MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021005	ATT	2	6	45997	46002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530403
1002	NC_021005	TGC	3	9	46020	46028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530403
1003	NC_021005	TGC	2	6	46032	46037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530403
1004	NC_021005	TTG	2	6	46040	46045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530403
1005	NC_021005	GTT	2	6	46180	46185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530403
1006	NC_021005	TGG	2	6	46189	46194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530403
1007	NC_021005	TCA	2	6	46256	46261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530403
1008	NC_021005	GCTG	2	8	46297	46304	0 %	25 %	50 %	25 %	480530403
1009	NC_021005	ACA	2	6	46327	46332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530403
1010	NC_021005	ATC	2	6	46342	46347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530403
1011	NC_021005	GTT	2	6	46354	46359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530403
1012	NC_021005	CAAT	2	8	46367	46374	50 %	25 %	0 %	25 %	480530403
1013	NC_021005	TTC	2	6	46689	46694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530403
1014	NC_021005	GAAT	2	8	46874	46881	50 %	25 %	25 %	0 %	480530403
1015	NC_021005	TAA	2	6	46884	46889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530403
1016	NC_021005	TGGT	2	8	46895	46902	0 %	50 %	50 %	0 %	480530403
1017	NC_021005	ACCA	2	8	46995	47002	50 %	0 %	0 %	50 %	480530403
1018	NC_021005	CATTAC	2	12	47007	47018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530403
1019	NC_021005	AGA	2	6	47034	47039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530403
1020	NC_021005	TGA	2	6	47061	47066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530403
1021	NC_021005	GAG	2	6	47114	47119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530403
1022	NC_021005	GA	3	6	47221	47226	50 %	0 %	50 %	0 %	480530404
1023	NC_021005	TGG	2	6	47249	47254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530404
1024	NC_021005	AACA	2	8	47280	47287	75 %	0 %	0 %	25 %	480530404
1025	NC_021005	GAA	2	6	47337	47342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530404
1026	NC_021005	AG	3	6	47390	47395	50 %	0 %	50 %	0 %	480530404
1027	NC_021005	AAC	2	6	47408	47413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530404
1028	NC_021005	GAA	2	6	47451	47456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530404
1029	NC_021005	AAG	2	6	47543	47548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530404
1030	NC_021005	GGTCA	2	10	47640	47649	20 %	20 %	40 %	20 %	480530404
1031	NC_021005	AAT	2	6	47688	47693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530404
1032	NC_021005	ACA	3	9	47715	47723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530404
1033	NC_021005	GTT	2	6	47790	47795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530404
1034	NC_021005	GAAA	2	8	47930	47937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021005	AAG	2	6	48007	48012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021005	GAT	2	6	48120	48125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021005	CA	3	6	48143	48148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_021005	TCG	2	6	48319	48324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530405
1039	NC_021005	AGA	2	6	48373	48378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530405
1040	NC_021005	GTG	2	6	48382	48387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530405
1041	NC_021005	GTG	2	6	48394	48399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530405
1042	NC_021005	TTA	2	6	48403	48408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530405
1043	NC_021005	A	6	6	48443	48448	100 %	0 %	0 %	0 %	480530405
1044	NC_021005	TGT	2	6	48458	48463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530405
1045	NC_021005	AAC	2	6	48588	48593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530405
1046	NC_021005	AGA	2	6	48803	48808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530405
1047	NC_021005	TC	3	6	48814	48819	0 %	50 %	0 %	50 %	480530405
1048	NC_021005	GAT	2	6	48828	48833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530405
1049	NC_021005	TGG	2	6	48845	48850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530405
1050	NC_021005	TGG	2	6	48863	48868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530405
1051	NC_021005	GAA	2	6	49029	49034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530405
1052	NC_021005	AG	3	6	49039	49044	50 %	0 %	50 %	0 %	480530405
1053	NC_021005	ATCA	2	8	49059	49066	50 %	25 %	0 %	25 %	480530405
1054	NC_021005	GAAA	2	8	49097	49104	75 %	0 %	25 %	0 %	480530405
1055	NC_021005	AGT	2	6	49146	49151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530405
1056	NC_021005	AAGC	2	8	49296	49303	50 %	0 %	25 %	25 %	480530405
1057	NC_021005	CAAG	2	8	49325	49332	50 %	0 %	25 %	25 %	480530405
1058	NC_021005	CTGG	2	8	49362	49369	0 %	25 %	50 %	25 %	480530405
1059	NC_021005	AAGC	2	8	49524	49531	50 %	0 %	25 %	25 %	480530405
1060	NC_021005	CAAG	2	8	49553	49560	50 %	0 %	25 %	25 %	480530405
1061	NC_021005	CTGG	2	8	49590	49597	0 %	25 %	50 %	25 %	480530405
1062	NC_021005	AAGC	2	8	49752	49759	50 %	0 %	25 %	25 %	480530405
1063	NC_021005	CAAG	2	8	49781	49788	50 %	0 %	25 %	25 %	480530405
1064	NC_021005	CTGG	2	8	49818	49825	0 %	25 %	50 %	25 %	480530405
1065	NC_021005	GAC	3	9	49856	49864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530405
1066	NC_021005	GAG	2	6	49935	49940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530405
1067	NC_021005	CT	3	6	49941	49946	0 %	50 %	0 %	50 %	480530405
1068	NC_021005	CTA	2	6	50053	50058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1069	NC_021005	AGTA	2	8	50070	50077	50 %	25 %	25 %	0 %	480530405
1070	NC_021005	AAT	2	6	50246	50251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530405
1071	NC_021005	GTT	2	6	50381	50386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530405
1072	NC_021005	AAG	2	6	50398	50403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530405
1073	NC_021005	TTTGGA	2	12	50410	50421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480530405
1074	NC_021005	CTT	2	6	50452	50457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530405
1075	NC_021005	AAC	2	6	50515	50520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530405
1076	NC_021005	CTCG	2	8	50528	50535	0 %	25 %	25 %	50 %	480530405
1077	NC_021005	CTGA	2	8	50553	50560	25 %	25 %	25 %	25 %	480530405
1078	NC_021005	CTCA	2	8	50588	50595	25 %	25 %	0 %	50 %	480530405
1079	NC_021005	CTG	2	6	50602	50607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530405
1080	NC_021005	GACA	2	8	50639	50646	50 %	0 %	25 %	25 %	480530405
1081	NC_021005	GAA	2	6	50784	50789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530405
1082	NC_021005	AAC	2	6	50910	50915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530405
1083	NC_021005	A	6	6	51062	51067	100 %	0 %	0 %	0 %	480530405
1084	NC_021005	GGTA	2	8	51111	51118	25 %	25 %	50 %	0 %	480530405
1085	NC_021005	AT	3	6	51140	51145	50 %	50 %	0 %	0 %	480530405
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1088	NC_021005	ATT	2	6	51197	51202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530405
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1090	NC_021005	GACA	2	8	51467	51474	50 %	0 %	25 %	25 %	480530405
1091	NC_021005	GAA	2	6	51612	51617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530405
1092	NC_021005	AAC	2	6	51738	51743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530405
1093	NC_021005	A	6	6	51890	51895	100 %	0 %	0 %	0 %	480530405
1094	NC_021005	GGTA	2	8	51939	51946	25 %	25 %	50 %	0 %	480530405
1095	NC_021005	AT	3	6	51968	51973	50 %	50 %	0 %	0 %	480530405
1096	NC_021005	ACT	2	6	51988	51993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1097	NC_021005	A	6	6	51997	52002	100 %	0 %	0 %	0 %	480530405
1098	NC_021005	CAT	2	6	52024	52029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1099	NC_021005	TCA	2	6	52144	52149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1100	NC_021005	TAAA	2	8	52222	52229	75 %	25 %	0 %	0 %	480530405
1101	NC_021005	GAG	2	6	52269	52274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530405
1102	NC_021005	CAG	2	6	52291	52296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530405
1103	NC_021005	AAG	2	6	52342	52347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530405
1104	NC_021005	ATCA	2	8	52359	52366	50 %	25 %	0 %	25 %	480530405
1105	NC_021005	GCTA	2	8	52419	52426	25 %	25 %	25 %	25 %	480530405
1106	NC_021005	ACT	2	6	52473	52478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1107	NC_021005	ACT	2	6	52548	52553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1108	NC_021005	TAA	2	6	52586	52591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530405
1109	NC_021005	ACAA	2	8	52638	52645	75 %	0 %	0 %	25 %	480530405
1110	NC_021005	CAAA	2	8	52693	52700	75 %	0 %	0 %	25 %	480530405
1111	NC_021005	ACT	2	6	52758	52763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1112	NC_021005	TTG	2	6	52914	52919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530405
1113	NC_021005	AAT	2	6	53016	53021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530405
1114	NC_021005	GAA	2	6	53102	53107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530405
1115	NC_021005	TA	3	6	53284	53289	50 %	50 %	0 %	0 %	480530405
1116	NC_021005	AACT	2	8	53383	53390	50 %	25 %	0 %	25 %	480530405
1117	NC_021005	ATC	2	6	53430	53435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1118	NC_021005	AATC	2	8	53441	53448	50 %	25 %	0 %	25 %	480530405
1119	NC_021005	TTG	2	6	53473	53478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530405
1120	NC_021005	GA	3	6	53500	53505	50 %	0 %	50 %	0 %	480530405
1121	NC_021005	TCA	2	6	53524	53529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1122	NC_021005	TGC	2	6	53636	53641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530405
1123	NC_021005	TTA	2	6	53644	53649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530405
1124	NC_021005	TCT	2	6	53701	53706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530405
1125	NC_021005	CTA	2	6	53707	53712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
1126	NC_021005	AGG	2	6	53858	53863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530405
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1128	NC_021005	TAC	2	6	54038	54043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530405
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1252	NC_021005	TCT	2	6	59547	59552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1284	NC_021005	CT	3	6	61531	61536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1286	NC_021005	AAG	2	6	61596	61601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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