MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020566	TATG	2	8	120817	120824	25 %	50 %	25 %	0 %	470221853
3002	NC_020566	AAC	2	6	120828	120833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221853
3003	NC_020566	AATC	2	8	120900	120907	50 %	25 %	0 %	25 %	470221853
3004	NC_020566	GAG	2	6	120936	120941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470221853
3005	NC_020566	AAG	2	6	120952	120957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221853
3006	NC_020566	TTTA	2	8	121103	121110	25 %	75 %	0 %	0 %	470221854
3007	NC_020566	TTA	2	6	121129	121134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3008	NC_020566	T	6	6	121146	121151	0 %	100 %	0 %	0 %	470221854
3009	NC_020566	ATT	2	6	121162	121167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3010	NC_020566	ATT	2	6	121186	121191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3011	NC_020566	TTTG	2	8	121196	121203	0 %	75 %	25 %	0 %	470221854
3012	NC_020566	T	6	6	121207	121212	0 %	100 %	0 %	0 %	470221854
3013	NC_020566	GAT	2	6	121213	121218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221854
3014	NC_020566	TTA	2	6	121226	121231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3015	NC_020566	ATTT	2	8	121279	121286	25 %	75 %	0 %	0 %	470221854
3016	NC_020566	GAT	2	6	121296	121301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221854
3017	NC_020566	A	6	6	121324	121329	100 %	0 %	0 %	0 %	470221854
3018	NC_020566	TTATA	2	10	121344	121353	40 %	60 %	0 %	0 %	470221854
3019	NC_020566	TAT	2	6	121380	121385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3020	NC_020566	TGA	2	6	121431	121436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221854
3021	NC_020566	AATG	2	8	121455	121462	50 %	25 %	25 %	0 %	470221854
3022	NC_020566	ATT	2	6	121489	121494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3023	NC_020566	ATTT	2	8	121621	121628	25 %	75 %	0 %	0 %	470221854
3024	NC_020566	TTA	2	6	121631	121636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3025	NC_020566	TAG	2	6	121647	121652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221854
3026	NC_020566	ACT	2	6	121724	121729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221854
3027	NC_020566	CAT	2	6	121805	121810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221854
3028	NC_020566	TTG	2	6	121940	121945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221854
3029	NC_020566	ATA	2	6	121949	121954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221854
3030	NC_020566	ATT	2	6	121998	122003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3031	NC_020566	TTTA	2	8	122018	122025	25 %	75 %	0 %	0 %	470221854
3032	NC_020566	ATT	2	6	122034	122039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221854
3033	NC_020566	TTG	2	6	122075	122080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221854
3034	NC_020566	TAA	2	6	122121	122126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221854
3035	NC_020566	TTTTA	2	10	122142	122151	20 %	80 %	0 %	0 %	470221854
3036	NC_020566	ATT	2	6	122228	122233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_020566	ATT	2	6	122288	122293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221855
3038	NC_020566	GTG	2	6	122313	122318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221855
3039	NC_020566	TTTC	2	8	122334	122341	0 %	75 %	0 %	25 %	470221855
3040	NC_020566	TGA	2	6	122361	122366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221855
3041	NC_020566	CAG	2	6	122441	122446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221855
3042	NC_020566	ATT	2	6	122470	122475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221855
3043	NC_020566	TATT	2	8	122520	122527	25 %	75 %	0 %	0 %	470221855
3044	NC_020566	GAT	2	6	122528	122533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221855
3045	NC_020566	CTA	2	6	122549	122554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221855
3046	NC_020566	TAT	2	6	122566	122571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221855
3047	NC_020566	GCA	2	6	122576	122581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221855
3048	NC_020566	TTG	2	6	122643	122648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221855
3049	NC_020566	GTATT	2	10	122655	122664	20 %	60 %	20 %	0 %	470221855
3050	NC_020566	GTT	2	6	122672	122677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221855
3051	NC_020566	ATCA	2	8	122691	122698	50 %	25 %	0 %	25 %	470221855
3052	NC_020566	TGTA	2	8	122709	122716	25 %	50 %	25 %	0 %	470221855
3053	NC_020566	CTATTG	2	12	122721	122732	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470221855
3054	NC_020566	TCGT	2	8	122824	122831	0 %	50 %	25 %	25 %	470221855
3055	NC_020566	TTA	2	6	122843	122848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221855
3056	NC_020566	TA	3	6	122868	122873	50 %	50 %	0 %	0 %	470221855
3057	NC_020566	GTT	2	6	122888	122893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221855
3058	NC_020566	TAG	2	6	122901	122906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221855
3059	NC_020566	CAA	2	6	122915	122920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221855
3060	NC_020566	TAA	2	6	123055	123060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221855
3061	NC_020566	CAT	2	6	123120	123125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221855
3062	NC_020566	TTTA	2	8	123126	123133	25 %	75 %	0 %	0 %	470221855
3063	NC_020566	TGA	2	6	123171	123176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221855
3064	NC_020566	TTA	2	6	123236	123241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221855
3065	NC_020566	AATAA	2	10	123248	123257	80 %	20 %	0 %	0 %	470221855
3066	NC_020566	TA	3	6	123261	123266	50 %	50 %	0 %	0 %	470221855
3067	NC_020566	TAT	2	6	123303	123308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221855
3068	NC_020566	AT	3	6	123320	123325	50 %	50 %	0 %	0 %	470221855
3069	NC_020566	CTTA	2	8	123376	123383	25 %	50 %	0 %	25 %	470221855
3070	NC_020566	TTG	2	6	123393	123398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221855
3071	NC_020566	TGC	2	6	123454	123459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221855
3072	NC_020566	ATG	2	6	123464	123469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221855
3073	NC_020566	ATT	2	6	123495	123500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221855
3074	NC_020566	TACGC	2	10	123515	123524	20 %	20 %	20 %	40 %	470221855
3075	NC_020566	TAG	2	6	123546	123551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221855
3076	NC_020566	ATG	2	6	123566	123571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221855
3077	NC_020566	AAG	2	6	123667	123672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_020566	T	6	6	123708	123713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_020566	TA	3	6	123803	123808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_020566	AAAT	2	8	123821	123828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_020566	AAT	3	9	123826	123834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_020566	AC	3	6	123844	123849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_020566	ATTA	2	8	123855	123862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_020566	AGG	2	6	123884	123889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_020566	CATATG	2	12	123924	123935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470221856
3086	NC_020566	AT	3	6	123949	123954	50 %	50 %	0 %	0 %	470221856
3087	NC_020566	TCA	2	6	123976	123981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221856
3088	NC_020566	TACG	2	8	123997	124004	25 %	25 %	25 %	25 %	470221856
3089	NC_020566	ATCA	2	8	124047	124054	50 %	25 %	0 %	25 %	470221856
3090	NC_020566	TAA	2	6	124114	124119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221856
3091	NC_020566	GGT	2	6	124124	124129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221856
3092	NC_020566	CATT	2	8	124139	124146	25 %	50 %	0 %	25 %	470221856
3093	NC_020566	GAA	2	6	124175	124180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221856
3094	NC_020566	CAA	2	6	124257	124262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221856
3095	NC_020566	ATT	2	6	124264	124269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221856
3096	NC_020566	GTT	2	6	124292	124297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221856
3097	NC_020566	ATG	2	6	124299	124304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221856
3098	NC_020566	CTA	2	6	124396	124401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221856
3099	NC_020566	A	6	6	124463	124468	100 %	0 %	0 %	0 %	470221856
3100	NC_020566	TGA	2	6	124471	124476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221856
3101	NC_020566	AGC	2	6	124486	124491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221856
3102	NC_020566	ATA	2	6	124495	124500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221856
3103	NC_020566	T	6	6	124544	124549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_020566	ATA	2	6	124610	124615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_020566	TTA	2	6	124640	124645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_020566	TTG	2	6	124646	124651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_020566	ATG	2	6	124658	124663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_020566	TA	3	6	124674	124679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_020566	ACA	2	6	124686	124691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_020566	ATTA	2	8	124694	124701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_020566	TAAA	2	8	124718	124725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_020566	ATT	2	6	124741	124746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_020566	A	6	6	124771	124776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_020566	TTG	2	6	124796	124801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_020566	AATGTA	2	12	124825	124836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_020566	A	6	6	124868	124873	100 %	0 %	0 %	0 %	470221857
3117	NC_020566	AATG	2	8	124960	124967	50 %	25 %	25 %	0 %	470221857
3118	NC_020566	ATC	2	6	124998	125003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221857
3119	NC_020566	AGT	2	6	125017	125022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221857
3120	NC_020566	ATG	2	6	125121	125126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221857
3121	NC_020566	TGG	2	6	125284	125289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221857
3122	NC_020566	CAA	2	6	125327	125332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221857
3123	NC_020566	AC	4	8	125349	125356	50 %	0 %	0 %	50 %	470221857
3124	NC_020566	ACA	2	6	125377	125382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221857
3125	NC_020566	ATC	2	6	125395	125400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221857
3126	NC_020566	ATG	2	6	125411	125416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221857
3127	NC_020566	TCA	2	6	125438	125443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221857
3128	NC_020566	ATC	2	6	125445	125450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221857
3129	NC_020566	A	6	6	125468	125473	100 %	0 %	0 %	0 %	470221857
3130	NC_020566	GCT	2	6	125483	125488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221857
3131	NC_020566	ACT	2	6	125533	125538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221857
3132	NC_020566	GAC	2	6	125568	125573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221857
3133	NC_020566	CAA	2	6	125577	125582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221857
3134	NC_020566	ATAA	2	8	125583	125590	75 %	25 %	0 %	0 %	470221857
3135	NC_020566	ATA	2	6	125593	125598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_020566	TAA	2	6	125603	125608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_020566	GAGC	2	8	125631	125638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_020566	AGT	2	6	125684	125689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_020566	TGAA	2	8	125694	125701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_020566	TCA	2	6	125750	125755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_020566	A	6	6	125755	125760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_020566	TAA	2	6	125773	125778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_020566	TAA	2	6	125782	125787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221858
3144	NC_020566	TTA	2	6	125845	125850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221858
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3146	NC_020566	CAA	2	6	125899	125904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221858
3147	NC_020566	TGAT	2	8	125976	125983	25 %	50 %	25 %	0 %	470221858
3148	NC_020566	GTC	2	6	126024	126029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221858
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3154	NC_020566	TGA	2	6	126219	126224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221858
3155	NC_020566	TTTG	2	8	126298	126305	0 %	75 %	25 %	0 %	470221858
3156	NC_020566	TCCCT	2	10	126321	126330	0 %	40 %	0 %	60 %	470221858
3157	NC_020566	CT	3	6	126337	126342	0 %	50 %	0 %	50 %	470221858
3158	NC_020566	GC	3	6	126405	126410	0 %	0 %	50 %	50 %	470221858
3159	NC_020566	TA	3	6	126473	126478	50 %	50 %	0 %	0 %	470221858
3160	NC_020566	TAT	2	6	126482	126487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221858
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3162	NC_020566	AAT	2	6	126564	126569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_020566	ATAG	2	8	126605	126612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_020566	TAG	2	6	126640	126645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_020566	CTGTAA	2	12	126646	126657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3166	NC_020566	A	6	6	126702	126707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_020566	TAT	3	9	126708	126716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_020566	GGA	2	6	126759	126764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470221859
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3170	NC_020566	AATG	2	8	126798	126805	50 %	25 %	25 %	0 %	470221859
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3172	NC_020566	A	6	6	126943	126948	100 %	0 %	0 %	0 %	470221859
3173	NC_020566	GGTATG	2	12	126967	126978	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470221859
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3175	NC_020566	A	6	6	127027	127032	100 %	0 %	0 %	0 %	470221859
3176	NC_020566	ATG	2	6	127082	127087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221859
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3184	NC_020566	CAA	2	6	127412	127417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221859
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3204	NC_020566	TA	3	6	128189	128194	50 %	50 %	0 %	0 %	470221860
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3220	NC_020566	AT	3	6	128858	128863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_020566	TAAA	2	8	128882	128889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_020566	TA	3	6	128895	128900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_020566	GAG	2	6	128905	128910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_020566	AGTA	2	8	128912	128919	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3225	NC_020566	AT	3	6	128933	128938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3226	NC_020566	ATC	2	6	128988	128993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3228	NC_020566	GCA	2	6	129054	129059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3230	NC_020566	TCA	2	6	129190	129195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3231	NC_020566	TGA	2	6	129224	129229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_020566	ACA	2	6	129233	129238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3233	NC_020566	CA	3	6	129272	129277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3234	NC_020566	ATT	2	6	129287	129292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_020566	TTG	2	6	129302	129307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_020566	AGA	2	6	129404	129409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_020566	CGTA	2	8	129467	129474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3238	NC_020566	AGA	2	6	129479	129484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_020566	CAGATT	2	12	129562	129573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3240	NC_020566	AT	4	8	129578	129585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_020566	AGT	2	6	129788	129793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221861
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3243	NC_020566	ATACT	2	10	129818	129827	40 %	40 %	0 %	20 %	470221861
3244	NC_020566	CAA	2	6	129945	129950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221861
3245	NC_020566	GAA	2	6	129954	129959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221861
3246	NC_020566	GTT	2	6	129975	129980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221861
3247	NC_020566	TGC	2	6	130088	130093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221861
3248	NC_020566	AGA	2	6	130115	130120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221861
3249	NC_020566	TAT	2	6	130184	130189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221861
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3251	NC_020566	ATG	2	6	130303	130308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221861
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