MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020566	CGA	2	6	225586	225591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221931
5502	NC_020566	GAA	3	9	225792	225800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221931
5503	NC_020566	CAT	2	6	225936	225941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_020566	AGG	2	6	225948	225953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020566	CAT	2	6	225956	225961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221932
5506	NC_020566	TGG	2	6	225992	225997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221932
5507	NC_020566	GAT	2	6	226085	226090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221932
5508	NC_020566	TTG	2	6	226153	226158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221932
5509	NC_020566	GGT	2	6	226163	226168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221932
5510	NC_020566	GAC	2	6	226259	226264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221932
5511	NC_020566	TAA	2	6	226295	226300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221932
5512	NC_020566	ATT	2	6	226310	226315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221932
5513	NC_020566	CA	3	6	226338	226343	50 %	0 %	0 %	50 %	470221932
5514	NC_020566	A	6	6	226362	226367	100 %	0 %	0 %	0 %	470221932
5515	NC_020566	TGGT	2	8	226384	226391	0 %	50 %	50 %	0 %	470221932
5516	NC_020566	TAG	2	6	226399	226404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221932
5517	NC_020566	TGGG	2	8	226439	226446	0 %	25 %	75 %	0 %	470221932
5518	NC_020566	AAC	2	6	226588	226593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221932
5519	NC_020566	GAT	2	6	226644	226649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221932
5520	NC_020566	AGCA	2	8	226682	226689	50 %	0 %	25 %	25 %	470221932
5521	NC_020566	ATTT	2	8	226771	226778	25 %	75 %	0 %	0 %	470221932
5522	NC_020566	AT	3	6	226788	226793	50 %	50 %	0 %	0 %	470221932
5523	NC_020566	AAAGC	2	10	226819	226828	60 %	0 %	20 %	20 %	470221932
5524	NC_020566	GA	3	6	226860	226865	50 %	0 %	50 %	0 %	470221932
5525	NC_020566	AGA	2	6	226901	226906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221932
5526	NC_020566	GAA	2	6	226923	226928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221932
5527	NC_020566	ATT	2	6	227003	227008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_020566	AT	3	6	227009	227014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_020566	AAG	2	6	227037	227042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_020566	TAT	2	6	227077	227082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221933
5531	NC_020566	TGGAT	2	10	227129	227138	20 %	40 %	40 %	0 %	470221933
5532	NC_020566	GGT	2	6	227157	227162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221933
5533	NC_020566	GTT	2	6	227195	227200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221933
5534	NC_020566	CAGA	2	8	227242	227249	50 %	0 %	25 %	25 %	470221933
5535	NC_020566	AAG	2	6	227314	227319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221933
5536	NC_020566	GTT	2	6	227373	227378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221933
5537	NC_020566	GAT	2	6	227406	227411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221933
5538	NC_020566	AT	3	6	227624	227629	50 %	50 %	0 %	0 %	470221933
5539	NC_020566	TGG	2	6	227658	227663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221933
5540	NC_020566	TGC	2	6	227681	227686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221933
5541	NC_020566	TCA	2	6	227717	227722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221933
5542	NC_020566	TTA	3	9	227881	227889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221933
5543	NC_020566	TAT	2	6	227930	227935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221933
5544	NC_020566	AGA	2	6	227942	227947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221933
5545	NC_020566	CAG	2	6	228001	228006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221933
5546	NC_020566	TGG	2	6	228012	228017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221933
5547	NC_020566	ATA	2	6	228020	228025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221933
5548	NC_020566	TGG	2	6	228065	228070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020566	TGAA	2	8	228077	228084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020566	TTGT	2	8	228136	228143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020566	AAG	2	6	228145	228150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020566	TA	3	6	228159	228164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020566	TA	3	6	228221	228226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_020566	ATA	2	6	228251	228256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_020566	A	7	7	228256	228262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020566	TGT	2	6	228266	228271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_020566	AATAT	2	10	228311	228320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_020566	TGA	2	6	228363	228368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_020566	TCT	2	6	228403	228408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221934
5560	NC_020566	TAA	2	6	228447	228452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
5561	NC_020566	GT	3	6	228471	228476	0 %	50 %	50 %	0 %	470221934
5562	NC_020566	TAA	3	9	228477	228485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
5563	NC_020566	ATG	2	6	228505	228510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221934
5564	NC_020566	AAG	2	6	228514	228519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221934
5565	NC_020566	TA	3	6	228542	228547	50 %	50 %	0 %	0 %	470221934
5566	NC_020566	TAA	2	6	228557	228562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
5567	NC_020566	AAT	2	6	228583	228588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
5568	NC_020566	ACC	2	6	228603	228608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221934
5569	NC_020566	TAA	2	6	228617	228622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
5570	NC_020566	ATAA	2	8	228625	228632	75 %	25 %	0 %	0 %	470221934
5571	NC_020566	TAA	2	6	228698	228703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
5572	NC_020566	GT	3	6	228738	228743	0 %	50 %	50 %	0 %	470221934
5573	NC_020566	ATAG	2	8	228865	228872	50 %	25 %	25 %	0 %	470221934
5574	NC_020566	ATG	2	6	228877	228882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221934
5575	NC_020566	TCC	2	6	228883	228888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470221934
5576	NC_020566	ACA	2	6	228922	228927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221934
5577	NC_020566	TATT	2	8	228968	228975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020566	TAA	2	6	229035	229040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_020566	AT	3	6	229073	229078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_020566	T	6	6	229117	229122	0 %	100 %	0 %	0 %	470221935
5581	NC_020566	CTTT	2	8	229199	229206	0 %	75 %	0 %	25 %	470221935
5582	NC_020566	AAC	2	6	229246	229251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221935
5583	NC_020566	GGC	2	6	229257	229262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470221935
5584	NC_020566	TAT	2	6	229395	229400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
5585	NC_020566	CTTA	2	8	229407	229414	25 %	50 %	0 %	25 %	470221935
5586	NC_020566	ATT	2	6	229479	229484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
5587	NC_020566	TGG	2	6	229524	229529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221935
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5589	NC_020566	GGT	2	6	229618	229623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221935
5590	NC_020566	GGT	2	6	229633	229638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221935
5591	NC_020566	TTC	2	6	229663	229668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221935
5592	NC_020566	ATT	2	6	229734	229739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
5593	NC_020566	GAT	2	6	229750	229755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221935
5594	NC_020566	AGA	2	6	229758	229763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221935
5595	NC_020566	GAA	2	6	229783	229788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221935
5596	NC_020566	A	6	6	229855	229860	100 %	0 %	0 %	0 %	470221935
5597	NC_020566	TAT	2	6	230039	230044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
5598	NC_020566	TTA	2	6	230062	230067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
5599	NC_020566	GTC	2	6	230072	230077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221935
5600	NC_020566	TGT	2	6	230118	230123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221935
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5602	NC_020566	ATT	2	6	230205	230210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
5603	NC_020566	GGC	2	6	230322	230327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470221935
5604	NC_020566	TGGA	2	8	230379	230386	25 %	25 %	50 %	0 %	470221935
5605	NC_020566	TCT	2	6	230402	230407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221935
5606	NC_020566	ATT	2	6	230415	230420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
5607	NC_020566	GAA	2	6	230458	230463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221935
5608	NC_020566	AT	3	6	230597	230602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_020566	CT	3	6	230748	230753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_020566	GAAA	2	8	230766	230773	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_020566	GCTT	2	8	230856	230863	0 %	50 %	25 %	25 %	470221936
5612	NC_020566	AAT	2	6	230866	230871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221936
5613	NC_020566	T	6	6	230894	230899	0 %	100 %	0 %	0 %	470221936
5614	NC_020566	AAT	2	6	231013	231018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221936
5615	NC_020566	TCGCA	2	10	231053	231062	20 %	20 %	20 %	40 %	470221936
5616	NC_020566	CAA	2	6	231139	231144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221936
5617	NC_020566	ATA	2	6	231155	231160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221936
5618	NC_020566	ATC	2	6	231161	231166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221936
5619	NC_020566	CAT	2	6	231196	231201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221936
5620	NC_020566	TTG	2	6	231233	231238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221936
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5622	NC_020566	TAA	2	6	231302	231307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221936
5623	NC_020566	ATG	2	6	231320	231325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221936
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5625	NC_020566	ATA	2	6	231367	231372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221936
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5889	NC_020566	TCGT	2	8	243968	243975	0 %	50 %	25 %	25 %	470221943
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5998	NC_020566	TGTT	2	8	249412	249419	0 %	75 %	25 %	0 %	470221946
5999	NC_020566	TCA	2	6	249446	249451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221946
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