MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021006	ATG	2	6	22182	22187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021006	GAT	2	6	22189	22194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021006	AG	3	6	22197	22202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021006	GA	3	6	22255	22260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021006	ATT	2	6	22295	22300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532194
506	NC_021006	TAG	2	6	22310	22315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532194
507	NC_021006	AGA	2	6	22329	22334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532194
508	NC_021006	AGA	2	6	22380	22385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532194
509	NC_021006	ATT	2	6	22438	22443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532194
510	NC_021006	ATT	2	6	22504	22509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532194
511	NC_021006	AAC	2	6	22588	22593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532194
512	NC_021006	CTT	2	6	22650	22655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532194
513	NC_021006	A	7	7	22725	22731	100 %	0 %	0 %	0 %	480532194
514	NC_021006	AGA	2	6	22809	22814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532194
515	NC_021006	GA	3	6	22820	22825	50 %	0 %	50 %	0 %	480532194
516	NC_021006	TA	3	6	22855	22860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021006	G	6	6	22897	22902	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021006	T	6	6	23030	23035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021006	TAT	2	6	23092	23097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021006	TGA	2	6	23147	23152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021006	AAT	2	6	23175	23180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532195
522	NC_021006	GAT	2	6	23191	23196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532195
523	NC_021006	TAG	2	6	23222	23227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532195
524	NC_021006	ATT	2	6	23300	23305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532195
525	NC_021006	GAT	2	6	23308	23313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532195
526	NC_021006	A	7	7	23334	23340	100 %	0 %	0 %	0 %	480532195
527	NC_021006	TAT	2	6	23356	23361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021006	T	6	6	23361	23366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021006	TGA	2	6	23398	23403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021006	GTT	2	6	23408	23413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532196
531	NC_021006	TAA	2	6	23452	23457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532196
532	NC_021006	GAA	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532196
533	NC_021006	TAA	2	6	23535	23540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532196
534	NC_021006	TA	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	480532196
535	NC_021006	ATG	2	6	23591	23596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532196
536	NC_021006	GA	3	6	23676	23681	50 %	0 %	50 %	0 %	480532196
537	NC_021006	TTA	2	6	23712	23717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532196
538	NC_021006	GTT	2	6	23753	23758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532196
539	NC_021006	GTT	2	6	23847	23852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532196
540	NC_021006	TGA	2	6	23929	23934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532196
541	NC_021006	TTG	3	9	24009	24017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532196
542	NC_021006	ATG	2	6	24024	24029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532196
543	NC_021006	ATCA	2	8	24067	24074	50 %	25 %	0 %	25 %	480532196
544	NC_021006	GAAA	2	8	24094	24101	75 %	0 %	25 %	0 %	480532196
545	NC_021006	A	7	7	24120	24126	100 %	0 %	0 %	0 %	480532196
546	NC_021006	AAAT	2	8	24163	24170	75 %	25 %	0 %	0 %	480532196
547	NC_021006	AGG	2	6	24209	24214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021006	ATT	2	6	24233	24238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532197
549	NC_021006	T	6	6	24314	24319	0 %	100 %	0 %	0 %	480532197
550	NC_021006	TGG	2	6	24367	24372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532197
551	NC_021006	GAA	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532197
552	NC_021006	CAT	2	6	24573	24578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532197
553	NC_021006	ATC	2	6	24618	24623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532197
554	NC_021006	TGG	2	6	24685	24690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532197
555	NC_021006	AG	3	6	24698	24703	50 %	0 %	50 %	0 %	480532197
556	NC_021006	CAAT	2	8	24710	24717	50 %	25 %	0 %	25 %	480532197
557	NC_021006	TA	3	6	24758	24763	50 %	50 %	0 %	0 %	480532197
558	NC_021006	ATCT	2	8	24783	24790	25 %	50 %	0 %	25 %	480532197
559	NC_021006	TAT	2	6	24859	24864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532197
560	NC_021006	TGG	2	6	24919	24924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532197
561	NC_021006	GCA	2	6	24941	24946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532197
562	NC_021006	ACG	2	6	25142	25147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_021006	A	6	6	25190	25195	100 %	0 %	0 %	0 %	480532198
564	NC_021006	TGG	2	6	25222	25227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532198
565	NC_021006	GAA	2	6	25337	25342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532198
566	NC_021006	ATG	2	6	25359	25364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532198
567	NC_021006	TGG	2	6	25378	25383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532198
568	NC_021006	TGA	2	6	25417	25422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532198
569	NC_021006	GA	4	8	25421	25428	50 %	0 %	50 %	0 %	480532198
570	NC_021006	ATCA	2	8	25493	25500	50 %	25 %	0 %	25 %	480532198
571	NC_021006	ACAAA	2	10	25641	25650	80 %	0 %	0 %	20 %	480532198
572	NC_021006	GAA	2	6	25808	25813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532198
573	NC_021006	TTA	2	6	25889	25894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532198
574	NC_021006	TGT	2	6	25903	25908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532198
575	NC_021006	ATA	2	6	25917	25922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532198
576	NC_021006	ACCT	2	8	26004	26011	25 %	25 %	0 %	50 %	480532198
577	NC_021006	TA	3	6	26072	26077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021006	T	6	6	26087	26092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021006	AAC	2	6	26128	26133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021006	TGAA	2	8	26207	26214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021006	ATTCGA	2	12	26306	26317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480532199
582	NC_021006	GGA	2	6	26377	26382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532199
583	NC_021006	GT	3	6	26536	26541	0 %	50 %	50 %	0 %	480532199
584	NC_021006	GGTAT	2	10	26644	26653	20 %	40 %	40 %	0 %	480532199
585	NC_021006	GAT	2	6	26744	26749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532199
586	NC_021006	TGG	2	6	26755	26760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532199
587	NC_021006	ATT	2	6	26774	26779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532199
588	NC_021006	TGG	2	6	26925	26930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532199
589	NC_021006	CAT	2	6	26939	26944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532199
590	NC_021006	GTC	2	6	27014	27019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532199
591	NC_021006	CAA	2	6	27062	27067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532199
592	NC_021006	TAA	2	6	27094	27099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532199
593	NC_021006	GA	3	6	27100	27105	50 %	0 %	50 %	0 %	480532199
594	NC_021006	AAG	2	6	27431	27436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532199
595	NC_021006	AGC	2	6	27483	27488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532199
596	NC_021006	AGCCTT	2	12	27580	27591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480532199
597	NC_021006	TTA	2	6	27622	27627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532199
598	NC_021006	GGA	2	6	27650	27655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532199
599	NC_021006	CCAGAT	2	12	27656	27667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480532199
600	NC_021006	GTC	2	6	27669	27674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532199
601	NC_021006	AAATC	2	10	27795	27804	60 %	20 %	0 %	20 %	480532199
602	NC_021006	TAG	2	6	27810	27815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532199
603	NC_021006	TGGAA	2	10	27819	27828	40 %	20 %	40 %	0 %	480532199
604	NC_021006	AGA	2	6	27871	27876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532199
605	NC_021006	AGAA	2	8	27888	27895	75 %	0 %	25 %	0 %	480532199
606	NC_021006	AGCA	2	8	27907	27914	50 %	0 %	25 %	25 %	480532199
607	NC_021006	TC	3	6	27945	27950	0 %	50 %	0 %	50 %	480532199
608	NC_021006	TGA	2	6	27982	27987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021006	TA	3	6	28011	28016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021006	TAA	2	6	28020	28025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021006	CAA	2	6	28146	28151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021006	AAG	2	6	28224	28229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021006	T	6	6	28265	28270	0 %	100 %	0 %	0 %	480532200
614	NC_021006	TAAT	2	8	28276	28283	50 %	50 %	0 %	0 %	480532200
615	NC_021006	ATA	2	6	28333	28338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532200
616	NC_021006	AGC	2	6	28402	28407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532200
617	NC_021006	ATT	2	6	28431	28436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532200
618	NC_021006	TTTA	2	8	28463	28470	25 %	75 %	0 %	0 %	480532200
619	NC_021006	TAC	2	6	28538	28543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532200
620	NC_021006	GTA	2	6	28555	28560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532200
621	NC_021006	CTGA	2	8	28572	28579	25 %	25 %	25 %	25 %	480532200
622	NC_021006	GAT	2	6	28580	28585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532200
623	NC_021006	AAAAT	2	10	28645	28654	80 %	20 %	0 %	0 %	480532200
624	NC_021006	CAA	2	6	28671	28676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532200
625	NC_021006	TTG	2	6	28707	28712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021006	TAG	2	6	28754	28759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021006	ACA	2	6	28791	28796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021006	TAA	2	6	28833	28838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021006	A	6	6	28996	29001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021006	AAT	2	6	29009	29014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_021006	T	6	6	29105	29110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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