MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021006	TAC	2	6	239202	239207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532370
5003	NC_021006	ATA	2	6	239262	239267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532370
5004	NC_021006	CAA	2	6	239339	239344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532370
5005	NC_021006	TGA	2	6	239350	239355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532370
5006	NC_021006	GA	3	6	239354	239359	50 %	0 %	50 %	0 %	480532370
5007	NC_021006	AGAA	2	8	239513	239520	75 %	0 %	25 %	0 %	480532370
5008	NC_021006	AAT	2	6	239550	239555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532370
5009	NC_021006	AAT	2	6	239562	239567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532370
5010	NC_021006	AGA	2	6	239615	239620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532370
5011	NC_021006	CTT	2	6	239795	239800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532370
5012	NC_021006	A	6	6	239836	239841	100 %	0 %	0 %	0 %	480532370
5013	NC_021006	CCA	2	6	239855	239860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532370
5014	NC_021006	GA	3	6	239935	239940	50 %	0 %	50 %	0 %	480532370
5015	NC_021006	AAG	2	6	239985	239990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532371
5016	NC_021006	TTC	2	6	240166	240171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532371
5017	NC_021006	TCAT	2	8	240227	240234	25 %	50 %	0 %	25 %	480532371
5018	NC_021006	TGA	2	6	240235	240240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532371
5019	NC_021006	TCAA	2	8	240251	240258	50 %	25 %	0 %	25 %	480532371
5020	NC_021006	GTC	2	6	240264	240269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532371
5021	NC_021006	TTC	2	6	240406	240411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532371
5022	NC_021006	T	6	6	240427	240432	0 %	100 %	0 %	0 %	480532371
5023	NC_021006	TTC	2	6	240436	240441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532371
5024	NC_021006	TTGA	2	8	240524	240531	25 %	50 %	25 %	0 %	480532371
5025	NC_021006	T	6	6	240605	240610	0 %	100 %	0 %	0 %	480532371
5026	NC_021006	TAG	2	6	240631	240636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532371
5027	NC_021006	TGT	2	6	240718	240723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532371
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5029	NC_021006	CTT	2	6	240783	240788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532371
5030	NC_021006	TAAG	2	8	240792	240799	50 %	25 %	25 %	0 %	480532371
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5033	NC_021006	TTC	2	6	240935	240940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532372
5034	NC_021006	CAT	2	6	240986	240991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532372
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5036	NC_021006	CAT	2	6	241103	241108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532372
5037	NC_021006	CAC	3	9	241171	241179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532372
5038	NC_021006	GAC	2	6	241276	241281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532372
5039	NC_021006	ATA	2	6	241320	241325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532372
5040	NC_021006	CAT	2	6	241468	241473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532372
5041	NC_021006	CCA	2	6	241477	241482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532372
5042	NC_021006	GA	3	6	241496	241501	50 %	0 %	50 %	0 %	480532372
5043	NC_021006	CT	3	6	241508	241513	0 %	50 %	0 %	50 %	480532372
5044	NC_021006	TTC	2	6	241574	241579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532372
5045	NC_021006	GACA	2	8	241753	241760	50 %	0 %	25 %	25 %	480532372
5046	NC_021006	TTAG	2	8	241842	241849	25 %	50 %	25 %	0 %	480532372
5047	NC_021006	TCA	2	6	242020	242025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532373
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5049	NC_021006	TAA	2	6	242228	242233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532373
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5051	NC_021006	CAC	2	6	242336	242341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532373
5052	NC_021006	ATG	2	6	242350	242355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532373
5053	NC_021006	TCT	2	6	242395	242400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532373
5054	NC_021006	T	6	6	242438	242443	0 %	100 %	0 %	0 %	480532373
5055	NC_021006	ATC	2	6	242578	242583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532373
5056	NC_021006	A	7	7	242605	242611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021006	TC	3	6	242617	242622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_021006	TAT	2	6	242623	242628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021006	TCC	2	6	242664	242669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_021006	TAT	2	6	242699	242704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021006	TAA	2	6	242757	242762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021006	AAT	2	6	242791	242796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021006	TTA	2	6	242874	242879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021006	TGAA	2	8	242915	242922	50 %	25 %	25 %	0 %	480532374
5065	NC_021006	ATT	2	6	242972	242977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532374
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5071	NC_021006	T	6	6	243300	243305	0 %	100 %	0 %	0 %	480532374
5072	NC_021006	TTG	2	6	243423	243428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532374
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5074	NC_021006	TGCCAA	2	12	243571	243582	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480532374
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5076	NC_021006	GTTA	2	8	243641	243648	25 %	50 %	25 %	0 %	480532374
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5081	NC_021006	GGC	2	6	243884	243889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480532374
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5091	NC_021006	CT	3	6	244479	244484	0 %	50 %	0 %	50 %	480532375
5092	NC_021006	TAT	2	6	244507	244512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532375
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5096	NC_021006	A	6	6	244632	244637	100 %	0 %	0 %	0 %	480532375
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5107	NC_021006	A	8	8	245233	245240	100 %	0 %	0 %	0 %	480532376
5108	NC_021006	CTG	2	6	245265	245270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532376
5109	NC_021006	TGA	2	6	245279	245284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532376
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5111	NC_021006	ATT	2	6	245424	245429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532376
5112	NC_021006	GAA	3	9	245430	245438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532376
5113	NC_021006	TCT	2	6	245475	245480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532376
5114	NC_021006	AGA	2	6	245528	245533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532376
5115	NC_021006	A	6	6	245661	245666	100 %	0 %	0 %	0 %	480532376
5116	NC_021006	CTC	2	6	245800	245805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532376
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5119	NC_021006	GAAA	2	8	245843	245850	75 %	0 %	25 %	0 %	480532376
5120	NC_021006	A	6	6	245919	245924	100 %	0 %	0 %	0 %	480532376
5121	NC_021006	ACC	2	6	245966	245971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532376
5122	NC_021006	ACT	2	6	246048	246053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_021006	TAG	2	6	246083	246088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021006	CAT	2	6	246120	246125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_021006	ATG	2	6	246151	246156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_021006	TAG	2	6	246186	246191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_021006	CA	3	6	252457	252462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5241	NC_021006	TGCC	2	8	252498	252505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5249	NC_021006	T	6	6	252947	252952	0 %	100 %	0 %	0 %	480532381
5250	NC_021006	CT	3	6	253011	253016	0 %	50 %	0 %	50 %	480532381
5251	NC_021006	ACA	2	6	253050	253055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532381
5252	NC_021006	GTC	2	6	253092	253097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532381
5253	NC_021006	TCT	2	6	253185	253190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532381
5254	NC_021006	T	7	7	253208	253214	0 %	100 %	0 %	0 %	480532381
5255	NC_021006	ATT	2	6	253224	253229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532381
5256	NC_021006	TCT	2	6	253274	253279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532382
5257	NC_021006	TTC	2	6	253306	253311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532382
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5261	NC_021006	AACT	2	8	253537	253544	50 %	25 %	0 %	25 %	480532382
5262	NC_021006	ATAC	2	8	253609	253616	50 %	25 %	0 %	25 %	480532382
5263	NC_021006	TCA	2	6	253691	253696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532382
5264	NC_021006	TCC	2	6	253771	253776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5265	NC_021006	CT	3	6	253788	253793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5266	NC_021006	GTTTT	2	10	253876	253885	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_021006	T	6	6	253882	253887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_021006	CTATA	2	10	253892	253901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5269	NC_021006	AGG	2	6	253923	253928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_021006	TAAA	2	8	253974	253981	75 %	25 %	0 %	0 %	480532383
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5279	NC_021006	AAC	2	6	254341	254346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5280	NC_021006	TTTA	2	8	254369	254376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_021006	TG	3	6	254401	254406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_021006	T	7	7	254442	254448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_021006	CTA	2	6	254466	254471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5288	NC_021006	CTTA	2	8	254657	254664	25 %	50 %	0 %	25 %	480532384
5289	NC_021006	GAG	2	6	254760	254765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532384
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5302	NC_021006	A	6	6	255547	255552	100 %	0 %	0 %	0 %	480532384
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5316	NC_021006	ATA	2	6	256131	256136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5317	NC_021006	T	6	6	256183	256188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5318	NC_021006	GGTG	2	8	256238	256245	0 %	25 %	75 %	0 %	480532385
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5350	NC_021006	CTTG	2	8	257779	257786	0 %	50 %	25 %	25 %	480532387
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5357	NC_021006	TGG	2	6	258253	258258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532387
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5360	NC_021006	A	6	6	258407	258412	100 %	0 %	0 %	0 %	480532387
5361	NC_021006	AAAT	2	8	258421	258428	75 %	25 %	0 %	0 %	480532387
5362	NC_021006	T	6	6	258471	258476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_021006	A	6	6	258529	258534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_021006	T	7	7	258550	258556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_021006	AAT	2	6	258683	258688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5366	NC_021006	TTC	2	6	258947	258952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532388
5367	NC_021006	GAAA	2	8	258986	258993	75 %	0 %	25 %	0 %	480532388
5368	NC_021006	G	8	8	258995	259002	0 %	0 %	100 %	0 %	480532388
5369	NC_021006	CTG	2	6	259009	259014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532388
5370	NC_021006	TTG	2	6	259054	259059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532388
5371	NC_021006	CCA	2	6	259107	259112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532388
5372	NC_021006	ATC	2	6	259131	259136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532388
5373	NC_021006	GTT	2	6	259221	259226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532388
5374	NC_021006	TGC	2	6	259238	259243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532388
5375	NC_021006	AAAAGG	2	12	259256	259267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532388
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5377	NC_021006	GGT	2	6	259305	259310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532388
5378	NC_021006	CTTGG	2	10	259329	259338	0 %	40 %	40 %	20 %	480532388
5379	NC_021006	GGT	2	6	259407	259412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532388
5380	NC_021006	CCTT	2	8	259600	259607	0 %	50 %	0 %	50 %	480532388
5381	NC_021006	TGG	2	6	259769	259774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532388
5382	NC_021006	TCA	2	6	259864	259869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532388
5383	NC_021006	CTTGGA	2	12	259890	259901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480532388
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5386	NC_021006	ATT	2	6	260082	260087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_021006	A	6	6	260094	260099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_021006	TCA	2	6	260169	260174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_021006	TCT	2	6	260212	260217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532389
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5406	NC_021006	ACAG	2	8	260985	260992	50 %	0 %	25 %	25 %	480532389
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5422	NC_021006	ATG	3	9	261459	261467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532389
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5437	NC_021006	TAT	2	6	262123	262128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5438	NC_021006	A	6	6	262132	262137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5439	NC_021006	AGCT	2	8	262272	262279	25 %	25 %	25 %	25 %	480532391
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5496	NC_021006	T	6	6	265044	265049	0 %	100 %	0 %	0 %	480532394
5497	NC_021006	AAC	2	6	265153	265158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532394
5498	NC_021006	ATG	2	6	265236	265241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532394
5499	NC_021006	CA	4	8	265364	265371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5500	NC_021006	A	6	6	265396	265401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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