MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_021005	CGA	2	6	1249968	1249973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531467
25503	NC_021005	TCAT	2	8	1250000	1250007	25 %	50 %	0 %	25 %	480531467
25504	NC_021005	CT	3	6	1250093	1250098	0 %	50 %	0 %	50 %	480531467
25505	NC_021005	TTG	2	6	1250114	1250119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531467
25506	NC_021005	TC	3	6	1250169	1250174	0 %	50 %	0 %	50 %	480531467
25507	NC_021005	CAG	2	6	1250175	1250180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531467
25508	NC_021005	T	6	6	1250262	1250267	0 %	100 %	0 %	0 %	480531468
25509	NC_021005	TGCT	2	8	1250325	1250332	0 %	50 %	25 %	25 %	480531468
25510	NC_021005	TCCAG	2	10	1250334	1250343	20 %	20 %	20 %	40 %	480531468
25511	NC_021005	A	6	6	1250430	1250435	100 %	0 %	0 %	0 %	480531468
25512	NC_021005	T	6	6	1250576	1250581	0 %	100 %	0 %	0 %	480531468
25513	NC_021005	CAT	2	6	1250669	1250674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531468
25514	NC_021005	A	6	6	1250725	1250730	100 %	0 %	0 %	0 %	480531468
25515	NC_021005	TTC	2	6	1250768	1250773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531468
25516	NC_021005	ACC	2	6	1250793	1250798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531468
25517	NC_021005	CCAGA	2	10	1250822	1250831	40 %	0 %	20 %	40 %	480531468
25518	NC_021005	ATTTTC	2	12	1250961	1250972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480531468
25519	NC_021005	AAAT	2	8	1251005	1251012	75 %	25 %	0 %	0 %	480531469
25520	NC_021005	CT	3	6	1251044	1251049	0 %	50 %	0 %	50 %	480531469
25521	NC_021005	TTG	2	6	1251090	1251095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531469
25522	NC_021005	TCT	2	6	1251205	1251210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531469
25523	NC_021005	TCT	2	6	1251238	1251243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531469
25524	NC_021005	GAC	2	6	1251386	1251391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531469
25525	NC_021005	CGCT	2	8	1251441	1251448	0 %	25 %	25 %	50 %	480531469
25526	NC_021005	ATG	2	6	1251460	1251465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531469
25527	NC_021005	TCC	2	6	1251490	1251495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531469
25528	NC_021005	ATCCA	2	10	1251585	1251594	40 %	20 %	0 %	40 %	480531469
25529	NC_021005	AAATC	2	10	1251650	1251659	60 %	20 %	0 %	20 %	480531469
25530	NC_021005	TGT	2	6	1251668	1251673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531469
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25532	NC_021005	CGAT	2	8	1251694	1251701	25 %	25 %	25 %	25 %	480531469
25533	NC_021005	ATC	2	6	1251756	1251761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531469
25534	NC_021005	AGAC	2	8	1251869	1251876	50 %	0 %	25 %	25 %	480531469
25535	NC_021005	CCA	2	6	1251946	1251951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531469
25536	NC_021005	CAG	2	6	1252002	1252007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531469
25537	NC_021005	TGA	2	6	1252040	1252045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531469
25538	NC_021005	AAT	2	6	1252064	1252069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531469
25539	NC_021005	T	6	6	1252116	1252121	0 %	100 %	0 %	0 %	480531469
25540	NC_021005	ATT	2	6	1252132	1252137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25541	NC_021005	GTCC	2	8	1252188	1252195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25542	NC_021005	GATGGT	2	12	1252199	1252210	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25543	NC_021005	TTC	2	6	1252214	1252219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531470
25544	NC_021005	ATCA	2	8	1252226	1252233	50 %	25 %	0 %	25 %	480531470
25545	NC_021005	TCT	2	6	1252239	1252244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531470
25546	NC_021005	TCA	2	6	1252248	1252253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531470
25547	NC_021005	ATT	2	6	1252289	1252294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531470
25548	NC_021005	T	6	6	1252302	1252307	0 %	100 %	0 %	0 %	480531470
25549	NC_021005	TCT	2	6	1252473	1252478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531470
25550	NC_021005	ATC	2	6	1252484	1252489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531470
25551	NC_021005	T	6	6	1252612	1252617	0 %	100 %	0 %	0 %	480531471
25552	NC_021005	T	6	6	1252619	1252624	0 %	100 %	0 %	0 %	480531471
25553	NC_021005	TGA	2	6	1252691	1252696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531471
25554	NC_021005	ATC	2	6	1252805	1252810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531471
25555	NC_021005	CAA	2	6	1252832	1252837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531471
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25557	NC_021005	CAA	2	6	1252972	1252977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531471
25558	NC_021005	AT	3	6	1252980	1252985	50 %	50 %	0 %	0 %	480531471
25559	NC_021005	TCC	2	6	1253007	1253012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531472
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25563	NC_021005	CTT	2	6	1253371	1253376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531472
25564	NC_021005	TGA	2	6	1253458	1253463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531472
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25568	NC_021005	TAG	2	6	1253595	1253600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531472
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25571	NC_021005	CTT	2	6	1253683	1253688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531472
25572	NC_021005	TCGT	2	8	1253823	1253830	0 %	50 %	25 %	25 %	480531473
25573	NC_021005	GAATAC	2	12	1253927	1253938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480531473
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25577	NC_021005	AG	3	6	1254149	1254154	50 %	0 %	50 %	0 %	480531473
25578	NC_021005	CCCAT	2	10	1254274	1254283	20 %	20 %	0 %	60 %	480531473
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25584	NC_021005	TAG	2	6	1254577	1254582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531473
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25586	NC_021005	CAT	2	6	1254714	1254719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531473
25587	NC_021005	TCC	2	6	1254721	1254726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25588	NC_021005	TTC	2	6	1254737	1254742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25589	NC_021005	TC	3	6	1254741	1254746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25590	NC_021005	TAT	2	6	1254747	1254752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25591	NC_021005	AGG	2	6	1254763	1254768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25592	NC_021005	TATT	2	8	1254797	1254804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25593	NC_021005	TTTCA	2	10	1254835	1254844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25594	NC_021005	T	6	6	1254852	1254857	0 %	100 %	0 %	0 %	480531474
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25597	NC_021005	ATTC	2	8	1254992	1254999	25 %	50 %	0 %	25 %	480531474
25598	NC_021005	TAC	2	6	1255005	1255010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531474
25599	NC_021005	T	7	7	1255022	1255028	0 %	100 %	0 %	0 %	480531474
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25601	NC_021005	T	6	6	1255109	1255114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25602	NC_021005	T	6	6	1255158	1255163	0 %	100 %	0 %	0 %	480531475
25603	NC_021005	TAAGC	2	10	1255174	1255183	40 %	20 %	20 %	20 %	480531475
25604	NC_021005	GAT	2	6	1255198	1255203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531475
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25606	NC_021005	AAT	2	6	1255312	1255317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531475
25607	NC_021005	TTGGG	2	10	1255360	1255369	0 %	40 %	60 %	0 %	480531475
25608	NC_021005	AAG	2	6	1255388	1255393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531475
25609	NC_021005	TAG	2	6	1255410	1255415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531475
25610	NC_021005	CTA	2	6	1255428	1255433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531475
25611	NC_021005	CTTCAG	2	12	1255554	1255565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480531475
25612	NC_021005	CTTT	2	8	1255595	1255602	0 %	75 %	0 %	25 %	480531475
25613	NC_021005	TCA	2	6	1255682	1255687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531475
25614	NC_021005	CAA	2	6	1255728	1255733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531475
25615	NC_021005	TAA	2	6	1255857	1255862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531475
25616	NC_021005	TCC	2	6	1255877	1255882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25617	NC_021005	TATT	2	8	1255894	1255901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25619	NC_021005	AGAA	2	8	1256001	1256008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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25990	NC_021005	TCAT	2	8	1273027	1273034	25 %	50 %	0 %	25 %	480531487
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25993	NC_021005	AGA	2	6	1273233	1273238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531487
25994	NC_021005	GAAG	2	8	1273324	1273331	50 %	0 %	50 %	0 %	480531487
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26000	NC_021005	AATTGC	2	12	1273596	1273607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480531487

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