MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021028	TGC	3	9	46020	46028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535843
1002	NC_021028	TGC	2	6	46032	46037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535843
1003	NC_021028	TTG	2	6	46040	46045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535843
1004	NC_021028	GTT	2	6	46180	46185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535843
1005	NC_021028	TGG	2	6	46189	46194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535843
1006	NC_021028	TCA	2	6	46256	46261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535843
1007	NC_021028	GCTG	2	8	46297	46304	0 %	25 %	50 %	25 %	480535843
1008	NC_021028	ACA	2	6	46327	46332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535843
1009	NC_021028	ATC	2	6	46342	46347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535843
1010	NC_021028	GTT	2	6	46354	46359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535843
1011	NC_021028	CAAT	2	8	46367	46374	50 %	25 %	0 %	25 %	480535843
1012	NC_021028	TTC	2	6	46689	46694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535843
1013	NC_021028	GAAT	2	8	46874	46881	50 %	25 %	25 %	0 %	480535843
1014	NC_021028	TAA	2	6	46884	46889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535843
1015	NC_021028	TGGT	2	8	46895	46902	0 %	50 %	50 %	0 %	480535843
1016	NC_021028	ACCA	2	8	46995	47002	50 %	0 %	0 %	50 %	480535843
1017	NC_021028	CATTAC	2	12	47007	47018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535843
1018	NC_021028	AGA	2	6	47034	47039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535843
1019	NC_021028	TGA	2	6	47061	47066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535843
1020	NC_021028	GAG	2	6	47114	47119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535843
1021	NC_021028	GA	3	6	47221	47226	50 %	0 %	50 %	0 %	480535844
1022	NC_021028	TGG	2	6	47249	47254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535844
1023	NC_021028	AACA	2	8	47280	47287	75 %	0 %	0 %	25 %	480535844
1024	NC_021028	GAA	2	6	47337	47342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535844
1025	NC_021028	AG	3	6	47390	47395	50 %	0 %	50 %	0 %	480535844
1026	NC_021028	AAC	2	6	47408	47413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535844
1027	NC_021028	GAA	2	6	47451	47456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535844
1028	NC_021028	AAG	2	6	47543	47548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535844
1029	NC_021028	GGTCA	2	10	47640	47649	20 %	20 %	40 %	20 %	480535844
1030	NC_021028	AAT	2	6	47688	47693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535844
1031	NC_021028	ACA	3	9	47715	47723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535844
1032	NC_021028	GTT	2	6	47790	47795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535844
1033	NC_021028	GAAA	2	8	47930	47937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021028	AAG	2	6	48007	48012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021028	GAT	2	6	48120	48125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021028	CA	3	6	48143	48148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_021028	TCG	2	6	48319	48324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535845
1038	NC_021028	AGA	2	6	48373	48378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535845
1039	NC_021028	GTG	2	6	48382	48387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535845
1040	NC_021028	GTG	2	6	48394	48399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535845
1041	NC_021028	TTA	2	6	48403	48408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535845
1042	NC_021028	A	6	6	48443	48448	100 %	0 %	0 %	0 %	480535845
1043	NC_021028	TGT	2	6	48458	48463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535845
1044	NC_021028	AAC	2	6	48588	48593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535845
1045	NC_021028	AGA	2	6	48803	48808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535845
1046	NC_021028	TC	3	6	48814	48819	0 %	50 %	0 %	50 %	480535845
1047	NC_021028	GAT	2	6	48828	48833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535845
1048	NC_021028	TGG	2	6	48845	48850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535845
1049	NC_021028	TGG	2	6	48863	48868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535845
1050	NC_021028	GAA	2	6	49029	49034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535845
1051	NC_021028	AG	3	6	49039	49044	50 %	0 %	50 %	0 %	480535845
1052	NC_021028	ATCA	2	8	49059	49066	50 %	25 %	0 %	25 %	480535845
1053	NC_021028	GAAA	2	8	49097	49104	75 %	0 %	25 %	0 %	480535845
1054	NC_021028	AGT	2	6	49146	49151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535845
1055	NC_021028	AAGC	2	8	49296	49303	50 %	0 %	25 %	25 %	480535845
1056	NC_021028	CAAG	2	8	49325	49332	50 %	0 %	25 %	25 %	480535845
1057	NC_021028	CTGG	2	8	49362	49369	0 %	25 %	50 %	25 %	480535845
1058	NC_021028	AAGC	2	8	49524	49531	50 %	0 %	25 %	25 %	480535845
1059	NC_021028	CAAG	2	8	49553	49560	50 %	0 %	25 %	25 %	480535845
1060	NC_021028	CTGG	2	8	49590	49597	0 %	25 %	50 %	25 %	480535845
1061	NC_021028	AAGC	2	8	49752	49759	50 %	0 %	25 %	25 %	480535845
1062	NC_021028	CAAG	2	8	49781	49788	50 %	0 %	25 %	25 %	480535845
1063	NC_021028	CTGG	2	8	49818	49825	0 %	25 %	50 %	25 %	480535845
1064	NC_021028	GAC	3	9	49856	49864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535845
1065	NC_021028	GAG	2	6	49935	49940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535845
1066	NC_021028	CT	3	6	49941	49946	0 %	50 %	0 %	50 %	480535845
1067	NC_021028	CTA	2	6	50053	50058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1068	NC_021028	AGTA	2	8	50070	50077	50 %	25 %	25 %	0 %	480535845
1069	NC_021028	AAT	2	6	50246	50251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535845
1070	NC_021028	GTT	2	6	50381	50386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535845
1071	NC_021028	AAG	2	6	50398	50403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535845
1072	NC_021028	TTTGGA	2	12	50410	50421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480535845
1073	NC_021028	CTT	2	6	50452	50457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535845
1074	NC_021028	AAC	2	6	50515	50520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535845
1075	NC_021028	CTCG	2	8	50528	50535	0 %	25 %	25 %	50 %	480535845
1076	NC_021028	CTGA	2	8	50553	50560	25 %	25 %	25 %	25 %	480535845
1077	NC_021028	CTCA	2	8	50588	50595	25 %	25 %	0 %	50 %	480535845
1078	NC_021028	CTG	2	6	50602	50607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535845
1079	NC_021028	GACA	2	8	50639	50646	50 %	0 %	25 %	25 %	480535845
1080	NC_021028	GAA	2	6	50784	50789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535845
1081	NC_021028	AAC	2	6	50910	50915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535845
1082	NC_021028	A	6	6	51062	51067	100 %	0 %	0 %	0 %	480535845
1083	NC_021028	GGTA	2	8	51111	51118	25 %	25 %	50 %	0 %	480535845
1084	NC_021028	AT	3	6	51140	51145	50 %	50 %	0 %	0 %	480535845
1085	NC_021028	ACT	2	6	51160	51165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1086	NC_021028	A	6	6	51169	51174	100 %	0 %	0 %	0 %	480535845
1087	NC_021028	ATT	2	6	51197	51202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535845
1088	NC_021028	CTG	2	6	51430	51435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535845
1089	NC_021028	GACA	2	8	51467	51474	50 %	0 %	25 %	25 %	480535845
1090	NC_021028	GAA	2	6	51612	51617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535845
1091	NC_021028	AAC	2	6	51738	51743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535845
1092	NC_021028	A	6	6	51890	51895	100 %	0 %	0 %	0 %	480535845
1093	NC_021028	GGTA	2	8	51939	51946	25 %	25 %	50 %	0 %	480535845
1094	NC_021028	AT	3	6	51968	51973	50 %	50 %	0 %	0 %	480535845
1095	NC_021028	ACT	2	6	51988	51993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1096	NC_021028	A	6	6	51997	52002	100 %	0 %	0 %	0 %	480535845
1097	NC_021028	CAT	2	6	52024	52029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1098	NC_021028	TCA	2	6	52144	52149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1099	NC_021028	TAAA	2	8	52222	52229	75 %	25 %	0 %	0 %	480535845
1100	NC_021028	GAG	2	6	52269	52274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535845
1101	NC_021028	CAG	2	6	52291	52296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535845
1102	NC_021028	AAG	2	6	52342	52347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535845
1103	NC_021028	ATCA	2	8	52359	52366	50 %	25 %	0 %	25 %	480535845
1104	NC_021028	GCTA	2	8	52419	52426	25 %	25 %	25 %	25 %	480535845
1105	NC_021028	ACT	2	6	52473	52478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1106	NC_021028	ACT	2	6	52548	52553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1107	NC_021028	TAA	2	6	52586	52591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535845
1108	NC_021028	ACAA	2	8	52638	52645	75 %	0 %	0 %	25 %	480535845
1109	NC_021028	CAAA	2	8	52693	52700	75 %	0 %	0 %	25 %	480535845
1110	NC_021028	ACT	2	6	52758	52763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1111	NC_021028	TTG	2	6	52914	52919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535845
1112	NC_021028	AAT	2	6	53016	53021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535845
1113	NC_021028	GAA	2	6	53102	53107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535845
1114	NC_021028	TA	3	6	53284	53289	50 %	50 %	0 %	0 %	480535845
1115	NC_021028	AACT	2	8	53383	53390	50 %	25 %	0 %	25 %	480535845
1116	NC_021028	ATC	2	6	53430	53435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1117	NC_021028	AATC	2	8	53441	53448	50 %	25 %	0 %	25 %	480535845
1118	NC_021028	TTG	2	6	53473	53478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535845
1119	NC_021028	GA	3	6	53500	53505	50 %	0 %	50 %	0 %	480535845
1120	NC_021028	TCA	2	6	53524	53529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1121	NC_021028	TGC	2	6	53636	53641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535845
1122	NC_021028	TTA	2	6	53644	53649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535845
1123	NC_021028	TCT	2	6	53701	53706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535845
1124	NC_021028	CTA	2	6	53707	53712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1125	NC_021028	AGG	2	6	53858	53863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535845
1126	NC_021028	AAC	2	6	53945	53950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535845
1127	NC_021028	TAC	2	6	54038	54043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535845
1128	NC_021028	AGG	2	6	54122	54127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535845
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1283	NC_021028	CT	3	6	61531	61536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1387	NC_021028	A	6	6	66086	66091	100 %	0 %	0 %	0 %	480535862
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