MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021005	CGT	2	6	23151	23156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530364
502	NC_021005	GGTT	2	8	23160	23167	0 %	50 %	50 %	0 %	480530364
503	NC_021005	CGT	2	6	23193	23198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530364
504	NC_021005	CTTT	2	8	23217	23224	0 %	75 %	0 %	25 %	480530364
505	NC_021005	TG	3	6	23268	23273	0 %	50 %	50 %	0 %	480530364
506	NC_021005	ACT	2	6	23302	23307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530364
507	NC_021005	CTAT	2	8	23344	23351	25 %	50 %	0 %	25 %	480530364
508	NC_021005	AGA	2	6	23372	23377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530364
509	NC_021005	TCG	2	6	23432	23437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530364
510	NC_021005	TTGG	2	8	23448	23455	0 %	50 %	50 %	0 %	480530364
511	NC_021005	AACA	2	8	23494	23501	75 %	0 %	0 %	25 %	480530364
512	NC_021005	AAG	2	6	23580	23585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021005	CCT	2	6	23587	23592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_021005	TTG	2	6	23596	23601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021005	CTTTT	2	10	23618	23627	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
516	NC_021005	ATA	2	6	23630	23635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021005	T	6	6	23667	23672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021005	AAT	2	6	23707	23712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021005	T	7	7	23765	23771	0 %	100 %	0 %	0 %	480530365
520	NC_021005	TGT	2	6	23797	23802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530365
521	NC_021005	AAT	2	6	23902	23907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530365
522	NC_021005	GAA	2	6	23920	23925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530365
523	NC_021005	CAT	2	6	23932	23937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530365
524	NC_021005	TTCA	2	8	23965	23972	25 %	50 %	0 %	25 %	480530365
525	NC_021005	TGA	2	6	24006	24011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530365
526	NC_021005	ACC	2	6	24013	24018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530365
527	NC_021005	TA	3	6	24034	24039	50 %	50 %	0 %	0 %	480530365
528	NC_021005	ATA	2	6	24103	24108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530365
529	NC_021005	ATC	2	6	24127	24132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530365
530	NC_021005	CCT	2	6	24170	24175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530365
531	NC_021005	TCT	2	6	24338	24343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530365
532	NC_021005	GCA	2	6	24392	24397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530365
533	NC_021005	CAT	2	6	24465	24470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530365
534	NC_021005	TTA	2	6	24611	24616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530365
535	NC_021005	GTA	2	6	24634	24639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530365
536	NC_021005	TTCTTG	2	12	24730	24741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	480530365
537	NC_021005	TTG	2	6	24745	24750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530365
538	NC_021005	ACTTTT	2	12	24799	24810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480530365
539	NC_021005	T	6	6	24807	24812	0 %	100 %	0 %	0 %	480530365
540	NC_021005	T	7	7	24816	24822	0 %	100 %	0 %	0 %	480530365
541	NC_021005	GAA	2	6	24829	24834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530365
542	NC_021005	A	6	6	24833	24838	100 %	0 %	0 %	0 %	480530365
543	NC_021005	TAT	2	6	24906	24911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530365
544	NC_021005	T	6	6	25086	25091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021005	TAA	2	6	25167	25172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530366
546	NC_021005	T	6	6	25182	25187	0 %	100 %	0 %	0 %	480530366
547	NC_021005	CAA	2	6	25214	25219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530366
548	NC_021005	CAA	2	6	25238	25243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530366
549	NC_021005	GT	3	6	25255	25260	0 %	50 %	50 %	0 %	480530366
550	NC_021005	ACC	2	6	25284	25289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530366
551	NC_021005	GCA	2	6	25297	25302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530366
552	NC_021005	CTT	2	6	25313	25318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530366
553	NC_021005	TGC	2	6	25389	25394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530366
554	NC_021005	TCT	3	9	25399	25407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530366
555	NC_021005	GATA	2	8	25415	25422	50 %	25 %	25 %	0 %	480530366
556	NC_021005	T	6	6	25446	25451	0 %	100 %	0 %	0 %	480530366
557	NC_021005	A	6	6	25507	25512	100 %	0 %	0 %	0 %	480530366
558	NC_021005	AATC	2	8	25557	25564	50 %	25 %	0 %	25 %	480530366
559	NC_021005	TAT	2	6	25700	25705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530366
560	NC_021005	CAA	2	6	25799	25804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530366
561	NC_021005	ATC	2	6	25881	25886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530366
562	NC_021005	TTC	3	9	25890	25898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530366
563	NC_021005	GATT	2	8	25901	25908	25 %	50 %	25 %	0 %	480530366
564	NC_021005	CAA	2	6	25925	25930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530366
565	NC_021005	AACA	2	8	25964	25971	75 %	0 %	0 %	25 %	480530366
566	NC_021005	GTA	2	6	26103	26108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530367
567	NC_021005	GAT	2	6	26174	26179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530367
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571	NC_021005	T	6	6	26289	26294	0 %	100 %	0 %	0 %	480530367
572	NC_021005	TTA	2	6	26302	26307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530367
573	NC_021005	TCA	2	6	26350	26355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530367
574	NC_021005	CTT	2	6	26447	26452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530368
575	NC_021005	GAT	2	6	26478	26483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530368
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578	NC_021005	CAT	2	6	26520	26525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530368
579	NC_021005	TTC	2	6	26541	26546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530368
580	NC_021005	AAT	2	6	26624	26629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530368
581	NC_021005	AGT	2	6	26645	26650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530368
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583	NC_021005	CTA	2	6	26713	26718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530368
584	NC_021005	TTC	2	6	26730	26735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530368
585	NC_021005	T	6	6	26780	26785	0 %	100 %	0 %	0 %	480530368
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587	NC_021005	ATT	2	6	26891	26896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021005	A	6	6	26929	26934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021005	TAG	2	6	26987	26992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_021005	T	6	6	27065	27070	0 %	100 %	0 %	0 %	480530369
592	NC_021005	AGG	2	6	27074	27079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530369
593	NC_021005	A	6	6	27117	27122	100 %	0 %	0 %	0 %	480530369
594	NC_021005	TAG	2	6	27154	27159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530369
595	NC_021005	A	6	6	27160	27165	100 %	0 %	0 %	0 %	480530369
596	NC_021005	TCT	2	6	27377	27382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530370
597	NC_021005	TCC	2	6	27408	27413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_021005	ATT	2	6	27459	27464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021005	AGG	2	6	27508	27513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021005	ATC	2	6	27530	27535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530371
601	NC_021005	TCA	2	6	27552	27557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530371
602	NC_021005	AGCC	2	8	27613	27620	25 %	0 %	25 %	50 %	480530371
603	NC_021005	GAA	2	6	27655	27660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530371
604	NC_021005	TTGA	2	8	27721	27728	25 %	50 %	25 %	0 %	480530372
605	NC_021005	CAT	2	6	27773	27778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530372
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607	NC_021005	CAT	2	6	27991	27996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021005	AGG	2	6	28092	28097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021005	ATGA	2	8	28104	28111	50 %	25 %	25 %	0 %	480530373
610	NC_021005	TGT	2	6	28130	28135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530373
611	NC_021005	AATC	2	8	28139	28146	50 %	25 %	0 %	25 %	480530373
612	NC_021005	TAC	2	6	28167	28172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530373
613	NC_021005	A	6	6	28190	28195	100 %	0 %	0 %	0 %	480530373
614	NC_021005	A	7	7	28212	28218	100 %	0 %	0 %	0 %	480530373
615	NC_021005	GAT	2	6	28224	28229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530373
616	NC_021005	AAAT	2	8	28247	28254	75 %	25 %	0 %	0 %	480530373
617	NC_021005	T	6	6	28266	28271	0 %	100 %	0 %	0 %	480530374
618	NC_021005	T	6	6	28290	28295	0 %	100 %	0 %	0 %	480530374
619	NC_021005	TTTG	2	8	28304	28311	0 %	75 %	25 %	0 %	480530374
620	NC_021005	TCAT	2	8	28387	28394	25 %	50 %	0 %	25 %	480530374
621	NC_021005	GT	3	6	28492	28497	0 %	50 %	50 %	0 %	480530374
622	NC_021005	TGT	3	9	28495	28503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530374
623	NC_021005	TATC	2	8	28511	28518	25 %	50 %	0 %	25 %	480530374
624	NC_021005	AT	3	6	28612	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	480530374
625	NC_021005	ATT	2	6	28633	28638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530374
626	NC_021005	AAG	2	6	28767	28772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530375
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631	NC_021005	CT	3	6	28957	28962	0 %	50 %	0 %	50 %	480530375
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