MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020568	GTTT	2	8	164288	164295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020568	CAT	2	6	164308	164313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_020568	TCA	2	6	164394	164399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_020568	TGTA	2	8	164402	164409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020568	ATG	2	6	164421	164426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020568	TA	4	8	164517	164524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020568	TTTA	2	8	164527	164534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020568	AT	3	6	164570	164575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020568	A	7	7	164601	164607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020568	T	6	6	164649	164654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020568	AGG	2	6	164668	164673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020568	TTA	2	6	164676	164681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020568	ATT	2	6	164687	164692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223854
4014	NC_020568	TTA	2	6	164694	164699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223854
4015	NC_020568	AGA	2	6	164732	164737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223854
4016	NC_020568	GCA	2	6	164751	164756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223854
4017	NC_020568	TTATT	2	10	164822	164831	20 %	80 %	0 %	0 %	470223854
4018	NC_020568	AAG	2	6	164902	164907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223854
4019	NC_020568	GAA	2	6	165045	165050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223854
4020	NC_020568	ATGT	2	8	165079	165086	25 %	50 %	25 %	0 %	470223854
4021	NC_020568	TGA	2	6	165125	165130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223854
4022	NC_020568	CG	4	8	165144	165151	0 %	0 %	50 %	50 %	470223854
4023	NC_020568	TAA	2	6	165192	165197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223854
4024	NC_020568	ACA	2	6	165199	165204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_020568	TGA	2	6	165208	165213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020568	AT	3	6	165215	165220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020568	TA	3	6	165222	165227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020568	AGT	2	6	165284	165289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020568	GAA	2	6	165296	165301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020568	TAG	2	6	165353	165358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020568	CGT	2	6	165376	165381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_020568	ATC	2	6	165428	165433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_020568	TAG	2	6	165510	165515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020568	CAA	2	6	165548	165553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223855
4035	NC_020568	ACA	2	6	165556	165561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223855
4036	NC_020568	CATC	2	8	165689	165696	25 %	25 %	0 %	50 %	470223855
4037	NC_020568	ATT	2	6	165710	165715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223855
4038	NC_020568	ACA	2	6	165730	165735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223855
4039	NC_020568	CAT	2	6	165767	165772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223855
4040	NC_020568	TGC	2	6	165777	165782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223855
4041	NC_020568	ACA	2	6	165801	165806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223855
4042	NC_020568	GGATT	2	10	165810	165819	20 %	40 %	40 %	0 %	470223855
4043	NC_020568	TGA	2	6	165835	165840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223855
4044	NC_020568	AGA	2	6	165874	165879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223855
4045	NC_020568	AAC	2	6	165921	165926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223855
4046	NC_020568	GATG	2	8	165973	165980	25 %	25 %	50 %	0 %	470223855
4047	NC_020568	TAT	2	6	166063	166068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223855
4048	NC_020568	TGA	2	6	166087	166092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223855
4049	NC_020568	ATT	2	6	166142	166147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223855
4050	NC_020568	ATC	3	9	166242	166250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223855
4051	NC_020568	ATT	2	6	166266	166271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223855
4052	NC_020568	GAGT	2	8	166278	166285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020568	TCA	2	6	166312	166317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223856
4054	NC_020568	TGA	3	9	166438	166446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223856
4055	NC_020568	A	6	6	166449	166454	100 %	0 %	0 %	0 %	470223856
4056	NC_020568	TTA	2	6	166455	166460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223856
4057	NC_020568	ATC	2	6	166471	166476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223856
4058	NC_020568	AAT	2	6	166506	166511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223856
4059	NC_020568	CAT	2	6	166629	166634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223856
4060	NC_020568	TAA	2	6	166682	166687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223856
4061	NC_020568	GAT	2	6	166692	166697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223856
4062	NC_020568	CAG	2	6	166807	166812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223856
4063	NC_020568	TGA	2	6	166919	166924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223856
4064	NC_020568	TG	3	6	166947	166952	0 %	50 %	50 %	0 %	470223856
4065	NC_020568	ATGA	2	8	167037	167044	50 %	25 %	25 %	0 %	470223856
4066	NC_020568	GCAA	2	8	167047	167054	50 %	0 %	25 %	25 %	470223856
4067	NC_020568	CAT	2	6	167073	167078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223856
4068	NC_020568	ACA	2	6	167183	167188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223856
4069	NC_020568	ATG	2	6	167212	167217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223856
4070	NC_020568	TTG	2	6	167221	167226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223856
4071	NC_020568	AGG	2	6	167242	167247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223856
4072	NC_020568	TAT	2	6	167293	167298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_020568	TAT	2	6	167305	167310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020568	ATT	3	9	167336	167344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223857
4075	NC_020568	TGT	2	6	167470	167475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223857
4076	NC_020568	TTG	2	6	167480	167485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223857
4077	NC_020568	CTT	2	6	167503	167508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223857
4078	NC_020568	GGAA	2	8	167513	167520	50 %	0 %	50 %	0 %	470223857
4079	NC_020568	ACA	2	6	167532	167537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223857
4080	NC_020568	TGT	2	6	167596	167601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223857
4081	NC_020568	TTGGTA	2	12	167610	167621	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223857
4082	NC_020568	GCGATT	2	12	167630	167641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470223857
4083	NC_020568	GCT	2	6	167651	167656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223857
4084	NC_020568	T	6	6	167656	167661	0 %	100 %	0 %	0 %	470223857
4085	NC_020568	AAATTT	2	12	167728	167739	50 %	50 %	0 %	0 %	470223857
4086	NC_020568	GGT	2	6	167745	167750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223857
4087	NC_020568	AT	3	6	167763	167768	50 %	50 %	0 %	0 %	470223857
4088	NC_020568	T	6	6	167878	167883	0 %	100 %	0 %	0 %	470223857
4089	NC_020568	AGA	2	6	167914	167919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223857
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4091	NC_020568	ATT	2	6	167947	167952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223857
4092	NC_020568	TAT	2	6	167959	167964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223857
4093	NC_020568	AGA	2	6	168002	168007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223857
4094	NC_020568	GA	3	6	168021	168026	50 %	0 %	50 %	0 %	470223858
4095	NC_020568	TGA	3	9	168027	168035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223858
4096	NC_020568	TAG	2	6	168075	168080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223858
4097	NC_020568	TGA	2	6	168085	168090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223858
4098	NC_020568	TAT	2	6	168098	168103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223858
4099	NC_020568	CAA	2	6	168119	168124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223858
4100	NC_020568	GGC	2	6	168151	168156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470223858
4101	NC_020568	A	6	6	168163	168168	100 %	0 %	0 %	0 %	470223858
4102	NC_020568	ACA	2	6	168206	168211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223858
4103	NC_020568	AAT	2	6	168278	168283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223858
4104	NC_020568	ACA	2	6	168289	168294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223858
4105	NC_020568	AC	3	6	168382	168387	50 %	0 %	0 %	50 %	470223858
4106	NC_020568	GTAA	2	8	168431	168438	50 %	25 %	25 %	0 %	470223858
4107	NC_020568	AAG	2	6	168444	168449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223858
4108	NC_020568	ATT	2	6	168453	168458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223858
4109	NC_020568	ATC	2	6	168481	168486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223858
4110	NC_020568	A	6	6	168543	168548	100 %	0 %	0 %	0 %	470223858
4111	NC_020568	T	6	6	168553	168558	0 %	100 %	0 %	0 %	470223858
4112	NC_020568	ATC	2	6	168623	168628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223858
4113	NC_020568	ATG	2	6	168633	168638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223858
4114	NC_020568	ATG	2	6	168777	168782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223858
4115	NC_020568	A	6	6	168794	168799	100 %	0 %	0 %	0 %	470223858
4116	NC_020568	AG	3	6	168815	168820	50 %	0 %	50 %	0 %	470223858
4117	NC_020568	TAACT	2	10	168847	168856	40 %	40 %	0 %	20 %	470223858
4118	NC_020568	GAA	2	6	168883	168888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223858
4119	NC_020568	TATT	2	8	168899	168906	25 %	75 %	0 %	0 %	470223858
4120	NC_020568	GTC	2	6	168929	168934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223858
4121	NC_020568	TGG	2	6	168937	168942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223858
4122	NC_020568	AC	3	6	168954	168959	50 %	0 %	0 %	50 %	470223858
4123	NC_020568	TTC	3	9	168995	169003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223858
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4125	NC_020568	T	6	6	169078	169083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_020568	TTG	2	6	179249	179254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
4375	NC_020568	GAT	2	6	179272	179277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
4376	NC_020568	GTT	2	6	179278	179283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
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4380	NC_020568	CAT	2	6	179407	179412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223861
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4393	NC_020568	AT	3	6	180069	180074	50 %	50 %	0 %	0 %	470223861
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4400	NC_020568	ATTG	2	8	180567	180574	25 %	50 %	25 %	0 %	470223862
4401	NC_020568	TATGA	2	10	180604	180613	40 %	40 %	20 %	0 %	470223862
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4403	NC_020568	GTGAA	2	10	180638	180647	40 %	20 %	40 %	0 %	470223862
4404	NC_020568	ATTT	2	8	180657	180664	25 %	75 %	0 %	0 %	470223862
4405	NC_020568	A	6	6	180718	180723	100 %	0 %	0 %	0 %	470223862
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4493	NC_020568	TTAC	2	8	184659	184666	25 %	50 %	0 %	25 %	470223866
4494	NC_020568	ATT	2	6	184703	184708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223866
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4497	NC_020568	TG	3	6	184801	184806	0 %	50 %	50 %	0 %	470223866
4498	NC_020568	AATT	2	8	184841	184848	50 %	50 %	0 %	0 %	470223866
4499	NC_020568	ATC	2	6	184890	184895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223866
4500	NC_020568	CCT	2	6	184903	184908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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