MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 4802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020564	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020564	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020564	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020564	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	470217947
5	NC_020564	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	470217947
6	NC_020564	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	470217947
7	NC_020564	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020564	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020564	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020564	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020564	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020564	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	470217948
13	NC_020564	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020564	AC	3	6	3653	3658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020564	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	470217949
16	NC_020564	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	470217950
17	NC_020564	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	470217950
18	NC_020564	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	470217950
19	NC_020564	AG	3	6	7467	7472	50 %	0 %	50 %	0 %	470217951
20	NC_020564	AG	4	8	8312	8319	50 %	0 %	50 %	0 %	470217951
21	NC_020564	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020564	AT	3	6	10896	10901	50 %	50 %	0 %	0 %	470217953
23	NC_020564	CT	3	6	11313	11318	0 %	50 %	0 %	50 %	470217953
24	NC_020564	TA	3	6	11521	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	470217953
25	NC_020564	GT	3	6	12209	12214	0 %	50 %	50 %	0 %	470217953
26	NC_020564	AT	3	6	12512	12517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020564	AG	3	6	12531	12536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020564	AT	4	8	12565	12572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020564	TA	3	6	13469	13474	50 %	50 %	0 %	0 %	470217954
30	NC_020564	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020564	TA	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020564	TA	3	6	14873	14878	50 %	50 %	0 %	0 %	470217955
33	NC_020564	AT	3	6	15191	15196	50 %	50 %	0 %	0 %	470217955
34	NC_020564	AT	3	6	16320	16325	50 %	50 %	0 %	0 %	470217956
35	NC_020564	TA	3	6	17088	17093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020564	CA	3	6	17234	17239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020564	GT	3	6	18075	18080	0 %	50 %	50 %	0 %	470217957
38	NC_020564	AT	3	6	18968	18973	50 %	50 %	0 %	0 %	470217958
39	NC_020564	GT	3	6	19394	19399	0 %	50 %	50 %	0 %	470217958
40	NC_020564	AG	3	6	19510	19515	50 %	0 %	50 %	0 %	470217958
41	NC_020564	AT	4	8	19693	19700	50 %	50 %	0 %	0 %	470217958
42	NC_020564	AC	3	6	20720	20725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020564	TC	3	6	21800	21805	0 %	50 %	0 %	50 %	470217959
44	NC_020564	AT	3	6	22242	22247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020564	CG	3	6	22537	22542	0 %	0 %	50 %	50 %	470217960
46	NC_020564	TA	3	6	23737	23742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020564	AT	3	6	24375	24380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020564	AT	3	6	24730	24735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020564	TA	3	6	24781	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020564	AT	3	6	25584	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	470217961
51	NC_020564	TA	3	6	26093	26098	50 %	50 %	0 %	0 %	470217962
52	NC_020564	AT	3	6	27535	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	470217963
53	NC_020564	CA	3	6	28896	28901	50 %	0 %	0 %	50 %	470217964
54	NC_020564	GT	3	6	29160	29165	0 %	50 %	50 %	0 %	470217964
55	NC_020564	AG	3	6	29951	29956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020564	AT	3	6	30765	30770	50 %	50 %	0 %	0 %	470217965
57	NC_020564	CG	3	6	31768	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	470217966
58	NC_020564	GC	3	6	33203	33208	0 %	0 %	50 %	50 %	470217966
59	NC_020564	AT	3	6	33326	33331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020564	TA	3	6	34584	34589	50 %	50 %	0 %	0 %	470217969
61	NC_020564	AT	3	6	34706	34711	50 %	50 %	0 %	0 %	470217969
62	NC_020564	TA	4	8	35993	36000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020564	AT	3	6	36025	36030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020564	CA	3	6	36289	36294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020564	AG	3	6	36427	36432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020564	TC	3	6	36748	36753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020564	GA	3	6	38168	38173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020564	AT	3	6	38175	38180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020564	AT	3	6	38280	38285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020564	AT	3	6	40450	40455	50 %	50 %	0 %	0 %	470217971
71	NC_020564	AT	3	6	40597	40602	50 %	50 %	0 %	0 %	470217971
72	NC_020564	TA	3	6	40672	40677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020564	TA	3	6	40837	40842	50 %	50 %	0 %	0 %	470217972
74	NC_020564	AT	3	6	41355	41360	50 %	50 %	0 %	0 %	470217972
75	NC_020564	TA	4	8	41456	41463	50 %	50 %	0 %	0 %	470217972
76	NC_020564	AT	3	6	42659	42664	50 %	50 %	0 %	0 %	470217973
77	NC_020564	AC	3	6	43286	43291	50 %	0 %	0 %	50 %	470217973
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79	NC_020564	AT	3	6	44440	44445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020564	TA	3	6	44861	44866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020564	TA	3	6	44952	44957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020564	TA	3	6	45081	45086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020564	TA	3	6	45089	45094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020564	AT	3	6	45310	45315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_020564	AT	3	6	46427	46432	50 %	50 %	0 %	0 %	470217976
89	NC_020564	AT	4	8	46843	46850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_020564	AC	3	6	46941	46946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020564	TA	3	6	48384	48389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020564	TA	3	6	50033	50038	50 %	50 %	0 %	0 %	470217978
94	NC_020564	AT	3	6	50372	50377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020564	TA	3	6	50964	50969	50 %	50 %	0 %	0 %	470217979
96	NC_020564	AT	3	6	51283	51288	50 %	50 %	0 %	0 %	470217979
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98	NC_020564	AT	3	6	51662	51667	50 %	50 %	0 %	0 %	470217979
99	NC_020564	AT	3	6	51704	51709	50 %	50 %	0 %	0 %	470217979
100	NC_020564	AT	3	6	51713	51718	50 %	50 %	0 %	0 %	470217979
101	NC_020564	AT	3	6	51905	51910	50 %	50 %	0 %	0 %	470217979
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105	NC_020564	TA	3	6	53786	53791	50 %	50 %	0 %	0 %	470217981
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108	NC_020564	AT	3	6	54986	54991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020564	CT	3	6	55351	55356	0 %	50 %	0 %	50 %	470217982
110	NC_020564	TA	3	6	55584	55589	50 %	50 %	0 %	0 %	470217982
111	NC_020564	AT	3	6	56147	56152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020564	AT	3	6	56816	56821	50 %	50 %	0 %	0 %	470217983
113	NC_020564	TA	3	6	57375	57380	50 %	50 %	0 %	0 %	470217983
114	NC_020564	AT	3	6	57493	57498	50 %	50 %	0 %	0 %	470217983
115	NC_020564	TA	3	6	58762	58767	50 %	50 %	0 %	0 %	470217984
116	NC_020564	AT	3	6	59208	59213	50 %	50 %	0 %	0 %	470217984
117	NC_020564	AT	3	6	59260	59265	50 %	50 %	0 %	0 %	470217984
118	NC_020564	AT	3	6	59819	59824	50 %	50 %	0 %	0 %	470217984
119	NC_020564	AT	3	6	59950	59955	50 %	50 %	0 %	0 %	470217984
120	NC_020564	AT	3	6	60119	60124	50 %	50 %	0 %	0 %	470217984
121	NC_020564	TC	3	6	60342	60347	0 %	50 %	0 %	50 %	470217985
122	NC_020564	AT	3	6	60417	60422	50 %	50 %	0 %	0 %	470217985
123	NC_020564	TG	3	6	61141	61146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_020564	AT	3	6	61478	61483	50 %	50 %	0 %	0 %	470217986
126	NC_020564	GT	3	6	61895	61900	0 %	50 %	50 %	0 %	470217986
127	NC_020564	TA	3	6	61998	62003	50 %	50 %	0 %	0 %	470217986
128	NC_020564	AT	5	10	62245	62254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020564	TA	3	6	62311	62316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020564	AT	3	6	63037	63042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020564	AT	3	6	63046	63051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020564	TA	3	6	63659	63664	50 %	50 %	0 %	0 %	470217987
133	NC_020564	TA	3	6	63816	63821	50 %	50 %	0 %	0 %	470217987
134	NC_020564	TA	3	6	64016	64021	50 %	50 %	0 %	0 %	470217987
135	NC_020564	AT	3	6	64284	64289	50 %	50 %	0 %	0 %	470217987
136	NC_020564	AT	3	6	64296	64301	50 %	50 %	0 %	0 %	470217987
137	NC_020564	AT	5	10	64359	64368	50 %	50 %	0 %	0 %	470217987
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141	NC_020564	TC	3	6	65177	65182	0 %	50 %	0 %	50 %	470217987
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144	NC_020564	TG	3	6	65580	65585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020564	AT	4	8	66071	66078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020564	AT	3	6	66608	66613	50 %	50 %	0 %	0 %	470217988
147	NC_020564	AT	3	6	66794	66799	50 %	50 %	0 %	0 %	470217988
148	NC_020564	AT	3	6	67236	67241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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