MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 41242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021026	TGT	2	6	193074	193079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534149
4002	NC_021026	TTC	2	6	193082	193087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534149
4003	NC_021026	ATC	2	6	193102	193107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534149
4004	NC_021026	TCA	2	6	193113	193118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534149
4005	NC_021026	CAT	2	6	193125	193130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534149
4006	NC_021026	ATT	2	6	193136	193141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534149
4007	NC_021026	TAA	2	6	193180	193185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534149
4008	NC_021026	TG	3	6	193201	193206	0 %	50 %	50 %	0 %	480534149
4009	NC_021026	TTTC	2	8	193211	193218	0 %	75 %	0 %	25 %	480534149
4010	NC_021026	ACC	2	6	193225	193230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534149
4011	NC_021026	T	7	7	193231	193237	0 %	100 %	0 %	0 %	480534149
4012	NC_021026	AC	3	6	193298	193303	50 %	0 %	0 %	50 %	480534149
4013	NC_021026	TGT	2	6	193504	193509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534149
4014	NC_021026	GCT	2	6	193511	193516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534149
4015	NC_021026	GTC	2	6	193558	193563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534149
4016	NC_021026	AACAAG	2	12	193567	193578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480534149
4017	NC_021026	CTT	2	6	193605	193610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534149
4018	NC_021026	ATA	2	6	193666	193671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534150
4019	NC_021026	GTTT	2	8	193785	193792	0 %	75 %	25 %	0 %	480534150
4020	NC_021026	TG	3	6	193911	193916	0 %	50 %	50 %	0 %	480534150
4021	NC_021026	TTGAT	2	10	193917	193926	20 %	60 %	20 %	0 %	480534150
4022	NC_021026	ATC	2	6	193940	193945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534150
4023	NC_021026	T	7	7	193946	193952	0 %	100 %	0 %	0 %	480534150
4024	NC_021026	ACG	2	6	193992	193997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534150
4025	NC_021026	TCAT	2	8	194091	194098	25 %	50 %	0 %	25 %	480534150
4026	NC_021026	TGA	2	6	194118	194123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534150
4027	NC_021026	ATT	2	6	194268	194273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534150
4028	NC_021026	TCACT	2	10	194292	194301	20 %	40 %	0 %	40 %	480534151
4029	NC_021026	AT	4	8	194429	194436	50 %	50 %	0 %	0 %	480534151
4030	NC_021026	TCA	2	6	194444	194449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534151
4031	NC_021026	TGT	2	6	194456	194461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534151
4032	NC_021026	C	6	6	194489	194494	0 %	0 %	0 %	100 %	480534151
4033	NC_021026	T	6	6	194566	194571	0 %	100 %	0 %	0 %	480534151
4034	NC_021026	ATTTT	2	10	194615	194624	20 %	80 %	0 %	0 %	480534151
4035	NC_021026	TCC	2	6	194741	194746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534151
4036	NC_021026	CCA	2	6	194793	194798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534151
4037	NC_021026	CTT	3	9	194844	194852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534151
4038	NC_021026	GATT	2	8	194867	194874	25 %	50 %	25 %	0 %	480534151
4039	NC_021026	TCCA	2	8	194893	194900	25 %	25 %	0 %	50 %	480534151
4040	NC_021026	TTAAG	2	10	194967	194976	40 %	40 %	20 %	0 %	480534151
4041	NC_021026	ATT	2	6	195013	195018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534151
4042	NC_021026	ACT	2	6	195080	195085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534151
4043	NC_021026	ACA	2	6	195142	195147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534151
4044	NC_021026	TC	3	6	195211	195216	0 %	50 %	0 %	50 %	480534151
4045	NC_021026	CCA	2	6	195227	195232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534151
4046	NC_021026	A	6	6	195232	195237	100 %	0 %	0 %	0 %	480534151
4047	NC_021026	AAT	2	6	195277	195282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534151
4048	NC_021026	GGATTG	2	12	195296	195307	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480534151
4049	NC_021026	AT	3	6	195350	195355	50 %	50 %	0 %	0 %	480534151
4050	NC_021026	A	7	7	195382	195388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021026	ACT	2	6	195406	195411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_021026	TCT	2	6	195508	195513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_021026	ACC	2	6	195579	195584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_021026	CCCTG	2	10	195599	195608	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4055	NC_021026	GAT	2	6	195629	195634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021026	CTC	2	6	195715	195720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_021026	AG	3	6	195758	195763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021026	TCAGG	2	10	195882	195891	20 %	20 %	40 %	20 %	480534152
4059	NC_021026	AGG	2	6	195898	195903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534152
4060	NC_021026	TAT	2	6	196034	196039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534152
4061	NC_021026	GCT	2	6	196041	196046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534152
4062	NC_021026	CAG	2	6	196134	196139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534152
4063	NC_021026	GTA	2	6	196164	196169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534152
4064	NC_021026	GCAA	2	8	196205	196212	50 %	0 %	25 %	25 %	480534152
4065	NC_021026	GAA	2	6	196233	196238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534152
4066	NC_021026	GTT	2	6	196387	196392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534153
4067	NC_021026	ATG	2	6	196432	196437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534153
4068	NC_021026	ATG	2	6	196459	196464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534153
4069	NC_021026	GTT	2	6	196481	196486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534153
4070	NC_021026	CAGG	2	8	196503	196510	25 %	0 %	50 %	25 %	480534153
4071	NC_021026	CAA	2	6	196532	196537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534153
4072	NC_021026	TGAC	2	8	196594	196601	25 %	25 %	25 %	25 %	480534153
4073	NC_021026	TTG	2	6	196738	196743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534153
4074	NC_021026	A	6	6	196830	196835	100 %	0 %	0 %	0 %	480534153
4075	NC_021026	TGA	2	6	196898	196903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534153
4076	NC_021026	ATG	2	6	196937	196942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534153
4077	NC_021026	CTT	2	6	197022	197027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534154
4078	NC_021026	CTT	2	6	197086	197091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534154
4079	NC_021026	CAA	2	6	197111	197116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534154
4080	NC_021026	TTC	2	6	197147	197152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534154
4081	NC_021026	TGA	2	6	197187	197192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534154
4082	NC_021026	TGT	2	6	197194	197199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534154
4083	NC_021026	AAC	2	6	197289	197294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534154
4084	NC_021026	ACT	2	6	197296	197301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534154
4085	NC_021026	AGA	2	6	197338	197343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534154
4086	NC_021026	ATT	2	6	197344	197349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534154
4087	NC_021026	ATT	2	6	197405	197410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534154
4088	NC_021026	GCCTT	2	10	197496	197505	0 %	40 %	20 %	40 %	480534154
4089	NC_021026	TAT	2	6	197509	197514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534154
4090	NC_021026	GAAA	2	8	197521	197528	75 %	0 %	25 %	0 %	480534154
4091	NC_021026	CTA	2	6	197539	197544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534154
4092	NC_021026	TGA	2	6	197714	197719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021026	TAA	2	6	197729	197734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021026	A	6	6	197742	197747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_021026	GTC	2	6	197925	197930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534155
4096	NC_021026	TGA	2	6	197972	197977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534155
4097	NC_021026	TCT	2	6	198025	198030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534155
4098	NC_021026	TTC	2	6	198042	198047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534155
4099	NC_021026	TTCCC	2	10	198070	198079	0 %	40 %	0 %	60 %	480534155
4100	NC_021026	ACC	2	6	198177	198182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534155
4101	NC_021026	CAA	2	6	198216	198221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534155
4102	NC_021026	TGAC	2	8	198241	198248	25 %	25 %	25 %	25 %	480534155
4103	NC_021026	GTTC	2	8	198283	198290	0 %	50 %	25 %	25 %	480534155
4104	NC_021026	TTC	2	6	198326	198331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534155
4105	NC_021026	AGT	2	6	198353	198358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534155
4106	NC_021026	GGT	2	6	198455	198460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534155
4107	NC_021026	T	6	6	198491	198496	0 %	100 %	0 %	0 %	480534155
4108	NC_021026	ATC	2	6	198594	198599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534155
4109	NC_021026	TAG	2	6	198788	198793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534155
4110	NC_021026	TCC	2	6	198807	198812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_021026	AGA	2	6	198871	198876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021026	AGCT	2	8	198959	198966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_021026	A	6	6	199004	199009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021026	TGCACT	2	12	199079	199090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480534156
4115	NC_021026	AGG	2	6	199131	199136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534156
4116	NC_021026	GCT	2	6	199137	199142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534156
4117	NC_021026	AAT	2	6	199145	199150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534156
4118	NC_021026	TTG	2	6	199201	199206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534156
4119	NC_021026	AGA	2	6	199210	199215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534156
4120	NC_021026	AGT	2	6	199318	199323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534156
4121	NC_021026	CCA	2	6	199344	199349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534156
4122	NC_021026	AGA	2	6	199365	199370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534156
4123	NC_021026	AATC	2	8	199373	199380	50 %	25 %	0 %	25 %	480534156
4124	NC_021026	AAG	2	6	199407	199412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534156
4125	NC_021026	TGA	2	6	199447	199452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534156
4126	NC_021026	ATC	2	6	199470	199475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534156
4127	NC_021026	ATC	2	6	199484	199489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534156
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4129	NC_021026	TGA	2	6	199663	199668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534156
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4132	NC_021026	T	6	6	199759	199764	0 %	100 %	0 %	0 %	480534157
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4141	NC_021026	TGA	2	6	200412	200417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534157
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4149	NC_021026	TAT	2	6	200738	200743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_021026	T	7	7	200780	200786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4153	NC_021026	TCAT	2	8	200842	200849	25 %	50 %	0 %	25 %	480534158
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4156	NC_021026	CT	3	6	200959	200964	0 %	50 %	0 %	50 %	480534158
4157	NC_021026	AG	3	6	200990	200995	50 %	0 %	50 %	0 %	480534158
4158	NC_021026	CTCG	2	8	201109	201116	0 %	25 %	25 %	50 %	480534158
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4222	NC_021026	A	6	6	204744	204749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_021026	A	8	8	204753	204760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4225	NC_021026	GGTA	2	8	204834	204841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4226	NC_021026	A	6	6	204882	204887	100 %	0 %	0 %	0 %	480534160
4227	NC_021026	AGTTA	2	10	204913	204922	40 %	40 %	20 %	0 %	480534160
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4231	NC_021026	GAAA	2	8	205300	205307	75 %	0 %	25 %	0 %	480534161
4232	NC_021026	A	7	7	205310	205316	100 %	0 %	0 %	0 %	480534161
4233	NC_021026	TGGT	2	8	205350	205357	0 %	50 %	50 %	0 %	480534161
4234	NC_021026	A	6	6	205367	205372	100 %	0 %	0 %	0 %	480534161
4235	NC_021026	GAA	2	6	205444	205449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534161
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4238	NC_021026	T	6	6	205534	205539	0 %	100 %	0 %	0 %	480534161
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4240	NC_021026	TGA	2	6	205573	205578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534161
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4243	NC_021026	GGA	2	6	205639	205644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534161
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4247	NC_021026	CAGA	2	8	205842	205849	50 %	0 %	25 %	25 %	480534161
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4249	NC_021026	GAA	2	6	205975	205980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534162
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4373	NC_021026	CTT	2	6	211981	211986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534168
4374	NC_021026	GTC	2	6	211995	212000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534168
4375	NC_021026	AGA	2	6	212064	212069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534168
4376	NC_021026	TTC	2	6	212106	212111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534168
4377	NC_021026	T	6	6	212165	212170	0 %	100 %	0 %	0 %	480534168
4378	NC_021026	CTAT	2	8	212257	212264	25 %	50 %	0 %	25 %	480534168
4379	NC_021026	GAT	2	6	212271	212276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534168
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4381	NC_021026	GAAA	2	8	212384	212391	75 %	0 %	25 %	0 %	480534168
4382	NC_021026	AAC	2	6	212392	212397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534168
4383	NC_021026	GTCTG	2	10	212430	212439	0 %	40 %	40 %	20 %	480534168
4384	NC_021026	CAA	2	6	212469	212474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534168
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4386	NC_021026	GCAT	2	8	212631	212638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4387	NC_021026	AGA	2	6	212650	212655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534169
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4394	NC_021026	GCTG	2	8	212914	212921	0 %	25 %	50 %	25 %	480534169
4395	NC_021026	CAA	2	6	213004	213009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534169
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4454	NC_021026	CCTTG	2	10	216400	216409	0 %	40 %	20 %	40 %	480534173
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4459	NC_021026	ACTTA	2	10	216740	216749	40 %	40 %	0 %	20 %	480534173
4460	NC_021026	AGA	2	6	216755	216760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4461	NC_021026	AGA	2	6	216766	216771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4462	NC_021026	GAA	2	6	216788	216793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4463	NC_021026	A	7	7	216818	216824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4464	NC_021026	A	6	6	216827	216832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4465	NC_021026	TAT	2	6	216874	216879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4466	NC_021026	TAT	2	6	216979	216984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4467	NC_021026	CAAA	2	8	217015	217022	75 %	0 %	0 %	25 %	480534174
4468	NC_021026	A	7	7	217020	217026	100 %	0 %	0 %	0 %	480534174
4469	NC_021026	AC	3	6	217215	217220	50 %	0 %	0 %	50 %	480534174
4470	NC_021026	A	6	6	217252	217257	100 %	0 %	0 %	0 %	480534174
4471	NC_021026	TGA	2	6	217270	217275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534174
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4474	NC_021026	A	6	6	217507	217512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4475	NC_021026	A	6	6	217557	217562	100 %	0 %	0 %	0 %	480534175
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4482	NC_021026	GTG	2	6	218023	218028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534175
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4489	NC_021026	ATC	2	6	218295	218300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534176
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4492	NC_021026	CAC	2	6	218425	218430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534176
4493	NC_021026	GTG	4	12	218437	218448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534176
4494	NC_021026	TCG	2	6	218501	218506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534176
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4497	NC_021026	GAA	2	6	218655	218660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534176
4498	NC_021026	CTT	2	6	218760	218765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534176
4499	NC_021026	CA	3	6	218768	218773	50 %	0 %	0 %	50 %	480534176
4500	NC_021026	AGC	2	6	218774	218779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534176

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