MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021005	GAA	2	6	291262	291267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530628
6002	NC_021005	TGA	2	6	291311	291316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530628
6003	NC_021005	TGGA	2	8	291320	291327	25 %	25 %	50 %	0 %	480530628
6004	NC_021005	TTG	2	6	291355	291360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530628
6005	NC_021005	GGA	2	6	291432	291437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530628
6006	NC_021005	A	6	6	291598	291603	100 %	0 %	0 %	0 %	480530628
6007	NC_021005	AAAC	2	8	291610	291617	75 %	0 %	0 %	25 %	480530628
6008	NC_021005	GAA	2	6	291681	291686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530628
6009	NC_021005	AGC	2	6	291712	291717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530629
6010	NC_021005	GTAT	2	8	291795	291802	25 %	50 %	25 %	0 %	480530629
6011	NC_021005	T	6	6	291810	291815	0 %	100 %	0 %	0 %	480530629
6012	NC_021005	CAG	2	6	291831	291836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530629
6013	NC_021005	ATT	2	6	291863	291868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530629
6014	NC_021005	ATA	2	6	291873	291878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530629
6015	NC_021005	TGG	2	6	291879	291884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530629
6016	NC_021005	TG	3	6	291912	291917	0 %	50 %	50 %	0 %	480530629
6017	NC_021005	CTT	2	6	291925	291930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530629
6018	NC_021005	A	6	6	292022	292027	100 %	0 %	0 %	0 %	480530629
6019	NC_021005	GTG	2	6	292140	292145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530629
6020	NC_021005	GAC	2	6	292171	292176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530629
6021	NC_021005	ATCCT	2	10	292385	292394	20 %	40 %	0 %	40 %	480530630
6022	NC_021005	CAG	2	6	292460	292465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530630
6023	NC_021005	GAC	2	6	292468	292473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530630
6024	NC_021005	TTGA	2	8	292499	292506	25 %	50 %	25 %	0 %	480530630
6025	NC_021005	TGG	2	6	292524	292529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530630
6026	NC_021005	A	6	6	292580	292585	100 %	0 %	0 %	0 %	480530630
6027	NC_021005	CGC	2	6	292637	292642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480530630
6028	NC_021005	AAGC	2	8	292700	292707	50 %	0 %	25 %	25 %	480530630
6029	NC_021005	GTGGA	2	10	292779	292788	20 %	20 %	60 %	0 %	480530630
6030	NC_021005	GA	3	6	292891	292896	50 %	0 %	50 %	0 %	480530630
6031	NC_021005	TGAT	2	8	292917	292924	25 %	50 %	25 %	0 %	480530630
6032	NC_021005	GGA	2	6	292942	292947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530630
6033	NC_021005	GAC	2	6	292964	292969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530630
6034	NC_021005	ATCC	2	8	293045	293052	25 %	25 %	0 %	50 %	480530630
6035	NC_021005	AAC	2	6	293061	293066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530630
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6038	NC_021005	TCT	2	6	293162	293167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530631
6039	NC_021005	GAG	2	6	293170	293175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530631
6040	NC_021005	TTA	2	6	293309	293314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530631
6041	NC_021005	TTC	3	9	293332	293340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530631
6042	NC_021005	T	6	6	293354	293359	0 %	100 %	0 %	0 %	480530631
6043	NC_021005	GAT	2	6	293371	293376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530631
6044	NC_021005	ATG	2	6	293393	293398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530631
6045	NC_021005	TCA	2	6	293399	293404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530631
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6047	NC_021005	CTTT	2	8	293475	293482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_021005	T	6	6	293528	293533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021005	TA	3	6	293621	293626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021005	TAG	2	6	293703	293708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021005	GGAA	2	8	293765	293772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021005	TA	4	8	293801	293808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021005	AACAA	2	10	293821	293830	80 %	0 %	0 %	20 %	480530632
6054	NC_021005	AGT	2	6	293913	293918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530632
6055	NC_021005	A	6	6	293937	293942	100 %	0 %	0 %	0 %	480530632
6056	NC_021005	CA	3	6	293960	293965	50 %	0 %	0 %	50 %	480530632
6057	NC_021005	A	6	6	294022	294027	100 %	0 %	0 %	0 %	480530632
6058	NC_021005	CTA	2	6	294042	294047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530632
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6060	NC_021005	ACC	2	6	294059	294064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530632
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6062	NC_021005	CA	3	6	294152	294157	50 %	0 %	0 %	50 %	480530632
6063	NC_021005	TTG	2	6	294197	294202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530632
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6076	NC_021005	TCTTGT	2	12	294890	294901	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6079	NC_021005	A	6	6	294996	295001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6089	NC_021005	TA	3	6	295342	295347	50 %	50 %	0 %	0 %	480530634
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6097	NC_021005	ACT	2	6	295597	295602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530635
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6105	NC_021005	ATC	2	6	295790	295795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530635
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6107	NC_021005	CT	3	6	295851	295856	0 %	50 %	0 %	50 %	480530635
6108	NC_021005	TGA	2	6	295884	295889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530635
6109	NC_021005	GAA	2	6	295903	295908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530635
6110	NC_021005	TGA	2	6	295935	295940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530635
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6114	NC_021005	AAT	2	6	296125	296130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530635
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6120	NC_021005	AGA	2	6	296592	296597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530635
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6122	NC_021005	TTG	2	6	296711	296716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530635
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