC	2	8	19782	19789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021056	CGTC	2	8	19839	19846	0 %	25 %	25 %	50 %	479323930
64	NC_021056	ACCG	2	8	19887	19894	25 %	0 %	25 %	50 %	479323930
65	NC_021056	CTCC	2	8	20187	20194	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_021056	CCGG	2	8	20556	20563	0 %	0 %	50 %	50 %	479323931
67	NC_021056	AGGG	2	8	20702	20709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021056	AGGC	2	8	20815	20822	25 %	0 %	50 %	25 %	479323932
69	NC_021056	CCGG	2	8	21865	21872	0 %	0 %	50 %	50 %	479323933
70	NC_021056	CACC	2	8	22414	22421	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_021056	GGGA	2	8	22453	22460	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021056	GCAC	2	8	22563	22570	25 %	0 %	25 %	50 %	479323934
73	NC_021056	CGAA	2	8	22689	22696	50 %	0 %	25 %	25 %	479323934
74	NC_021056	ACGT	2	8	23311	23318	25 %	25 %	25 %	25 %	479323935
75	NC_021056	GACC	2	8	23688	23695	25 %	0 %	25 %	50 %	479323935
76	NC_021056	GACC	2	8	24782	24789	25 %	0 %	25 %	50 %	479323937
77	NC_021056	TGGC	2	8	24973	24980	0 %	25 %	50 %	25 %	479323937
78	NC_021056	AGCC	2	8	25024	25031	25 %	0 %	25 %	50 %	479323937
79	NC_021056	GTTG	2	8	26042	26049	0 %	50 %	50 %	0 %	479323940
80	NC_021056	GACA	2	8	26136	26143	50 %	0 %	25 %	25 %	479323940
81	NC_021056	ACGA	2	8	26229	26236	50 %	0 %	25 %	25 %	479323940
82	NC_021056	TCCG	2	8	26658	26665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021056	AGCC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021056	GACG	2	8	27729	27736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021056	CGCA	2	8	27846	27853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021056	CTGA	2	8	28005	28012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021056	CGAG	2	8	28266	28273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021056	TGAC	2	8	28884	28891	25 %	25 %	25 %	25 %	479323943
89	NC_021056	GGGC	2	8	29303	29310	0 %	0 %	75 %	25 %	479323944
90	NC_021056	CGTG	2	8	29347	29354	0 %	25 %	50 %	25 %	479323945
91	NC_021056	TCGA	2	8	30141	30148	25 %	25 %	25 %	25 %	479323945
92	NC_021056	TCAT	2	8	30387	30394	25 %	50 %	0 %	25 %	479323945
93	NC_021056	CCGC	2	8	30728	30735	0 %	0 %	25 %	75 %	479323946
94	NC_021056	GAGG	2	8	30756	30763	25 %	0 %	75 %	0 %	479323946
95	NC_021056	GCGG	2	8	30828	30835	0 %	0 %	75 %	25 %	479323946
96	NC_021056	CGGT	2	8	30865	30872	0 %	25 %	50 %	25 %	479323946
97	NC_021056	CCTT	2	8	30972	30979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021056	ACCA	2	8	31152	31159	50 %	0 %	0 %	50 %	479323947
99	NC_021056	GGGT	2	8	31479	31486	0 %	25 %	75 %	0 %	479323948
100	NC_021056	CTGG	2	8	31555	31562	0 %	25 %	50 %	25 %	479323948
101	NC_021056	CGAC	2	8	32117	32124	25 %	0 %	25 %	50 %	479323948
102	NC_021056	GCCG	2	8	32716	32723	0 %	0 %	50 %	50 %	479323949
103	NC_021056	GATC	2	8	32829	32836	25 %	25 %	25 %	25 %	479323949
104	NC_021056	GGCT	2	8	33148	33155	0 %	25 %	50 %	25 %	479323949
105	NC_021056	GCGG	2	8	33523	33530	0 %	0 %	75 %	25 %	479323949
106	NC_021056	ATGA	2	8	33805	33812	50 %	25 %	25 %	0 %	479323949
107	NC_021056	GCCG	2	8	34050	34057	0 %	0 %	50 %	50 %	479323949
108	NC_021056	CCGG	2	8	34142	34149	0 %	0 %	50 %	50 %	479323949
109	NC_021056	CCCG	2	8	34155	34162	0 %	0 %	25 %	75 %	479323949
110	NC_021056	CTGA	2	8	34553	34560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021056	ACGA	2	8	35119	35126	50 %	0 %	25 %	25 %	479323950
112	NC_021056	TCGT	2	8	35202	35209	0 %	50 %	25 %	25 %	479323951
113	NC_021056	GCCG	2	8	35299	35306	0 %	0 %	50 %	50 %	479323951
114	NC_021056	TGCG	2	8	35619	35626	0 %	25 %	50 %	25 %	479323952
115	NC_021056	CGGC	2	8	35681	35688	0 %	0 %	50 %	50 %	479323952
116	NC_021056	CTGC	2	8	36769	36776	0 %	25 %	25 %	50 %	479323953
117	NC_021056	CGGC	2	8	37486	37493	0 %	0 %	50 %	50 %	479323954
118	NC_021056	GCTC	2	8	37669	37676	0 %	25 %	25 %	50 %	479323954
119	NC_021056	CCGC	2	8	37692	37699	0 %	0 %	25 %	75 %	479323954
120	NC_021056	CGGG	2	8	38293	38300	0 %	0 %	75 %	25 %	479323954
121	NC_021056	TCGG	2	8	38831	38838	0 %	25 %	50 %	25 %	479323954
122	NC_021056	GCCT	2	8	39133	39140	0 %	25 %	25 %	50 %	479323955
123	NC_021056	GCCG	2	8	40037	40044	0 %	0 %	50 %	50 %	479323956
124	NC_021056	GCCC	2	8	40110	40117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_021056	CCGG	2	8	40188	40195	0 %	0 %	50 %	50 %	479323957
126	NC_021056	GTGC	2	8	40198	40205	0 %	25 %	50 %	25 %	479323957
127	NC_021056	GTCC	2	8	41184	41191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021056	GGAA	2	8	41831	41838	50 %	0 %	50 %	0 %	479323960
129	NC_021056	AGCA	2	8	41885	41892	50 %	0 %	25 %	25 %	479323960
130	NC_021056	CGGC	2	8	42221	42228	0 %	0 %	50 %	50 %	479323961
131	NC_021056	GTGC	2	8	42459	42466	0 %	25 %	50 %	25 %	479323962
132	NC_021056	CCGT	2	8	42531	42538	0 %	25 %	25 %	50 %	479323962
133	NC_021056	GTCG	2	8	42611	42618	0 %	25 %	50 %	25 %	479323962
134	NC_021056	ACGC	2	8	43164	43171	25 %	0 %	25 %	50 %	479323963
135	NC_021056	GCCG	2	8	43521	43528	0 %	0 %	50 %	50 %	479323963
136	NC_021056	GACC	2	8	43587	43594	25 %	0 %	25 %	50 %	479323963
137	NC_021056	AGCG	2	8	43696	43703	25 %	0 %	50 %	25 %	479323963
138	NC_021056	GGCC	2	8	43950	43957	0 %	0 %	50 %	50 %	479323963
139	NC_021056	CCGC	2	8	44330	44337	0 %	0 %	25 %	75 %	479323963
140	NC_021056	ACCC	2	8	44866	44873	25 %	0 %	0 %	75 %	479323965
141	NC_021056	CGCA	2	8	44940	44947	25 %	0 %	25 %	50 %	479323965
142	NC_021056	GCCG	2	8	44954	44961	0 %	0 %	50 %	50 %	479323965
143	NC_021056	GCCG	2	8	45068	45075	0 %	0 %	50 %	50 %	479323965
144	NC_021056	GCCT	2	8	45107	45114	0 %	25 %	25 %	50 %	479323965
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322	NC_021056	GCGG	2	8	102861	102868	0 %	0 %	75 %	25 %	479324017
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325	NC_021056	CGGG	2	8	103728	103735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.