MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020567	TA	3	6	578	583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020567	AC	3	6	1890	1895	50 %	0 %	0 %	50 %	472455814
4	NC_020567	GC	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	472455814
5	NC_020567	AC	3	6	2301	2306	50 %	0 %	0 %	50 %	472455814
6	NC_020567	AC	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020567	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020567	TA	3	6	3836	3841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020567	TC	3	6	5114	5119	0 %	50 %	0 %	50 %	472455816
10	NC_020567	AT	3	6	5481	5486	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
11	NC_020567	AT	3	6	5538	5543	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
12	NC_020567	AT	3	6	5783	5788	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
13	NC_020567	TA	3	6	6852	6857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020567	AT	3	6	7159	7164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020567	CT	3	6	7208	7213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020567	TA	5	10	7223	7232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020567	TA	3	6	7323	7328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020567	AC	3	6	7957	7962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020567	AG	3	6	8414	8419	50 %	0 %	50 %	0 %	472455818
20	NC_020567	TA	3	6	8476	8481	50 %	50 %	0 %	0 %	472455818
21	NC_020567	TC	3	6	8682	8687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020567	TA	3	6	8772	8777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020567	AT	3	6	8808	8813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020567	AG	3	6	9448	9453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020567	CT	3	6	9466	9471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020567	AT	5	10	9549	9558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020567	GA	3	6	9590	9595	50 %	0 %	50 %	0 %	472455819
28	NC_020567	TA	3	6	9756	9761	50 %	50 %	0 %	0 %	472455819
29	NC_020567	TA	3	6	9881	9886	50 %	50 %	0 %	0 %	472455819
30	NC_020567	AG	3	6	10443	10448	50 %	0 %	50 %	0 %	472455820
31	NC_020567	AT	3	6	10486	10491	50 %	50 %	0 %	0 %	472455820
32	NC_020567	CT	3	6	10493	10498	0 %	50 %	0 %	50 %	472455820
33	NC_020567	AT	3	6	11858	11863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020567	GA	3	6	12304	12309	50 %	0 %	50 %	0 %	472455821
35	NC_020567	TA	3	6	12625	12630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020567	TA	3	6	12880	12885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020567	CT	3	6	12997	13002	0 %	50 %	0 %	50 %	472455822
38	NC_020567	TC	3	6	13024	13029	0 %	50 %	0 %	50 %	472455822
39	NC_020567	AT	3	6	13360	13365	50 %	50 %	0 %	0 %	472455822
40	NC_020567	TA	3	6	13462	13467	50 %	50 %	0 %	0 %	472455822
41	NC_020567	AT	3	6	13619	13624	50 %	50 %	0 %	0 %	472455822
42	NC_020567	TA	3	6	13914	13919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020567	TA	3	6	14021	14026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020567	AT	4	8	14046	14053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020567	TA	3	6	14633	14638	50 %	50 %	0 %	0 %	472455823
46	NC_020567	GA	3	6	15604	15609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020567	GA	4	8	16907	16914	50 %	0 %	50 %	0 %	472455824
48	NC_020567	AT	3	6	16973	16978	50 %	50 %	0 %	0 %	472455824
49	NC_020567	AT	3	6	17492	17497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020567	AT	3	6	17813	17818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020567	TA	4	8	18082	18089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020567	AG	3	6	18833	18838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020567	TA	3	6	19099	19104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020567	TG	3	6	19358	19363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020567	TA	3	6	19427	19432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020567	AG	3	6	19501	19506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020567	TA	3	6	19571	19576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020567	GA	3	6	19816	19821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020567	TA	3	6	19976	19981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020567	AT	3	6	20501	20506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020567	TA	3	6	21293	21298	50 %	50 %	0 %	0 %	472455825
62	NC_020567	AT	3	6	21921	21926	50 %	50 %	0 %	0 %	472455826
63	NC_020567	GA	3	6	21937	21942	50 %	0 %	50 %	0 %	472455826
64	NC_020567	TA	3	6	22428	22433	50 %	50 %	0 %	0 %	472455826
65	NC_020567	TA	3	6	23282	23287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020567	TA	3	6	23350	23355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020567	GA	3	6	23580	23585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020567	TA	3	6	24113	24118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020567	AT	3	6	24337	24342	50 %	50 %	0 %	0 %	472455828
70	NC_020567	GA	3	6	24923	24928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020567	AT	3	6	24963	24968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020567	TA	3	6	25138	25143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020567	TC	3	6	25213	25218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020567	AG	3	6	25238	25243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020567	AT	3	6	25676	25681	50 %	50 %	0 %	0 %	472455829
76	NC_020567	TA	3	6	26183	26188	50 %	50 %	0 %	0 %	472455829
77	NC_020567	TA	3	6	26532	26537	50 %	50 %	0 %	0 %	472455830
78	NC_020567	GT	3	6	27432	27437	0 %	50 %	50 %	0 %	472455831
79	NC_020567	AT	3	6	28315	28320	50 %	50 %	0 %	0 %	472455832
80	NC_020567	TA	3	6	28924	28929	50 %	50 %	0 %	0 %	472455832
81	NC_020567	CT	3	6	29552	29557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020567	TA	3	6	30973	30978	50 %	50 %	0 %	0 %	472455834
83	NC_020567	TC	3	6	31351	31356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020567	AT	3	6	31462	31467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020567	TG	3	6	31892	31897	0 %	50 %	50 %	0 %	472455835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.