MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021005	GAG	2	6	218793	218798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530556
4502	NC_021005	ATG	2	6	218820	218825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530557
4503	NC_021005	A	6	6	218831	218836	100 %	0 %	0 %	0 %	480530557
4504	NC_021005	TCA	2	6	218841	218846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530557
4505	NC_021005	CA	3	6	218907	218912	50 %	0 %	0 %	50 %	480530557
4506	NC_021005	CAAG	2	8	218923	218930	50 %	0 %	25 %	25 %	480530557
4507	NC_021005	GCT	2	6	218939	218944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530557
4508	NC_021005	A	6	6	219038	219043	100 %	0 %	0 %	0 %	480530557
4509	NC_021005	ATC	2	6	219047	219052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530557
4510	NC_021005	GTT	2	6	219082	219087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530557
4511	NC_021005	TGC	2	6	219088	219093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530557
4512	NC_021005	AAT	2	6	219102	219107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530557
4513	NC_021005	AGG	2	6	219111	219116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021005	CAA	3	9	219146	219154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530558
4515	NC_021005	CTT	2	6	219173	219178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530558
4516	NC_021005	CAA	2	6	219197	219202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530558
4517	NC_021005	TTG	2	6	219224	219229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530558
4518	NC_021005	AAC	3	9	219253	219261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530558
4519	NC_021005	GGT	2	6	219286	219291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530558
4520	NC_021005	TAA	2	6	219330	219335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530558
4521	NC_021005	GTT	2	6	219352	219357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530558
4522	NC_021005	TACAC	2	10	219404	219413	40 %	20 %	0 %	40 %	480530558
4523	NC_021005	CAT	2	6	219432	219437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530558
4524	NC_021005	GTG	3	9	219572	219580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530558
4525	NC_021005	TGC	2	6	219591	219596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530558
4526	NC_021005	AAC	2	6	219716	219721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530558
4527	NC_021005	GGT	3	9	219820	219828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530558
4528	NC_021005	TCGT	2	8	219932	219939	0 %	50 %	25 %	25 %	480530558
4529	NC_021005	ATA	2	6	219954	219959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530558
4530	NC_021005	ACA	2	6	220034	220039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_021005	A	6	6	220076	220081	100 %	0 %	0 %	0 %	480530559
4532	NC_021005	TCG	2	6	220089	220094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530559
4533	NC_021005	TGA	2	6	220104	220109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530559
4534	NC_021005	A	6	6	220109	220114	100 %	0 %	0 %	0 %	480530559
4535	NC_021005	ACG	2	6	220131	220136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530559
4536	NC_021005	A	6	6	220142	220147	100 %	0 %	0 %	0 %	480530559
4537	NC_021005	TTA	2	6	220149	220154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530559
4538	NC_021005	GACG	2	8	220217	220224	25 %	0 %	50 %	25 %	480530559
4539	NC_021005	AAG	2	6	220248	220253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530559
4540	NC_021005	GAC	2	6	220316	220321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530559
4541	NC_021005	GCAATC	2	12	220459	220470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480530560
4542	NC_021005	CAAA	2	8	220484	220491	75 %	0 %	0 %	25 %	480530560
4543	NC_021005	GCT	2	6	220492	220497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530560
4544	NC_021005	ATC	2	6	220501	220506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530560
4545	NC_021005	TTTGG	2	10	220549	220558	0 %	60 %	40 %	0 %	480530560
4546	NC_021005	GTA	2	6	220573	220578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530560
4547	NC_021005	CAA	2	6	220653	220658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530560
4548	NC_021005	AGG	2	6	220698	220703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530560
4549	NC_021005	CAT	2	6	220749	220754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530561
4550	NC_021005	GCA	2	6	220855	220860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530561
4551	NC_021005	TTCAC	2	10	220905	220914	20 %	40 %	0 %	40 %	480530561
4552	NC_021005	GGT	2	6	220945	220950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530561
4553	NC_021005	ACATCA	2	12	221006	221017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480530561
4554	NC_021005	AAC	2	6	221027	221032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530561
4555	NC_021005	CGT	2	6	221098	221103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530561
4556	NC_021005	CA	3	6	221233	221238	50 %	0 %	0 %	50 %	480530561
4557	NC_021005	GAA	2	6	221266	221271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530561
4558	NC_021005	TAC	2	6	221277	221282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530561
4559	NC_021005	GTG	2	6	221318	221323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530561
4560	NC_021005	TTC	2	6	221327	221332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530561
4561	NC_021005	AGG	2	6	221352	221357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530561
4562	NC_021005	CGT	2	6	221395	221400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530562
4563	NC_021005	AAG	2	6	221441	221446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530562
4564	NC_021005	GCT	2	6	221512	221517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530562
4565	NC_021005	GTG	2	6	221546	221551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530562
4566	NC_021005	CA	3	6	221576	221581	50 %	0 %	0 %	50 %	480530562
4567	NC_021005	AAG	2	6	221843	221848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530563
4568	NC_021005	A	6	6	221875	221880	100 %	0 %	0 %	0 %	480530563
4569	NC_021005	GCT	2	6	221905	221910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530563
4570	NC_021005	AACA	2	8	221924	221931	75 %	0 %	0 %	25 %	480530563
4571	NC_021005	A	6	6	221950	221955	100 %	0 %	0 %	0 %	480530563
4572	NC_021005	ATA	2	6	221994	221999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530563
4573	NC_021005	AAT	2	6	222031	222036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530564
4574	NC_021005	TTG	2	6	222047	222052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530564
4575	NC_021005	GACAA	2	10	222076	222085	60 %	0 %	20 %	20 %	480530564
4576	NC_021005	ACC	2	6	222113	222118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530564
4577	NC_021005	ACT	2	6	222140	222145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530564
4578	NC_021005	A	6	6	222148	222153	100 %	0 %	0 %	0 %	480530564
4579	NC_021005	ATG	2	6	222164	222169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530564
4580	NC_021005	AAG	2	6	222185	222190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530564
4581	NC_021005	CGTA	2	8	222198	222205	25 %	25 %	25 %	25 %	480530564
4582	NC_021005	GTT	2	6	222256	222261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530564
4583	NC_021005	GAA	2	6	222262	222267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530564
4584	NC_021005	TCA	2	6	222272	222277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530564
4585	NC_021005	ACA	2	6	222342	222347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530565
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4587	NC_021005	TGG	2	6	222451	222456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530565
4588	NC_021005	A	6	6	222464	222469	100 %	0 %	0 %	0 %	480530565
4589	NC_021005	GTT	2	6	222476	222481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530565
4590	NC_021005	TCGT	2	8	222492	222499	0 %	50 %	25 %	25 %	480530565
4591	NC_021005	TCG	2	6	222514	222519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530565
4592	NC_021005	GCA	2	6	222554	222559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530565
4593	NC_021005	ATC	2	6	222563	222568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530565
4594	NC_021005	CTC	2	6	222582	222587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530565
4595	NC_021005	GGT	2	6	222632	222637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530565
4596	NC_021005	A	7	7	222762	222768	100 %	0 %	0 %	0 %	480530566
4597	NC_021005	TGT	2	6	222816	222821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530566
4598	NC_021005	GGT	2	6	222913	222918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530566
4599	NC_021005	ATC	2	6	222919	222924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530566
4600	NC_021005	AGC	2	6	222933	222938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530566
4601	NC_021005	A	6	6	223015	223020	100 %	0 %	0 %	0 %	480530566
4602	NC_021005	ACA	2	6	223028	223033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530566
4603	NC_021005	A	6	6	223033	223038	100 %	0 %	0 %	0 %	480530566
4604	NC_021005	AAGGA	2	10	223065	223074	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021005	AGT	2	6	223118	223123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530567
4606	NC_021005	ACT	2	6	223147	223152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530567
4607	NC_021005	GCT	2	6	223242	223247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530567
4608	NC_021005	GAA	2	6	223248	223253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530567
4609	NC_021005	A	6	6	223296	223301	100 %	0 %	0 %	0 %	480530567
4610	NC_021005	GTG	2	6	223360	223365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530567
4611	NC_021005	CAA	2	6	223438	223443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530567
4612	NC_021005	AC	3	6	223468	223473	50 %	0 %	0 %	50 %	480530567
4613	NC_021005	AAC	2	6	223556	223561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530567
4614	NC_021005	ATA	2	6	223622	223627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530567
4615	NC_021005	AGG	2	6	223629	223634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021005	A	6	6	223649	223654	100 %	0 %	0 %	0 %	480530568
4617	NC_021005	AG	3	6	223667	223672	50 %	0 %	50 %	0 %	480530568
4618	NC_021005	A	6	6	223683	223688	100 %	0 %	0 %	0 %	480530568
4619	NC_021005	TTG	2	6	223689	223694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530568
4620	NC_021005	TGC	2	6	223714	223719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530568
4621	NC_021005	GGC	2	6	223726	223731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480530568
4622	NC_021005	GAA	2	6	223963	223968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021005	CA	3	6	223999	224004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_021005	A	7	7	224061	224067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_021005	ACT	2	6	224171	224176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_021005	TGAC	2	8	224204	224211	25 %	25 %	25 %	25 %	480530569
4627	NC_021005	A	6	6	224293	224298	100 %	0 %	0 %	0 %	480530569
4628	NC_021005	A	6	6	224334	224339	100 %	0 %	0 %	0 %	480530569
4629	NC_021005	ACAA	2	8	224360	224367	75 %	0 %	0 %	25 %	480530569
4630	NC_021005	A	6	6	224461	224466	100 %	0 %	0 %	0 %	480530569
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4633	NC_021005	GTTT	2	8	224648	224655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_021005	ACAA	2	8	224656	224663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4635	NC_021005	GTTCA	2	10	224699	224708	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4636	NC_021005	TAA	2	6	224801	224806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530570
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4641	NC_021005	AAGA	2	8	225036	225043	75 %	0 %	25 %	0 %	480530570
4642	NC_021005	GGTT	2	8	225059	225066	0 %	50 %	50 %	0 %	480530570
4643	NC_021005	CAA	3	9	225169	225177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530570
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4650	NC_021005	AAG	2	6	225301	225306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530570
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4653	NC_021005	ACC	2	6	225344	225349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4654	NC_021005	AAAC	2	8	225427	225434	75 %	0 %	0 %	25 %	480530571
4655	NC_021005	CT	3	6	225470	225475	0 %	50 %	0 %	50 %	480530571
4656	NC_021005	CTG	2	6	225480	225485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530571
4657	NC_021005	TGAT	2	8	225537	225544	25 %	50 %	25 %	0 %	480530571
4658	NC_021005	AAG	2	6	225588	225593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530571
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4661	NC_021005	AGA	2	6	225810	225815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530572
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4681	NC_021005	ATG	2	6	226527	226532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4734	NC_021005	ATCGA	2	10	229254	229263	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4740	NC_021005	GTA	2	6	229704	229709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530578
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4996	NC_021005	A	6	6	241536	241541	100 %	0 %	0 %	0 %	480530591
4997	NC_021005	TTCT	2	8	241592	241599	0 %	75 %	0 %	25 %	480530591
4998	NC_021005	GAA	2	6	241663	241668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530591
4999	NC_021005	AG	3	6	241687	241692	50 %	0 %	50 %	0 %	480530591
5000	NC_021005	GTGA	2	8	241700	241707	25 %	25 %	50 %	0 %	480530591

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