MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021005	ATAA	2	8	123094	123101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021005	A	6	6	123100	123105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_021005	TTACT	2	10	123164	123173	20 %	60 %	0 %	20 %	480530466
2504	NC_021005	TGC	2	6	123208	123213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530466
2505	NC_021005	AATC	2	8	123234	123241	50 %	25 %	0 %	25 %	480530466
2506	NC_021005	AAC	2	6	123307	123312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530466
2507	NC_021005	GAA	2	6	123353	123358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530466
2508	NC_021005	GAA	2	6	123377	123382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530466
2509	NC_021005	AAG	2	6	123398	123403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530466
2510	NC_021005	TGTT	2	8	123405	123412	0 %	75 %	25 %	0 %	480530466
2511	NC_021005	AAGA	2	8	123419	123426	75 %	0 %	25 %	0 %	480530466
2512	NC_021005	ACA	2	6	123485	123490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530466
2513	NC_021005	CTT	2	6	123527	123532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530466
2514	NC_021005	AC	3	6	123555	123560	50 %	0 %	0 %	50 %	480530466
2515	NC_021005	ACA	2	6	123651	123656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530466
2516	NC_021005	GGA	2	6	123770	123775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530466
2517	NC_021005	TGGGA	2	10	123818	123827	20 %	20 %	60 %	0 %	480530466
2518	NC_021005	CGT	2	6	123956	123961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530466
2519	NC_021005	AGA	2	6	123973	123978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530466
2520	NC_021005	A	6	6	124048	124053	100 %	0 %	0 %	0 %	480530466
2521	NC_021005	AGCT	2	8	124214	124221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_021005	GCT	2	6	124226	124231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_021005	AT	3	6	124279	124284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_021005	GTTT	2	8	124337	124344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_021005	TGTA	2	8	124373	124380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_021005	T	6	6	124416	124421	0 %	100 %	0 %	0 %	480530467
2527	NC_021005	ATG	2	6	124513	124518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530467
2528	NC_021005	AT	3	6	124553	124558	50 %	50 %	0 %	0 %	480530467
2529	NC_021005	CTA	2	6	124647	124652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530467
2530	NC_021005	AGAC	2	8	124657	124664	50 %	0 %	25 %	25 %	480530467
2531	NC_021005	TGCTT	2	10	124691	124700	0 %	60 %	20 %	20 %	480530467
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2534	NC_021005	TGGCT	2	10	124874	124883	0 %	40 %	40 %	20 %	480530467
2535	NC_021005	GTGC	2	8	124899	124906	0 %	25 %	50 %	25 %	480530467
2536	NC_021005	GA	3	6	125015	125020	50 %	0 %	50 %	0 %	480530467
2537	NC_021005	TGG	2	6	125053	125058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530467
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2539	NC_021005	ACC	2	6	125185	125190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530467
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2542	NC_021005	T	6	6	125290	125295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_021005	A	6	6	125303	125308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021005	AAAG	2	8	125443	125450	75 %	0 %	25 %	0 %	480530468
2545	NC_021005	AGA	2	6	125497	125502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530468
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2548	NC_021005	CTTG	2	8	125565	125572	0 %	50 %	25 %	25 %	480530468
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2550	NC_021005	AG	3	6	125635	125640	50 %	0 %	50 %	0 %	480530468
2551	NC_021005	AAAG	2	8	125660	125667	75 %	0 %	25 %	0 %	480530468
2552	NC_021005	TTG	2	6	125723	125728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530468
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2555	NC_021005	CTA	2	6	125824	125829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530468
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2558	NC_021005	AGCT	2	8	125861	125868	25 %	25 %	25 %	25 %	480530468
2559	NC_021005	TGCT	2	8	125890	125897	0 %	50 %	25 %	25 %	480530468
2560	NC_021005	GATA	2	8	125926	125933	50 %	25 %	25 %	0 %	480530468
2561	NC_021005	TG	4	8	125989	125996	0 %	50 %	50 %	0 %	480530468
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2573	NC_021005	TTC	2	6	126407	126412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530468
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2575	NC_021005	CCT	2	6	126513	126518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_021005	TTAG	2	8	126521	126528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_021005	TAG	2	6	126544	126549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2606	NC_021005	T	7	7	127867	127873	0 %	100 %	0 %	0 %	480530470
2607	NC_021005	CTT	2	6	127906	127911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530470
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2610	NC_021005	ATG	2	6	128083	128088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530471
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2617	NC_021005	CCT	2	6	128385	128390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_021005	TA	4	8	128411	128418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_021005	ACAT	2	8	128429	128436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2620	NC_021005	AAAG	2	8	128447	128454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_021005	TA	4	8	128483	128490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_021005	A	6	6	128490	128495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_021005	TCA	2	6	128561	128566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530472
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2752	NC_021005	TGA	2	6	134874	134879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530477
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2755	NC_021005	TCC	2	6	134951	134956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530477
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