MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 2600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021056	CGA	2	6	99433	99438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324013
2502	NC_021056	GATC	2	8	99481	99488	25 %	25 %	25 %	25 %	479324013
2503	NC_021056	TCG	2	6	99588	99593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324013
2504	NC_021056	CCG	2	6	99594	99599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2505	NC_021056	CCGGC	2	10	99689	99698	0 %	0 %	40 %	60 %	479324013
2506	NC_021056	GCC	2	6	99725	99730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2507	NC_021056	CGG	2	6	99793	99798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324013
2508	NC_021056	CGGA	2	8	99800	99807	25 %	0 %	50 %	25 %	479324013
2509	NC_021056	AC	3	6	99861	99866	50 %	0 %	0 %	50 %	479324013
2510	NC_021056	GCC	2	6	99890	99895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2511	NC_021056	CCG	2	6	99901	99906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2512	NC_021056	GCA	2	6	99918	99923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324013
2513	NC_021056	GCT	2	6	100065	100070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2514	NC_021056	CTTC	2	8	100106	100113	0 %	50 %	0 %	50 %	479324014
2515	NC_021056	GCT	2	6	100119	100124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2516	NC_021056	GTG	2	6	100207	100212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479324014
2517	NC_021056	CCGG	2	8	100221	100228	0 %	0 %	50 %	50 %	479324014
2518	NC_021056	TCG	2	6	100241	100246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2519	NC_021056	CGC	2	6	100263	100268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324014
2520	NC_021056	CCA	2	6	100271	100276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324014
2521	NC_021056	GCC	2	6	100298	100303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324014
2522	NC_021056	CCA	2	6	100374	100379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324014
2523	NC_021056	CGA	2	6	100395	100400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2524	NC_021056	CCA	2	6	100403	100408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324014
2525	NC_021056	CCGA	2	8	100499	100506	25 %	0 %	25 %	50 %	479324014
2526	NC_021056	AC	4	8	100528	100535	50 %	0 %	0 %	50 %	479324014
2527	NC_021056	CAC	2	6	100546	100551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324014
2528	NC_021056	CGAT	2	8	100554	100561	25 %	25 %	25 %	25 %	479324014
2529	NC_021056	GC	3	6	100584	100589	0 %	0 %	50 %	50 %	479324014
2530	NC_021056	GTCACC	2	12	100654	100665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324014
2531	NC_021056	AAGGCG	2	12	100732	100743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324014
2532	NC_021056	CAG	2	6	100781	100786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2533	NC_021056	TGA	2	6	100794	100799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324015
2534	NC_021056	CGC	2	6	100811	100816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2535	NC_021056	CGT	2	6	100885	100890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2536	NC_021056	CCG	2	6	100914	100919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2537	NC_021056	CAC	2	6	100933	100938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324015
2538	NC_021056	CTC	2	6	100970	100975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479324015
2539	NC_021056	CCA	2	6	100996	101001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324015
2540	NC_021056	GCC	2	6	101030	101035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2541	NC_021056	CTG	2	6	101038	101043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2542	NC_021056	CTA	2	6	101065	101070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324015
2543	NC_021056	CGG	2	6	101074	101079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324015
2544	NC_021056	CTC	2	6	101222	101227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479324015
2545	NC_021056	GCC	2	6	101238	101243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2546	NC_021056	GCC	2	6	101298	101303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2547	NC_021056	CAG	2	6	101323	101328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2548	NC_021056	GCC	2	6	101360	101365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2549	NC_021056	GTC	2	6	101393	101398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2550	NC_021056	CGAGGA	2	12	101524	101535	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324015
2551	NC_021056	CCG	2	6	101554	101559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2552	NC_021056	CCT	2	6	101590	101595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479324015
2553	NC_021056	CTC	3	9	101624	101632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479324015
2554	NC_021056	ACGA	2	8	101660	101667	50 %	0 %	25 %	25 %	479324015
2555	NC_021056	CGT	2	6	101677	101682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2556	NC_021056	GAC	2	6	101761	101766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2557	NC_021056	GCTG	2	8	101825	101832	0 %	25 %	50 %	25 %	479324016
2558	NC_021056	CCG	2	6	101843	101848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324016
2559	NC_021056	TCG	2	6	101855	101860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324016
2560	NC_021056	CGCA	2	8	101871	101878	25 %	0 %	25 %	50 %	479324016
2561	NC_021056	CTG	2	6	101887	101892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324016
2562	NC_021056	CAC	2	6	101943	101948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324016
2563	NC_021056	AAC	2	6	101950	101955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479324016
2564	NC_021056	CCG	2	6	102027	102032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324016
2565	NC_021056	CGT	2	6	102097	102102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324016
2566	NC_021056	CGG	2	6	102112	102117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324016
2567	NC_021056	GA	3	6	102122	102127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_021056	ACT	2	6	102164	102169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_021056	ACG	2	6	102190	102195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_021056	TGT	2	6	102240	102245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_021056	GTC	2	6	102301	102306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324017
2572	NC_021056	GTA	2	6	102307	102312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324017
2573	NC_021056	CTG	2	6	102397	102402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324017
2574	NC_021056	CTT	2	6	102457	102462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479324017
2575	NC_021056	CGG	2	6	102463	102468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324017
2576	NC_021056	CCG	2	6	102579	102584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324017
2577	NC_021056	CGGCC	2	10	102599	102608	0 %	0 %	40 %	60 %	479324017
2578	NC_021056	TGA	2	6	102648	102653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324017
2579	NC_021056	CTT	2	6	102661	102666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479324017
2580	NC_021056	CGG	2	6	102701	102706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324017
2581	NC_021056	CG	3	6	102773	102778	0 %	0 %	50 %	50 %	479324017
2582	NC_021056	GCGG	2	8	102861	102868	0 %	0 %	75 %	25 %	479324017
2583	NC_021056	TGG	2	6	102891	102896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479324017
2584	NC_021056	CCTC	2	8	103007	103014	0 %	25 %	0 %	75 %	479324017
2585	NC_021056	GATGC	2	10	103132	103141	20 %	20 %	40 %	20 %	479324017
2586	NC_021056	GACG	2	8	103162	103169	25 %	0 %	50 %	25 %	479324017
2587	NC_021056	AAG	2	6	103273	103278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_021056	CAC	2	6	103298	103303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324018
2589	NC_021056	CGT	2	6	103314	103319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324018
2590	NC_021056	CCA	2	6	103333	103338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324018
2591	NC_021056	CGG	3	9	103388	103396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324018
2592	NC_021056	CAC	2	6	103417	103422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324018
2593	NC_021056	AACGC	2	10	103458	103467	40 %	0 %	20 %	40 %	479324018
2594	NC_021056	CGA	2	6	103500	103505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324018
2595	NC_021056	CGGG	2	8	103728	103735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2596	NC_021056	GC	3	6	103755	103760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_021056	TCA	2	6	103795	103800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_021056	CAG	2	6	103937	103942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_021056	CCG	2	6	103999	104004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_021056	CGC	2	6	104015	104020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.