MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 41242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021026	AAAT	2	8	145800	145807	75 %	25 %	0 %	0 %	480534108
3003	NC_021026	AAT	2	6	145824	145829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534108
3004	NC_021026	AAG	2	6	145846	145851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534108
3005	NC_021026	GAT	2	6	145853	145858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534108
3006	NC_021026	ATG	2	6	145924	145929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534108
3007	NC_021026	GGA	2	6	145938	145943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534108
3008	NC_021026	GCG	2	6	145985	145990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534108
3009	NC_021026	AGC	2	6	146012	146017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534108
3010	NC_021026	ACA	2	6	146118	146123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534108
3011	NC_021026	CAA	2	6	146132	146137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534108
3012	NC_021026	GA	3	6	146150	146155	50 %	0 %	50 %	0 %	480534108
3013	NC_021026	A	6	6	146203	146208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021026	TTA	2	6	146215	146220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021026	T	8	8	146221	146228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021026	ATC	2	6	146243	146248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021026	T	6	6	146255	146260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021026	GAA	2	6	146280	146285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021026	A	6	6	146288	146293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021026	ATT	2	6	146298	146303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021026	T	7	7	146317	146323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021026	T	7	7	146407	146413	0 %	100 %	0 %	0 %	480534109
3023	NC_021026	T	7	7	146522	146528	0 %	100 %	0 %	0 %	480534109
3024	NC_021026	AAGA	2	8	146586	146593	75 %	0 %	25 %	0 %	480534109
3025	NC_021026	TTA	2	6	146599	146604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534109
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3028	NC_021026	TGA	2	6	146693	146698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534109
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3030	NC_021026	TATT	2	8	146752	146759	25 %	75 %	0 %	0 %	480534109
3031	NC_021026	ATC	2	6	146778	146783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534109
3032	NC_021026	TAC	2	6	146789	146794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534109
3033	NC_021026	ATCA	2	8	146820	146827	50 %	25 %	0 %	25 %	480534109
3034	NC_021026	TAA	2	6	146837	146842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534109
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3036	NC_021026	ATG	2	6	146974	146979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534109
3037	NC_021026	A	7	7	147033	147039	100 %	0 %	0 %	0 %	480534109
3038	NC_021026	CTG	2	6	147087	147092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534109
3039	NC_021026	TAACAA	2	12	147110	147121	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	480534109
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3041	NC_021026	AATC	2	8	147164	147171	50 %	25 %	0 %	25 %	480534109
3042	NC_021026	T	6	6	147179	147184	0 %	100 %	0 %	0 %	480534109
3043	NC_021026	TAT	2	6	147186	147191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534109
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3047	NC_021026	AGG	2	6	147331	147336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021026	TGT	2	6	147372	147377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534110
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3053	NC_021026	A	6	6	147511	147516	100 %	0 %	0 %	0 %	480534110
3054	NC_021026	TAA	2	6	147518	147523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534110
3055	NC_021026	GCA	3	9	147565	147573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534110
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3059	NC_021026	TA	3	6	147747	147752	50 %	50 %	0 %	0 %	480534111
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3061	NC_021026	T	7	7	147802	147808	0 %	100 %	0 %	0 %	480534111
3062	NC_021026	TATC	2	8	147865	147872	25 %	50 %	0 %	25 %	480534111
3063	NC_021026	TAA	2	6	147961	147966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534111
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3066	NC_021026	TCA	2	6	148219	148224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534111
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3072	NC_021026	CAAAG	2	10	148385	148394	60 %	0 %	20 %	20 %	480534111
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3075	NC_021026	TAA	2	6	148554	148559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_021026	ATTT	2	8	148699	148706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021026	AT	4	8	148735	148742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3083	NC_021026	AT	4	8	148988	148995	50 %	50 %	0 %	0 %	480534112
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3089	NC_021026	TTCTA	2	10	149446	149455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3092	NC_021026	ATAAAA	2	12	149531	149542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	480534114
3093	NC_021026	GAAA	2	8	149649	149656	75 %	0 %	25 %	0 %	480534114
3094	NC_021026	T	6	6	149697	149702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021026	GTT	2	6	149703	149708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021026	A	6	6	149719	149724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021026	CT	3	6	149729	149734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_021026	GAAG	2	8	149759	149766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021026	ATG	2	6	149767	149772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_021026	TAA	2	6	149854	149859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021026	G	6	6	149893	149898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021026	A	6	6	149937	149942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021026	A	7	7	149975	149981	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3105	NC_021026	TTG	2	6	150027	150032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534115
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3107	NC_021026	AGA	2	6	150096	150101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
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3110	NC_021026	AAG	2	6	150137	150142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
3111	NC_021026	ACG	2	6	150147	150152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534115
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3113	NC_021026	A	6	6	150182	150187	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3114	NC_021026	AGA	2	6	150201	150206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
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3117	NC_021026	GCT	2	6	150239	150244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534115
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3119	NC_021026	A	6	6	150347	150352	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3120	NC_021026	AGCAGA	2	12	150355	150366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480534115
3121	NC_021026	A	7	7	150368	150374	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3122	NC_021026	GAG	2	6	150380	150385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534115
3123	NC_021026	ACTAA	2	10	150389	150398	60 %	20 %	0 %	20 %	480534115
3124	NC_021026	AAC	2	6	150430	150435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534115
3125	NC_021026	A	6	6	150476	150481	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3126	NC_021026	AGA	2	6	150484	150489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
3127	NC_021026	AGA	2	6	150499	150504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
3128	NC_021026	GAA	2	6	150556	150561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
3129	NC_021026	TTGAAA	2	12	150582	150593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480534115
3130	NC_021026	AAG	2	6	150624	150629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
3131	NC_021026	A	6	6	150662	150667	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3132	NC_021026	CTT	2	6	150668	150673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534115
3133	NC_021026	TGA	2	6	150688	150693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534115
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3135	NC_021026	A	7	7	150763	150769	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3136	NC_021026	CTT	2	6	150788	150793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534115
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3143	NC_021026	A	7	7	151006	151012	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3144	NC_021026	CTT	2	6	151031	151036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534115
3145	NC_021026	GCT	2	6	151085	151090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534115
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3147	NC_021026	GAT	2	6	151196	151201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534115
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3149	NC_021026	CTA	2	6	151227	151232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
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3151	NC_021026	A	6	6	151248	151253	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
3152	NC_021026	GAA	3	9	151304	151312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
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3157	NC_021026	TAC	2	6	151760	151765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
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3160	NC_021026	TAC	2	6	152003	152008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
3161	NC_021026	TAC	2	6	152063	152068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
3162	NC_021026	AAGC	2	8	152151	152158	50 %	0 %	25 %	25 %	480534115
3163	NC_021026	ATTAA	2	10	152274	152283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_021026	A	7	7	152397	152403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_021026	GTT	2	6	152447	152452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_021026	TTAT	2	8	152453	152460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_021026	TGAA	2	8	152471	152478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_021026	AAG	3	9	152482	152490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3169	NC_021026	CAT	2	6	152500	152505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_021026	TCT	2	6	152564	152569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3172	NC_021026	CA	3	6	152622	152627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3173	NC_021026	GTG	3	9	152710	152718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534116
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3189	NC_021026	AAT	2	6	153818	153823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3190	NC_021026	ATG	2	6	153837	153842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3191	NC_021026	T	6	6	153868	153873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3192	NC_021026	CTT	2	6	153882	153887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3193	NC_021026	CAA	2	6	153938	153943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534117
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3200	NC_021026	ACTT	2	8	154221	154228	25 %	50 %	0 %	25 %	480534117
3201	NC_021026	GA	3	6	154388	154393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3202	NC_021026	GAA	2	6	154415	154420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534118
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3206	NC_021026	TGG	2	6	154788	154793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534118
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3220	NC_021026	TGA	2	6	155640	155645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534118
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3230	NC_021026	CAG	2	6	156231	156236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534118
3231	NC_021026	GTA	2	6	156276	156281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534118
3232	NC_021026	CGT	2	6	156313	156318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3233	NC_021026	CTT	2	6	156322	156327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3234	NC_021026	AAAG	2	8	156455	156462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_021026	TTG	2	6	156497	156502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_021026	AT	3	6	156604	156609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_021026	TAT	2	6	156642	156647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534119
3238	NC_021026	ATC	2	6	156666	156671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534119
3239	NC_021026	GAT	3	9	156674	156682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534119
3240	NC_021026	CT	3	6	156833	156838	0 %	50 %	0 %	50 %	480534119
3241	NC_021026	ATC	2	6	156882	156887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534119
3242	NC_021026	AGAT	2	8	156935	156942	50 %	25 %	25 %	0 %	480534119
3243	NC_021026	CGA	2	6	156945	156950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534119
3244	NC_021026	CAG	2	6	157042	157047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534119
3245	NC_021026	ACC	2	6	157211	157216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534119
3246	NC_021026	ATG	2	6	157278	157283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534119
3247	NC_021026	TTG	2	6	157293	157298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534119
3248	NC_021026	TAG	2	6	157303	157308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534119
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