MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 41242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021026	T	6	6	267957	267962	0 %	100 %	0 %	0 %	480534228
5502	NC_021026	TTG	2	6	267972	267977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534228
5503	NC_021026	TCTT	2	8	268044	268051	0 %	75 %	0 %	25 %	480534228
5504	NC_021026	TTC	2	6	268142	268147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534228
5505	NC_021026	T	6	6	268154	268159	0 %	100 %	0 %	0 %	480534228
5506	NC_021026	AGT	2	6	268174	268179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534228
5507	NC_021026	GTT	2	6	268212	268217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534228
5508	NC_021026	TAG	2	6	268225	268230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534228
5509	NC_021026	AGT	2	6	268232	268237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534228
5510	NC_021026	GCA	2	6	268290	268295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534228
5511	NC_021026	TGG	2	6	268301	268306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534228
5512	NC_021026	TCT	2	6	268323	268328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534228
5513	NC_021026	GAA	2	6	268362	268367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534228
5514	NC_021026	GCT	2	6	268395	268400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534228
5515	NC_021026	GGT	2	6	268424	268429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534228
5516	NC_021026	TGT	2	6	268438	268443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534228
5517	NC_021026	TGGT	2	8	268456	268463	0 %	50 %	50 %	0 %	480534228
5518	NC_021026	TCG	2	6	268470	268475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534228
5519	NC_021026	GCAA	2	8	268500	268507	50 %	0 %	25 %	25 %	480534228
5520	NC_021026	T	7	7	268573	268579	0 %	100 %	0 %	0 %	480534228
5521	NC_021026	CAAT	2	8	268617	268624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_021026	GTA	2	6	268648	268653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021026	A	7	7	268686	268692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021026	TA	3	6	268725	268730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021026	AAGCC	2	10	268764	268773	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5526	NC_021026	TAT	2	6	268775	268780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021026	GAT	2	6	268787	268792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_021026	A	6	6	268841	268846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_021026	ACAA	2	8	268860	268867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_021026	AAT	2	6	268884	268889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021026	TC	3	6	268912	268917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_021026	AC	3	6	268957	268962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_021026	GAT	2	6	268964	268969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021026	ATC	2	6	268986	268991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_021026	A	7	7	269001	269007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021026	A	6	6	269116	269121	100 %	0 %	0 %	0 %	480534229
5537	NC_021026	CAAA	2	8	269125	269132	75 %	0 %	0 %	25 %	480534229
5538	NC_021026	CAC	2	6	269141	269146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534229
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5540	NC_021026	A	6	6	269188	269193	100 %	0 %	0 %	0 %	480534229
5541	NC_021026	GTG	2	6	269296	269301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534229
5542	NC_021026	CTT	2	6	269302	269307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534229
5543	NC_021026	GTG	2	6	269357	269362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534229
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5554	NC_021026	TGC	2	6	269833	269838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534230
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5558	NC_021026	ATG	2	6	270046	270051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021026	CGA	2	6	270101	270106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_021026	GCA	2	6	270132	270137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5562	NC_021026	CAA	2	6	270242	270247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_021026	TTA	2	6	270292	270297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021026	AATAG	2	10	270310	270319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021026	AAAT	2	8	270327	270334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021026	AAAC	2	8	270340	270347	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_021026	A	6	6	270373	270378	100 %	0 %	0 %	0 %	480534231
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5597	NC_021026	CAAGA	2	10	271605	271614	60 %	0 %	20 %	20 %	480534231
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5607	NC_021026	TCG	2	6	271930	271935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534231
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5620	NC_021026	TAG	2	6	272508	272513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5622	NC_021026	AATG	2	8	272531	272538	50 %	25 %	25 %	0 %	480534232
5623	NC_021026	TGA	2	6	272558	272563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
5624	NC_021026	CTG	2	6	272579	272584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534232
5625	NC_021026	AAAG	2	8	272712	272719	75 %	0 %	25 %	0 %	480534232
5626	NC_021026	GAA	2	6	272728	272733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
5627	NC_021026	CTA	2	6	272811	272816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
5628	NC_021026	TATT	2	8	272906	272913	25 %	75 %	0 %	0 %	480534232
5629	NC_021026	AAG	2	6	272947	272952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
5630	NC_021026	ATC	2	6	272954	272959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
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5632	NC_021026	AGA	2	6	273020	273025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
5633	NC_021026	ATG	2	6	273026	273031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
5634	NC_021026	AAC	2	6	273119	273124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534232
5635	NC_021026	CCT	2	6	273139	273144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534232
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5637	NC_021026	GAC	2	6	273240	273245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534232
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5639	NC_021026	TCA	2	6	273407	273412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
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5641	NC_021026	GTT	2	6	273502	273507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534232
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5643	NC_021026	GCT	2	6	273622	273627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534232
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5646	NC_021026	ACG	2	6	273829	273834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534232
5647	NC_021026	CTAT	2	8	273845	273852	25 %	50 %	0 %	25 %	480534232
5648	NC_021026	TGA	2	6	273912	273917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
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5652	NC_021026	GTC	2	6	274268	274273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534232
5653	NC_021026	A	6	6	274366	274371	100 %	0 %	0 %	0 %	480534232
5654	NC_021026	AGGT	2	8	274409	274416	25 %	25 %	50 %	0 %	480534232
5655	NC_021026	A	6	6	274419	274424	100 %	0 %	0 %	0 %	480534232
5656	NC_021026	GCG	2	6	274582	274587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534232
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5658	NC_021026	CTAT	2	8	274634	274641	25 %	50 %	0 %	25 %	480534232
5659	NC_021026	GGA	2	6	274677	274682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534232
5660	NC_021026	GAA	2	6	274774	274779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
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5663	NC_021026	TTG	2	6	275111	275116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534232
5664	NC_021026	TGGT	2	8	275222	275229	0 %	50 %	50 %	0 %	480534232
5665	NC_021026	CT	4	8	275291	275298	0 %	50 %	0 %	50 %	480534232
5666	NC_021026	GTCAGT	2	12	275315	275326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480534232
5667	NC_021026	CCTT	2	8	275441	275448	0 %	50 %	0 %	50 %	480534232
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5670	NC_021026	GCG	2	6	275674	275679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534232
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5672	NC_021026	G	6	6	275709	275714	0 %	0 %	100 %	0 %	480534232
5673	NC_021026	GTT	2	6	275719	275724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534232
5674	NC_021026	CAG	2	6	275771	275776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534232
5675	NC_021026	ATG	2	6	275777	275782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
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5677	NC_021026	ATG	2	6	275861	275866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
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5679	NC_021026	GTCTG	2	10	276099	276108	0 %	40 %	40 %	20 %	480534232
5680	NC_021026	TTGG	2	8	276126	276133	0 %	50 %	50 %	0 %	480534232
5681	NC_021026	GAC	2	6	276196	276201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534232
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5684	NC_021026	GA	3	6	276301	276306	50 %	0 %	50 %	0 %	480534232
5685	NC_021026	TAA	2	6	276333	276338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534232
5686	NC_021026	ATG	2	6	276415	276420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
5687	NC_021026	TATT	2	8	276456	276463	25 %	75 %	0 %	0 %	480534232
5688	NC_021026	ACT	2	6	276464	276469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
5689	NC_021026	TCA	2	6	276533	276538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
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5691	NC_021026	GAA	2	6	276570	276575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
5692	NC_021026	GAC	2	6	276684	276689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534232
5693	NC_021026	CCA	2	6	276721	276726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534232
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5695	NC_021026	CT	3	6	276799	276804	0 %	50 %	0 %	50 %	480534232
5696	NC_021026	GTG	2	6	276824	276829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534232
5697	NC_021026	TCA	2	6	276835	276840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
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5699	NC_021026	GTTT	2	8	276905	276912	0 %	75 %	25 %	0 %	480534232
5700	NC_021026	GTT	2	6	276918	276923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534232
5701	NC_021026	A	6	6	276926	276931	100 %	0 %	0 %	0 %	480534232
5702	NC_021026	TAA	2	6	276937	276942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5703	NC_021026	CTTT	2	8	276986	276993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5704	NC_021026	T	6	6	276991	276996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5708	NC_021026	A	6	6	277315	277320	100 %	0 %	0 %	0 %	480534234
5709	NC_021026	ATT	2	6	277359	277364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534234
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5711	NC_021026	TCAT	2	8	277422	277429	25 %	50 %	0 %	25 %	480534234
5712	NC_021026	CCAG	2	8	277473	277480	25 %	0 %	25 %	50 %	480534234
5713	NC_021026	ATTT	2	8	277553	277560	25 %	75 %	0 %	0 %	480534234
5714	NC_021026	AAG	2	6	277620	277625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534235
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5717	NC_021026	AAAATA	2	12	277730	277741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	480534235
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5724	NC_021026	AGC	2	6	278195	278200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534236
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5729	NC_021026	CGT	2	6	278538	278543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534236
5730	NC_021026	ATC	2	6	278592	278597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534236
5731	NC_021026	CTG	2	6	278644	278649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534236
5732	NC_021026	TCAG	2	8	278747	278754	25 %	25 %	25 %	25 %	480534236
5733	NC_021026	CTT	2	6	278762	278767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534236
5734	NC_021026	GTT	2	6	278832	278837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534236
5735	NC_021026	CTT	2	6	278967	278972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534236
5736	NC_021026	ATA	2	6	279004	279009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534237
5737	NC_021026	TAT	2	6	279176	279181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534237
5738	NC_021026	T	6	6	279217	279222	0 %	100 %	0 %	0 %	480534237
5739	NC_021026	AT	3	6	279350	279355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_021026	AGG	2	6	279412	279417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5741	NC_021026	CCT	2	6	279434	279439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5742	NC_021026	TGATA	2	10	279442	279451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5743	NC_021026	A	6	6	279555	279560	100 %	0 %	0 %	0 %	480534238
5744	NC_021026	TGA	2	6	279584	279589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534238
5745	NC_021026	A	6	6	279589	279594	100 %	0 %	0 %	0 %	480534238
5746	NC_021026	CTA	2	6	279644	279649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534238
5747	NC_021026	ATG	2	6	279651	279656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534238
5748	NC_021026	TTG	2	6	279717	279722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534238
5749	NC_021026	AAT	2	6	279801	279806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534238
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5752	NC_021026	TCA	2	6	280025	280030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534238
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5754	NC_021026	GTG	2	6	280065	280070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534238
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5757	NC_021026	T	6	6	280340	280345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5758	NC_021026	AGG	2	6	280391	280396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5826	NC_021026	TGGT	2	8	283441	283448	0 %	50 %	50 %	0 %	480534241
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5832	NC_021026	T	6	6	283597	283602	0 %	100 %	0 %	0 %	480534242
5833	NC_021026	T	6	6	283653	283658	0 %	100 %	0 %	0 %	480534242
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5854	NC_021026	CTGA	2	8	284487	284494	25 %	25 %	25 %	25 %	480534242
5855	NC_021026	GCA	2	6	284504	284509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534242
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5859	NC_021026	T	6	6	284563	284568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5860	NC_021026	A	7	7	284625	284631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5861	NC_021026	A	6	6	284647	284652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5862	NC_021026	A	6	6	284655	284660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5863	NC_021026	GAG	2	6	284695	284700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5864	NC_021026	A	6	6	284732	284737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5865	NC_021026	GAA	2	6	284742	284747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5866	NC_021026	ATTAG	2	10	284774	284783	40 %	40 %	20 %	0 %	480534243
5867	NC_021026	TCG	2	6	284832	284837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534243
5868	NC_021026	TCT	2	6	284853	284858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534243
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5995	NC_021026	AGCAG	2	10	290928	290937	40 %	0 %	40 %	20 %	480534248
5996	NC_021026	TAT	2	6	290946	290951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534248
5997	NC_021026	TCA	2	6	291072	291077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534248
5998	NC_021026	GTG	2	6	291085	291090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534248
5999	NC_021026	AAG	2	6	291212	291217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534248
6000	NC_021026	AGCA	2	8	291231	291238	50 %	0 %	25 %	25 %	480534248

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