MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI3T3 complete sequence

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020565	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020565	TA	3	6	577	582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020565	AC	3	6	1889	1894	50 %	0 %	0 %	50 %	469823628
4	NC_020565	GC	3	6	2116	2121	0 %	0 %	50 %	50 %	469823628
5	NC_020565	AC	3	6	2300	2305	50 %	0 %	0 %	50 %	469823628
6	NC_020565	AC	3	6	3260	3265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020565	AT	3	6	3711	3716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020565	TA	3	6	3835	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020565	TC	3	6	5113	5118	0 %	50 %	0 %	50 %	469823630
10	NC_020565	AT	3	6	5480	5485	50 %	50 %	0 %	0 %	469823630
11	NC_020565	AT	3	6	5537	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	469823630
12	NC_020565	AT	3	6	5782	5787	50 %	50 %	0 %	0 %	469823630
13	NC_020565	TA	3	6	6851	6856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020565	AT	3	6	7158	7163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020565	CT	3	6	7207	7212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020565	TA	5	10	7222	7231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020565	TA	3	6	7322	7327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020565	AC	3	6	7956	7961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020565	AG	3	6	8413	8418	50 %	0 %	50 %	0 %	469823632
20	NC_020565	TA	3	6	8475	8480	50 %	50 %	0 %	0 %	469823632
21	NC_020565	TC	3	6	8681	8686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020565	TA	3	6	8771	8776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020565	AT	3	6	8807	8812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020565	AG	3	6	9447	9452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020565	CT	3	6	9465	9470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020565	AT	5	10	9548	9557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020565	GA	3	6	9589	9594	50 %	0 %	50 %	0 %	469823633
28	NC_020565	TA	3	6	9755	9760	50 %	50 %	0 %	0 %	469823633
29	NC_020565	TA	3	6	9880	9885	50 %	50 %	0 %	0 %	469823633
30	NC_020565	AG	3	6	10442	10447	50 %	0 %	50 %	0 %	469823634
31	NC_020565	AT	3	6	10485	10490	50 %	50 %	0 %	0 %	469823634
32	NC_020565	CT	3	6	10492	10497	0 %	50 %	0 %	50 %	469823634
33	NC_020565	AT	3	6	11857	11862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020565	AT	3	6	12213	12218	50 %	50 %	0 %	0 %	469823635
35	NC_020565	TA	3	6	12589	12594	50 %	50 %	0 %	0 %	469823635
36	NC_020565	GA	3	6	13634	13639	50 %	0 %	50 %	0 %	469823636
37	NC_020565	TA	3	6	13955	13960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020565	TA	3	6	14210	14215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020565	CT	3	6	14327	14332	0 %	50 %	0 %	50 %	469823637
40	NC_020565	TC	3	6	14354	14359	0 %	50 %	0 %	50 %	469823637
41	NC_020565	AT	3	6	14690	14695	50 %	50 %	0 %	0 %	469823637
42	NC_020565	TA	3	6	14792	14797	50 %	50 %	0 %	0 %	469823637
43	NC_020565	AT	3	6	14949	14954	50 %	50 %	0 %	0 %	469823637
44	NC_020565	TA	3	6	15244	15249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020565	TA	3	6	15351	15356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020565	AT	4	8	15376	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020565	TA	3	6	15963	15968	50 %	50 %	0 %	0 %	469823638
48	NC_020565	AT	3	6	16976	16981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020565	AT	3	6	17297	17302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020565	TA	4	8	17566	17573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020565	AG	3	6	18317	18322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020565	TA	3	6	18583	18588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020565	TG	3	6	18842	18847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020565	TA	3	6	18911	18916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020565	AG	3	6	18985	18990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020565	TA	3	6	19055	19060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020565	GA	3	6	19300	19305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020565	TA	3	6	19460	19465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020565	AT	3	6	19985	19990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020565	TA	3	6	20777	20782	50 %	50 %	0 %	0 %	469823639
61	NC_020565	AT	3	6	21405	21410	50 %	50 %	0 %	0 %	469823640
62	NC_020565	GA	3	6	21421	21426	50 %	0 %	50 %	0 %	469823640
63	NC_020565	TA	3	6	21912	21917	50 %	50 %	0 %	0 %	469823640
64	NC_020565	TA	3	6	22766	22771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020565	TA	3	6	22834	22839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020565	GA	3	6	23064	23069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020565	TA	3	6	23597	23602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020565	AT	3	6	23821	23826	50 %	50 %	0 %	0 %	469823642
69	NC_020565	GA	3	6	24407	24412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020565	AT	3	6	24447	24452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020565	TA	3	6	24622	24627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020565	TC	3	6	24697	24702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020565	AG	3	6	24722	24727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020565	AT	3	6	25160	25165	50 %	50 %	0 %	0 %	469823643
75	NC_020565	TA	3	6	25667	25672	50 %	50 %	0 %	0 %	469823643
76	NC_020565	TA	3	6	26016	26021	50 %	50 %	0 %	0 %	469823644
77	NC_020565	GT	3	6	26916	26921	0 %	50 %	50 %	0 %	469823645
78	NC_020565	AT	3	6	27799	27804	50 %	50 %	0 %	0 %	469823646
79	NC_020565	TA	3	6	28408	28413	50 %	50 %	0 %	0 %	469823646
80	NC_020565	CT	3	6	29036	29041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020565	TA	3	6	30457	30462	50 %	50 %	0 %	0 %	469823648
82	NC_020565	TC	3	6	30835	30840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020565	AT	3	6	30946	30951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020565	TG	3	6	31376	31381	0 %	50 %	50 %	0 %	469823649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.