MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020566	TGT	2	6	99186	99191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2502	NC_020566	TTG	2	6	99195	99200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2503	NC_020566	GTT	2	6	99310	99315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2504	NC_020566	TGT	2	6	99360	99365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2505	NC_020566	TTG	2	6	99369	99374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2506	NC_020566	T	6	6	99413	99418	0 %	100 %	0 %	0 %	470221835
2507	NC_020566	GTC	2	6	99452	99457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221835
2508	NC_020566	TGAA	2	8	99468	99475	50 %	25 %	25 %	0 %	470221835
2509	NC_020566	TTG	2	6	99533	99538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2510	NC_020566	TTG	2	6	99543	99548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2511	NC_020566	TTG	2	6	99557	99562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2512	NC_020566	ATC	2	6	99635	99640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221835
2513	NC_020566	TTG	2	6	99716	99721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221835
2514	NC_020566	GCA	2	6	99738	99743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221835
2515	NC_020566	GCA	2	6	99747	99752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221835
2516	NC_020566	CCA	2	6	99762	99767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221835
2517	NC_020566	TTTTTC	2	12	99834	99845	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470221835
2518	NC_020566	TGTA	2	8	99860	99867	25 %	50 %	25 %	0 %	470221835
2519	NC_020566	TCA	2	6	99877	99882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221835
2520	NC_020566	TTAAAT	2	12	99929	99940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020566	AAAT	2	8	99960	99967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_020566	TAA	2	6	100032	100037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_020566	T	6	6	100060	100065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020566	A	6	6	100096	100101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020566	GTT	2	6	100183	100188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020566	A	6	6	100211	100216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020566	ATT	2	6	100267	100272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221836
2528	NC_020566	TAA	2	6	100304	100309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221836
2529	NC_020566	TAA	2	6	100325	100330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221836
2530	NC_020566	TGC	2	6	100347	100352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221836
2531	NC_020566	TTTC	2	8	100377	100384	0 %	75 %	0 %	25 %	470221836
2532	NC_020566	TTA	2	6	100405	100410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221836
2533	NC_020566	T	6	6	100422	100427	0 %	100 %	0 %	0 %	470221836
2534	NC_020566	ATT	2	6	100430	100435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221836
2535	NC_020566	TGG	2	6	100464	100469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221836
2536	NC_020566	AAG	2	6	100490	100495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221836
2537	NC_020566	ATA	2	6	100521	100526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221836
2538	NC_020566	T	6	6	100565	100570	0 %	100 %	0 %	0 %	470221836
2539	NC_020566	ATA	2	6	100572	100577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221836
2540	NC_020566	CAT	2	6	100598	100603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221836
2541	NC_020566	ATC	2	6	100635	100640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221836
2542	NC_020566	TC	3	6	100714	100719	0 %	50 %	0 %	50 %	470221836
2543	NC_020566	GTT	2	6	100720	100725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221836
2544	NC_020566	TCA	2	6	100755	100760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221836
2545	NC_020566	AT	3	6	100782	100787	50 %	50 %	0 %	0 %	470221836
2546	NC_020566	TCT	2	6	100855	100860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221836
2547	NC_020566	GT	3	6	100870	100875	0 %	50 %	50 %	0 %	470221836
2548	NC_020566	TGA	2	6	100884	100889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221836
2549	NC_020566	AATA	2	8	100890	100897	75 %	25 %	0 %	0 %	470221836
2550	NC_020566	T	6	6	100946	100951	0 %	100 %	0 %	0 %	470221836
2551	NC_020566	AT	3	6	100965	100970	50 %	50 %	0 %	0 %	470221836
2552	NC_020566	TTA	2	6	101007	101012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221836
2553	NC_020566	ATA	2	6	101066	101071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020566	AAT	2	6	101077	101082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020566	ATA	2	6	101102	101107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020566	TTA	2	6	101116	101121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020566	GAA	2	6	101199	101204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020566	ATTG	2	8	101206	101213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_020566	TA	3	6	101244	101249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020566	TAACAA	2	12	101286	101297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2561	NC_020566	A	7	7	101311	101317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_020566	GTTA	2	8	101328	101335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020566	TAA	2	6	101378	101383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_020566	TAA	3	9	101407	101415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221837
2565	NC_020566	GAA	2	6	101422	101427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221837
2566	NC_020566	AGC	2	6	101440	101445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221837
2567	NC_020566	AATA	2	8	101446	101453	75 %	25 %	0 %	0 %	470221837
2568	NC_020566	CTG	2	6	101457	101462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221837
2569	NC_020566	CTT	2	6	101466	101471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221837
2570	NC_020566	AAT	2	6	101527	101532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221837
2571	NC_020566	GTG	2	6	101589	101594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221837
2572	NC_020566	CTA	2	6	101622	101627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221837
2573	NC_020566	TAG	2	6	101652	101657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221837
2574	NC_020566	TAAGCC	2	12	101695	101706	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470221837
2575	NC_020566	TCA	2	6	101720	101725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221837
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2577	NC_020566	GCA	2	6	101858	101863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221837
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2579	NC_020566	GAT	2	6	101932	101937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221837
2580	NC_020566	ATC	2	6	101987	101992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221837
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2582	NC_020566	CAC	2	6	102087	102092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221837
2583	NC_020566	ATA	2	6	102104	102109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221837
2584	NC_020566	T	6	6	102128	102133	0 %	100 %	0 %	0 %	470221837
2585	NC_020566	ATC	2	6	102299	102304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221837
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2587	NC_020566	T	6	6	102364	102369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020566	ATA	2	6	102409	102414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221838
2589	NC_020566	ATT	2	6	102478	102483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221838
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2592	NC_020566	TAA	2	6	102567	102572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221838
2593	NC_020566	TGA	2	6	102653	102658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221838
2594	NC_020566	ATA	2	6	102661	102666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221838
2595	NC_020566	ATC	2	6	102667	102672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221838
2596	NC_020566	GTC	2	6	102714	102719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221838
2597	NC_020566	TCA	2	6	102725	102730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221838
2598	NC_020566	TG	3	6	102740	102745	0 %	50 %	50 %	0 %	470221838
2599	NC_020566	AAT	2	6	102789	102794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221838
2600	NC_020566	ATA	2	6	102845	102850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221838
2601	NC_020566	ATA	2	6	102874	102879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221838
2602	NC_020566	ATCGCA	2	12	102910	102921	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470221838
2603	NC_020566	GGTGA	2	10	102941	102950	20 %	20 %	60 %	0 %	470221838
2604	NC_020566	CAA	2	6	102980	102985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221838
2605	NC_020566	AAC	2	6	102996	103001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221838
2606	NC_020566	A	6	6	103077	103082	100 %	0 %	0 %	0 %	470221838
2607	NC_020566	CAA	2	6	103149	103154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221838
2608	NC_020566	GCA	2	6	103171	103176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221838
2609	NC_020566	ACA	2	6	103222	103227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221838
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2611	NC_020566	ATT	2	6	103394	103399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221839
2612	NC_020566	ATC	2	6	103497	103502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221839
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2614	NC_020566	GCA	2	6	103585	103590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221839
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2617	NC_020566	ATA	2	6	103672	103677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221839
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2622	NC_020566	CTT	2	6	103895	103900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221839
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2995	NC_020566	CAA	2	6	120606	120611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221853
2996	NC_020566	ATG	2	6	120634	120639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221853
2997	NC_020566	TAT	2	6	120676	120681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221853
2998	NC_020566	ATACG	2	10	120686	120695	40 %	20 %	20 %	20 %	470221853
2999	NC_020566	TAA	2	6	120703	120708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221853
3000	NC_020566	TAG	2	6	120799	120804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221853

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