MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020566	AAC	2	6	141739	141744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221870
3502	NC_020566	TGA	2	6	141765	141770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221870
3503	NC_020566	TGGTA	2	10	141784	141793	20 %	40 %	40 %	0 %	470221870
3504	NC_020566	CGAAC	2	10	141874	141883	40 %	0 %	20 %	40 %	470221870
3505	NC_020566	TA	3	6	141900	141905	50 %	50 %	0 %	0 %	470221870
3506	NC_020566	ATG	2	6	141917	141922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221870
3507	NC_020566	TGG	3	9	141955	141963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221870
3508	NC_020566	GATG	2	8	141970	141977	25 %	25 %	50 %	0 %	470221870
3509	NC_020566	CAT	2	6	142017	142022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221870
3510	NC_020566	ATT	2	6	142220	142225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221870
3511	NC_020566	TGA	2	6	142239	142244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221870
3512	NC_020566	CAG	2	6	142263	142268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221870
3513	NC_020566	ATC	2	6	142384	142389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221870
3514	NC_020566	AG	3	6	142415	142420	50 %	0 %	50 %	0 %	470221870
3515	NC_020566	TGG	2	6	142504	142509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221870
3516	NC_020566	TAC	2	6	142548	142553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221870
3517	NC_020566	ATT	2	6	142597	142602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221870
3518	NC_020566	TTC	2	6	142616	142621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221870
3519	NC_020566	GT	3	6	142764	142769	0 %	50 %	50 %	0 %	470221870
3520	NC_020566	GAA	3	9	142772	142780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221870
3521	NC_020566	AAG	2	6	142848	142853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221870
3522	NC_020566	CAT	2	6	142887	142892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221870
3523	NC_020566	AAT	2	6	142905	142910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221870
3524	NC_020566	ATA	2	6	142918	142923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020566	A	6	6	142954	142959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020566	TATT	2	8	143007	143014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020566	T	7	7	143048	143054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020566	TAC	2	6	143098	143103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_020566	ATT	2	6	143115	143120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020566	AAT	2	6	143149	143154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020566	TAAT	2	8	143167	143174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020566	TA	5	10	143204	143213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020566	AAT	2	6	143248	143253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221871
3534	NC_020566	AAG	2	6	143283	143288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221871
3535	NC_020566	A	7	7	143295	143301	100 %	0 %	0 %	0 %	470221871
3536	NC_020566	ATT	2	6	143315	143320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221871
3537	NC_020566	TAT	2	6	143328	143333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221871
3538	NC_020566	ATT	2	6	143339	143344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221871
3539	NC_020566	A	6	6	143643	143648	100 %	0 %	0 %	0 %	470221871
3540	NC_020566	CAG	2	6	143739	143744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221871
3541	NC_020566	TA	4	8	143812	143819	50 %	50 %	0 %	0 %	470221871
3542	NC_020566	TCT	2	6	143820	143825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221871
3543	NC_020566	GAA	2	6	143858	143863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221871
3544	NC_020566	AGAA	2	8	143871	143878	75 %	0 %	25 %	0 %	470221871
3545	NC_020566	TTCAA	2	10	143899	143908	40 %	40 %	0 %	20 %	470221871
3546	NC_020566	TTAA	2	8	143913	143920	50 %	50 %	0 %	0 %	470221871
3547	NC_020566	A	6	6	143941	143946	100 %	0 %	0 %	0 %	470221872
3548	NC_020566	ACA	3	9	143957	143965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221872
3549	NC_020566	CAA	2	6	143991	143996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221872
3550	NC_020566	CAT	2	6	144028	144033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221872
3551	NC_020566	ATA	2	6	144213	144218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221872
3552	NC_020566	TAA	2	6	144376	144381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221872
3553	NC_020566	ATT	3	9	144392	144400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221872
3554	NC_020566	A	7	7	144486	144492	100 %	0 %	0 %	0 %	470221872
3555	NC_020566	A	6	6	144509	144514	100 %	0 %	0 %	0 %	470221872
3556	NC_020566	GCAG	2	8	144536	144543	25 %	0 %	50 %	25 %	470221872
3557	NC_020566	TCT	2	6	144587	144592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221872
3558	NC_020566	TTA	2	6	144595	144600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221872
3559	NC_020566	TAT	2	6	144605	144610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221872
3560	NC_020566	TGAT	2	8	144626	144633	25 %	50 %	25 %	0 %	470221873
3561	NC_020566	AT	3	6	144644	144649	50 %	50 %	0 %	0 %	470221873
3562	NC_020566	GAT	2	6	144687	144692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221873
3563	NC_020566	ACA	2	6	144712	144717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221873
3564	NC_020566	ACATC	2	10	144742	144751	40 %	20 %	0 %	40 %	470221873
3565	NC_020566	TAT	2	6	144850	144855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221873
3566	NC_020566	TTA	2	6	144908	144913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221873
3567	NC_020566	ATT	2	6	144984	144989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221873
3568	NC_020566	ATT	2	6	145021	145026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221873
3569	NC_020566	TTAA	2	8	145081	145088	50 %	50 %	0 %	0 %	470221873
3570	NC_020566	A	7	7	145141	145147	100 %	0 %	0 %	0 %	470221873
3571	NC_020566	ATT	2	6	145271	145276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221873
3572	NC_020566	TTA	2	6	145295	145300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221873
3573	NC_020566	AGTT	2	8	145310	145317	25 %	50 %	25 %	0 %	470221873
3574	NC_020566	TGA	2	6	145320	145325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221873
3575	NC_020566	A	7	7	145327	145333	100 %	0 %	0 %	0 %	470221873
3576	NC_020566	CAA	2	6	145351	145356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221873
3577	NC_020566	TTA	2	6	145492	145497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221874
3578	NC_020566	ATT	2	6	145534	145539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221874
3579	NC_020566	CAT	2	6	145571	145576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221874
3580	NC_020566	ATTT	2	8	145585	145592	25 %	75 %	0 %	0 %	470221874
3581	NC_020566	ATC	2	6	145602	145607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221874
3582	NC_020566	GTGA	2	8	145628	145635	25 %	25 %	50 %	0 %	470221874
3583	NC_020566	GAC	2	6	145660	145665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221874
3584	NC_020566	TTA	2	6	145674	145679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221874
3585	NC_020566	TGG	2	6	145683	145688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221874
3586	NC_020566	T	6	6	145718	145723	0 %	100 %	0 %	0 %	470221874
3587	NC_020566	GAT	2	6	145744	145749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221874
3588	NC_020566	TAA	2	6	145822	145827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221874
3589	NC_020566	GTT	2	6	145841	145846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221874
3590	NC_020566	GAT	2	6	145928	145933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221874
3591	NC_020566	A	7	7	146027	146033	100 %	0 %	0 %	0 %	470221874
3592	NC_020566	TCA	2	6	146034	146039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221874
3593	NC_020566	GAAA	2	8	146071	146078	75 %	0 %	25 %	0 %	470221874
3594	NC_020566	TAA	2	6	146080	146085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221874
3595	NC_020566	ATGG	2	8	146096	146103	25 %	25 %	50 %	0 %	470221874
3596	NC_020566	AGA	2	6	146131	146136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221874
3597	NC_020566	A	6	6	146171	146176	100 %	0 %	0 %	0 %	470221874
3598	NC_020566	AGA	2	6	146185	146190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221874
3599	NC_020566	GATATG	2	12	146219	146230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221874
3600	NC_020566	GGT	2	6	146276	146281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221874
3601	NC_020566	TAT	2	6	146332	146337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221874
3602	NC_020566	TATT	2	8	146362	146369	25 %	75 %	0 %	0 %	470221874
3603	NC_020566	AATC	2	8	146371	146378	50 %	25 %	0 %	25 %	470221874
3604	NC_020566	A	6	6	146401	146406	100 %	0 %	0 %	0 %	470221874
3605	NC_020566	TAT	2	6	146422	146427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221874
3606	NC_020566	GCA	3	9	146498	146506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221874
3607	NC_020566	CA	3	6	146505	146510	50 %	0 %	0 %	50 %	470221874
3608	NC_020566	GAA	2	6	146540	146545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221874
3609	NC_020566	ATA	3	9	146553	146561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221874
3610	NC_020566	CTG	2	6	146580	146585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221874
3611	NC_020566	GCT	2	6	146588	146593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221874
3612	NC_020566	ATT	2	6	146690	146695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221874
3613	NC_020566	ATG	2	6	146706	146711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221874
3614	NC_020566	TTG	2	6	146730	146735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221874
3615	NC_020566	GAA	2	6	146801	146806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221874
3616	NC_020566	GCAG	2	8	146884	146891	25 %	0 %	50 %	25 %	470221874
3617	NC_020566	TAATT	2	10	146965	146974	40 %	60 %	0 %	0 %	470221874
3618	NC_020566	A	6	6	146987	146992	100 %	0 %	0 %	0 %	470221874
3619	NC_020566	GAC	2	6	146996	147001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221874
3620	NC_020566	A	6	6	147036	147041	100 %	0 %	0 %	0 %	470221874
3621	NC_020566	A	6	6	147093	147098	100 %	0 %	0 %	0 %	470221874
3622	NC_020566	ACA	2	6	147115	147120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221874
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3997	NC_020566	T	6	6	164220	164225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_020566	CAA	2	6	164303	164308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_020566	AAAT	2	8	164363	164370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_020566	TCCCAC	2	12	164392	164403	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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