MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH1

Total Repeats: 4298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020894	GGCA	2	8	18784	18791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_020894	CAG	2	6	18793	18798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_020894	GCA	2	6	18843	18848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_020894	CGA	2	6	18874	18879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_020894	AGC	3	9	18895	18903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020894	GCG	2	6	18931	18936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987177
507	NC_020894	AGC	3	9	18986	18994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987177
508	NC_020894	GGC	2	6	19015	19020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987177
509	NC_020894	GTC	2	6	19024	19029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987177
510	NC_020894	GGC	2	6	19035	19040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987177
511	NC_020894	TGC	2	6	19042	19047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987177
512	NC_020894	GCGA	2	8	19049	19056	25 %	0 %	50 %	25 %	474987177
513	NC_020894	CCG	2	6	19062	19067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987177
514	NC_020894	GGGGC	2	10	19089	19098	0 %	0 %	80 %	20 %	474987177
515	NC_020894	TGG	2	6	19121	19126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987177
516	NC_020894	CG	3	6	19132	19137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_020894	GCT	2	6	19165	19170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020894	ACG	2	6	19207	19212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020894	CG	3	6	19218	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_020894	TCG	2	6	19260	19265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987178
521	NC_020894	TGCG	2	8	19296	19303	0 %	25 %	50 %	25 %	474987178
522	NC_020894	CGG	2	6	19318	19323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987178
523	NC_020894	GCG	2	6	19455	19460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987178
524	NC_020894	GC	3	6	19462	19467	0 %	0 %	50 %	50 %	474987178
525	NC_020894	GCG	2	6	19479	19484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987178
526	NC_020894	GTT	2	6	19556	19561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020894	AGC	2	6	19562	19567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020894	CGG	2	6	19571	19576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_020894	CTC	2	6	19597	19602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987179
530	NC_020894	GCG	2	6	19604	19609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987179
531	NC_020894	GGCC	2	8	19630	19637	0 %	0 %	50 %	50 %	474987179
532	NC_020894	CTG	2	6	19665	19670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987179
533	NC_020894	GCA	2	6	19720	19725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987179
534	NC_020894	GCG	2	6	19742	19747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987179
535	NC_020894	GTC	2	6	19758	19763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987179
536	NC_020894	CTG	3	9	19805	19813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987179
537	NC_020894	GCCA	2	8	19886	19893	25 %	0 %	25 %	50 %	474987179
538	NC_020894	CCG	3	9	19933	19941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987179
539	NC_020894	TGG	2	6	20042	20047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987179
540	NC_020894	GTC	3	9	20061	20069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987179
541	NC_020894	CGGG	2	8	20094	20101	0 %	0 %	75 %	25 %	474987179
542	NC_020894	GGC	2	6	20141	20146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987179
543	NC_020894	CAC	2	6	20165	20170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474987179
544	NC_020894	TG	3	6	20290	20295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020894	CGC	2	6	20419	20424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987180
546	NC_020894	GGT	2	6	20482	20487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987180
547	NC_020894	CGG	2	6	20553	20558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987180
548	NC_020894	GGAC	2	8	20562	20569	25 %	0 %	50 %	25 %	474987180
549	NC_020894	CG	3	6	20598	20603	0 %	0 %	50 %	50 %	474987180
550	NC_020894	GAA	2	6	20626	20631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474987180
551	NC_020894	CG	3	6	20638	20643	0 %	0 %	50 %	50 %	474987180
552	NC_020894	GGC	2	6	20650	20655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987180
553	NC_020894	CGG	2	6	20693	20698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987181
554	NC_020894	CGC	2	6	20699	20704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987181
555	NC_020894	CTG	2	6	20745	20750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987181
556	NC_020894	GCT	2	6	20801	20806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987181
557	NC_020894	CTC	2	6	20841	20846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987181
558	NC_020894	CAG	2	6	20847	20852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987181
559	NC_020894	TGG	2	6	20861	20866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987181
560	NC_020894	CTC	2	6	20874	20879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987181
561	NC_020894	CGG	2	6	20957	20962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_020894	GCT	2	6	21049	21054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020894	CGTCGG	2	12	21105	21116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020894	GCG	2	6	21159	21164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_020894	GTT	2	6	21187	21192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020894	GC	3	6	21212	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_020894	GAC	2	6	21273	21278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_020894	TG	5	10	21300	21309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020894	GGC	2	6	21387	21392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_020894	CGC	2	6	21398	21403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_020894	AAG	2	6	21422	21427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474987182
572	NC_020894	CCG	2	6	21533	21538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987182
573	NC_020894	GGCT	2	8	21564	21571	0 %	25 %	50 %	25 %	474987182
574	NC_020894	GCCGC	2	10	21607	21616	0 %	0 %	40 %	60 %	474987182
575	NC_020894	GCA	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987182
576	NC_020894	CTT	2	6	21733	21738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474987182
577	NC_020894	CGC	2	6	21820	21825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987183
578	NC_020894	CG	3	6	21857	21862	0 %	0 %	50 %	50 %	474987183
579	NC_020894	ACT	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474987183
580	NC_020894	CCG	2	6	21922	21927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987183
581	NC_020894	GC	3	6	21937	21942	0 %	0 %	50 %	50 %	474987183
582	NC_020894	GTGC	2	8	22063	22070	0 %	25 %	50 %	25 %	474987183
583	NC_020894	CCT	2	6	22233	22238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987184
584	NC_020894	GAG	2	6	22285	22290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474987184
585	NC_020894	GGC	2	6	22297	22302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987184
586	NC_020894	GGACC	2	10	22318	22327	20 %	0 %	40 %	40 %	474987184
587	NC_020894	GGA	2	6	22350	22355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474987184
588	NC_020894	CTG	2	6	22366	22371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987184
589	NC_020894	GGC	2	6	22466	22471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987184
590	NC_020894	CCG	2	6	22505	22510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987184
591	NC_020894	C	6	6	22520	22525	0 %	0 %	0 %	100 %	474987184
592	NC_020894	GCC	2	6	22560	22565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987184
593	NC_020894	CCG	2	6	22568	22573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987184
594	NC_020894	CCGG	2	8	22593	22600	0 %	0 %	50 %	50 %	474987184
595	NC_020894	ACGG	2	8	22601	22608	25 %	0 %	50 %	25 %	474987184
596	NC_020894	CGTC	2	8	22614	22621	0 %	25 %	25 %	50 %	474987184
597	NC_020894	CGA	2	6	22630	22635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987184
598	NC_020894	GCCA	2	8	22672	22679	25 %	0 %	25 %	50 %	474987184
599	NC_020894	GTGA	2	8	22699	22706	25 %	25 %	50 %	0 %	474987184
600	NC_020894	GCA	2	6	22712	22717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987184
601	NC_020894	ACG	2	6	22769	22774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987184
602	NC_020894	TGG	2	6	22840	22845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987184
603	NC_020894	CGC	2	6	22851	22856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987184
604	NC_020894	CGC	2	6	22875	22880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987184
605	NC_020894	CCT	2	6	22884	22889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987184
606	NC_020894	CGC	2	6	22890	22895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987184
607	NC_020894	CCA	2	6	22896	22901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474987184
608	NC_020894	CG	3	6	22930	22935	0 %	0 %	50 %	50 %	474987184
609	NC_020894	CCGG	2	8	22965	22972	0 %	0 %	50 %	50 %	474987184
610	NC_020894	CCAG	2	8	22986	22993	25 %	0 %	25 %	50 %	474987184
611	NC_020894	GCACC	2	10	22998	23007	20 %	0 %	20 %	60 %	474987184
612	NC_020894	AAG	2	6	23048	23053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474987184
613	NC_020894	CGAC	2	8	23117	23124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_020894	CGT	2	6	23132	23137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_020894	CAG	2	6	23143	23148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_020894	GTC	2	6	23149	23154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_020894	AGG	2	6	23163	23168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020894	AAC	2	6	23179	23184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_020894	ATC	2	6	23185	23190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020894	CGT	2	6	23196	23201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_020894	CG	4	8	23238	23245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_020894	CAG	2	6	23322	23327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020894	CCCT	2	8	23521	23528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
624	NC_020894	CGG	2	6	23552	23557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020894	CGA	2	6	23573	23578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_020894	CGC	2	6	23612	23617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_020894	GCCG	2	8	23628	23635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_020894	CCA	2	6	23658	23663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474987185
629	NC_020894	AGG	2	6	23664	23669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474987185
630	NC_020894	TGG	2	6	23685	23690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987185
631	NC_020894	TCC	2	6	23709	23714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987185
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755	NC_020894	CGG	2	6	29443	29448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
756	NC_020894	CCGTG	2	10	29449	29458	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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759	NC_020894	GTC	2	6	29483	29488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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884	NC_020894	GACC	2	8	33816	33823	25 %	0 %	25 %	50 %	474987199
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