MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 41242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021026	GAA	2	6	291262	291267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534248
6002	NC_021026	TGA	2	6	291311	291316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534248
6003	NC_021026	TGGA	2	8	291320	291327	25 %	25 %	50 %	0 %	480534248
6004	NC_021026	TTG	2	6	291355	291360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534248
6005	NC_021026	GGA	2	6	291432	291437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534248
6006	NC_021026	A	6	6	291598	291603	100 %	0 %	0 %	0 %	480534248
6007	NC_021026	AAAC	2	8	291610	291617	75 %	0 %	0 %	25 %	480534248
6008	NC_021026	GAA	2	6	291681	291686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534248
6009	NC_021026	AGC	2	6	291712	291717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534249
6010	NC_021026	GTAT	2	8	291795	291802	25 %	50 %	25 %	0 %	480534249
6011	NC_021026	T	6	6	291810	291815	0 %	100 %	0 %	0 %	480534249
6012	NC_021026	CAG	2	6	291831	291836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534249
6013	NC_021026	ATT	2	6	291863	291868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534249
6014	NC_021026	ATA	2	6	291873	291878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534249
6015	NC_021026	TGG	2	6	291879	291884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534249
6016	NC_021026	TG	3	6	291912	291917	0 %	50 %	50 %	0 %	480534249
6017	NC_021026	CTT	2	6	291925	291930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534249
6018	NC_021026	A	6	6	292022	292027	100 %	0 %	0 %	0 %	480534249
6019	NC_021026	GTG	2	6	292140	292145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534249
6020	NC_021026	GAC	2	6	292171	292176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534249
6021	NC_021026	ATCCT	2	10	292385	292394	20 %	40 %	0 %	40 %	480534250
6022	NC_021026	CAG	2	6	292460	292465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534250
6023	NC_021026	GAC	2	6	292468	292473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534250
6024	NC_021026	TTGA	2	8	292499	292506	25 %	50 %	25 %	0 %	480534250
6025	NC_021026	TGG	2	6	292524	292529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534250
6026	NC_021026	A	6	6	292580	292585	100 %	0 %	0 %	0 %	480534250
6027	NC_021026	CGC	2	6	292637	292642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480534250
6028	NC_021026	AAGC	2	8	292700	292707	50 %	0 %	25 %	25 %	480534250
6029	NC_021026	GTGGA	2	10	292779	292788	20 %	20 %	60 %	0 %	480534250
6030	NC_021026	GA	3	6	292891	292896	50 %	0 %	50 %	0 %	480534250
6031	NC_021026	TGAT	2	8	292917	292924	25 %	50 %	25 %	0 %	480534250
6032	NC_021026	GGA	2	6	292942	292947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534250
6033	NC_021026	GAC	2	6	292964	292969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534250
6034	NC_021026	ATCC	2	8	293045	293052	25 %	25 %	0 %	50 %	480534250
6035	NC_021026	AAC	2	6	293061	293066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534250
6036	NC_021026	ATG	2	6	293082	293087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534250
6037	NC_021026	A	6	6	293093	293098	100 %	0 %	0 %	0 %	480534250
6038	NC_021026	TCT	2	6	293162	293167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534251
6039	NC_021026	GAG	2	6	293170	293175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534251
6040	NC_021026	TTA	2	6	293309	293314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534251
6041	NC_021026	TTC	3	9	293332	293340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534251
6042	NC_021026	T	6	6	293354	293359	0 %	100 %	0 %	0 %	480534251
6043	NC_021026	GAT	2	6	293371	293376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534251
6044	NC_021026	ATG	2	6	293393	293398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534251
6045	NC_021026	TCA	2	6	293399	293404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534251
6046	NC_021026	AT	3	6	293462	293467	50 %	50 %	0 %	0 %	480534251
6047	NC_021026	CTTT	2	8	293475	293482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_021026	T	6	6	293528	293533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021026	TA	3	6	293621	293626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021026	TAG	2	6	293703	293708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021026	GGAA	2	8	293765	293772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021026	TA	4	8	293801	293808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021026	AACAA	2	10	293821	293830	80 %	0 %	0 %	20 %	480534252
6054	NC_021026	AGT	2	6	293913	293918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534252
6055	NC_021026	A	6	6	293937	293942	100 %	0 %	0 %	0 %	480534252
6056	NC_021026	CA	3	6	293960	293965	50 %	0 %	0 %	50 %	480534252
6057	NC_021026	A	6	6	294022	294027	100 %	0 %	0 %	0 %	480534252
6058	NC_021026	CTA	2	6	294042	294047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534252
6059	NC_021026	CACT	2	8	294048	294055	25 %	25 %	0 %	50 %	480534252
6060	NC_021026	ACC	2	6	294059	294064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534252
6061	NC_021026	TTGA	2	8	294121	294128	25 %	50 %	25 %	0 %	480534252
6062	NC_021026	CA	3	6	294152	294157	50 %	0 %	0 %	50 %	480534252
6063	NC_021026	TTG	2	6	294197	294202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534252
6064	NC_021026	CAA	2	6	294226	294231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534252
6065	NC_021026	AAGGA	2	10	294263	294272	60 %	0 %	40 %	0 %	480534252
6066	NC_021026	CGT	2	6	294313	294318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534253
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6070	NC_021026	ACG	2	6	294464	294469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534253
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6075	NC_021026	GTT	2	6	294762	294767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_021026	TCTTGT	2	12	294890	294901	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6079	NC_021026	A	6	6	294996	295001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_021026	T	6	6	295028	295033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6083	NC_021026	TAT	2	6	295087	295092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534254
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6089	NC_021026	TA	3	6	295342	295347	50 %	50 %	0 %	0 %	480534254
6090	NC_021026	GAT	2	6	295351	295356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534254
6091	NC_021026	GAATTA	2	12	295398	295409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480534254
6092	NC_021026	AAG	2	6	295471	295476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_021026	CTT	2	6	295504	295509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_021026	TAA	2	6	295562	295567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534255
6095	NC_021026	AGG	2	6	295581	295586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534255
6096	NC_021026	A	6	6	295587	295592	100 %	0 %	0 %	0 %	480534255
6097	NC_021026	ACT	2	6	295597	295602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534255
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6099	NC_021026	GTG	2	6	295625	295630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534255
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6104	NC_021026	GTC	2	6	295709	295714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534255
6105	NC_021026	ATC	2	6	295790	295795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534255
6106	NC_021026	AGA	2	6	295803	295808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534255
6107	NC_021026	CT	3	6	295851	295856	0 %	50 %	0 %	50 %	480534255
6108	NC_021026	TGA	2	6	295884	295889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534255
6109	NC_021026	GAA	2	6	295903	295908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534255
6110	NC_021026	TGA	2	6	295935	295940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534255
6111	NC_021026	TCA	2	6	295967	295972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534255
6112	NC_021026	TGG	2	6	296016	296021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534255
6113	NC_021026	ATTG	2	8	296037	296044	25 %	50 %	25 %	0 %	480534255
6114	NC_021026	AAT	2	6	296125	296130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534255
6115	NC_021026	ATA	2	6	296195	296200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534255
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6119	NC_021026	AAT	2	6	296563	296568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534255
6120	NC_021026	AGA	2	6	296592	296597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534255
6121	NC_021026	AAT	2	6	296608	296613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534255
6122	NC_021026	TTG	2	6	296711	296716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534255
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6124	NC_021026	ATGGT	2	10	296753	296762	20 %	40 %	40 %	0 %	480534255
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6500	NC_021026	AATG	2	8	314254	314261	50 %	25 %	25 %	0 %	480534268

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