MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI3T3 complete sequence

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020565	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020565	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020565	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020565	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020565	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020565	TGA	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020565	CAT	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020565	GCT	2	6	761	766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020565	TTC	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020565	TCA	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823628
11	NC_020565	TAG	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823628
12	NC_020565	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823628
13	NC_020565	ATC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823628
14	NC_020565	GCA	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469823628
15	NC_020565	CAT	2	6	1202	1207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823628
16	NC_020565	TGA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823628
17	NC_020565	AAT	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823628
18	NC_020565	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823628
19	NC_020565	ATT	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823628
20	NC_020565	TGT	2	6	1711	1716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469823628
21	NC_020565	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823628
22	NC_020565	TTC	2	6	1860	1865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823628
23	NC_020565	CCA	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469823628
24	NC_020565	AAT	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823628
25	NC_020565	AGT	2	6	2200	2205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823628
26	NC_020565	TCA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823628
27	NC_020565	AGC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469823628
28	NC_020565	ATA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823628
29	NC_020565	ATT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823628
30	NC_020565	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823628
31	NC_020565	ACA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469823628
32	NC_020565	ATG	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823628
33	NC_020565	TCA	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823628
34	NC_020565	TCT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823628
35	NC_020565	TAG	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823628
36	NC_020565	TCT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823628
37	NC_020565	TTC	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823628
38	NC_020565	TCT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823628
39	NC_020565	CTT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020565	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020565	TCA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020565	CTT	2	6	3162	3167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020565	ACC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020565	ATG	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020565	TTC	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020565	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020565	TAT	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020565	TCA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020565	ATA	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020565	AAT	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020565	ATT	2	6	3721	3726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020565	TGA	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020565	TAT	2	6	3816	3821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020565	ATA	2	6	3888	3893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020565	ATA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020565	ATA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020565	CAT	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823629
58	NC_020565	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823629
59	NC_020565	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469823629
60	NC_020565	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469823629
61	NC_020565	TAT	2	6	4474	4479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823629
62	NC_020565	ATC	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823629
63	NC_020565	TTA	2	6	4602	4607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823629
64	NC_020565	AAT	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823629
65	NC_020565	TAT	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
66	NC_020565	AAG	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823630
67	NC_020565	TTA	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
68	NC_020565	TTA	2	6	5004	5009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
69	NC_020565	CTT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823630
70	NC_020565	TAA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823630
71	NC_020565	AAT	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823630
72	NC_020565	ACC	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469823630
73	NC_020565	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823630
74	NC_020565	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
75	NC_020565	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
76	NC_020565	TCT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823630
77	NC_020565	TAT	3	9	5612	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
78	NC_020565	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823630
79	NC_020565	TAT	2	6	5741	5746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
80	NC_020565	AGA	2	6	5826	5831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823630
81	NC_020565	AAG	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823630
82	NC_020565	GAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823630
83	NC_020565	ATG	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823630
84	NC_020565	TAA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823630
85	NC_020565	ATG	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823630
86	NC_020565	TCT	2	6	6477	6482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823630
87	NC_020565	ATT	2	6	6485	6490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
88	NC_020565	TAA	2	6	6557	6562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823630
89	NC_020565	GGT	2	6	6565	6570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469823630
90	NC_020565	TAT	2	6	6603	6608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823630
91	NC_020565	AAG	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020565	TCA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020565	AGA	2	6	6918	6923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020565	TAA	2	6	6957	6962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020565	GAA	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020565	GAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020565	ATA	2	6	7097	7102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020565	TTA	2	6	7126	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020565	TAA	2	6	7144	7149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020565	TTG	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469823631
101	NC_020565	TAA	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823631
102	NC_020565	AGA	2	6	7610	7615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823631
103	NC_020565	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469823631
104	NC_020565	TTC	2	6	7712	7717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823631
105	NC_020565	GTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469823631
106	NC_020565	AAT	2	6	7893	7898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823631
107	NC_020565	TTG	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020565	ATC	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823632
109	NC_020565	AAG	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823632
110	NC_020565	ATG	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823632
111	NC_020565	ATT	2	6	8264	8269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823632
112	NC_020565	ATT	2	6	8280	8285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823632
113	NC_020565	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823632
114	NC_020565	GTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469823632
115	NC_020565	AGA	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823632
116	NC_020565	AAG	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823632
117	NC_020565	ATT	2	6	8711	8716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020565	TAA	2	6	8729	8734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020565	TAA	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020565	TAT	3	9	8916	8924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020565	ACA	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020565	ATT	2	6	9415	9420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020565	GTA	3	9	9477	9485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020565	ATA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020565	ATT	2	6	9559	9564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823633
126	NC_020565	TGC	2	6	9668	9673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469823633
127	NC_020565	CAT	2	6	9694	9699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823633
128	NC_020565	CCT	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469823633
129	NC_020565	ATT	2	6	9828	9833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469823633
130	NC_020565	ATA	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823633
131	NC_020565	GTT	2	6	9861	9866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469823633
132	NC_020565	TTC	2	6	9953	9958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823633
133	NC_020565	ATA	2	6	10004	10009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823633
134	NC_020565	TAC	2	6	10021	10026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823633
135	NC_020565	AGT	3	9	10052	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823633
136	NC_020565	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823633
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266	NC_020565	TAT	2	6	18576	18581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_020565	TTA	3	9	18602	18610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020565	AGA	2	6	18744	18749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_020565	TGA	2	6	18792	18797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_020565	GAA	2	6	18798	18803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_020565	AGA	2	6	18831	18836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020565	CAT	2	6	18895	18900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_020565	ATT	2	6	18959	18964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020565	TTA	2	6	18965	18970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_020565	TCT	2	6	19038	19043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_020565	ATA	2	6	19251	19256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_020565	TTC	2	6	19615	19620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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395	NC_020565	ATC	2	6	28801	28806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823646
396	NC_020565	TTC	2	6	28891	28896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823646
397	NC_020565	TTC	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_020565	AAC	2	6	29111	29116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_020565	TGC	2	6	29152	29157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_020565	ACC	2	6	29172	29177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
401	NC_020565	CAA	2	6	29229	29234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_020565	CAA	2	6	29252	29257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_020565	AAT	2	6	29282	29287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_020565	CAC	2	6	29350	29355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
405	NC_020565	CCA	2	6	29498	29503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469823647
406	NC_020565	TAA	2	6	29519	29524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823647
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409	NC_020565	GAT	2	6	29674	29679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823647
410	NC_020565	TGA	2	6	29685	29690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823647
411	NC_020565	ACC	2	6	29729	29734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469823647
412	NC_020565	TCC	2	6	29944	29949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469823647
413	NC_020565	CCA	2	6	30002	30007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469823647
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415	NC_020565	CTT	2	6	30188	30193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469823648
416	NC_020565	ATC	2	6	30198	30203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823648
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418	NC_020565	AAT	2	6	30691	30696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_020565	TAA	2	6	30748	30753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_020565	ACA	2	6	30864	30869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_020565	TAA	2	6	30912	30917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_020565	CTG	2	6	30930	30935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_020565	ATT	2	6	31126	31131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_020565	AAT	2	6	31145	31150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_020565	AAG	2	6	31245	31250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_020565	TTC	2	6	31256	31261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_020565	ACA	2	6	31370	31375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469823649
428	NC_020565	CAA	2	6	31511	31516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469823649
429	NC_020565	GCA	2	6	31552	31557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469823649
430	NC_020565	TCC	2	6	31642	31647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469823649
431	NC_020565	CAG	2	6	31688	31693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469823649
432	NC_020565	TGC	2	6	31800	31805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469823649
433	NC_020565	TCT	2	6	32159	32164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.