MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH1

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020894	GC	3	6	1	6	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020894	CG	3	6	698	703	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
3	NC_020894	CG	3	6	713	718	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
4	NC_020894	GT	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	474987155
5	NC_020894	GT	3	6	1236	1241	0 %	50 %	50 %	0 %	474987155
6	NC_020894	GC	3	6	2528	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
7	NC_020894	GC	3	6	2567	2572	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
8	NC_020894	AG	3	6	2612	2617	50 %	0 %	50 %	0 %	474987155
9	NC_020894	GC	3	6	2924	2929	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
10	NC_020894	CG	4	8	3155	3162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020894	CG	3	6	3173	3178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020894	GC	4	8	3433	3440	0 %	0 %	50 %	50 %	474987156
13	NC_020894	GC	3	6	3718	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020894	GC	3	6	3778	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	474987157
15	NC_020894	GT	3	6	4239	4244	0 %	50 %	50 %	0 %	474987159
16	NC_020894	GC	3	6	4912	4917	0 %	0 %	50 %	50 %	474987159
17	NC_020894	TG	3	6	6165	6170	0 %	50 %	50 %	0 %	474987160
18	NC_020894	GC	3	6	6263	6268	0 %	0 %	50 %	50 %	474987160
19	NC_020894	TC	3	6	8030	8035	0 %	50 %	0 %	50 %	474987162
20	NC_020894	TC	3	6	9051	9056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020894	GC	3	6	9222	9227	0 %	0 %	50 %	50 %	474987164
22	NC_020894	GC	3	6	9513	9518	0 %	0 %	50 %	50 %	474987164
23	NC_020894	CT	3	6	10341	10346	0 %	50 %	0 %	50 %	474987165
24	NC_020894	GC	3	6	10762	10767	0 %	0 %	50 %	50 %	474987165
25	NC_020894	CG	3	6	13026	13031	0 %	0 %	50 %	50 %	474987169
26	NC_020894	GC	3	6	13041	13046	0 %	0 %	50 %	50 %	474987169
27	NC_020894	TG	4	8	14143	14150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020894	CG	4	8	14246	14253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020894	CG	3	6	15127	15132	0 %	0 %	50 %	50 %	474987170
30	NC_020894	GT	3	6	15730	15735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020894	GC	3	6	16883	16888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020894	CG	3	6	17989	17994	0 %	0 %	50 %	50 %	474987175
33	NC_020894	AG	3	6	18274	18279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020894	GA	3	6	18484	18489	50 %	0 %	50 %	0 %	474987176
35	NC_020894	CG	3	6	19132	19137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020894	CG	3	6	19218	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020894	GC	3	6	19462	19467	0 %	0 %	50 %	50 %	474987178
38	NC_020894	TG	3	6	20290	20295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020894	CG	3	6	20598	20603	0 %	0 %	50 %	50 %	474987180
40	NC_020894	CG	3	6	20638	20643	0 %	0 %	50 %	50 %	474987180
41	NC_020894	GC	3	6	21212	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020894	TG	5	10	21300	21309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020894	CG	3	6	21857	21862	0 %	0 %	50 %	50 %	474987183
44	NC_020894	GC	3	6	21937	21942	0 %	0 %	50 %	50 %	474987183
45	NC_020894	CG	3	6	22930	22935	0 %	0 %	50 %	50 %	474987184
46	NC_020894	CG	4	8	23238	23245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020894	CG	3	6	24379	24384	0 %	0 %	50 %	50 %	474987186
48	NC_020894	CG	3	6	26851	26856	0 %	0 %	50 %	50 %	474987190
49	NC_020894	GC	3	6	26861	26866	0 %	0 %	50 %	50 %	474987190
50	NC_020894	CG	3	6	28347	28352	0 %	0 %	50 %	50 %	474987192
51	NC_020894	GT	3	6	28634	28639	0 %	50 %	50 %	0 %	474987192
52	NC_020894	GC	3	6	28688	28693	0 %	0 %	50 %	50 %	474987192
53	NC_020894	GC	3	6	29062	29067	0 %	0 %	50 %	50 %	474987193
54	NC_020894	CG	3	6	30912	30917	0 %	0 %	50 %	50 %	474987195
55	NC_020894	GC	4	8	31953	31960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020894	CG	3	6	32013	32018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020894	CG	4	8	32219	32226	0 %	0 %	50 %	50 %	474987196
58	NC_020894	GC	3	6	32610	32615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020894	TC	3	6	33075	33080	0 %	50 %	0 %	50 %	474987198
60	NC_020894	GC	3	6	33169	33174	0 %	0 %	50 %	50 %	474987198
61	NC_020894	CG	3	6	33187	33192	0 %	0 %	50 %	50 %	474987198
62	NC_020894	AC	3	6	33634	33639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020894	GC	3	6	34376	34381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020894	CG	3	6	34473	34478	0 %	0 %	50 %	50 %	474987200
65	NC_020894	CG	3	6	34949	34954	0 %	0 %	50 %	50 %	474987201
66	NC_020894	GC	3	6	35115	35120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020894	AC	3	6	35247	35252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020894	GC	3	6	36175	36180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020894	CG	3	6	37282	37287	0 %	0 %	50 %	50 %	474987205
70	NC_020894	GC	3	6	38133	38138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020894	CG	4	8	38400	38407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020894	CG	3	6	39092	39097	0 %	0 %	50 %	50 %	474987206
73	NC_020894	GC	3	6	39504	39509	0 %	0 %	50 %	50 %	474987206
74	NC_020894	CG	3	6	39579	39584	0 %	0 %	50 %	50 %	474987206
75	NC_020894	CG	3	6	40641	40646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020894	CG	3	6	40702	40707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020894	CG	3	6	40763	40768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020894	CG	3	6	40824	40829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020894	GT	3	6	41087	41092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020894	TC	3	6	41452	41457	0 %	50 %	0 %	50 %	474987208
81	NC_020894	CG	3	6	41856	41861	0 %	0 %	50 %	50 %	474987208
82	NC_020894	GT	3	6	42408	42413	0 %	50 %	50 %	0 %	474987209
83	NC_020894	CG	3	6	44125	44130	0 %	0 %	50 %	50 %	474987211
84	NC_020894	GC	3	6	44822	44827	0 %	0 %	50 %	50 %	474987211
85	NC_020894	CA	3	6	45822	45827	50 %	0 %	0 %	50 %	474987213
86	NC_020894	CG	3	6	46068	46073	0 %	0 %	50 %	50 %	474987213
87	NC_020894	CG	3	6	46273	46278	0 %	0 %	50 %	50 %	474987213
88	NC_020894	AC	3	6	46789	46794	50 %	0 %	0 %	50 %	474987213
89	NC_020894	CG	3	6	47028	47033	0 %	0 %	50 %	50 %	474987213
90	NC_020894	GC	3	6	48744	48749	0 %	0 %	50 %	50 %	474987214
91	NC_020894	AC	3	6	48791	48796	50 %	0 %	0 %	50 %	474987214
92	NC_020894	GC	3	6	49105	49110	0 %	0 %	50 %	50 %	474987214
93	NC_020894	CA	3	6	50295	50300	50 %	0 %	0 %	50 %	474987214
94	NC_020894	CA	3	6	50938	50943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020894	GC	3	6	51126	51131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020894	CG	3	6	51464	51469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020894	GC	3	6	52188	52193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020894	GC	3	6	52319	52324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020894	CG	3	6	52988	52993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020894	CG	3	6	53049	53054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020894	CG	3	6	53171	53176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020894	AC	4	8	53541	53548	50 %	0 %	0 %	50 %	474987216
103	NC_020894	CT	3	6	53725	53730	0 %	50 %	0 %	50 %	474987216
104	NC_020894	CG	3	6	54174	54179	0 %	0 %	50 %	50 %	474987216
105	NC_020894	CG	3	6	58055	58060	0 %	0 %	50 %	50 %	474987220
106	NC_020894	CG	3	6	58682	58687	0 %	0 %	50 %	50 %	474987220
107	NC_020894	CG	3	6	58743	58748	0 %	0 %	50 %	50 %	474987220
108	NC_020894	GC	3	6	58836	58841	0 %	0 %	50 %	50 %	474987220
109	NC_020894	GC	3	6	58989	58994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020894	GC	3	6	59419	59424	0 %	0 %	50 %	50 %	474987221
111	NC_020894	CG	3	6	59750	59755	0 %	0 %	50 %	50 %	474987221
112	NC_020894	CG	4	8	60448	60455	0 %	0 %	50 %	50 %	474987221
113	NC_020894	AC	3	6	61693	61698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020894	CG	3	6	61731	61736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020894	GC	3	6	62342	62347	0 %	0 %	50 %	50 %	474987222
116	NC_020894	GT	3	6	62413	62418	0 %	50 %	50 %	0 %	474987222
117	NC_020894	CG	3	6	62832	62837	0 %	0 %	50 %	50 %	474987223
118	NC_020894	GC	3	6	62975	62980	0 %	0 %	50 %	50 %	474987223
119	NC_020894	GC	3	6	63029	63034	0 %	0 %	50 %	50 %	474987223
120	NC_020894	GC	3	6	63471	63476	0 %	0 %	50 %	50 %	474987224
121	NC_020894	GC	3	6	64089	64094	0 %	0 %	50 %	50 %	474987224
122	NC_020894	GC	3	6	64343	64348	0 %	0 %	50 %	50 %	474987225
123	NC_020894	CG	3	6	64396	64401	0 %	0 %	50 %	50 %	474987225
124	NC_020894	CG	3	6	64653	64658	0 %	0 %	50 %	50 %	474987225
125	NC_020894	GC	3	6	65454	65459	0 %	0 %	50 %	50 %	474987226
126	NC_020894	AG	3	6	65616	65621	50 %	0 %	50 %	0 %	474987226
127	NC_020894	CA	3	6	65953	65958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020894	AC	3	6	67429	67434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020894	GC	3	6	68638	68643	0 %	0 %	50 %	50 %	474987231
130	NC_020894	GC	3	6	69241	69246	0 %	0 %	50 %	50 %	474987232
131	NC_020894	AC	3	6	69901	69906	50 %	0 %	0 %	50 %	474987234
132	NC_020894	GT	5	10	70001	70010	0 %	50 %	50 %	0 %	474987234
133	NC_020894	CG	4	8	70435	70442	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
134	NC_020894	CG	3	6	70544	70549	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
135	NC_020894	CG	3	6	70733	70738	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
136	NC_020894	CG	3	6	70847	70852	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
137	NC_020894	AC	3	6	72067	72072	50 %	0 %	0 %	50 %	474987236
138	NC_020894	CG	3	6	72336	72341	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
139	NC_020894	CG	3	6	72401	72406	0 %	0 %	50 %	50 %	474987236
140	NC_020894	CA	3	6	72483	72488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020894	GC	3	6	72786	72791	0 %	0 %	50 %	50 %	474987237
142	NC_020894	GC	3	6	73094	73099	0 %	0 %	50 %	50 %	474987238
143	NC_020894	GC	3	6	73388	73393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020894	GA	3	6	73469	73474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020894	GC	3	6	73948	73953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020894	CG	3	6	75941	75946	0 %	0 %	50 %	50 %	474987240
147	NC_020894	GC	3	6	76663	76668	0 %	0 %	50 %	50 %	474987241
148	NC_020894	CG	3	6	76983	76988	0 %	0 %	50 %	50 %	474987241
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.