MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021005	TTG	2	6	267972	267977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530608
5503	NC_021005	TCTT	2	8	268044	268051	0 %	75 %	0 %	25 %	480530608
5504	NC_021005	TTC	2	6	268142	268147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530608
5505	NC_021005	T	6	6	268154	268159	0 %	100 %	0 %	0 %	480530608
5506	NC_021005	AGT	2	6	268174	268179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530608
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5509	NC_021005	AGT	2	6	268232	268237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530608
5510	NC_021005	GCA	2	6	268290	268295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530608
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5512	NC_021005	TCT	2	6	268323	268328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530608
5513	NC_021005	GAA	2	6	268362	268367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530608
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5516	NC_021005	TGT	2	6	268438	268443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530608
5517	NC_021005	TGGT	2	8	268456	268463	0 %	50 %	50 %	0 %	480530608
5518	NC_021005	TCG	2	6	268470	268475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530608
5519	NC_021005	GCAA	2	8	268500	268507	50 %	0 %	25 %	25 %	480530608
5520	NC_021005	T	7	7	268573	268579	0 %	100 %	0 %	0 %	480530608
5521	NC_021005	CAAT	2	8	268617	268624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_021005	GTA	2	6	268648	268653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021005	A	7	7	268686	268692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021005	TA	3	6	268725	268730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021005	AAGCC	2	10	268764	268773	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5526	NC_021005	TAT	2	6	268775	268780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021005	GAT	2	6	268787	268792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5529	NC_021005	ACAA	2	8	268860	268867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_021005	AAT	2	6	268884	268889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021005	TC	3	6	268912	268917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_021005	AC	3	6	268957	268962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_021005	GAT	2	6	268964	268969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021005	ATC	2	6	268986	268991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_021005	A	7	7	269001	269007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021005	A	6	6	269116	269121	100 %	0 %	0 %	0 %	480530609
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5563	NC_021005	TTA	2	6	270292	270297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5597	NC_021005	CAAGA	2	10	271605	271614	60 %	0 %	20 %	20 %	480530611
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5620	NC_021005	TAG	2	6	272508	272513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5624	NC_021005	CTG	2	6	272579	272584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530612
5625	NC_021005	AAAG	2	8	272712	272719	75 %	0 %	25 %	0 %	480530612
5626	NC_021005	GAA	2	6	272728	272733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530612
5627	NC_021005	CTA	2	6	272811	272816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530612
5628	NC_021005	TATT	2	8	272906	272913	25 %	75 %	0 %	0 %	480530612
5629	NC_021005	AAG	2	6	272947	272952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530612
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5654	NC_021005	AGGT	2	8	274409	274416	25 %	25 %	50 %	0 %	480530612
5655	NC_021005	A	6	6	274419	274424	100 %	0 %	0 %	0 %	480530612
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5664	NC_021005	TGGT	2	8	275222	275229	0 %	50 %	50 %	0 %	480530612
5665	NC_021005	CT	4	8	275291	275298	0 %	50 %	0 %	50 %	480530612
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5685	NC_021005	TAA	2	6	276333	276338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530612
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5699	NC_021005	GTTT	2	8	276905	276912	0 %	75 %	25 %	0 %	480530612
5700	NC_021005	GTT	2	6	276918	276923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530612
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5702	NC_021005	TAA	2	6	276937	276942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5703	NC_021005	CTTT	2	8	276986	276993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5714	NC_021005	AAG	2	6	277620	277625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530615
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5732	NC_021005	TCAG	2	8	278747	278754	25 %	25 %	25 %	25 %	480530616
5733	NC_021005	CTT	2	6	278762	278767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530616
5734	NC_021005	GTT	2	6	278832	278837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530616
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5737	NC_021005	TAT	2	6	279176	279181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530617
5738	NC_021005	T	6	6	279217	279222	0 %	100 %	0 %	0 %	480530617
5739	NC_021005	AT	3	6	279350	279355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_021005	AGG	2	6	279412	279417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5741	NC_021005	CCT	2	6	279434	279439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5742	NC_021005	TGATA	2	10	279442	279451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5743	NC_021005	A	6	6	279555	279560	100 %	0 %	0 %	0 %	480530618
5744	NC_021005	TGA	2	6	279584	279589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530618
5745	NC_021005	A	6	6	279589	279594	100 %	0 %	0 %	0 %	480530618
5746	NC_021005	CTA	2	6	279644	279649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530618
5747	NC_021005	ATG	2	6	279651	279656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530618
5748	NC_021005	TTG	2	6	279717	279722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530618
5749	NC_021005	AAT	2	6	279801	279806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530618
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5752	NC_021005	TCA	2	6	280025	280030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530618
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5757	NC_021005	T	6	6	280340	280345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5860	NC_021005	A	7	7	284625	284631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5861	NC_021005	A	6	6	284647	284652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5862	NC_021005	A	6	6	284655	284660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5863	NC_021005	GAG	2	6	284695	284700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5864	NC_021005	A	6	6	284732	284737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5865	NC_021005	GAA	2	6	284742	284747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5866	NC_021005	ATTAG	2	10	284774	284783	40 %	40 %	20 %	0 %	480530623
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5868	NC_021005	TCT	2	6	284853	284858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530623
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5995	NC_021005	AGCAG	2	10	290928	290937	40 %	0 %	40 %	20 %	480530628
5996	NC_021005	TAT	2	6	290946	290951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530628
5997	NC_021005	TCA	2	6	291072	291077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530628
5998	NC_021005	GTG	2	6	291085	291090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530628
5999	NC_021005	AAG	2	6	291212	291217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530628
6000	NC_021005	AGCA	2	8	291231	291238	50 %	0 %	25 %	25 %	480530628

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