MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021006	AG	3	6	287485	287490	50 %	0 %	50 %	0 %	480532416
6002	NC_021006	GAG	2	6	287495	287500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532416
6003	NC_021006	ATC	2	6	287535	287540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532416
6004	NC_021006	TC	3	6	287623	287628	0 %	50 %	0 %	50 %	480532416
6005	NC_021006	GAT	2	6	287678	287683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532416
6006	NC_021006	AGA	2	6	287710	287715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532416
6007	NC_021006	AGAGG	2	10	287728	287737	40 %	0 %	60 %	0 %	480532416
6008	NC_021006	ACC	2	6	287769	287774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532416
6009	NC_021006	A	6	6	287800	287805	100 %	0 %	0 %	0 %	480532416
6010	NC_021006	TGA	2	6	287810	287815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532416
6011	NC_021006	TAGG	2	8	287857	287864	25 %	25 %	50 %	0 %	480532416
6012	NC_021006	AGG	2	6	287913	287918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532416
6013	NC_021006	TCC	2	6	287989	287994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532417
6014	NC_021006	TCA	2	6	288041	288046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532417
6015	NC_021006	GA	3	6	288131	288136	50 %	0 %	50 %	0 %	480532417
6016	NC_021006	CAT	2	6	288221	288226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532417
6017	NC_021006	GAT	2	6	288231	288236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532417
6018	NC_021006	C	6	6	288306	288311	0 %	0 %	0 %	100 %	480532417
6019	NC_021006	TCCT	2	8	288336	288343	0 %	50 %	0 %	50 %	480532417
6020	NC_021006	CTT	2	6	288407	288412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532417
6021	NC_021006	C	6	6	288609	288614	0 %	0 %	0 %	100 %	480532417
6022	NC_021006	TC	3	6	288658	288663	0 %	50 %	0 %	50 %	480532417
6023	NC_021006	CCT	2	6	288785	288790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532417
6024	NC_021006	CCA	2	6	288857	288862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532417
6025	NC_021006	CTC	2	6	288914	288919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532417
6026	NC_021006	TTGAA	2	10	288921	288930	40 %	40 %	20 %	0 %	480532417
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6029	NC_021006	TTTC	2	8	289149	289156	0 %	75 %	0 %	25 %	480532417
6030	NC_021006	ACT	2	6	289161	289166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532417
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6032	NC_021006	ACAATG	2	12	289198	289209	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480532417
6033	NC_021006	ATTG	2	8	289322	289329	25 %	50 %	25 %	0 %	480532417
6034	NC_021006	GGTA	2	8	289346	289353	25 %	25 %	50 %	0 %	480532417
6035	NC_021006	CTG	2	6	289399	289404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532417
6036	NC_021006	CTG	2	6	289466	289471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532417
6037	NC_021006	CAA	2	6	289589	289594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532417
6038	NC_021006	ATA	2	6	289694	289699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532417
6039	NC_021006	GAA	2	6	289738	289743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_021006	CT	3	6	289758	289763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_021006	TAAG	2	8	289776	289783	50 %	25 %	25 %	0 %	480532418
6042	NC_021006	ATAG	2	8	289787	289794	50 %	25 %	25 %	0 %	480532418
6043	NC_021006	AAG	2	6	289838	289843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532418
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6046	NC_021006	TCCAT	2	10	289945	289954	20 %	40 %	0 %	40 %	480532418
6047	NC_021006	TAA	2	6	289969	289974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532418
6048	NC_021006	A	6	6	290046	290051	100 %	0 %	0 %	0 %	480532418
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6051	NC_021006	TGC	2	6	290211	290216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532418
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6058	NC_021006	ATA	2	6	290493	290498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532418
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6060	NC_021006	CTTC	2	8	290522	290529	0 %	50 %	0 %	50 %	480532418
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6062	NC_021006	TA	3	6	290783	290788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_021006	AGC	2	6	290837	290842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_021006	CTT	2	6	290890	290895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_021006	TCT	2	6	290944	290949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_021006	TTG	2	6	291044	291049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532419
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6074	NC_021006	AGTTG	2	10	291509	291518	20 %	40 %	40 %	0 %	480532419
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6093	NC_021006	GCA	2	6	292328	292333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532420
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6110	NC_021006	ATC	2	6	292912	292917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532420
6111	NC_021006	CTG	2	6	292947	292952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532420
6112	NC_021006	CAAG	2	8	292953	292960	50 %	0 %	25 %	25 %	480532420
6113	NC_021006	T	7	7	292964	292970	0 %	100 %	0 %	0 %	480532420
6114	NC_021006	TGAT	3	12	293020	293031	25 %	50 %	25 %	0 %	480532420
6115	NC_021006	TCC	2	6	293035	293040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532420
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6118	NC_021006	TAT	2	6	293171	293176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_021006	A	6	6	293204	293209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021006	CTT	2	6	293228	293233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_021006	T	6	6	293271	293276	0 %	100 %	0 %	0 %	480532421
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6123	NC_021006	GAT	2	6	293403	293408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532421
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6351	NC_021006	TTCTT	2	10	303869	303878	0 %	80 %	0 %	20 %	480532431
6352	NC_021006	T	6	6	303912	303917	0 %	100 %	0 %	0 %	480532431
6353	NC_021006	TTG	3	9	303943	303951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532431
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6355	NC_021006	TTGC	2	8	304100	304107	0 %	50 %	25 %	25 %	480532431
6356	NC_021006	CTG	2	6	304116	304121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532431
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6359	NC_021006	GAC	2	6	304235	304240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532432
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6361	NC_021006	TCT	2	6	304407	304412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532432
6362	NC_021006	TCA	2	6	304413	304418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532432
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6365	NC_021006	A	6	6	304505	304510	100 %	0 %	0 %	0 %	480532432
6366	NC_021006	ACC	2	6	304673	304678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532432
6367	NC_021006	ATA	2	6	304895	304900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532432
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6369	NC_021006	ATGGG	2	10	304959	304968	20 %	20 %	60 %	0 %	480532432
6370	NC_021006	GCCA	2	8	304991	304998	25 %	0 %	25 %	50 %	480532432
6371	NC_021006	CCG	2	6	305008	305013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532432
6372	NC_021006	ATA	2	6	305052	305057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532432
6373	NC_021006	GTTT	2	8	305106	305113	0 %	75 %	25 %	0 %	480532432
6374	NC_021006	ATC	2	6	305165	305170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532432
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6376	NC_021006	TC	3	6	305208	305213	0 %	50 %	0 %	50 %	480532432
6377	NC_021006	GAT	2	6	305254	305259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532432
6378	NC_021006	CTT	2	6	305377	305382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532433
6379	NC_021006	TGA	2	6	305402	305407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532433
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6383	NC_021006	ACC	2	6	305627	305632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532433
6384	NC_021006	ATT	2	6	305636	305641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532433
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6393	NC_021006	GCTT	2	8	306205	306212	0 %	50 %	25 %	25 %	480532433
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6453	NC_021006	CTT	2	6	309091	309096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532436
6454	NC_021006	TAC	2	6	309157	309162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532437
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6472	NC_021006	TTGA	2	8	310070	310077	25 %	50 %	25 %	0 %	480532437
6473	NC_021006	TCCT	2	8	310154	310161	0 %	50 %	0 %	50 %	480532437
6474	NC_021006	CTT	2	6	310244	310249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532437
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6479	NC_021006	A	6	6	310354	310359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6480	NC_021006	A	6	6	310413	310418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6481	NC_021006	GGA	2	6	310433	310438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6482	NC_021006	AG	3	6	310513	310518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6483	NC_021006	TGTC	2	8	310536	310543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6484	NC_021006	GTA	2	6	310560	310565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6486	NC_021006	GAA	2	6	310576	310581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6487	NC_021006	AATA	2	8	310658	310665	75 %	25 %	0 %	0 %	480532438
6488	NC_021006	CAA	2	6	310678	310683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532438
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6490	NC_021006	CA	4	8	310757	310764	50 %	0 %	0 %	50 %	480532438
6491	NC_021006	TTGAAA	2	12	310783	310794	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480532438
6492	NC_021006	AATA	2	8	310803	310810	75 %	25 %	0 %	0 %	480532438
6493	NC_021006	ACA	2	6	310819	310824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532438
6494	NC_021006	TCC	2	6	310861	310866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532438
6495	NC_021006	TA	3	6	310868	310873	50 %	50 %	0 %	0 %	480532438
6496	NC_021006	GAATT	2	10	310936	310945	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_021006	CAAG	2	8	310949	310956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6498	NC_021006	ACCA	2	8	310959	310966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6499	NC_021006	T	6	6	310974	310979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6500	NC_021006	TAA	2	6	311006	311011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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