MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020566	GTTT	2	8	164404	164411	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020566	CAT	2	6	164424	164429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_020566	TCA	2	6	164510	164515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_020566	TGTA	2	8	164518	164525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020566	ATG	2	6	164537	164542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020566	TA	4	8	164633	164640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020566	TTTA	2	8	164643	164650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020566	AT	3	6	164686	164691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020566	A	7	7	164717	164723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020566	T	6	6	164765	164770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020566	AGG	2	6	164784	164789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020566	TTA	2	6	164792	164797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020566	ATT	2	6	164803	164808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221889
4014	NC_020566	TTA	2	6	164810	164815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221889
4015	NC_020566	AGA	2	6	164848	164853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221889
4016	NC_020566	GCA	2	6	164867	164872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221889
4017	NC_020566	TTATT	2	10	164938	164947	20 %	80 %	0 %	0 %	470221889
4018	NC_020566	AAG	2	6	165018	165023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221889
4019	NC_020566	GAA	2	6	165161	165166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221889
4020	NC_020566	ATGT	2	8	165195	165202	25 %	50 %	25 %	0 %	470221889
4021	NC_020566	TGA	2	6	165241	165246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221889
4022	NC_020566	CG	4	8	165260	165267	0 %	0 %	50 %	50 %	470221889
4023	NC_020566	TAA	2	6	165308	165313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221889
4024	NC_020566	ACA	2	6	165315	165320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_020566	TGA	2	6	165324	165329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020566	AT	3	6	165331	165336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020566	TA	3	6	165338	165343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020566	AGT	2	6	165400	165405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020566	GAA	2	6	165412	165417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020566	TAG	2	6	165469	165474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020566	CGT	2	6	165492	165497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_020566	ATC	2	6	165544	165549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_020566	TAG	2	6	165626	165631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020566	CAA	2	6	165664	165669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221890
4035	NC_020566	ACA	2	6	165672	165677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221890
4036	NC_020566	CATC	2	8	165805	165812	25 %	25 %	0 %	50 %	470221890
4037	NC_020566	ATT	2	6	165826	165831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221890
4038	NC_020566	ACA	2	6	165846	165851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221890
4039	NC_020566	CAT	2	6	165883	165888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221890
4040	NC_020566	TGC	2	6	165893	165898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221890
4041	NC_020566	ACA	2	6	165917	165922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221890
4042	NC_020566	GGATT	2	10	165926	165935	20 %	40 %	40 %	0 %	470221890
4043	NC_020566	TGA	2	6	165951	165956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221890
4044	NC_020566	AGA	2	6	165990	165995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221890
4045	NC_020566	AAC	2	6	166037	166042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221890
4046	NC_020566	GATG	2	8	166089	166096	25 %	25 %	50 %	0 %	470221890
4047	NC_020566	TAT	2	6	166179	166184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221890
4048	NC_020566	TGA	2	6	166203	166208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221890
4049	NC_020566	ATT	2	6	166258	166263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221890
4050	NC_020566	ATC	3	9	166358	166366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221890
4051	NC_020566	ATT	2	6	166382	166387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221890
4052	NC_020566	GAGT	2	8	166394	166401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020566	TCA	2	6	166428	166433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221891
4054	NC_020566	TGA	3	9	166554	166562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221891
4055	NC_020566	A	6	6	166565	166570	100 %	0 %	0 %	0 %	470221891
4056	NC_020566	TTA	2	6	166571	166576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221891
4057	NC_020566	ATC	2	6	166587	166592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221891
4058	NC_020566	AAT	2	6	166622	166627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221891
4059	NC_020566	CAT	2	6	166745	166750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221891
4060	NC_020566	TAA	2	6	166798	166803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221891
4061	NC_020566	GAT	2	6	166808	166813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221891
4062	NC_020566	CAG	2	6	166923	166928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221891
4063	NC_020566	TGA	2	6	167035	167040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221891
4064	NC_020566	TG	3	6	167063	167068	0 %	50 %	50 %	0 %	470221891
4065	NC_020566	ATGA	2	8	167153	167160	50 %	25 %	25 %	0 %	470221891
4066	NC_020566	GCAA	2	8	167163	167170	50 %	0 %	25 %	25 %	470221891
4067	NC_020566	CAT	2	6	167189	167194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221891
4068	NC_020566	ACA	2	6	167299	167304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221891
4069	NC_020566	ATG	2	6	167328	167333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221891
4070	NC_020566	TTG	2	6	167337	167342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221891
4071	NC_020566	AGG	2	6	167358	167363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470221891
4072	NC_020566	TAT	2	6	167409	167414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_020566	TAT	2	6	167421	167426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020566	ATT	3	9	167452	167460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221892
4075	NC_020566	TGT	2	6	167586	167591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221892
4076	NC_020566	TTG	2	6	167596	167601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221892
4077	NC_020566	CTT	2	6	167619	167624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221892
4078	NC_020566	GGAA	2	8	167629	167636	50 %	0 %	50 %	0 %	470221892
4079	NC_020566	ACA	2	6	167648	167653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221892
4080	NC_020566	TGT	2	6	167712	167717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221892
4081	NC_020566	TTGGTA	2	12	167726	167737	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470221892
4082	NC_020566	GCGATT	2	12	167746	167757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470221892
4083	NC_020566	GCT	2	6	167767	167772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221892
4084	NC_020566	T	6	6	167772	167777	0 %	100 %	0 %	0 %	470221892
4085	NC_020566	AAATTT	2	12	167844	167855	50 %	50 %	0 %	0 %	470221892
4086	NC_020566	GGT	2	6	167861	167866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221892
4087	NC_020566	AT	3	6	167879	167884	50 %	50 %	0 %	0 %	470221892
4088	NC_020566	T	6	6	167994	167999	0 %	100 %	0 %	0 %	470221892
4089	NC_020566	AGA	2	6	168030	168035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221892
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4091	NC_020566	ATT	2	6	168063	168068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221892
4092	NC_020566	TAT	2	6	168075	168080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221892
4093	NC_020566	AGA	2	6	168118	168123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221892
4094	NC_020566	GA	3	6	168137	168142	50 %	0 %	50 %	0 %	470221893
4095	NC_020566	TGA	3	9	168143	168151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221893
4096	NC_020566	TAG	2	6	168191	168196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221893
4097	NC_020566	TGA	2	6	168201	168206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221893
4098	NC_020566	TAT	2	6	168214	168219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221893
4099	NC_020566	CAA	2	6	168235	168240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221893
4100	NC_020566	GGC	2	6	168267	168272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470221893
4101	NC_020566	A	6	6	168279	168284	100 %	0 %	0 %	0 %	470221893
4102	NC_020566	ACA	2	6	168322	168327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221893
4103	NC_020566	AAT	2	6	168394	168399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221893
4104	NC_020566	ACA	2	6	168405	168410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221893
4105	NC_020566	AC	3	6	168498	168503	50 %	0 %	0 %	50 %	470221893
4106	NC_020566	GTAA	2	8	168547	168554	50 %	25 %	25 %	0 %	470221893
4107	NC_020566	AAG	2	6	168560	168565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221893
4108	NC_020566	ATT	2	6	168569	168574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221893
4109	NC_020566	ATC	2	6	168597	168602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221893
4110	NC_020566	A	6	6	168659	168664	100 %	0 %	0 %	0 %	470221893
4111	NC_020566	T	6	6	168669	168674	0 %	100 %	0 %	0 %	470221893
4112	NC_020566	ATC	2	6	168739	168744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221893
4113	NC_020566	ATG	2	6	168749	168754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221893
4114	NC_020566	ATG	2	6	168893	168898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221893
4115	NC_020566	A	6	6	168910	168915	100 %	0 %	0 %	0 %	470221893
4116	NC_020566	AG	3	6	168931	168936	50 %	0 %	50 %	0 %	470221893
4117	NC_020566	TAACT	2	10	168963	168972	40 %	40 %	0 %	20 %	470221893
4118	NC_020566	GAA	2	6	168999	169004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221893
4119	NC_020566	TATT	2	8	169015	169022	25 %	75 %	0 %	0 %	470221893
4120	NC_020566	GTC	2	6	169045	169050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221893
4121	NC_020566	TGG	2	6	169053	169058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221893
4122	NC_020566	AC	3	6	169070	169075	50 %	0 %	0 %	50 %	470221893
4123	NC_020566	TTC	3	9	169111	169119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221893
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4125	NC_020566	T	6	6	169194	169199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4127	NC_020566	T	6	6	169223	169228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_020566	TTG	2	6	179365	179370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221896
4375	NC_020566	GAT	2	6	179388	179393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221896
4376	NC_020566	GTT	2	6	179394	179399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221896
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4380	NC_020566	CAT	2	6	179523	179528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221896
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4382	NC_020566	AGA	2	6	179585	179590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221896
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4386	NC_020566	AC	3	6	179908	179913	50 %	0 %	0 %	50 %	470221896
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4393	NC_020566	AT	3	6	180185	180190	50 %	50 %	0 %	0 %	470221896
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4403	NC_020566	GTGAA	2	10	180754	180763	40 %	20 %	40 %	0 %	470221897
4404	NC_020566	ATTT	2	8	180773	180780	25 %	75 %	0 %	0 %	470221897
4405	NC_020566	A	6	6	180834	180839	100 %	0 %	0 %	0 %	470221897
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4409	NC_020566	ACG	2	6	181065	181070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4410	NC_020566	ATCAT	2	10	181107	181116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4411	NC_020566	TAA	2	6	181123	181128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_020566	ATCA	2	8	181141	181148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4413	NC_020566	GAT	2	6	181161	181166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4482	NC_020566	TCAT	2	8	184424	184431	25 %	50 %	0 %	25 %	470221901
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4485	NC_020566	T	6	6	184521	184526	0 %	100 %	0 %	0 %	470221901
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4491	NC_020566	CTA	2	6	184752	184757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221901
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4493	NC_020566	TTAC	2	8	184775	184782	25 %	50 %	0 %	25 %	470221901
4494	NC_020566	ATT	2	6	184819	184824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221901
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4497	NC_020566	TG	3	6	184917	184922	0 %	50 %	50 %	0 %	470221901
4498	NC_020566	AATT	2	8	184957	184964	50 %	50 %	0 %	0 %	470221901
4499	NC_020566	ATC	2	6	185006	185011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221901
4500	NC_020566	CCT	2	6	185019	185024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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