MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021028	AGA	2	6	217333	217338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535991
4502	NC_021028	AGA	2	6	217342	217347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535991
4503	NC_021028	GAA	2	6	217364	217369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535991
4504	NC_021028	GGA	2	6	217387	217392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535991
4505	NC_021028	GA	3	6	217453	217458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021028	TAG	2	6	217586	217591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021028	TTA	2	6	217596	217601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021028	TTA	2	6	217645	217650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_021028	ATTG	2	8	217673	217680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021028	AGA	2	6	217714	217719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535992
4511	NC_021028	TAT	2	6	217816	217821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535992
4512	NC_021028	ATT	2	6	217873	217878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535992
4513	NC_021028	A	6	6	217892	217897	100 %	0 %	0 %	0 %	480535992
4514	NC_021028	GCAGAC	2	12	217967	217978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535992
4515	NC_021028	T	6	6	218048	218053	0 %	100 %	0 %	0 %	480535992
4516	NC_021028	AGG	2	6	218094	218099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535992
4517	NC_021028	TTA	2	6	218111	218116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535992
4518	NC_021028	TGG	2	6	218128	218133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535992
4519	NC_021028	TCA	2	6	218175	218180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535992
4520	NC_021028	GCAGA	2	10	218234	218243	40 %	0 %	40 %	20 %	480535992
4521	NC_021028	AAG	2	6	218267	218272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535992
4522	NC_021028	TGTC	2	8	218308	218315	0 %	50 %	25 %	25 %	480535992
4523	NC_021028	A	6	6	218318	218323	100 %	0 %	0 %	0 %	480535992
4524	NC_021028	CAGG	2	8	218351	218358	25 %	0 %	50 %	25 %	480535992
4525	NC_021028	T	6	6	218365	218370	0 %	100 %	0 %	0 %	480535992
4526	NC_021028	CAG	2	6	218444	218449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535992
4527	NC_021028	TCT	2	6	218479	218484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535992
4528	NC_021028	AAGGA	2	10	218496	218505	60 %	0 %	40 %	0 %	480535992
4529	NC_021028	TGA	2	6	218512	218517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535992
4530	NC_021028	CTGA	2	8	218726	218733	25 %	25 %	25 %	25 %	480535992
4531	NC_021028	TCT	2	6	218822	218827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535992
4532	NC_021028	GAA	2	6	218852	218857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535992
4533	NC_021028	TC	3	6	218894	218899	0 %	50 %	0 %	50 %	480535992
4534	NC_021028	CTG	2	6	218927	218932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535992
4535	NC_021028	TCA	2	6	219032	219037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535993
4536	NC_021028	TAG	2	6	219092	219097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535993
4537	NC_021028	AGG	2	6	219162	219167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535993
4538	NC_021028	AACC	2	8	219196	219203	50 %	0 %	0 %	50 %	480535993
4539	NC_021028	ACCG	2	8	219213	219220	25 %	0 %	25 %	50 %	480535993
4540	NC_021028	ATT	2	6	219367	219372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535993
4541	NC_021028	GAT	2	6	219376	219381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535993
4542	NC_021028	TCG	2	6	219413	219418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535993
4543	NC_021028	GAT	2	6	219421	219426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535993
4544	NC_021028	TTTTAC	2	12	219505	219516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4545	NC_021028	AAT	2	6	219523	219528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021028	AGG	2	6	219604	219609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_021028	ATT	2	6	219634	219639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535994
4548	NC_021028	TCTT	2	8	219702	219709	0 %	75 %	0 %	25 %	480535994
4549	NC_021028	ATC	2	6	219764	219769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535994
4550	NC_021028	GTT	2	6	219823	219828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535994
4551	NC_021028	A	6	6	219893	219898	100 %	0 %	0 %	0 %	480535994
4552	NC_021028	GAA	2	6	219913	219918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535994
4553	NC_021028	AAG	2	6	219939	219944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535994
4554	NC_021028	CTA	2	6	219956	219961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535994
4555	NC_021028	AAAG	2	8	219974	219981	75 %	0 %	25 %	0 %	480535994
4556	NC_021028	TCA	2	6	220002	220007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535994
4557	NC_021028	T	6	6	220064	220069	0 %	100 %	0 %	0 %	480535994
4558	NC_021028	AGA	2	6	220102	220107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535994
4559	NC_021028	ATTT	2	8	220126	220133	25 %	75 %	0 %	0 %	480535994
4560	NC_021028	AGA	2	6	220153	220158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535994
4561	NC_021028	ATG	2	6	220233	220238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535994
4562	NC_021028	TAA	2	6	220348	220353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535994
4563	NC_021028	ATTG	2	8	220372	220379	25 %	50 %	25 %	0 %	480535994
4564	NC_021028	TGG	2	6	220402	220407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535994
4565	NC_021028	GA	3	6	220442	220447	50 %	0 %	50 %	0 %	480535994
4566	NC_021028	GAG	2	6	220539	220544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535994
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4568	NC_021028	AATC	2	8	220675	220682	50 %	25 %	0 %	25 %	480535994
4569	NC_021028	AAG	2	6	220808	220813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535994
4570	NC_021028	TTCA	2	8	220814	220821	25 %	50 %	0 %	25 %	480535994
4571	NC_021028	GAG	2	6	220833	220838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535994
4572	NC_021028	CTT	2	6	220850	220855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535994
4573	NC_021028	CTG	2	6	220857	220862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535994
4574	NC_021028	GGT	2	6	220933	220938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535994
4575	NC_021028	CAAT	2	8	220944	220951	50 %	25 %	0 %	25 %	480535994
4576	NC_021028	AT	3	6	221043	221048	50 %	50 %	0 %	0 %	480535994
4577	NC_021028	AGAA	2	8	221201	221208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_021028	AGG	2	6	221211	221216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_021028	CTAA	2	8	221227	221234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4580	NC_021028	GAA	2	6	221236	221241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_021028	ATGAT	2	10	221246	221255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_021028	A	6	6	221317	221322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_021028	GT	3	6	221408	221413	0 %	50 %	50 %	0 %	480535995
4584	NC_021028	GTAGA	2	10	221417	221426	40 %	20 %	40 %	0 %	480535995
4585	NC_021028	CAT	2	6	221482	221487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535995
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4588	NC_021028	TCA	2	6	221625	221630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535995
4589	NC_021028	TAT	2	6	221653	221658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535995
4590	NC_021028	TAT	2	6	221677	221682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535995
4591	NC_021028	AGG	2	6	221748	221753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535995
4592	NC_021028	T	6	6	221822	221827	0 %	100 %	0 %	0 %	480535995
4593	NC_021028	TGG	2	6	221853	221858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535995
4594	NC_021028	TTTAG	2	10	221902	221911	20 %	60 %	20 %	0 %	480535995
4595	NC_021028	ATC	2	6	222000	222005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535995
4596	NC_021028	TTG	2	6	222037	222042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535995
4597	NC_021028	CTA	2	6	222135	222140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535995
4598	NC_021028	TGC	2	6	222144	222149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535995
4599	NC_021028	T	7	7	222241	222247	0 %	100 %	0 %	0 %	480535995
4600	NC_021028	TTG	2	6	222253	222258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535995
4601	NC_021028	CTTTT	2	10	222376	222385	0 %	80 %	0 %	20 %	480535995
4602	NC_021028	CTT	2	6	222404	222409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535995
4603	NC_021028	GTC	2	6	222418	222423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535995
4604	NC_021028	AGA	2	6	222487	222492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535995
4605	NC_021028	TTC	2	6	222529	222534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535995
4606	NC_021028	T	6	6	222588	222593	0 %	100 %	0 %	0 %	480535995
4607	NC_021028	CTAT	2	8	222680	222687	25 %	50 %	0 %	25 %	480535995
4608	NC_021028	GAT	2	6	222694	222699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535995
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4610	NC_021028	GAAA	2	8	222807	222814	75 %	0 %	25 %	0 %	480535995
4611	NC_021028	AAC	2	6	222815	222820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535995
4612	NC_021028	GTCTG	2	10	222853	222862	0 %	40 %	40 %	20 %	480535995
4613	NC_021028	CAA	2	6	222892	222897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535995
4614	NC_021028	AGAA	2	8	223032	223039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021028	GCAT	2	8	223054	223061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_021028	AGA	2	6	223073	223078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535996
4617	NC_021028	A	6	6	223078	223083	100 %	0 %	0 %	0 %	480535996
4618	NC_021028	CT	3	6	223099	223104	0 %	50 %	0 %	50 %	480535996
4619	NC_021028	TCG	2	6	223105	223110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535996
4620	NC_021028	CTGA	2	8	223227	223234	25 %	25 %	25 %	25 %	480535996
4621	NC_021028	GA	3	6	223233	223238	50 %	0 %	50 %	0 %	480535996
4622	NC_021028	ATT	2	6	223239	223244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535996
4623	NC_021028	GCTG	2	8	223337	223344	0 %	25 %	50 %	25 %	480535996
4624	NC_021028	CAA	2	6	223427	223432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535996
4625	NC_021028	TAA	2	6	223460	223465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535996
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4750	NC_021028	GTT	2	6	229775	229780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536005
4751	NC_021028	TACAC	2	10	229827	229836	40 %	20 %	0 %	40 %	480536005
4752	NC_021028	CAT	2	6	229855	229860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536005
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4754	NC_021028	TGC	2	6	230014	230019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536005
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4853	NC_021028	A	7	7	234484	234490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4857	NC_021028	A	6	6	234757	234762	100 %	0 %	0 %	0 %	480536016
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4863	NC_021028	ACAA	2	8	235079	235086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4864	NC_021028	GTTCA	2	10	235122	235131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4865	NC_021028	TAA	2	6	235224	235229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536017
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4867	NC_021028	ACT	2	6	235408	235413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536017
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4869	NC_021028	GTT	2	6	235435	235440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536017
4870	NC_021028	AAGA	2	8	235459	235466	75 %	0 %	25 %	0 %	480536017
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4872	NC_021028	CAA	3	9	235592	235600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536017
4873	NC_021028	GTT	2	6	235603	235608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536017
4874	NC_021028	AGT	2	6	235626	235631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536017
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4876	NC_021028	TACG	2	8	235648	235655	25 %	25 %	25 %	25 %	480536017
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4950	NC_021028	AAAAT	2	10	238929	238938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4963	NC_021028	ATCGA	2	10	239677	239686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4979	NC_021028	AGG	2	6	240454	240459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4992	NC_021028	AGC	2	6	241037	241042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536027
4993	NC_021028	GT	3	6	241066	241071	0 %	50 %	50 %	0 %	480536027
4994	NC_021028	A	6	6	241168	241173	100 %	0 %	0 %	0 %	480536027
4995	NC_021028	CTG	2	6	241198	241203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536027
4996	NC_021028	TTC	2	6	241286	241291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536027
4997	NC_021028	CTG	2	6	241336	241341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536027
4998	NC_021028	GTAG	2	8	241440	241447	25 %	25 %	50 %	0 %	480536027
4999	NC_021028	ATG	2	6	241450	241455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536027
5000	NC_021028	ATT	2	6	241497	241502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536027

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