MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 5930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021026	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021026	GAAA	2	8	188	195	75 %	0 %	25 %	0 %	480533969
3	NC_021026	AAGA	2	8	229	236	75 %	0 %	25 %	0 %	480533969
4	NC_021026	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	480533969
5	NC_021026	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	480533969
6	NC_021026	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	480533969
7	NC_021026	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	480533969
8	NC_021026	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021026	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	480533970
10	NC_021026	AGCA	2	8	2095	2102	50 %	0 %	25 %	25 %	480533970
11	NC_021026	ACTT	2	8	2699	2706	25 %	50 %	0 %	25 %	480533970
12	NC_021026	GATT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	25 %	0 %	480533970
13	NC_021026	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021026	AACT	2	8	3342	3349	50 %	25 %	0 %	25 %	480533972
15	NC_021026	AATT	2	8	3588	3595	50 %	50 %	0 %	0 %	480533972
16	NC_021026	CAAA	2	8	3865	3872	75 %	0 %	0 %	25 %	480533972
17	NC_021026	CTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	480533972
18	NC_021026	ACTT	2	8	4049	4056	25 %	50 %	0 %	25 %	480533972
19	NC_021026	AAAT	2	8	4365	4372	75 %	25 %	0 %	0 %	480533973
20	NC_021026	TTGA	2	8	4446	4453	25 %	50 %	25 %	0 %	480533973
21	NC_021026	ATGA	2	8	4569	4576	50 %	25 %	25 %	0 %	480533973
22	NC_021026	TATC	2	8	5146	5153	25 %	50 %	0 %	25 %	480533974
23	NC_021026	GATT	2	8	5314	5321	25 %	50 %	25 %	0 %	480533974
24	NC_021026	GAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	25 %	0 %	480533974
25	NC_021026	TTTA	2	8	7622	7629	25 %	75 %	0 %	0 %	480533974
26	NC_021026	GTCG	2	8	7683	7690	0 %	25 %	50 %	25 %	480533974
27	NC_021026	ATCA	2	8	7736	7743	50 %	25 %	0 %	25 %	480533974
28	NC_021026	GAAA	2	8	8205	8212	75 %	0 %	25 %	0 %	480533974
29	NC_021026	AAGA	2	8	8361	8368	75 %	0 %	25 %	0 %	480533974
30	NC_021026	GAAA	2	8	9344	9351	75 %	0 %	25 %	0 %	480533978
31	NC_021026	TATT	2	8	9380	9387	25 %	75 %	0 %	0 %	480533978
32	NC_021026	TAAA	2	8	9511	9518	75 %	25 %	0 %	0 %	480533978
33	NC_021026	ATCA	2	8	9586	9593	50 %	25 %	0 %	25 %	480533978
34	NC_021026	GAAG	2	8	9729	9736	50 %	0 %	50 %	0 %	480533978
35	NC_021026	TTCT	2	8	9848	9855	0 %	75 %	0 %	25 %	480533978
36	NC_021026	ATCA	2	8	9897	9904	50 %	25 %	0 %	25 %	480533978
37	NC_021026	CAGC	2	8	9922	9929	25 %	0 %	25 %	50 %	480533978
38	NC_021026	TTCT	2	8	10444	10451	0 %	75 %	0 %	25 %	480533978
39	NC_021026	CTAT	2	8	10936	10943	25 %	50 %	0 %	25 %	480533979
40	NC_021026	CTTA	2	8	11091	11098	25 %	50 %	0 %	25 %	480533979
41	NC_021026	ATTT	2	8	11490	11497	25 %	75 %	0 %	0 %	480533979
42	NC_021026	AATT	2	8	11523	11530	50 %	50 %	0 %	0 %	480533979
43	NC_021026	TTTA	2	8	11629	11636	25 %	75 %	0 %	0 %	480533979
44	NC_021026	AAAG	2	8	12146	12153	75 %	0 %	25 %	0 %	480533980
45	NC_021026	AGAA	2	8	12342	12349	75 %	0 %	25 %	0 %	480533980
46	NC_021026	TTAA	2	8	12380	12387	50 %	50 %	0 %	0 %	480533981
47	NC_021026	ACCA	2	8	12537	12544	50 %	0 %	0 %	50 %	480533981
48	NC_021026	TGCT	2	8	13062	13069	0 %	50 %	25 %	25 %	480533981
49	NC_021026	GATG	2	8	13306	13313	25 %	25 %	50 %	0 %	480533981
50	NC_021026	TTGG	2	8	13415	13422	0 %	50 %	50 %	0 %	480533981
51	NC_021026	TGAA	2	8	13557	13564	50 %	25 %	25 %	0 %	480533981
52	NC_021026	AAGA	2	8	13655	13662	75 %	0 %	25 %	0 %	480533981
53	NC_021026	TCTA	2	8	13831	13838	25 %	50 %	0 %	25 %	480533981
54	NC_021026	TGGC	2	8	13860	13867	0 %	25 %	50 %	25 %	480533981
55	NC_021026	AACA	2	8	14064	14071	75 %	0 %	0 %	25 %	480533981
56	NC_021026	GTTC	2	8	14093	14100	0 %	50 %	25 %	25 %	480533981
57	NC_021026	ATGA	2	8	14300	14307	50 %	25 %	25 %	0 %	480533981
58	NC_021026	GAGG	2	8	14730	14737	25 %	0 %	75 %	0 %	480533982
59	NC_021026	AAAC	2	8	14789	14796	75 %	0 %	0 %	25 %	480533982
60	NC_021026	GCTT	2	8	15415	15422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021026	CCTG	2	8	15463	15470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021026	GTGA	2	8	15743	15750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021026	AGCG	2	8	15914	15921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021026	AGCC	2	8	16795	16802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021026	GTAA	2	8	17217	17224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021026	GCGA	2	8	17373	17380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021026	ATTC	2	8	18239	18246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021026	CTAA	2	8	18593	18600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021026	GTCT	2	8	18618	18625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021026	TAGG	2	8	19249	19256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021026	CTTT	2	8	20764	20771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021026	ATGT	2	8	22200	22207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021026	GATA	2	8	22841	22848	50 %	25 %	25 %	0 %	480533984
74	NC_021026	CAAG	2	8	23005	23012	50 %	0 %	25 %	25 %	480533984
75	NC_021026	GGTT	2	8	23160	23167	0 %	50 %	50 %	0 %	480533984
76	NC_021026	CTTT	2	8	23217	23224	0 %	75 %	0 %	25 %	480533984
77	NC_021026	CTAT	2	8	23344	23351	25 %	50 %	0 %	25 %	480533984
78	NC_021026	TTGG	2	8	23448	23455	0 %	50 %	50 %	0 %	480533984
79	NC_021026	AACA	2	8	23494	23501	75 %	0 %	0 %	25 %	480533984
80	NC_021026	TTCA	2	8	23965	23972	25 %	50 %	0 %	25 %	480533985
81	NC_021026	GATA	2	8	25415	25422	50 %	25 %	25 %	0 %	480533986
82	NC_021026	AATC	2	8	25557	25564	50 %	25 %	0 %	25 %	480533986
83	NC_021026	GATT	2	8	25901	25908	25 %	50 %	25 %	0 %	480533986
84	NC_021026	AACA	2	8	25964	25971	75 %	0 %	0 %	25 %	480533986
85	NC_021026	AGCC	2	8	27613	27620	25 %	0 %	25 %	50 %	480533991
86	NC_021026	TTGA	2	8	27721	27728	25 %	50 %	25 %	0 %	480533992
87	NC_021026	ATGA	2	8	28104	28111	50 %	25 %	25 %	0 %	480533993
88	NC_021026	AATC	2	8	28139	28146	50 %	25 %	0 %	25 %	480533993
89	NC_021026	AAAT	2	8	28247	28254	75 %	25 %	0 %	0 %	480533993
90	NC_021026	TTTG	2	8	28304	28311	0 %	75 %	25 %	0 %	480533994
91	NC_021026	TCAT	2	8	28387	28394	25 %	50 %	0 %	25 %	480533994
92	NC_021026	TATC	2	8	28511	28518	25 %	50 %	0 %	25 %	480533994
93	NC_021026	GATT	2	8	29299	29306	25 %	50 %	25 %	0 %	480533995
94	NC_021026	GATG	2	8	29570	29577	25 %	25 %	50 %	0 %	480533996
95	NC_021026	TTGA	2	8	30151	30158	25 %	50 %	25 %	0 %	480533998
96	NC_021026	GGAA	2	8	30195	30202	50 %	0 %	50 %	0 %	480533998
97	NC_021026	AGGC	2	8	30363	30370	25 %	0 %	50 %	25 %	480533998
98	NC_021026	TGAT	2	8	30492	30499	25 %	50 %	25 %	0 %	480533999
99	NC_021026	ACGG	2	8	30854	30861	25 %	0 %	50 %	25 %	480533999
100	NC_021026	AAGA	2	8	31196	31203	75 %	0 %	25 %	0 %	480533999
101	NC_021026	ACCA	2	8	31304	31311	50 %	0 %	0 %	50 %	480534000
102	NC_021026	TGAA	2	8	31549	31556	50 %	25 %	25 %	0 %	480534001
103	NC_021026	AGCT	2	8	31681	31688	25 %	25 %	25 %	25 %	480534001
104	NC_021026	ACAA	2	8	32121	32128	75 %	0 %	0 %	25 %	480534001
105	NC_021026	GTTG	2	8	33620	33627	0 %	50 %	50 %	0 %	480534005
106	NC_021026	TGAT	2	8	33830	33837	25 %	50 %	25 %	0 %	480534006
107	NC_021026	AACA	2	8	33869	33876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021026	AAGA	2	8	34790	34797	75 %	0 %	25 %	0 %	480534008
109	NC_021026	GAGC	2	8	34880	34887	25 %	0 %	50 %	25 %	480534008
110	NC_021026	AGCA	2	8	35061	35068	50 %	0 %	25 %	25 %	480534008
111	NC_021026	AATC	2	8	35729	35736	50 %	25 %	0 %	25 %	480534009
112	NC_021026	CAAA	2	8	35887	35894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021026	GATG	2	8	36448	36455	25 %	25 %	50 %	0 %	480534011
114	NC_021026	TATC	2	8	36531	36538	25 %	50 %	0 %	25 %	480534011
115	NC_021026	TGCT	2	8	36648	36655	0 %	50 %	25 %	25 %	480534011
116	NC_021026	CAAG	2	8	36757	36764	50 %	0 %	25 %	25 %	480534011
117	NC_021026	TTCT	2	8	36880	36887	0 %	75 %	0 %	25 %	480534011
118	NC_021026	AATC	2	8	37157	37164	50 %	25 %	0 %	25 %	480534011
119	NC_021026	ATGA	2	8	37277	37284	50 %	25 %	25 %	0 %	480534011
120	NC_021026	GGTT	2	8	37610	37617	0 %	50 %	50 %	0 %	480534011
121	NC_021026	ATGA	2	8	38061	38068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021026	GTCA	2	8	38217	38224	25 %	25 %	25 %	25 %	480534012
123	NC_021026	ACTT	2	8	39237	39244	25 %	50 %	0 %	25 %	480534013
124	NC_021026	TTTA	2	8	39665	39672	25 %	75 %	0 %	0 %	480534014
125	NC_021026	AAGA	2	8	40026	40033	75 %	0 %	25 %	0 %	480534014
126	NC_021026	TTAC	2	8	40390	40397	25 %	50 %	0 %	25 %	480534015
127	NC_021026	AACC	2	8	40623	40630	50 %	0 %	0 %	50 %	480534015
128	NC_021026	AAAC	2	8	40733	40740	75 %	0 %	0 %	25 %	480534015
129	NC_021026	ATCT	2	8	41379	41386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021026	CAGG	2	8	41914	41921	25 %	0 %	50 %	25 %	480534018
131	NC_021026	GCAA	2	8	41993	42000	50 %	0 %	25 %	25 %	480534018
132	NC_021026	ACCT	2	8	42498	42505	25 %	25 %	0 %	50 %	480534020
133	NC_021026	TCTA	2	8	42723	42730	25 %	50 %	0 %	25 %	480534020
134	NC_021026	CAAC	2	8	43181	43188	50 %	0 %	0 %	50 %	480534021
135	NC_021026	TGGT	2	8	43354	43361	0 %	50 %	50 %	0 %	480534022
136	NC_021026	ATCA	2	8	43462	43469	50 %	25 %	0 %	25 %	480534022
137	NC_021026	ATGA	2	8	43473	43480	50 %	25 %	25 %	0 %	480534022
138	NC_021026	TTGC	2	8	44473	44480	0 %	50 %	25 %	25 %	480534023
139	NC_021026	CTAA	2	8	44641	44648	50 %	25 %	0 %	25 %	480534023
140	NC_021026	TTCA	2	8	44841	44848	25 %	50 %	0 %	25 %	480534023
141	NC_021026	GTAA	2	8	44938	44945	50 %	25 %	25 %	0 %	480534023
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143	NC_021026	AAAT	2	8	45579	45586	75 %	25 %	0 %	0 %	480534023
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