MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021006	AT	3	6	165525	165530	50 %	50 %	0 %	0 %	480532306
3502	NC_021006	TCA	2	6	165606	165611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532306
3503	NC_021006	TAA	2	6	165617	165622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532306
3504	NC_021006	AAC	2	6	165640	165645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_021006	AGA	2	6	165654	165659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021006	A	7	7	165659	165665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021006	T	6	6	165724	165729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021006	T	6	6	165882	165887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021006	TTG	2	6	165904	165909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021006	TTC	2	6	165949	165954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021006	TTC	2	6	165988	165993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_021006	ATC	3	9	165997	166005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021006	TTC	2	6	166063	166068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021006	TATAA	2	10	166108	166117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021006	CTA	2	6	166195	166200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532307
3516	NC_021006	AGA	2	6	166284	166289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532307
3517	NC_021006	GTT	2	6	166404	166409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532307
3518	NC_021006	CAT	2	6	166428	166433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532307
3519	NC_021006	TTA	2	6	166445	166450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532307
3520	NC_021006	TCTT	2	8	166514	166521	0 %	75 %	0 %	25 %	480532307
3521	NC_021006	AATCC	2	10	166561	166570	40 %	20 %	0 %	40 %	480532307
3522	NC_021006	CGTG	2	8	166576	166583	0 %	25 %	50 %	25 %	480532307
3523	NC_021006	ACG	2	6	166603	166608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532307
3524	NC_021006	TTTGA	2	10	166618	166627	20 %	60 %	20 %	0 %	480532307
3525	NC_021006	TCCA	2	8	166691	166698	25 %	25 %	0 %	50 %	480532307
3526	NC_021006	TAG	2	6	166709	166714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532307
3527	NC_021006	TCT	2	6	166766	166771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532307
3528	NC_021006	ACC	2	6	166789	166794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532307
3529	NC_021006	GAT	2	6	166882	166887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532307
3530	NC_021006	CTG	2	6	166899	166904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532307
3531	NC_021006	CTG	2	6	166914	166919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532307
3532	NC_021006	TAG	2	6	166944	166949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532307
3533	NC_021006	AAC	2	6	166960	166965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532307
3534	NC_021006	GCAT	2	8	167011	167018	25 %	25 %	25 %	25 %	480532307
3535	NC_021006	CAT	2	6	167026	167031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532307
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3539	NC_021006	TGA	2	6	167258	167263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532307
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3541	NC_021006	CTGG	2	8	167456	167463	0 %	25 %	50 %	25 %	480532307
3542	NC_021006	AGT	2	6	167478	167483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532307
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3544	NC_021006	T	7	7	167604	167610	0 %	100 %	0 %	0 %	480532307
3545	NC_021006	TAAA	2	8	167627	167634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021006	GAGAG	2	10	167643	167652	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021006	CTT	2	6	167682	167687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021006	GAG	2	6	167713	167718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021006	CGA	2	6	167740	167745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_021006	TAA	2	6	167748	167753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021006	GAG	2	6	167962	167967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532308
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3553	NC_021006	CTG	3	9	168052	168060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532308
3554	NC_021006	TCC	2	6	168095	168100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532308
3555	NC_021006	TGC	2	6	168149	168154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532308
3556	NC_021006	GCA	2	6	168207	168212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532308
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3559	NC_021006	TCA	2	6	168270	168275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532308
3560	NC_021006	GCA	2	6	168327	168332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532308
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3562	NC_021006	GAA	2	6	168491	168496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532308
3563	NC_021006	GAA	2	6	168548	168553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532308
3564	NC_021006	ACT	2	6	168561	168566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532308
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3594	NC_021006	AGAT	2	8	169440	169447	50 %	25 %	25 %	0 %	480532308
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3596	NC_021006	CTTTC	2	10	169475	169484	0 %	60 %	0 %	40 %	480532308
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3604	NC_021006	TA	3	6	169842	169847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021006	TAAA	2	8	169852	169859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021006	CAT	2	6	169946	169951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532310
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3618	NC_021006	AAGT	2	8	170852	170859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021006	TACA	2	8	170875	170882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_021006	T	7	7	170885	170891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021006	T	7	7	170895	170901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021006	AGG	2	6	170921	170926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021006	AC	3	6	170935	170940	50 %	0 %	0 %	50 %	480532311
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3991	NC_021006	GA	3	6	188846	188851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3992	NC_021006	TCAA	2	8	188974	188981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3993	NC_021006	GCT	2	6	189007	189012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3995	NC_021006	GTT	2	6	189046	189051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3997	NC_021006	ACC	2	6	189204	189209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3998	NC_021006	TGT	2	6	189222	189227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_021006	TCA	2	6	189298	189303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_021006	A	6	6	189309	189314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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