MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020568	TATG	2	8	120698	120705	25 %	50 %	25 %	0 %	470223817
3002	NC_020568	AAC	2	6	120709	120714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223817
3003	NC_020568	AATC	2	8	120781	120788	50 %	25 %	0 %	25 %	470223817
3004	NC_020568	GAG	2	6	120817	120822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223817
3005	NC_020568	AAG	2	6	120833	120838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223817
3006	NC_020568	TTTA	2	8	120984	120991	25 %	75 %	0 %	0 %	470223818
3007	NC_020568	TTA	2	6	121010	121015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3008	NC_020568	T	6	6	121027	121032	0 %	100 %	0 %	0 %	470223818
3009	NC_020568	ATT	2	6	121043	121048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3010	NC_020568	ATT	2	6	121067	121072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3011	NC_020568	TTTG	2	8	121077	121084	0 %	75 %	25 %	0 %	470223818
3012	NC_020568	T	6	6	121088	121093	0 %	100 %	0 %	0 %	470223818
3013	NC_020568	GAT	2	6	121094	121099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223818
3014	NC_020568	TTA	2	6	121107	121112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3015	NC_020568	ATTT	2	8	121160	121167	25 %	75 %	0 %	0 %	470223818
3016	NC_020568	GAT	2	6	121177	121182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223818
3017	NC_020568	A	6	6	121205	121210	100 %	0 %	0 %	0 %	470223818
3018	NC_020568	TTATA	2	10	121225	121234	40 %	60 %	0 %	0 %	470223818
3019	NC_020568	TAT	2	6	121261	121266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3020	NC_020568	TGA	2	6	121312	121317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223818
3021	NC_020568	AATG	2	8	121336	121343	50 %	25 %	25 %	0 %	470223818
3022	NC_020568	ATT	2	6	121370	121375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3023	NC_020568	ATTT	2	8	121502	121509	25 %	75 %	0 %	0 %	470223818
3024	NC_020568	TTA	2	6	121512	121517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3025	NC_020568	TAG	2	6	121528	121533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223818
3026	NC_020568	ACT	2	6	121605	121610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223818
3027	NC_020568	CAT	2	6	121686	121691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223818
3028	NC_020568	TTG	2	6	121821	121826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223818
3029	NC_020568	ATA	2	6	121830	121835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223818
3030	NC_020568	ATT	2	6	121879	121884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3031	NC_020568	TTTA	2	8	121899	121906	25 %	75 %	0 %	0 %	470223818
3032	NC_020568	ATT	2	6	121915	121920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223818
3033	NC_020568	TTG	2	6	121956	121961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223818
3034	NC_020568	TAA	2	6	122002	122007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223818
3035	NC_020568	TTTTA	2	10	122023	122032	20 %	80 %	0 %	0 %	470223818
3036	NC_020568	ATT	2	6	122109	122114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_020568	ATT	2	6	122169	122174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223819
3038	NC_020568	GTG	2	6	122194	122199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223819
3039	NC_020568	TTTC	2	8	122215	122222	0 %	75 %	0 %	25 %	470223819
3040	NC_020568	TGA	2	6	122242	122247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223819
3041	NC_020568	CAG	2	6	122322	122327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223819
3042	NC_020568	ATT	2	6	122351	122356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223819
3043	NC_020568	TATT	2	8	122401	122408	25 %	75 %	0 %	0 %	470223819
3044	NC_020568	GAT	2	6	122409	122414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223819
3045	NC_020568	CTA	2	6	122430	122435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223819
3046	NC_020568	TAT	2	6	122447	122452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223819
3047	NC_020568	GCA	2	6	122457	122462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223819
3048	NC_020568	TTG	2	6	122524	122529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223819
3049	NC_020568	GTATT	2	10	122536	122545	20 %	60 %	20 %	0 %	470223819
3050	NC_020568	GTT	2	6	122553	122558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223819
3051	NC_020568	ATCA	2	8	122572	122579	50 %	25 %	0 %	25 %	470223819
3052	NC_020568	TGTA	2	8	122590	122597	25 %	50 %	25 %	0 %	470223819
3053	NC_020568	CTATTG	2	12	122602	122613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223819
3054	NC_020568	TCGT	2	8	122705	122712	0 %	50 %	25 %	25 %	470223819
3055	NC_020568	TTA	2	6	122724	122729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223819
3056	NC_020568	TA	3	6	122749	122754	50 %	50 %	0 %	0 %	470223819
3057	NC_020568	GTT	2	6	122769	122774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223819
3058	NC_020568	TAG	2	6	122782	122787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223819
3059	NC_020568	CAA	2	6	122796	122801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223819
3060	NC_020568	TAA	2	6	122936	122941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223819
3061	NC_020568	CAT	2	6	123001	123006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223819
3062	NC_020568	TTTA	2	8	123007	123014	25 %	75 %	0 %	0 %	470223819
3063	NC_020568	TGA	2	6	123052	123057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223819
3064	NC_020568	TTA	2	6	123117	123122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223819
3065	NC_020568	AATAA	2	10	123129	123138	80 %	20 %	0 %	0 %	470223819
3066	NC_020568	TA	3	6	123142	123147	50 %	50 %	0 %	0 %	470223819
3067	NC_020568	TAT	2	6	123184	123189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223819
3068	NC_020568	AT	3	6	123201	123206	50 %	50 %	0 %	0 %	470223819
3069	NC_020568	CTTA	2	8	123257	123264	25 %	50 %	0 %	25 %	470223819
3070	NC_020568	TTG	2	6	123274	123279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223819
3071	NC_020568	TGC	2	6	123335	123340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223819
3072	NC_020568	ATG	2	6	123345	123350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223819
3073	NC_020568	ATT	2	6	123376	123381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223819
3074	NC_020568	TACGC	2	10	123396	123405	20 %	20 %	20 %	40 %	470223819
3075	NC_020568	TAG	2	6	123427	123432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223819
3076	NC_020568	ATG	2	6	123447	123452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223819
3077	NC_020568	AAG	2	6	123548	123553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_020568	T	6	6	123589	123594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_020568	TA	3	6	123684	123689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_020568	AAAT	2	8	123702	123709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_020568	AAT	3	9	123707	123715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_020568	AC	3	6	123725	123730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_020568	ATTA	2	8	123736	123743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_020568	AGG	2	6	123765	123770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_020568	CATATG	2	12	123805	123816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223820
3086	NC_020568	AT	3	6	123830	123835	50 %	50 %	0 %	0 %	470223820
3087	NC_020568	TCA	2	6	123857	123862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223820
3088	NC_020568	TACG	2	8	123878	123885	25 %	25 %	25 %	25 %	470223820
3089	NC_020568	ATCA	2	8	123928	123935	50 %	25 %	0 %	25 %	470223820
3090	NC_020568	TAA	2	6	123995	124000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223820
3091	NC_020568	GGT	2	6	124005	124010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223820
3092	NC_020568	CATT	2	8	124020	124027	25 %	50 %	0 %	25 %	470223820
3093	NC_020568	GAA	2	6	124056	124061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223820
3094	NC_020568	CAA	2	6	124138	124143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223820
3095	NC_020568	ATT	2	6	124145	124150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223820
3096	NC_020568	GTT	2	6	124173	124178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223820
3097	NC_020568	ATG	2	6	124180	124185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223820
3098	NC_020568	CTA	2	6	124277	124282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223820
3099	NC_020568	A	6	6	124344	124349	100 %	0 %	0 %	0 %	470223820
3100	NC_020568	TGA	2	6	124352	124357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223820
3101	NC_020568	AGC	2	6	124367	124372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223820
3102	NC_020568	ATA	2	6	124376	124381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223820
3103	NC_020568	T	6	6	124425	124430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_020568	ATA	2	6	124491	124496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_020568	TTA	2	6	124521	124526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_020568	TTG	2	6	124527	124532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_020568	ATG	2	6	124539	124544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_020568	TA	3	6	124555	124560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_020568	ACA	2	6	124567	124572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_020568	ATTA	2	8	124575	124582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_020568	TAAA	2	8	124599	124606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_020568	ATT	2	6	124622	124627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_020568	A	6	6	124652	124657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_020568	TTG	2	6	124677	124682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_020568	AATGTA	2	12	124706	124717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_020568	A	6	6	124749	124754	100 %	0 %	0 %	0 %	470223821
3117	NC_020568	AATG	2	8	124841	124848	50 %	25 %	25 %	0 %	470223821
3118	NC_020568	ATC	2	6	124879	124884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223821
3119	NC_020568	AGT	2	6	124898	124903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223821
3120	NC_020568	ATG	2	6	125002	125007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223821
3121	NC_020568	TGG	2	6	125165	125170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223821
3122	NC_020568	CAA	2	6	125208	125213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223821
3123	NC_020568	AC	4	8	125230	125237	50 %	0 %	0 %	50 %	470223821
3124	NC_020568	ACA	2	6	125258	125263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223821
3125	NC_020568	ATC	2	6	125276	125281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223821
3126	NC_020568	ATG	2	6	125292	125297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223821
3127	NC_020568	TCA	2	6	125319	125324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223821
3128	NC_020568	ATC	2	6	125326	125331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223821
3129	NC_020568	A	6	6	125349	125354	100 %	0 %	0 %	0 %	470223821
3130	NC_020568	GCT	2	6	125364	125369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223821
3131	NC_020568	ACT	2	6	125414	125419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223821
3132	NC_020568	GAC	2	6	125449	125454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223821
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3134	NC_020568	ATAA	2	8	125464	125471	75 %	25 %	0 %	0 %	470223821
3135	NC_020568	ATA	2	6	125474	125479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_020568	TAA	2	6	125484	125489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_020568	GAGC	2	8	125512	125519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_020568	AGT	2	6	125565	125570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_020568	TGAA	2	8	125575	125582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_020568	TCA	2	6	125631	125636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_020568	A	6	6	125636	125641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_020568	TAA	2	6	125654	125659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_020568	TAA	2	6	125663	125668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223822
3144	NC_020568	TTA	2	6	125726	125731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223822
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3154	NC_020568	TGA	2	6	126100	126105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223822
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3156	NC_020568	TCCCT	2	10	126202	126211	0 %	40 %	0 %	60 %	470223822
3157	NC_020568	CT	3	6	126218	126223	0 %	50 %	0 %	50 %	470223822
3158	NC_020568	GC	3	6	126286	126291	0 %	0 %	50 %	50 %	470223822
3159	NC_020568	TA	3	6	126354	126359	50 %	50 %	0 %	0 %	470223822
3160	NC_020568	TAT	2	6	126363	126368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223822
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3162	NC_020568	AAT	2	6	126445	126450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_020568	ATAG	2	8	126486	126493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_020568	TAG	2	6	126521	126526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_020568	CTGTAA	2	12	126527	126538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3166	NC_020568	A	6	6	126583	126588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_020568	TAT	3	9	126589	126597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_020568	GGA	2	6	126640	126645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223823
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3173	NC_020568	GGTATG	2	12	126848	126859	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470223823
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3175	NC_020568	A	6	6	126908	126913	100 %	0 %	0 %	0 %	470223823
3176	NC_020568	ATG	2	6	126963	126968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223823
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3184	NC_020568	CAA	2	6	127293	127298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223823
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3220	NC_020568	AT	3	6	128739	128744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_020568	TAAA	2	8	128763	128770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_020568	TA	3	6	128776	128781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_020568	GAG	2	6	128786	128791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_020568	AGTA	2	8	128793	128800	50 %	25 %	25 %	0 %	470223825
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3232	NC_020568	ACA	2	6	129114	129119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223825
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3234	NC_020568	ATT	2	6	129169	129174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223825
3235	NC_020568	TTG	2	6	129184	129189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223825
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3237	NC_020568	CGTA	2	8	129351	129358	25 %	25 %	25 %	25 %	470223825
3238	NC_020568	AGA	2	6	129363	129368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223825
3239	NC_020568	CAGATT	2	12	129446	129457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223825
3240	NC_020568	AT	4	8	129462	129469	50 %	50 %	0 %	0 %	470223825
3241	NC_020568	AGT	2	6	129672	129677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223826
3242	NC_020568	AAC	2	6	129689	129694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223826
3243	NC_020568	ATACT	2	10	129702	129711	40 %	40 %	0 %	20 %	470223826
3244	NC_020568	CAA	2	6	129829	129834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223826
3245	NC_020568	GAA	2	6	129838	129843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223826
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3247	NC_020568	TGC	2	6	129972	129977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223826
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3491	NC_020568	A	6	6	141088	141093	100 %	0 %	0 %	0 %	470223835
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3498	NC_020568	TAA	2	6	141557	141562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223835
3499	NC_020568	ATTT	2	8	141591	141598	25 %	75 %	0 %	0 %	470223835
3500	NC_020568	GAA	2	6	141600	141605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223835

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