MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021005	T	6	6	241733	241738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021005	TA	3	6	241766	241771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021005	TGT	2	6	241789	241794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021005	TAT	2	6	241812	241817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021005	A	6	6	241865	241870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021005	GAG	2	6	241890	241895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021005	ATT	2	6	241908	241913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530592
5008	NC_021005	ACA	2	6	241964	241969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530592
5009	NC_021005	GAA	3	9	242019	242027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530592
5010	NC_021005	GCC	2	6	242043	242048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480530592
5011	NC_021005	TTA	2	6	242049	242054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530592
5012	NC_021005	ACAA	2	8	242069	242076	75 %	0 %	0 %	25 %	480530592
5013	NC_021005	CT	3	6	242122	242127	0 %	50 %	0 %	50 %	480530592
5014	NC_021005	TTCA	2	8	242131	242138	25 %	50 %	0 %	25 %	480530592
5015	NC_021005	ATC	2	6	242143	242148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530592
5016	NC_021005	TTAAT	2	10	242170	242179	40 %	60 %	0 %	0 %	480530592
5017	NC_021005	ATT	2	6	242187	242192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530592
5018	NC_021005	A	6	6	242214	242219	100 %	0 %	0 %	0 %	480530592
5019	NC_021005	TAT	2	6	242231	242236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021005	TTA	2	6	242242	242247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021005	AGG	2	6	242254	242259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021005	GTTT	2	8	242281	242288	0 %	75 %	25 %	0 %	480530593
5023	NC_021005	GCA	2	6	242292	242297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530593
5024	NC_021005	ATA	2	6	242323	242328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530593
5025	NC_021005	GAT	2	6	242507	242512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530593
5026	NC_021005	A	6	6	242535	242540	100 %	0 %	0 %	0 %	480530593
5027	NC_021005	TAT	2	6	242589	242594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530594
5028	NC_021005	GATG	2	8	242601	242608	25 %	25 %	50 %	0 %	480530594
5029	NC_021005	GAT	2	6	242628	242633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530594
5030	NC_021005	AGT	2	6	242700	242705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530594
5031	NC_021005	TAT	2	6	242826	242831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530594
5032	NC_021005	TATCTG	2	12	242909	242920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480530594
5033	NC_021005	ATC	2	6	242940	242945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530594
5034	NC_021005	GTTTG	2	10	242992	243001	0 %	60 %	40 %	0 %	480530594
5035	NC_021005	GTA	2	6	243040	243045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530594
5036	NC_021005	CTT	2	6	243060	243065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530594
5037	NC_021005	TTA	2	6	243083	243088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530594
5038	NC_021005	TCT	2	6	243163	243168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530594
5039	NC_021005	TA	3	6	243176	243181	50 %	50 %	0 %	0 %	480530594
5040	NC_021005	TGG	2	6	243313	243318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530594
5041	NC_021005	GTA	2	6	243340	243345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530594
5042	NC_021005	AGT	2	6	243351	243356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530594
5043	NC_021005	TAA	2	6	243387	243392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530594
5044	NC_021005	CAA	2	6	243448	243453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530594
5045	NC_021005	GCA	2	6	243523	243528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530594
5046	NC_021005	TGG	2	6	243767	243772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530594
5047	NC_021005	TTA	2	6	243799	243804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530594
5048	NC_021005	TG	3	6	243899	243904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021005	CA	3	6	243918	243923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_021005	AG	3	6	243939	243944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021005	TAT	2	6	243991	243996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021005	GAAA	2	8	244003	244010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021005	GAAA	2	8	244024	244031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021005	AAC	2	6	244065	244070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530595
5055	NC_021005	TAAA	2	8	244133	244140	75 %	25 %	0 %	0 %	480530595
5056	NC_021005	A	6	6	244138	244143	100 %	0 %	0 %	0 %	480530595
5057	NC_021005	GA	3	6	244159	244164	50 %	0 %	50 %	0 %	480530595
5058	NC_021005	AAC	2	6	244202	244207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530595
5059	NC_021005	AT	3	6	244227	244232	50 %	50 %	0 %	0 %	480530595
5060	NC_021005	GAAA	2	8	244236	244243	75 %	0 %	25 %	0 %	480530595
5061	NC_021005	TCTA	2	8	244258	244265	25 %	50 %	0 %	25 %	480530595
5062	NC_021005	GAA	3	9	244270	244278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
5063	NC_021005	CTT	2	6	244301	244306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530595
5064	NC_021005	AGA	2	6	244407	244412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
5065	NC_021005	AAC	2	6	244421	244426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530595
5066	NC_021005	ATA	2	6	244454	244459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530595
5067	NC_021005	TTA	2	6	244483	244488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530595
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5072	NC_021005	ACT	2	6	244840	244845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530595
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5075	NC_021005	AT	3	6	244950	244955	50 %	50 %	0 %	0 %	480530595
5076	NC_021005	AGA	2	6	244986	244991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
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5082	NC_021005	ATGA	2	8	245242	245249	50 %	25 %	25 %	0 %	480530595
5083	NC_021005	TGA	2	6	245261	245266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
5084	NC_021005	TAA	2	6	245292	245297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530595
5085	NC_021005	TGA	2	6	245298	245303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
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5095	NC_021005	A	6	6	245776	245781	100 %	0 %	0 %	0 %	480530595
5096	NC_021005	GAA	2	6	245794	245799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
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5107	NC_021005	TGT	2	6	246327	246332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530595
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5109	NC_021005	TTC	2	6	246415	246420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530595
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5111	NC_021005	AG	3	6	246598	246603	50 %	0 %	50 %	0 %	480530596
5112	NC_021005	T	7	7	246615	246621	0 %	100 %	0 %	0 %	480530596
5113	NC_021005	ATTG	2	8	246645	246652	25 %	50 %	25 %	0 %	480530596
5114	NC_021005	GAT	2	6	246742	246747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530596
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5116	NC_021005	A	7	7	246801	246807	100 %	0 %	0 %	0 %	480530596
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5123	NC_021005	AT	3	6	247211	247216	50 %	50 %	0 %	0 %	480530597
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5125	NC_021005	TTG	2	6	247309	247314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530597
5126	NC_021005	GTT	2	6	247407	247412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530597
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5154	NC_021005	AATT	2	8	248378	248385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_021005	CTA	2	6	248431	248436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5158	NC_021005	ATTA	2	8	248493	248500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_021005	CTT	2	6	248556	248561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5222	NC_021005	GA	3	6	252086	252091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5223	NC_021005	TGAT	2	8	252109	252116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_021005	CAG	2	6	252186	252191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5236	NC_021005	TAT	2	6	252686	252691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_021005	TAAA	2	8	252700	252707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_021005	CCT	2	6	252710	252715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5239	NC_021005	TTTA	2	8	252719	252726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_021005	CTTTT	2	10	252740	252749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5241	NC_021005	ATA	2	6	252752	252757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_021005	T	6	6	252789	252794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_021005	AAT	2	6	252829	252834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_021005	T	6	6	252888	252893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_021005	GAA	2	6	252972	252977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_021005	ACT	2	6	252983	252988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_021005	TAA	2	6	252990	252995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021005	TAG	2	6	253010	253015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_021005	TCTTAA	2	12	253105	253116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5250	NC_021005	GAA	2	6	253138	253143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_021005	ATA	2	6	253179	253184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_021005	T	6	6	253260	253265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_021005	GAA	2	6	253305	253310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_021005	GAT	2	6	253333	253338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_021005	CAT	2	6	253357	253362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5256	NC_021005	CCT	2	6	253374	253379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5257	NC_021005	T	6	6	253457	253462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_021005	T	6	6	253476	253481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_021005	ATA	2	6	253485	253490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5283	NC_021005	CTTAA	2	10	255097	255106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5366	NC_021005	A	6	6	259885	259890	100 %	0 %	0 %	0 %	480530604
5367	NC_021005	AGA	2	6	260007	260012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_021005	A	6	6	260022	260027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_021005	T	6	6	260048	260053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_021005	CAGA	2	8	260146	260153	50 %	0 %	25 %	25 %	480530605
5371	NC_021005	CA	3	6	260308	260313	50 %	0 %	0 %	50 %	480530605
5372	NC_021005	GATGGT	2	12	260482	260493	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480530605
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5374	NC_021005	ATG	2	6	260624	260629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530605
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5378	NC_021005	ATA	2	6	260951	260956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530605
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5389	NC_021005	GAAA	2	8	261566	261573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5390	NC_021005	TA	3	6	261578	261583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_021005	TA	3	6	261659	261664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_021005	TG	3	6	261668	261673	0 %	50 %	50 %	0 %	480530606
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