MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 26153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021028	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021028	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021028	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021028	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021028	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021028	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535789
7	NC_021028	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535789
8	NC_021028	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
9	NC_021028	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535789
10	NC_021028	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535789
11	NC_021028	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535789
12	NC_021028	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
13	NC_021028	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
14	NC_021028	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535789
15	NC_021028	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535789
16	NC_021028	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535789
17	NC_021028	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535789
18	NC_021028	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535789
19	NC_021028	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535789
20	NC_021028	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021028	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021028	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535790
23	NC_021028	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535790
24	NC_021028	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
25	NC_021028	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
26	NC_021028	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
27	NC_021028	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
28	NC_021028	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535790
29	NC_021028	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535790
30	NC_021028	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
31	NC_021028	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
32	NC_021028	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535790
33	NC_021028	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535790
34	NC_021028	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535790
35	NC_021028	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535790
36	NC_021028	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021028	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535791
38	NC_021028	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535791
39	NC_021028	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535791
40	NC_021028	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535791
41	NC_021028	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
42	NC_021028	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
43	NC_021028	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535792
44	NC_021028	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
45	NC_021028	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535792
46	NC_021028	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
47	NC_021028	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
48	NC_021028	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
49	NC_021028	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
50	NC_021028	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
51	NC_021028	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
52	NC_021028	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535792
53	NC_021028	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
54	NC_021028	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535792
55	NC_021028	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
56	NC_021028	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
57	NC_021028	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021028	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535793
59	NC_021028	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535793
60	NC_021028	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535793
61	NC_021028	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535793
62	NC_021028	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535793
63	NC_021028	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535793
64	NC_021028	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535793
65	NC_021028	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535793
66	NC_021028	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535793
67	NC_021028	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
68	NC_021028	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535794
69	NC_021028	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
70	NC_021028	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
71	NC_021028	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535794
72	NC_021028	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535794
73	NC_021028	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
74	NC_021028	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535794
75	NC_021028	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
76	NC_021028	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
77	NC_021028	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
78	NC_021028	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
79	NC_021028	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
80	NC_021028	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
81	NC_021028	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
82	NC_021028	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535794
83	NC_021028	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535794
84	NC_021028	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535794
85	NC_021028	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535794
86	NC_021028	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535794
87	NC_021028	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
88	NC_021028	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
89	NC_021028	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
90	NC_021028	GAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
91	NC_021028	GTA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
92	NC_021028	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535794
93	NC_021028	TGT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535794
94	NC_021028	TGA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
95	NC_021028	TGA	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
96	NC_021028	GAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
97	NC_021028	CCG	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535794
98	NC_021028	ACA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535794
99	NC_021028	GAC	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535794
100	NC_021028	TAT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
101	NC_021028	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
102	NC_021028	GTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
103	NC_021028	ATA	2	6	8215	8220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535794
104	NC_021028	ATT	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
105	NC_021028	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
106	NC_021028	GAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
107	NC_021028	TCT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021028	AAT	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021028	TAA	2	6	8500	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021028	CGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535795
111	NC_021028	TGC	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535795
112	NC_021028	GCA	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535795
113	NC_021028	AGA	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535795
114	NC_021028	AAT	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535796
115	NC_021028	CGT	2	6	8821	8826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535796
116	NC_021028	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535796
117	NC_021028	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535796
118	NC_021028	TGA	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535796
119	NC_021028	TGC	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535796
120	NC_021028	TAT	2	6	9079	9084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535796
121	NC_021028	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535797
122	NC_021028	GAA	2	6	9197	9202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535797
123	NC_021028	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535797
124	NC_021028	AAG	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535797
125	NC_021028	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535798
126	NC_021028	TTG	2	6	9276	9281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535798
127	NC_021028	AGT	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535798
128	NC_021028	TTA	2	6	9353	9358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535798
129	NC_021028	TAG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535798
130	NC_021028	ATC	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535798
131	NC_021028	CAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535798
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133	NC_021028	ATC	2	6	9677	9682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535798
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260	NC_021028	GGT	2	6	19527	19532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021028	TCG	2	6	19642	19647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_021028	CGT	2	6	19722	19727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_021028	AGT	2	6	20180	20185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021028	GTA	2	6	20247	20252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021028	ATG	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_021028	TAA	3	9	20341	20349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_021028	TAT	2	6	20467	20472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_021028	GTG	2	6	20963	20968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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