MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020566	AATT	2	8	249575	249582	50 %	50 %	0 %	0 %	470221947
6002	NC_020566	AAT	2	6	249596	249601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221947
6003	NC_020566	CTT	2	6	249721	249726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221947
6004	NC_020566	TTTA	2	8	249875	249882	25 %	75 %	0 %	0 %	470221947
6005	NC_020566	CCA	2	6	249906	249911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221947
6006	NC_020566	TAAA	2	8	250008	250015	75 %	25 %	0 %	0 %	470221947
6007	NC_020566	CAT	2	6	250126	250131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221947
6008	NC_020566	TTC	2	6	250142	250147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221947
6009	NC_020566	AG	3	6	250160	250165	50 %	0 %	50 %	0 %	470221947
6010	NC_020566	ATT	2	6	250169	250174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221947
6011	NC_020566	AGC	2	6	250220	250225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221947
6012	NC_020566	TTC	2	6	250289	250294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221947
6013	NC_020566	AAT	2	6	250312	250317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221947
6014	NC_020566	TCT	2	6	250350	250355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221947
6015	NC_020566	AAC	2	6	250391	250396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221947
6016	NC_020566	GTC	2	6	250418	250423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221947
6017	NC_020566	CTT	2	6	250507	250512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221947
6018	NC_020566	TAAA	2	8	250517	250524	75 %	25 %	0 %	0 %	470221947
6019	NC_020566	TTG	2	6	250532	250537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221947
6020	NC_020566	AGT	2	6	250557	250562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221947
6021	NC_020566	TGTAA	2	10	250585	250594	40 %	40 %	20 %	0 %	470221947
6022	NC_020566	ATC	2	6	250631	250636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221947
6023	NC_020566	GTT	2	6	250638	250643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221947
6024	NC_020566	TTTAC	2	10	250650	250659	20 %	60 %	0 %	20 %	470221947
6025	NC_020566	TAA	2	6	250705	250710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221947
6026	NC_020566	TAA	2	6	250718	250723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221947
6027	NC_020566	A	6	6	250767	250772	100 %	0 %	0 %	0 %	470221947
6028	NC_020566	ATT	2	6	250787	250792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221947
6029	NC_020566	GAA	2	6	250815	250820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221947
6030	NC_020566	ATC	2	6	250871	250876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221947
6031	NC_020566	CGG	2	6	250984	250989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470221947
6032	NC_020566	ATCAC	2	10	251022	251031	40 %	20 %	0 %	40 %	470221947
6033	NC_020566	TGT	2	6	251046	251051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221947
6034	NC_020566	CAAG	2	8	251075	251082	50 %	0 %	25 %	25 %	470221947
6035	NC_020566	ATAAC	2	10	251147	251156	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6036	NC_020566	ATA	2	6	251194	251199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_020566	TGAAT	2	10	251258	251267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_020566	TA	3	6	251282	251287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_020566	ATTAA	2	10	251399	251408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_020566	TAT	2	6	251417	251422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_020566	ATC	2	6	251459	251464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221948
6042	NC_020566	GAA	2	6	251465	251470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221948
6043	NC_020566	AGA	2	6	251481	251486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221948
6044	NC_020566	ACA	2	6	251488	251493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221948
6045	NC_020566	TCA	2	6	251536	251541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221948
6046	NC_020566	ACAT	2	8	251570	251577	50 %	25 %	0 %	25 %	470221948
6047	NC_020566	AAG	2	6	251652	251657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221948
6048	NC_020566	AATC	2	8	251678	251685	50 %	25 %	0 %	25 %	470221948
6049	NC_020566	ATG	2	6	251702	251707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221948
6050	NC_020566	AGA	2	6	251832	251837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221948
6051	NC_020566	TAA	2	6	251922	251927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221948
6052	NC_020566	TTC	2	6	251989	251994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221948
6053	NC_020566	TTA	2	6	252038	252043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221948
6054	NC_020566	GGC	2	6	252058	252063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470221948
6055	NC_020566	TAT	2	6	252089	252094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221948
6056	NC_020566	TAG	2	6	252161	252166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221948
6057	NC_020566	GAA	2	6	252175	252180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221948
6058	NC_020566	ATT	2	6	252196	252201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221948
6059	NC_020566	ATT	2	6	252246	252251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221948
6060	NC_020566	TGC	2	6	252258	252263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221948
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6062	NC_020566	ATT	2	6	252336	252341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221948
6063	NC_020566	CGTG	2	8	252358	252365	0 %	25 %	50 %	25 %	470221948
6064	NC_020566	TGG	2	6	252375	252380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221948
6065	NC_020566	TTG	2	6	252401	252406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221948
6066	NC_020566	TGC	2	6	252408	252413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221948
6067	NC_020566	ATTT	2	8	252558	252565	25 %	75 %	0 %	0 %	470221948
6068	NC_020566	TG	3	6	252576	252581	0 %	50 %	50 %	0 %	470221948
6069	NC_020566	AGAA	2	8	252635	252642	75 %	0 %	25 %	0 %	470221948
6070	NC_020566	AAC	2	6	252650	252655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221948
6071	NC_020566	A	6	6	252658	252663	100 %	0 %	0 %	0 %	470221948
6072	NC_020566	AAT	3	9	252671	252679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221948
6073	NC_020566	GGAATA	2	12	252744	252755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_020566	A	6	6	252768	252773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_020566	TA	3	6	252809	252814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_020566	TAA	2	6	252842	252847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_020566	TCA	2	6	252863	252868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_020566	GTT	2	6	253002	253007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221949
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6081	NC_020566	ATTA	2	8	253187	253194	50 %	50 %	0 %	0 %	470221949
6082	NC_020566	ATC	2	6	253196	253201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221949
6083	NC_020566	TAT	2	6	253210	253215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221949
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6091	NC_020566	AT	3	6	253551	253556	50 %	50 %	0 %	0 %	470221949
6092	NC_020566	ATGAT	2	10	253635	253644	40 %	40 %	20 %	0 %	470221949
6093	NC_020566	T	7	7	253672	253678	0 %	100 %	0 %	0 %	470221949
6094	NC_020566	AAG	2	6	253702	253707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221949
6095	NC_020566	ATT	2	6	253745	253750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221949
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6103	NC_020566	T	7	7	254125	254131	0 %	100 %	0 %	0 %	470221949
6104	NC_020566	TGA	2	6	254238	254243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221949
6105	NC_020566	AAT	2	6	254292	254297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221949
6106	NC_020566	GCA	2	6	254304	254309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221949
6107	NC_020566	CTG	2	6	254428	254433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221949
6108	NC_020566	TTCAT	2	10	254460	254469	20 %	60 %	0 %	20 %	470221949
6109	NC_020566	CT	3	6	254475	254480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_020566	CAA	2	6	254502	254507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_020566	TGT	2	6	254543	254548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_020566	ATT	2	6	254561	254566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_020566	AATT	2	8	254574	254581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_020566	GTA	2	6	254582	254587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_020566	AAAT	2	8	254602	254609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_020566	AT	3	6	254654	254659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_020566	CTG	2	6	254677	254682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_020566	TAC	2	6	254686	254691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_020566	TGC	2	6	254716	254721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_020566	AAT	2	6	254901	254906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_020566	TAT	2	6	254976	254981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_020566	TGT	2	6	255066	255071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_020566	GAC	2	6	255077	255082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6125	NC_020566	ATC	2	6	255103	255108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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