MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020567	C	6	6	845	850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020567	T	7	7	1254	1260	0 %	100 %	0 %	0 %	472455814
4	NC_020567	T	6	6	1461	1466	0 %	100 %	0 %	0 %	472455814
5	NC_020567	T	6	6	1897	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	472455814
6	NC_020567	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	472455814
7	NC_020567	A	6	6	3406	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020567	A	6	6	3629	3634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020567	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020567	T	6	6	3829	3834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020567	T	6	6	4257	4262	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
12	NC_020567	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
13	NC_020567	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
14	NC_020567	T	6	6	4590	4595	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
15	NC_020567	T	8	8	4746	4753	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
16	NC_020567	T	6	6	5011	5016	0 %	100 %	0 %	0 %	472455816
17	NC_020567	A	7	7	5375	5381	100 %	0 %	0 %	0 %	472455816
18	NC_020567	A	8	8	5416	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	472455816
19	NC_020567	T	6	6	5770	5775	0 %	100 %	0 %	0 %	472455816
20	NC_020567	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	472455816
21	NC_020567	T	6	6	5904	5909	0 %	100 %	0 %	0 %	472455816
22	NC_020567	A	6	6	6457	6462	100 %	0 %	0 %	0 %	472455816
23	NC_020567	A	6	6	6668	6673	100 %	0 %	0 %	0 %	472455816
24	NC_020567	A	6	6	6761	6766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020567	A	6	6	6857	6862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020567	A	6	6	8745	8750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020567	T	6	6	8931	8936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020567	A	6	6	8990	8995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020567	A	6	6	9215	9220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020567	A	7	7	9580	9586	100 %	0 %	0 %	0 %	472455819
31	NC_020567	T	6	6	9782	9787	0 %	100 %	0 %	0 %	472455819
32	NC_020567	T	6	6	10075	10080	0 %	100 %	0 %	0 %	472455819
33	NC_020567	A	6	6	10168	10173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020567	T	6	6	10223	10228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020567	A	7	7	10241	10247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020567	T	6	6	10314	10319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020567	A	8	8	10346	10353	100 %	0 %	0 %	0 %	472455820
38	NC_020567	A	7	7	10553	10559	100 %	0 %	0 %	0 %	472455820
39	NC_020567	T	6	6	11943	11948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020567	A	6	6	12253	12258	100 %	0 %	0 %	0 %	472455821
41	NC_020567	A	6	6	12260	12265	100 %	0 %	0 %	0 %	472455821
42	NC_020567	A	6	6	12363	12368	100 %	0 %	0 %	0 %	472455821
43	NC_020567	A	6	6	12584	12589	100 %	0 %	0 %	0 %	472455821
44	NC_020567	T	7	7	13506	13512	0 %	100 %	0 %	0 %	472455822
45	NC_020567	T	6	6	13608	13613	0 %	100 %	0 %	0 %	472455822
46	NC_020567	T	6	6	13756	13761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020567	T	6	6	14028	14033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020567	A	6	6	14385	14390	100 %	0 %	0 %	0 %	472455823
49	NC_020567	A	6	6	14402	14407	100 %	0 %	0 %	0 %	472455823
50	NC_020567	A	6	6	14730	14735	100 %	0 %	0 %	0 %	472455823
51	NC_020567	A	7	7	15166	15172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020567	A	6	6	15388	15393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020567	A	7	7	16080	16086	100 %	0 %	0 %	0 %	472455824
54	NC_020567	A	6	6	16937	16942	100 %	0 %	0 %	0 %	472455824
55	NC_020567	A	6	6	17116	17121	100 %	0 %	0 %	0 %	472455824
56	NC_020567	A	8	8	17251	17258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020567	T	6	6	17294	17299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020567	T	7	7	17438	17444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020567	T	7	7	17449	17455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020567	A	6	6	17458	17463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020567	A	6	6	17647	17652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020567	A	6	6	17673	17678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020567	A	7	7	17765	17771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020567	T	6	6	17959	17964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020567	T	6	6	18218	18223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020567	A	7	7	18314	18320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020567	T	6	6	18629	18634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020567	A	6	6	18650	18655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020567	A	6	6	18841	18846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020567	T	6	6	19254	19259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020567	A	6	6	19298	19303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020567	A	7	7	19665	19671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020567	A	6	6	19859	19864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020567	T	7	7	20179	20185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020567	A	7	7	20209	20215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020567	A	6	6	20219	20224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020567	A	6	6	20282	20287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020567	A	7	7	20292	20298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020567	A	6	6	20337	20342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020567	A	6	6	20354	20359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020567	T	6	6	20549	20554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83	NC_020567	A	6	6	20854	20859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020567	A	6	6	20865	20870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_020567	T	6	6	21729	21734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020567	A	6	6	21814	21819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020567	A	8	8	22022	22029	100 %	0 %	0 %	0 %	472455826
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93	NC_020567	A	7	7	22670	22676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020567	A	6	6	22797	22802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020567	T	7	7	22830	22836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_020567	A	6	6	23013	23018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_020567	T	7	7	23209	23215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020567	A	8	8	23274	23281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020567	A	7	7	23308	23314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020567	A	6	6	23421	23426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_020567	T	7	7	23590	23596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_020567	T	6	6	23606	23611	0 %	100 %	0 %	0 %	472455827
108	NC_020567	A	6	6	23984	23989	100 %	0 %	0 %	0 %	472455827
109	NC_020567	T	6	6	24083	24088	0 %	100 %	0 %	0 %	472455827
110	NC_020567	A	6	6	24131	24136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_020567	A	7	7	24634	24640	100 %	0 %	0 %	0 %	472455828
113	NC_020567	T	7	7	24825	24831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020567	T	6	6	24833	24838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020567	T	6	6	25057	25062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020567	A	6	6	25126	25131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020567	A	6	6	25370	25375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020567	A	6	6	25786	25791	100 %	0 %	0 %	0 %	472455829
119	NC_020567	T	7	7	26299	26305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020567	T	6	6	26710	26715	0 %	100 %	0 %	0 %	472455830
121	NC_020567	G	6	6	27486	27491	0 %	0 %	100 %	0 %	472455831
122	NC_020567	T	6	6	28366	28371	0 %	100 %	0 %	0 %	472455832
123	NC_020567	C	6	6	29104	29109	0 %	0 %	0 %	100 %	472455832
124	NC_020567	T	6	6	29582	29587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020567	A	8	8	29879	29886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020567	T	6	6	29950	29955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020567	T	6	6	29970	29975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020567	T	6	6	30081	30086	0 %	100 %	0 %	0 %	472455833
129	NC_020567	T	6	6	31152	31157	0 %	100 %	0 %	0 %	472455834
130	NC_020567	T	6	6	31317	31322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020567	T	6	6	31646	31651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020567	A	6	6	31686	31691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020567	T	6	6	31719	31724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020567	A	6	6	31798	31803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020567	T	7	7	32231	32237	0 %	100 %	0 %	0 %	472455835
136	NC_020567	T	6	6	32391	32396	0 %	100 %	0 %	0 %	472455835
137	NC_020567	T	7	7	32493	32499	0 %	100 %	0 %	0 %	472455835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.