MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021028	AGC	2	6	168865	168870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535947
3502	NC_021028	GC	3	6	168915	168920	0 %	0 %	50 %	50 %	480535947
3503	NC_021028	GTT	2	6	168923	168928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535947
3504	NC_021028	ACG	2	6	168931	168936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535947
3505	NC_021028	A	6	6	168963	168968	100 %	0 %	0 %	0 %	480535947
3506	NC_021028	ATT	2	6	169083	169088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021028	TAT	2	6	169185	169190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021028	AGG	2	6	169248	169253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021028	TTTGCT	2	12	169273	169284	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3510	NC_021028	TTGC	2	8	169319	169326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_021028	GGA	2	6	169333	169338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021028	TCT	2	6	169341	169346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021028	CT	3	6	169403	169408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_021028	TCC	2	6	169421	169426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_021028	GTTTG	2	10	169441	169450	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021028	T	6	6	169485	169490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021028	TAG	2	6	169508	169513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021028	GGT	2	6	169553	169558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021028	ACATG	2	10	169574	169583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3520	NC_021028	TTA	2	6	169603	169608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021028	ATAAAA	2	12	169652	169663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021028	TAG	2	6	169697	169702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021028	ATAA	2	8	169842	169849	75 %	25 %	0 %	0 %	480535948
3524	NC_021028	TTA	2	6	169899	169904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535948
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3528	NC_021028	A	6	6	169954	169959	100 %	0 %	0 %	0 %	480535949
3529	NC_021028	ATTG	2	8	170096	170103	25 %	50 %	25 %	0 %	480535949
3530	NC_021028	T	7	7	170139	170145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021028	GAAAA	2	10	170166	170175	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021028	T	7	7	170189	170195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021028	ATT	2	6	170198	170203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021028	GTA	2	6	170264	170269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021028	TC	3	6	170343	170348	0 %	50 %	0 %	50 %	480535950
3536	NC_021028	GAC	2	6	170381	170386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535950
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3539	NC_021028	TTGGA	2	10	170451	170460	20 %	40 %	40 %	0 %	480535950
3540	NC_021028	AGTT	2	8	170569	170576	25 %	50 %	25 %	0 %	480535950
3541	NC_021028	GTCTA	2	10	170582	170591	20 %	40 %	20 %	20 %	480535950
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3543	NC_021028	TGG	2	6	170623	170628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535950
3544	NC_021028	CAA	2	6	170651	170656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535950
3545	NC_021028	TTG	2	6	170782	170787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535950
3546	NC_021028	AAG	2	6	170872	170877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535950
3547	NC_021028	CAG	2	6	171008	171013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535951
3548	NC_021028	CAGT	2	8	171060	171067	25 %	25 %	25 %	25 %	480535951
3549	NC_021028	ATG	2	6	171132	171137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535951
3550	NC_021028	CT	3	6	171174	171179	0 %	50 %	0 %	50 %	480535951
3551	NC_021028	GACA	2	8	171262	171269	50 %	0 %	25 %	25 %	480535951
3552	NC_021028	AAGA	2	8	171323	171330	75 %	0 %	25 %	0 %	480535951
3553	NC_021028	CTA	2	6	171361	171366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535951
3554	NC_021028	AG	3	6	171399	171404	50 %	0 %	50 %	0 %	480535951
3555	NC_021028	GATA	2	8	171417	171424	50 %	25 %	25 %	0 %	480535951
3556	NC_021028	TGA	2	6	171449	171454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535952
3557	NC_021028	ACG	2	6	171478	171483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535952
3558	NC_021028	TGG	2	6	171536	171541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535952
3559	NC_021028	GTC	2	6	171562	171567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535952
3560	NC_021028	GAG	2	6	171597	171602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535952
3561	NC_021028	GCC	2	6	171699	171704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535952
3562	NC_021028	GTG	2	6	171823	171828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535952
3563	NC_021028	CA	3	6	171831	171836	50 %	0 %	0 %	50 %	480535952
3564	NC_021028	TTG	2	6	171874	171879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535952
3565	NC_021028	GA	3	6	171880	171885	50 %	0 %	50 %	0 %	480535952
3566	NC_021028	GGTC	2	8	171920	171927	0 %	25 %	50 %	25 %	480535952
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3578	NC_021028	T	6	6	172494	172499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021028	TCA	2	6	172511	172516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3581	NC_021028	ATT	2	6	172584	172589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021028	A	6	6	172657	172662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021028	TCAA	2	8	172711	172718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3596	NC_021028	AGG	2	6	173642	173647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535953
3597	NC_021028	GTT	2	6	173758	173763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535953
3598	NC_021028	T	7	7	173823	173829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021028	GTT	2	6	173938	173943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021028	TAA	2	6	173955	173960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021028	A	6	6	174019	174024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021028	GGA	2	6	174032	174037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021028	T	7	7	174038	174044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021028	C	6	6	174049	174054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3605	NC_021028	C	6	6	174060	174065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3606	NC_021028	ATT	2	6	174169	174174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021028	TAGG	2	8	174231	174238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021028	GTAG	2	8	174329	174336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021028	AAGC	2	8	174350	174357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_021028	A	6	6	174419	174424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021028	AAT	2	6	174488	174493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021028	TCT	2	6	174498	174503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_021028	AG	3	6	174507	174512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021028	CTGC	2	8	174518	174525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_021028	ATAAAT	2	12	174575	174586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021028	T	6	6	174669	174674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021028	GTT	2	6	174711	174716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021028	GGA	2	6	174717	174722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021028	CAG	2	6	174733	174738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_021028	T	6	6	174802	174807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021028	TAT	2	6	174902	174907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021028	ATT	2	6	174980	174985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021028	CGT	2	6	175025	175030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_021028	AAAT	2	8	175067	175074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021028	TAA	2	6	175143	175148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021028	TGA	2	6	175260	175265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021028	AAT	2	6	175312	175317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021028	ATT	2	6	175353	175358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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