MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 4801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020566	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020566	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020566	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020566	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	470221771
5	NC_020566	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	470221771
6	NC_020566	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	470221771
7	NC_020566	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020566	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020566	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020566	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020566	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020566	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	470221772
13	NC_020566	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020566	AC	3	6	3653	3658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020566	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	470221773
16	NC_020566	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	470221774
17	NC_020566	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	470221774
18	NC_020566	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	470221774
19	NC_020566	AG	3	6	7467	7472	50 %	0 %	50 %	0 %	470221775
20	NC_020566	AG	4	8	8312	8319	50 %	0 %	50 %	0 %	470221775
21	NC_020566	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020566	AT	3	6	10896	10901	50 %	50 %	0 %	0 %	470221777
23	NC_020566	CT	3	6	11313	11318	0 %	50 %	0 %	50 %	470221777
24	NC_020566	TA	3	6	11521	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	470221777
25	NC_020566	GT	3	6	12209	12214	0 %	50 %	50 %	0 %	470221777
26	NC_020566	AT	3	6	12512	12517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020566	AG	3	6	12531	12536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020566	AT	4	8	12565	12572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020566	TA	3	6	13469	13474	50 %	50 %	0 %	0 %	470221778
30	NC_020566	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020566	TA	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020566	TA	3	6	14873	14878	50 %	50 %	0 %	0 %	470221779
33	NC_020566	AT	3	6	15191	15196	50 %	50 %	0 %	0 %	470221779
34	NC_020566	AT	3	6	16320	16325	50 %	50 %	0 %	0 %	470221780
35	NC_020566	TA	3	6	17088	17093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020566	CA	3	6	17234	17239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020566	GT	3	6	18075	18080	0 %	50 %	50 %	0 %	470221781
38	NC_020566	AT	3	6	18968	18973	50 %	50 %	0 %	0 %	470221782
39	NC_020566	GT	3	6	19394	19399	0 %	50 %	50 %	0 %	470221782
40	NC_020566	AG	3	6	19510	19515	50 %	0 %	50 %	0 %	470221782
41	NC_020566	AT	4	8	19693	19700	50 %	50 %	0 %	0 %	470221782
42	NC_020566	AC	3	6	20720	20725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020566	TC	3	6	21800	21805	0 %	50 %	0 %	50 %	470221783
44	NC_020566	AT	3	6	22242	22247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020566	CG	3	6	22537	22542	0 %	0 %	50 %	50 %	470221784
46	NC_020566	TA	3	6	23737	23742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020566	AT	3	6	24375	24380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020566	AT	3	6	24730	24735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020566	TA	3	6	24781	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020566	AT	3	6	25584	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	470221785
51	NC_020566	TA	3	6	26093	26098	50 %	50 %	0 %	0 %	470221786
52	NC_020566	AT	3	6	27535	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	470221787
53	NC_020566	CA	3	6	28896	28901	50 %	0 %	0 %	50 %	470221788
54	NC_020566	GT	3	6	29160	29165	0 %	50 %	50 %	0 %	470221788
55	NC_020566	AG	3	6	29951	29956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020566	AT	3	6	30765	30770	50 %	50 %	0 %	0 %	470221789
57	NC_020566	CG	3	6	31768	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	470221790
58	NC_020566	GC	3	6	33203	33208	0 %	0 %	50 %	50 %	470221790
59	NC_020566	AT	3	6	33326	33331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020566	TA	3	6	34584	34589	50 %	50 %	0 %	0 %	470221793
61	NC_020566	AT	3	6	34706	34711	50 %	50 %	0 %	0 %	470221793
62	NC_020566	TA	4	8	35993	36000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020566	AT	3	6	36025	36030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020566	CA	3	6	36289	36294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020566	AG	3	6	36427	36432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020566	TC	3	6	36748	36753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020566	GA	3	6	38168	38173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020566	AT	3	6	38175	38180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020566	AT	3	6	38280	38285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020566	AT	3	6	40450	40455	50 %	50 %	0 %	0 %	470221795
71	NC_020566	AT	3	6	40597	40602	50 %	50 %	0 %	0 %	470221795
72	NC_020566	TA	3	6	40672	40677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020566	TA	3	6	40837	40842	50 %	50 %	0 %	0 %	470221796
74	NC_020566	AT	3	6	41355	41360	50 %	50 %	0 %	0 %	470221796
75	NC_020566	TA	4	8	41456	41463	50 %	50 %	0 %	0 %	470221796
76	NC_020566	AT	3	6	42659	42664	50 %	50 %	0 %	0 %	470221797
77	NC_020566	AC	3	6	43286	43291	50 %	0 %	0 %	50 %	470221797
78	NC_020566	TG	3	6	43457	43462	0 %	50 %	50 %	0 %	470221797
79	NC_020566	AT	3	6	44440	44445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020566	TA	3	6	44861	44866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020566	TA	3	6	44952	44957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020566	TA	3	6	45081	45086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020566	TA	3	6	45089	45094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020566	AT	3	6	45310	45315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020566	GT	3	6	46038	46043	0 %	50 %	50 %	0 %	470221800
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88	NC_020566	AT	3	6	46427	46432	50 %	50 %	0 %	0 %	470221800
89	NC_020566	AT	4	8	46843	46850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020566	TC	3	6	46930	46935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020566	AC	3	6	46941	46946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020566	TA	3	6	48384	48389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020566	TA	3	6	50033	50038	50 %	50 %	0 %	0 %	470221802
94	NC_020566	AT	3	6	50372	50377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020566	TA	3	6	50964	50969	50 %	50 %	0 %	0 %	470221803
96	NC_020566	AT	3	6	51283	51288	50 %	50 %	0 %	0 %	470221803
97	NC_020566	TA	3	6	51501	51506	50 %	50 %	0 %	0 %	470221803
98	NC_020566	AT	3	6	51662	51667	50 %	50 %	0 %	0 %	470221803
99	NC_020566	AT	3	6	51704	51709	50 %	50 %	0 %	0 %	470221803
100	NC_020566	AT	3	6	51713	51718	50 %	50 %	0 %	0 %	470221803
101	NC_020566	AT	3	6	51905	51910	50 %	50 %	0 %	0 %	470221803
102	NC_020566	AT	3	6	52668	52673	50 %	50 %	0 %	0 %	470221804
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104	NC_020566	AT	3	6	53651	53656	50 %	50 %	0 %	0 %	470221804
105	NC_020566	TA	3	6	53786	53791	50 %	50 %	0 %	0 %	470221805
106	NC_020566	AT	3	6	53825	53830	50 %	50 %	0 %	0 %	470221805
107	NC_020566	GT	4	8	54257	54264	0 %	50 %	50 %	0 %	470221805
108	NC_020566	AT	3	6	54986	54991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020566	CT	3	6	55351	55356	0 %	50 %	0 %	50 %	470221806
110	NC_020566	TA	3	6	55584	55589	50 %	50 %	0 %	0 %	470221806
111	NC_020566	AT	3	6	56149	56154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020566	AT	3	6	56818	56823	50 %	50 %	0 %	0 %	470221807
113	NC_020566	TA	3	6	57377	57382	50 %	50 %	0 %	0 %	470221807
114	NC_020566	AT	3	6	57495	57500	50 %	50 %	0 %	0 %	470221807
115	NC_020566	TA	3	6	58764	58769	50 %	50 %	0 %	0 %	470221808
116	NC_020566	AT	3	6	59210	59215	50 %	50 %	0 %	0 %	470221808
117	NC_020566	AT	3	6	59262	59267	50 %	50 %	0 %	0 %	470221808
118	NC_020566	AT	3	6	59821	59826	50 %	50 %	0 %	0 %	470221808
119	NC_020566	AT	3	6	59952	59957	50 %	50 %	0 %	0 %	470221808
120	NC_020566	AT	3	6	60121	60126	50 %	50 %	0 %	0 %	470221808
121	NC_020566	TC	3	6	60344	60349	0 %	50 %	0 %	50 %	470221809
122	NC_020566	AT	3	6	60419	60424	50 %	50 %	0 %	0 %	470221809
123	NC_020566	TG	3	6	61143	61148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020566	AG	3	6	61293	61298	50 %	0 %	50 %	0 %	470221810
125	NC_020566	AT	3	6	61480	61485	50 %	50 %	0 %	0 %	470221810
126	NC_020566	GT	3	6	61897	61902	0 %	50 %	50 %	0 %	470221810
127	NC_020566	TA	3	6	62000	62005	50 %	50 %	0 %	0 %	470221810
128	NC_020566	AT	5	10	62247	62256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020566	TA	3	6	62313	62318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020566	AT	3	6	63039	63044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020566	AT	3	6	63048	63053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020566	TA	3	6	63661	63666	50 %	50 %	0 %	0 %	470221811
133	NC_020566	TA	3	6	63818	63823	50 %	50 %	0 %	0 %	470221811
134	NC_020566	TA	3	6	64018	64023	50 %	50 %	0 %	0 %	470221811
135	NC_020566	AT	3	6	64286	64291	50 %	50 %	0 %	0 %	470221811
136	NC_020566	AT	3	6	64298	64303	50 %	50 %	0 %	0 %	470221811
137	NC_020566	AT	5	10	64361	64370	50 %	50 %	0 %	0 %	470221811
138	NC_020566	AC	3	6	64673	64678	50 %	0 %	0 %	50 %	470221811
139	NC_020566	AT	3	6	64719	64724	50 %	50 %	0 %	0 %	470221811
140	NC_020566	AT	3	6	65003	65008	50 %	50 %	0 %	0 %	470221811
141	NC_020566	TC	3	6	65179	65184	0 %	50 %	0 %	50 %	470221811
142	NC_020566	CA	3	6	65293	65298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020566	TG	3	6	65422	65427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020566	TG	3	6	65582	65587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020566	AT	4	8	66073	66080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020566	AT	3	6	66610	66615	50 %	50 %	0 %	0 %	470221812
147	NC_020566	AT	3	6	66796	66801	50 %	50 %	0 %	0 %	470221812
148	NC_020566	AT	3	6	67238	67243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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