MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021006	TGT	2	6	189315	189320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021006	TAG	2	6	189347	189352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021006	ATT	2	6	189428	189433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021006	TTA	2	6	189434	189439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021006	TAT	2	6	189509	189514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021006	TGAAAA	2	12	189522	189533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021006	A	6	6	189530	189535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021006	CCT	2	6	189622	189627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532328
4009	NC_021006	GCA	2	6	189703	189708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532328
4010	NC_021006	AAG	2	6	189731	189736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532328
4011	NC_021006	CGC	2	6	189744	189749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532328
4012	NC_021006	ACA	2	6	189791	189796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532328
4013	NC_021006	CAC	2	6	189812	189817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532328
4014	NC_021006	AAAT	2	8	189830	189837	75 %	25 %	0 %	0 %	480532328
4015	NC_021006	CAA	2	6	189920	189925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532328
4016	NC_021006	GT	3	6	189945	189950	0 %	50 %	50 %	0 %	480532328
4017	NC_021006	T	8	8	190061	190068	0 %	100 %	0 %	0 %	480532328
4018	NC_021006	CAG	2	6	190079	190084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532328
4019	NC_021006	CAT	2	6	190092	190097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532328
4020	NC_021006	A	7	7	190123	190129	100 %	0 %	0 %	0 %	480532328
4021	NC_021006	TTA	2	6	190195	190200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532328
4022	NC_021006	GCA	2	6	190225	190230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532328
4023	NC_021006	CGAA	2	8	190263	190270	50 %	0 %	25 %	25 %	480532328
4024	NC_021006	CTTT	2	8	190303	190310	0 %	75 %	0 %	25 %	480532328
4025	NC_021006	GCAA	2	8	190317	190324	50 %	0 %	25 %	25 %	480532328
4026	NC_021006	AAAT	2	8	190337	190344	75 %	25 %	0 %	0 %	480532328
4027	NC_021006	GAA	2	6	190348	190353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532328
4028	NC_021006	ATA	2	6	190357	190362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532328
4029	NC_021006	T	6	6	190375	190380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021006	TGG	2	6	190444	190449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021006	A	6	6	190565	190570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021006	TAA	2	6	190603	190608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532329
4033	NC_021006	TTGA	2	8	190623	190630	25 %	50 %	25 %	0 %	480532329
4034	NC_021006	AAT	2	6	190661	190666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532329
4035	NC_021006	TTTC	2	8	190673	190680	0 %	75 %	0 %	25 %	480532329
4036	NC_021006	AAT	2	6	190695	190700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532329
4037	NC_021006	AGC	2	6	190710	190715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532329
4038	NC_021006	ATC	2	6	190761	190766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532329
4039	NC_021006	TCA	2	6	190771	190776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532329
4040	NC_021006	TTA	2	6	190894	190899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532329
4041	NC_021006	CTAG	2	8	190927	190934	25 %	25 %	25 %	25 %	480532329
4042	NC_021006	AGA	2	6	190988	190993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532329
4043	NC_021006	TCT	2	6	191164	191169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532329
4044	NC_021006	T	6	6	191305	191310	0 %	100 %	0 %	0 %	480532329
4045	NC_021006	TAT	2	6	191327	191332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532329
4046	NC_021006	T	10	10	191332	191341	0 %	100 %	0 %	0 %	480532329
4047	NC_021006	CTT	3	9	191383	191391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532330
4048	NC_021006	ATC	2	6	191532	191537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532330
4049	NC_021006	T	7	7	191583	191589	0 %	100 %	0 %	0 %	480532330
4050	NC_021006	ACC	2	6	191618	191623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532330
4051	NC_021006	TTG	2	6	191632	191637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532330
4052	NC_021006	CAA	2	6	191722	191727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532330
4053	NC_021006	TGAT	2	8	191795	191802	25 %	50 %	25 %	0 %	480532330
4054	NC_021006	ATA	2	6	191838	191843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532330
4055	NC_021006	CAA	2	6	191861	191866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532330
4056	NC_021006	AGA	2	6	191980	191985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532330
4057	NC_021006	CAT	2	6	191992	191997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532330
4058	NC_021006	ACT	2	6	192066	192071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532330
4059	NC_021006	TTGT	2	8	192138	192145	0 %	75 %	25 %	0 %	480532330
4060	NC_021006	GAA	2	6	192146	192151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532330
4061	NC_021006	GAT	2	6	192157	192162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532330
4062	NC_021006	TCA	2	6	192198	192203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532330
4063	NC_021006	TTC	2	6	192317	192322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532330
4064	NC_021006	TCA	2	6	192489	192494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532330
4065	NC_021006	ACG	2	6	192533	192538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532330
4066	NC_021006	TCA	2	6	192592	192597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532330
4067	NC_021006	GAT	2	6	192635	192640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532330
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4070	NC_021006	ACG	2	6	192731	192736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532330
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4073	NC_021006	TCA	2	6	192942	192947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532330
4074	NC_021006	CTG	2	6	192952	192957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532330
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4081	NC_021006	ATTC	3	12	193660	193671	25 %	50 %	0 %	25 %	480532330
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4083	NC_021006	AGTA	2	8	193841	193848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021006	ACA	2	6	193849	193854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4086	NC_021006	TAA	2	6	193982	193987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021006	ACA	2	6	194024	194029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532331
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4089	NC_021006	CTTCA	2	10	194186	194195	20 %	40 %	0 %	40 %	480532331
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4102	NC_021006	TAC	2	6	194715	194720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532331
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4106	NC_021006	A	6	6	194908	194913	100 %	0 %	0 %	0 %	480532331
4107	NC_021006	TAT	2	6	194942	194947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532331
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4109	NC_021006	ATC	2	6	195020	195025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_021006	GTT	2	6	195031	195036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021006	T	7	7	195035	195041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021006	T	7	7	195047	195053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021006	TAT	2	6	195057	195062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021006	GTTGAA	2	12	195068	195079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021006	GTT	2	6	195103	195108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021006	ATTTT	2	10	195144	195153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021006	ATA	2	6	195194	195199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021006	ACTT	2	8	195219	195226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_021006	T	6	6	195272	195277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021006	TTC	2	6	195306	195311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_021006	T	6	6	195314	195319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021006	A	6	6	195408	195413	100 %	0 %	0 %	0 %	480532332
4123	NC_021006	AGT	2	6	195525	195530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532332
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4125	NC_021006	TTC	2	6	195573	195578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532332
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4246	NC_021006	TCTA	2	8	200842	200849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4247	NC_021006	TGA	2	6	201015	201020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4249	NC_021006	ATT	2	6	201055	201060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4274	NC_021006	T	6	6	202889	202894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4369	NC_021006	TCCA	2	8	207423	207430	25 %	25 %	0 %	50 %	480532347
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4373	NC_021006	CAT	2	6	207589	207594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532347
4374	NC_021006	TCT	2	6	207651	207656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532347
4375	NC_021006	CT	3	6	207655	207660	0 %	50 %	0 %	50 %	480532347
4376	NC_021006	TAAA	2	8	207671	207678	75 %	25 %	0 %	0 %	480532347
4377	NC_021006	CAT	2	6	207716	207721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532348
4378	NC_021006	GCC	2	6	207735	207740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532348
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4381	NC_021006	TTTC	2	8	207892	207899	0 %	75 %	0 %	25 %	480532348
4382	NC_021006	CGG	2	6	207957	207962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480532348
4383	NC_021006	ATG	2	6	208014	208019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532348
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4385	NC_021006	CGTT	2	8	208071	208078	0 %	50 %	25 %	25 %	480532348
4386	NC_021006	CCTT	2	8	208089	208096	0 %	50 %	0 %	50 %	480532348
4387	NC_021006	TCCG	2	8	208209	208216	0 %	25 %	25 %	50 %	480532348
4388	NC_021006	AGT	2	6	208273	208278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532348
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4390	NC_021006	TCA	2	6	208368	208373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532348
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4392	NC_021006	TGA	2	6	208503	208508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532348
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4394	NC_021006	ATC	2	6	208670	208675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532348
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4398	NC_021006	AAT	2	6	208738	208743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532348
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4403	NC_021006	ACCTG	2	10	208965	208974	20 %	20 %	20 %	40 %	480532348
4404	NC_021006	A	6	6	209015	209020	100 %	0 %	0 %	0 %	480532348
4405	NC_021006	CAT	2	6	209260	209265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532348
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4407	NC_021006	TAA	2	6	209379	209384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532348
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4413	NC_021006	CT	3	6	209688	209693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4414	NC_021006	GAA	2	6	209736	209741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4415	NC_021006	TCTT	2	8	209773	209780	0 %	75 %	0 %	25 %	480532349
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4431	NC_021006	AT	3	6	210732	210737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4432	NC_021006	TAT	3	9	210740	210748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_021006	AAAG	2	8	210770	210777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4434	NC_021006	A	6	6	210779	210784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4435	NC_021006	T	7	7	210827	210833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4436	NC_021006	GA	3	6	210851	210856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4444	NC_021006	AAC	2	6	211375	211380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532350
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4448	NC_021006	TGAAA	2	10	211563	211572	60 %	20 %	20 %	0 %	480532350
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4464	NC_021006	CAA	2	6	212360	212365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532350
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4472	NC_021006	GCT	2	6	212695	212700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532350
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4484	NC_021006	ACA	2	6	213343	213348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532351
4485	NC_021006	TGA	2	6	213376	213381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532351
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4489	NC_021006	CAT	2	6	213524	213529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532351
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4491	NC_021006	TA	3	6	214016	214021	50 %	50 %	0 %	0 %	480532352
4492	NC_021006	CTA	2	6	214167	214172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532352
4493	NC_021006	ATG	2	6	214181	214186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532352
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4495	NC_021006	GCAA	2	8	214399	214406	50 %	0 %	25 %	25 %	480532352
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