MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020567	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020567	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020567	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020567	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020567	TGA	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020567	CAT	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020567	GCT	2	6	762	767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020567	TTC	2	6	828	833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020567	TCA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
11	NC_020567	TAG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
12	NC_020567	ATT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455814
13	NC_020567	ATC	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
14	NC_020567	GCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455814
15	NC_020567	CAT	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
16	NC_020567	TGA	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
17	NC_020567	AAT	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455814
18	NC_020567	TTC	2	6	1639	1644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
19	NC_020567	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455814
20	NC_020567	TGT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455814
21	NC_020567	TTC	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
22	NC_020567	TTC	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
23	NC_020567	CCA	2	6	2015	2020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455814
24	NC_020567	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455814
25	NC_020567	AGT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
26	NC_020567	TCA	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
27	NC_020567	AGC	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455814
28	NC_020567	ATA	2	6	2357	2362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455814
29	NC_020567	ATT	2	6	2393	2398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455814
30	NC_020567	CTT	2	6	2424	2429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
31	NC_020567	ACA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455814
32	NC_020567	ATG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
33	NC_020567	TCA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
34	NC_020567	TCT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
35	NC_020567	TAG	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
36	NC_020567	TCT	2	6	2786	2791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
37	NC_020567	TTC	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
38	NC_020567	TCT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
39	NC_020567	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020567	ATC	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020567	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020567	CTT	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020567	ACC	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020567	ATG	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020567	TTC	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020567	ATC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020567	TAT	2	6	3475	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020567	TCA	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020567	ATA	2	6	3597	3602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020567	AAT	2	6	3618	3623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020567	ATT	2	6	3722	3727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020567	TGA	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020567	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020567	ATA	2	6	3889	3894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020567	ATA	2	6	3938	3943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020567	ATA	2	6	3950	3955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020567	CAT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455815
58	NC_020567	TAT	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455815
59	NC_020567	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455815
60	NC_020567	GTT	2	6	4421	4426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455815
61	NC_020567	TAT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455815
62	NC_020567	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455815
63	NC_020567	TTA	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455815
64	NC_020567	AAT	2	6	4885	4890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455815
65	NC_020567	TAT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
66	NC_020567	AAG	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455816
67	NC_020567	TTA	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
68	NC_020567	TTA	2	6	5005	5010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
69	NC_020567	CTT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455816
70	NC_020567	TAA	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
71	NC_020567	AAT	2	6	5140	5145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
72	NC_020567	ACC	2	6	5197	5202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455816
73	NC_020567	ATA	2	6	5258	5263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
74	NC_020567	TTA	2	6	5291	5296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
75	NC_020567	TTA	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
76	NC_020567	TCT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455816
77	NC_020567	TAT	3	9	5613	5621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
78	NC_020567	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
79	NC_020567	TAT	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
80	NC_020567	AGA	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455816
81	NC_020567	AAG	2	6	5846	5851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455816
82	NC_020567	GAA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455816
83	NC_020567	ATG	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455816
84	NC_020567	TAA	2	6	6342	6347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
85	NC_020567	ATG	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455816
86	NC_020567	TCT	2	6	6478	6483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455816
87	NC_020567	ATT	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
88	NC_020567	TAA	2	6	6558	6563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
89	NC_020567	GGT	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472455816
90	NC_020567	TAT	2	6	6604	6609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
91	NC_020567	AAG	2	6	6810	6815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020567	TCA	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020567	AGA	2	6	6919	6924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020567	TAA	2	6	6958	6963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020567	GAA	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020567	GAA	2	6	7037	7042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020567	ATA	2	6	7098	7103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020567	TTA	2	6	7127	7132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020567	TAA	2	6	7145	7150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020567	TTG	2	6	7514	7519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455817
101	NC_020567	TAA	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455817
102	NC_020567	AGA	2	6	7611	7616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455817
103	NC_020567	GCA	2	6	7672	7677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455817
104	NC_020567	TTC	2	6	7713	7718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455817
105	NC_020567	GTC	2	6	7760	7765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455817
106	NC_020567	AAT	2	6	7894	7899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455817
107	NC_020567	TTG	2	6	7982	7987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020567	ATC	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455818
109	NC_020567	AAG	2	6	8185	8190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455818
110	NC_020567	ATG	2	6	8257	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455818
111	NC_020567	ATT	2	6	8265	8270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455818
112	NC_020567	ATT	2	6	8281	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455818
113	NC_020567	ATG	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455818
114	NC_020567	GTG	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472455818
115	NC_020567	AGA	2	6	8561	8566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455818
116	NC_020567	AAG	2	6	8593	8598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455818
117	NC_020567	ATT	2	6	8712	8717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020567	TAA	2	6	8730	8735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020567	TAA	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020567	TAT	3	9	8917	8925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020567	ACA	2	6	8998	9003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020567	ATT	2	6	9416	9421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020567	GTA	3	9	9478	9486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020567	ATA	2	6	9525	9530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020567	ATT	2	6	9560	9565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455819
126	NC_020567	TGC	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455819
127	NC_020567	CAT	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455819
128	NC_020567	CCT	2	6	9728	9733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472455819
129	NC_020567	ATT	2	6	9829	9834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455819
130	NC_020567	ATA	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455819
131	NC_020567	GTT	2	6	9862	9867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455819
132	NC_020567	TTC	2	6	9954	9959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455819
133	NC_020567	ATA	2	6	10005	10010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455819
134	NC_020567	TAC	2	6	10022	10027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455819
135	NC_020567	AGT	3	9	10053	10061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455819
136	NC_020567	TCA	2	6	10124	10129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455819
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266	NC_020567	TTA	2	6	18620	18625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_020567	GCA	2	6	28991	28996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455832
395	NC_020567	CGC	2	6	29176	29181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472455832
396	NC_020567	CCG	2	6	29183	29188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472455832
397	NC_020567	AAT	2	6	29194	29199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455832
398	NC_020567	AGA	2	6	29201	29206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455832
399	NC_020567	TTC	2	6	29257	29262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455832
400	NC_020567	ATC	2	6	29317	29322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455832
401	NC_020567	TTC	2	6	29407	29412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455832
402	NC_020567	TTC	2	6	29621	29626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_020567	AAC	2	6	29627	29632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_020567	TGC	2	6	29668	29673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_020567	ACC	2	6	29688	29693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
406	NC_020567	CAA	2	6	29745	29750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_020567	CAA	2	6	29768	29773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_020567	AAT	2	6	29798	29803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_020567	CAC	2	6	29866	29871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
410	NC_020567	CCA	2	6	30014	30019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455833
411	NC_020567	TAA	2	6	30035	30040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455833
412	NC_020567	GCT	2	6	30074	30079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455833
413	NC_020567	CAC	2	6	30163	30168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455833
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416	NC_020567	ACC	2	6	30245	30250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455833
417	NC_020567	TCC	2	6	30460	30465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472455833
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420	NC_020567	CTT	2	6	30704	30709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455834
421	NC_020567	ATC	2	6	30714	30719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455834
422	NC_020567	AAC	2	6	31117	31122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455834
423	NC_020567	AAT	2	6	31207	31212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_020567	TAA	2	6	31264	31269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_020567	ACA	2	6	31380	31385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_020567	TAA	2	6	31428	31433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_020567	CTG	2	6	31446	31451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_020567	ATT	2	6	31642	31647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_020567	AAT	2	6	31661	31666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_020567	AAG	2	6	31761	31766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_020567	TTC	2	6	31772	31777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_020567	ACA	2	6	31886	31891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455835
433	NC_020567	CAA	2	6	32027	32032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455835
434	NC_020567	GCA	2	6	32068	32073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455835
435	NC_020567	TCC	2	6	32158	32163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472455835
436	NC_020567	CAG	2	6	32204	32209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455835
437	NC_020567	TGC	2	6	32316	32321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455835
438	NC_020567	TCT	2	6	32675	32680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.