MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 41242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021026	ATAA	2	8	123094	123101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021026	A	6	6	123100	123105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_021026	TTACT	2	10	123164	123173	20 %	60 %	0 %	20 %	480534086
2504	NC_021026	TGC	2	6	123208	123213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534086
2505	NC_021026	AATC	2	8	123234	123241	50 %	25 %	0 %	25 %	480534086
2506	NC_021026	AAC	2	6	123307	123312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534086
2507	NC_021026	GAA	2	6	123353	123358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534086
2508	NC_021026	GAA	2	6	123377	123382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534086
2509	NC_021026	AAG	2	6	123398	123403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534086
2510	NC_021026	TGTT	2	8	123405	123412	0 %	75 %	25 %	0 %	480534086
2511	NC_021026	AAGA	2	8	123419	123426	75 %	0 %	25 %	0 %	480534086
2512	NC_021026	ACA	2	6	123485	123490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534086
2513	NC_021026	CTT	2	6	123527	123532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534086
2514	NC_021026	AC	3	6	123555	123560	50 %	0 %	0 %	50 %	480534086
2515	NC_021026	ACA	2	6	123651	123656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534086
2516	NC_021026	GGA	2	6	123770	123775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534086
2517	NC_021026	TGGGA	2	10	123818	123827	20 %	20 %	60 %	0 %	480534086
2518	NC_021026	CGT	2	6	123956	123961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534086
2519	NC_021026	AGA	2	6	123973	123978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534086
2520	NC_021026	A	6	6	124048	124053	100 %	0 %	0 %	0 %	480534086
2521	NC_021026	AGCT	2	8	124214	124221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_021026	GCT	2	6	124226	124231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_021026	AT	3	6	124279	124284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_021026	GTTT	2	8	124337	124344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_021026	TGTA	2	8	124373	124380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_021026	T	6	6	124416	124421	0 %	100 %	0 %	0 %	480534087
2527	NC_021026	ATG	2	6	124513	124518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534087
2528	NC_021026	AT	3	6	124553	124558	50 %	50 %	0 %	0 %	480534087
2529	NC_021026	CTA	2	6	124647	124652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534087
2530	NC_021026	AGAC	2	8	124657	124664	50 %	0 %	25 %	25 %	480534087
2531	NC_021026	TGCTT	2	10	124691	124700	0 %	60 %	20 %	20 %	480534087
2532	NC_021026	TTTTGA	2	12	124736	124747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480534087
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2534	NC_021026	TGGCT	2	10	124874	124883	0 %	40 %	40 %	20 %	480534087
2535	NC_021026	GTGC	2	8	124899	124906	0 %	25 %	50 %	25 %	480534087
2536	NC_021026	GA	3	6	125015	125020	50 %	0 %	50 %	0 %	480534087
2537	NC_021026	TGG	2	6	125053	125058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534087
2538	NC_021026	AGA	2	6	125117	125122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534087
2539	NC_021026	ACC	2	6	125185	125190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534087
2540	NC_021026	AAG	2	6	125254	125259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534087
2541	NC_021026	AAGCAG	2	12	125264	125275	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480534087
2542	NC_021026	T	6	6	125290	125295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_021026	A	6	6	125303	125308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021026	AAAG	2	8	125443	125450	75 %	0 %	25 %	0 %	480534088
2545	NC_021026	AGA	2	6	125497	125502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534088
2546	NC_021026	GGA	2	6	125503	125508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534088
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2548	NC_021026	CTTG	2	8	125565	125572	0 %	50 %	25 %	25 %	480534088
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2550	NC_021026	AG	3	6	125635	125640	50 %	0 %	50 %	0 %	480534088
2551	NC_021026	AAAG	2	8	125660	125667	75 %	0 %	25 %	0 %	480534088
2552	NC_021026	TTG	2	6	125723	125728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534088
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2554	NC_021026	AGA	3	9	125806	125814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534088
2555	NC_021026	CTA	2	6	125824	125829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534088
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2558	NC_021026	AGCT	2	8	125861	125868	25 %	25 %	25 %	25 %	480534088
2559	NC_021026	TGCT	2	8	125890	125897	0 %	50 %	25 %	25 %	480534088
2560	NC_021026	GATA	2	8	125926	125933	50 %	25 %	25 %	0 %	480534088
2561	NC_021026	TG	4	8	125989	125996	0 %	50 %	50 %	0 %	480534088
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2563	NC_021026	AAG	2	6	126137	126142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534088
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2569	NC_021026	TCT	2	6	126312	126317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534088
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2572	NC_021026	T	7	7	126372	126378	0 %	100 %	0 %	0 %	480534088
2573	NC_021026	TTC	2	6	126407	126412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534088
2574	NC_021026	CTTG	2	8	126455	126462	0 %	50 %	25 %	25 %	480534088
2575	NC_021026	CCT	2	6	126513	126518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_021026	TTAG	2	8	126521	126528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_021026	TAG	2	6	126544	126549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2581	NC_021026	GAT	2	6	126772	126777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534089
2582	NC_021026	CAGT	2	8	126795	126802	25 %	25 %	25 %	25 %	480534089
2583	NC_021026	CTTC	2	8	126935	126942	0 %	50 %	0 %	50 %	480534089
2584	NC_021026	GGA	2	6	126948	126953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534089
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2591	NC_021026	GATG	2	8	127223	127230	25 %	25 %	50 %	0 %	480534089
2592	NC_021026	ATC	2	6	127249	127254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534089
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2595	NC_021026	AAG	2	6	127411	127416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534089
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2606	NC_021026	T	7	7	127867	127873	0 %	100 %	0 %	0 %	480534090
2607	NC_021026	CTT	2	6	127906	127911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534090
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2610	NC_021026	ATG	2	6	128083	128088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534091
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2615	NC_021026	T	6	6	128232	128237	0 %	100 %	0 %	0 %	480534091
2616	NC_021026	TCAA	2	8	128347	128354	50 %	25 %	0 %	25 %	480534091
2617	NC_021026	CCT	2	6	128385	128390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_021026	TA	4	8	128411	128418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_021026	ACAT	2	8	128429	128436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2620	NC_021026	AAAG	2	8	128447	128454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_021026	TA	4	8	128483	128490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_021026	A	6	6	128490	128495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_021026	TCA	2	6	128561	128566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534092
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2752	NC_021026	TGA	2	6	134874	134879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534097
2753	NC_021026	GAT	3	9	134882	134890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534097
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2755	NC_021026	TCC	2	6	134951	134956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534097
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2764	NC_021026	GGCTT	2	10	135396	135405	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2765	NC_021026	A	6	6	135467	135472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2766	NC_021026	A	6	6	135491	135496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2768	NC_021026	CAT	2	6	135658	135663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534098
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