MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 41242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021026	TGC	3	9	46020	46028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534023
1003	NC_021026	TGC	2	6	46032	46037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534023
1004	NC_021026	TTG	2	6	46040	46045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534023
1005	NC_021026	GTT	2	6	46180	46185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534023
1006	NC_021026	TGG	2	6	46189	46194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534023
1007	NC_021026	TCA	2	6	46256	46261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534023
1008	NC_021026	GCTG	2	8	46297	46304	0 %	25 %	50 %	25 %	480534023
1009	NC_021026	ACA	2	6	46327	46332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534023
1010	NC_021026	ATC	2	6	46342	46347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534023
1011	NC_021026	GTT	2	6	46354	46359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534023
1012	NC_021026	CAAT	2	8	46367	46374	50 %	25 %	0 %	25 %	480534023
1013	NC_021026	TTC	2	6	46689	46694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534023
1014	NC_021026	GAAT	2	8	46874	46881	50 %	25 %	25 %	0 %	480534023
1015	NC_021026	TAA	2	6	46884	46889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534023
1016	NC_021026	TGGT	2	8	46895	46902	0 %	50 %	50 %	0 %	480534023
1017	NC_021026	ACCA	2	8	46995	47002	50 %	0 %	0 %	50 %	480534023
1018	NC_021026	CATTAC	2	12	47007	47018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534023
1019	NC_021026	AGA	2	6	47034	47039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534023
1020	NC_021026	TGA	2	6	47061	47066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534023
1021	NC_021026	GAG	2	6	47114	47119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534023
1022	NC_021026	GA	3	6	47221	47226	50 %	0 %	50 %	0 %	480534024
1023	NC_021026	TGG	2	6	47249	47254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534024
1024	NC_021026	AACA	2	8	47280	47287	75 %	0 %	0 %	25 %	480534024
1025	NC_021026	GAA	2	6	47337	47342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534024
1026	NC_021026	AG	3	6	47390	47395	50 %	0 %	50 %	0 %	480534024
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1028	NC_021026	GAA	2	6	47451	47456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534024
1029	NC_021026	AAG	2	6	47543	47548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534024
1030	NC_021026	GGTCA	2	10	47640	47649	20 %	20 %	40 %	20 %	480534024
1031	NC_021026	AAT	2	6	47688	47693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534024
1032	NC_021026	ACA	3	9	47715	47723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534024
1033	NC_021026	GTT	2	6	47790	47795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534024
1034	NC_021026	GAAA	2	8	47930	47937	75 %	0 %	25 %	0 %	480534025
1035	NC_021026	AAG	2	6	48007	48012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534025
1036	NC_021026	GAT	2	6	48120	48125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534025
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1041	NC_021026	GTG	2	6	48394	48399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534025
1042	NC_021026	TTA	2	6	48403	48408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534025
1043	NC_021026	A	6	6	48443	48448	100 %	0 %	0 %	0 %	480534025
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1051	NC_021026	GAA	2	6	49029	49034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534025
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1053	NC_021026	ATCA	2	8	49059	49066	50 %	25 %	0 %	25 %	480534025
1054	NC_021026	GAAA	2	8	49097	49104	75 %	0 %	25 %	0 %	480534025
1055	NC_021026	AGT	2	6	49146	49151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534025
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1059	NC_021026	AAGC	2	8	49524	49531	50 %	0 %	25 %	25 %	480534025
1060	NC_021026	CAAG	2	8	49553	49560	50 %	0 %	25 %	25 %	480534025
1061	NC_021026	CTGG	2	8	49590	49597	0 %	25 %	50 %	25 %	480534025
1062	NC_021026	AAGC	2	8	49752	49759	50 %	0 %	25 %	25 %	480534025
1063	NC_021026	CAAG	2	8	49781	49788	50 %	0 %	25 %	25 %	480534025
1064	NC_021026	CTGG	2	8	49818	49825	0 %	25 %	50 %	25 %	480534025
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1093	NC_021026	A	6	6	51890	51895	100 %	0 %	0 %	0 %	480534025
1094	NC_021026	GGTA	2	8	51939	51946	25 %	25 %	50 %	0 %	480534025
1095	NC_021026	AT	3	6	51968	51973	50 %	50 %	0 %	0 %	480534025
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1097	NC_021026	A	6	6	51997	52002	100 %	0 %	0 %	0 %	480534025
1098	NC_021026	CAT	2	6	52024	52029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534025
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1101	NC_021026	GAG	2	6	52269	52274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534025
1102	NC_021026	CAG	2	6	52291	52296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534025
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1105	NC_021026	GCTA	2	8	52419	52426	25 %	25 %	25 %	25 %	480534025
1106	NC_021026	ACT	2	6	52473	52478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534025
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1109	NC_021026	ACAA	2	8	52638	52645	75 %	0 %	0 %	25 %	480534025
1110	NC_021026	CAAA	2	8	52693	52700	75 %	0 %	0 %	25 %	480534025
1111	NC_021026	ACT	2	6	52758	52763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534025
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1116	NC_021026	AACT	2	8	53383	53390	50 %	25 %	0 %	25 %	480534025
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1125	NC_021026	CTA	2	6	53707	53712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534025
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1127	NC_021026	AAC	2	6	53945	53950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534025
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1251	NC_021026	A	6	6	59466	59471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_021026	TCT	2	6	59547	59552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_021026	AGGTTG	2	12	59563	59574	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480534037
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1261	NC_021026	CAT	2	6	59978	59983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534037
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1281	NC_021026	GAA	2	6	61415	61420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_021026	CTA	2	6	61466	61471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1284	NC_021026	CT	3	6	61531	61536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1285	NC_021026	A	6	6	61578	61583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1286	NC_021026	AAG	2	6	61596	61601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1287	NC_021026	TC	3	6	61644	61649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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