MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020564	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217948
2	NC_020564	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020564	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020564	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470217951
5	NC_020564	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470217951
6	NC_020564	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470217951
7	NC_020564	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217951
8	NC_020564	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470217951
9	NC_020564	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470217953
10	NC_020564	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470217953
11	NC_020564	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020564	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470217957
13	NC_020564	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470217957
14	NC_020564	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470217958
15	NC_020564	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020564	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020564	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470217959
18	NC_020564	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470217959
19	NC_020564	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217960
20	NC_020564	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470217961
21	NC_020564	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470217963
22	NC_020564	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470217966
23	NC_020564	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470217967
24	NC_020564	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217969
25	NC_020564	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020564	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020564	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470217971
28	NC_020564	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020564	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020564	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470217977
31	NC_020564	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470217977
32	NC_020564	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470217980
33	NC_020564	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470217981
34	NC_020564	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470217981
35	NC_020564	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470217982
36	NC_020564	TTGTGA	2	12	59570	59581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470217984
37	NC_020564	TTTATA	2	12	59910	59921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217984
38	NC_020564	TTTATC	2	12	60212	60223	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470217985
39	NC_020564	ACAAAT	2	12	63545	63556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470217987
40	NC_020564	AATTAA	2	12	63636	63647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217987
41	NC_020564	ATTTAT	2	12	66055	66066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020564	TTAATG	2	12	66579	66590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470217988
43	NC_020564	AAGTCA	2	12	67784	67795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470217989
44	NC_020564	AAAAAG	2	12	67898	67909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470217989
45	NC_020564	GAAAAA	2	12	68211	68222	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470217989
46	NC_020564	AATTAT	2	12	70450	70461	50 %	50 %	0 %	0 %	470217991
47	NC_020564	ACCCTT	2	12	72289	72300	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470217992
48	NC_020564	TTTAGC	2	12	74198	74209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470217993
49	NC_020564	AAATAA	2	12	74249	74260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470217993
50	NC_020564	GTTAGA	2	12	76372	76383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217994
51	NC_020564	AAAAGA	2	12	76426	76437	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470217994
52	NC_020564	GCTAAA	2	12	79214	79225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470217996
53	NC_020564	AACAAA	2	12	79635	79646	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020564	TAAAGA	2	12	83362	83373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218001
55	NC_020564	AACCAC	2	12	87233	87244	50 %	0 %	0 %	50 %	470218003
56	NC_020564	AATATA	2	12	88935	88946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020564	AACCGA	2	12	90544	90555	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470218005
58	NC_020564	ATAGAT	2	12	95444	95455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218008
59	NC_020564	TATCAT	2	12	96211	96222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218009
60	NC_020564	TTTATT	2	12	96619	96630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470218010
61	NC_020564	TATTTG	2	12	96705	96716	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470218010
62	NC_020564	TAAATA	2	12	98138	98149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218010
63	NC_020564	TTTTTC	2	12	99832	99843	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470218011
64	NC_020564	TTAAAT	2	12	99927	99938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020564	TAACAA	2	12	101284	101295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020564	TAAGCC	2	12	101693	101704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218013
67	NC_020564	ATCGCA	2	12	102908	102919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218014
68	NC_020564	TTTGAA	2	12	103939	103950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218015
69	NC_020564	CAATGG	2	12	112897	112908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470218021
70	NC_020564	TGAAGA	2	12	113731	113742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218022
71	NC_020564	TTTCAT	2	12	114412	114423	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470218023
72	NC_020564	TGTATA	2	12	118632	118643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218027
73	NC_020564	TCGAAA	2	12	120133	120144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218029
74	NC_020564	CTATTG	2	12	122719	122730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470218031
75	NC_020564	CATATG	2	12	123922	123933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218032
76	NC_020564	AATGTA	2	12	124823	124834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020564	CTGTAA	2	12	126644	126655	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020564	GGTATG	2	12	126965	126976	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470218035
79	NC_020564	CAGATT	2	12	129563	129574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218037
80	NC_020564	AGATAT	2	12	136941	136952	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218044
81	NC_020564	GTTTTT	2	12	137850	137861	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020564	ATGCCT	2	12	138080	138091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470218045
83	NC_020564	TGAAAG	2	12	138720	138731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218045
84	NC_020564	GATATG	2	12	146220	146231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218051
85	NC_020564	ATTTGA	2	12	150126	150137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218054
86	NC_020564	GATTTT	2	12	154637	154648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470218059
87	NC_020564	ACAAAG	2	12	159157	159168	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470218063
88	NC_020564	TGTAAT	2	12	160181	160192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020564	AAAGAT	2	12	161170	161181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218064
90	NC_020564	ATTAAT	2	12	163076	163087	50 %	50 %	0 %	0 %	470218065
91	NC_020564	CAATAT	2	12	163642	163653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218065
92	NC_020564	TCCCAC	2	12	164393	164404	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020564	TTGGTA	2	12	167727	167738	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218069
94	NC_020564	GCGATT	2	12	167747	167758	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470218069
95	NC_020564	AAATTT	2	12	167845	167856	50 %	50 %	0 %	0 %	470218069
96	NC_020564	ACCTGC	2	12	170748	170759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470218071
97	NC_020564	AAGATA	2	12	170894	170905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218071
98	NC_020564	CGTTAA	2	12	173828	173839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218073
99	NC_020564	CTATTA	2	12	175679	175690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218073
100	NC_020564	TATGAT	2	12	177213	177224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218073
101	NC_020564	TTGAAA	2	12	177665	177676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218073
102	NC_020564	AACATT	2	12	180105	180116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218073
103	NC_020564	AGCAAC	2	12	183594	183605	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470218077
104	NC_020564	TGTTTG	2	12	183642	183653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218077
105	NC_020564	CACCTT	2	12	185646	185657	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470218079
106	NC_020564	ACCTTT	2	12	186151	186162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470218079
107	NC_020564	TTTATA	2	12	186247	186258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020564	ATTAAT	2	12	186270	186281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020564	GTAAAT	2	12	189890	189901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218082
110	NC_020564	ATTTTA	2	12	191485	191496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218083
111	NC_020564	TATCTT	2	12	196099	196110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470218086
112	NC_020564	ATTTGG	2	12	197112	197123	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218087
113	NC_020564	GAGTTT	2	12	200455	200466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218088
114	NC_020564	TATACA	2	12	204456	204467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218092
115	NC_020564	TTATTT	2	12	206488	206499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470218093
116	NC_020564	ATTTAT	2	12	207067	207078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
117	NC_020564	TTTTTA	2	12	207098	207109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020564	CCCTGA	2	12	209825	209836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470218096
119	NC_020564	TCCTGA	2	12	210644	210655	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470218096
120	NC_020564	TCAATT	2	12	212795	212806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218098
121	NC_020564	AATATG	2	12	214095	214106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218099
122	NC_020564	GATTTT	2	12	217251	217262	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020564	AAAAAT	2	12	217602	217613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470218101
124	NC_020564	AGGACA	2	12	219462	219473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470218103
125	NC_020564	ACATTT	2	12	219798	219809	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218103
126	NC_020564	TTCTTG	2	12	224727	224738	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470218107
127	NC_020564	GGACGT	2	12	235229	235240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470218116
128	NC_020564	ATATGA	2	12	237966	237977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020564	GGAATA	2	12	252827	252838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020564	TGGTAT	2	12	264407	264418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020564	TATAGA	2	12	267761	267772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218135
132	NC_020564	ATATAG	2	12	274054	274065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020564	ACGATG	2	12	274390	274401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470218140
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135	NC_020564	ATAATT	2	12	280320	280331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020564	AGAATC	2	12	281948	281959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218145
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140	NC_020564	GACATT	2	12	288043	288054	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218151
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151	NC_020564	TAATTA	2	12	306788	306799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020564	ACAAGA	2	12	307628	307639	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470218165
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227	NC_020564	AAGTGA	2	12	463107	463118	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218285
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232	NC_020564	AAAATA	2	12	473489	473500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_020564	GTTGGT	2	12	474843	474854	0 %	50 %	50 %	0 %	470218291
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235	NC_020564	GATCAT	2	12	476511	476522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218292
236	NC_020564	AATTTA	2	12	477418	477429	50 %	50 %	0 %	0 %	470218293
237	NC_020564	CAAGAA	2	12	480547	480558	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
238	NC_020564	AAAATG	2	12	490280	490291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
239	NC_020564	CAAGAT	2	12	490307	490318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_020564	AGTTGA	2	12	490546	490557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
241	NC_020564	TAAAAA	2	12	491494	491505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470218299
242	NC_020564	TTATAA	2	12	492941	492952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_020564	TTTATA	2	12	493858	493869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218301
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245	NC_020564	ATTGGT	2	12	497551	497562	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218304
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271	NC_020564	GCTGAA	2	12	553100	553111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470218340
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275	NC_020564	GTTATA	2	12	555497	555508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_020564	CCAAAC	2	12	596073	596084	50 %	0 %	0 %	50 %	470218366
342	NC_020564	TTTTGA	2	12	601860	601871	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470218372
343	NC_020564	TATATT	2	12	604017	604028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218373
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345	NC_020564	TATTTA	2	12	605974	605985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218374
346	NC_020564	AATGAT	2	12	608651	608662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
347	NC_020564	TAGATG	2	12	608724	608735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
348	NC_020564	CATGAC	2	12	610674	610685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
349	NC_020564	GCAATT	2	12	612513	612524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218379
350	NC_020564	GAAAAA	2	12	613074	613085	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470218379
351	NC_020564	CTTGAT	2	12	616110	616121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470218382
352	NC_020564	TTGATA	2	12	617322	617333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218383
353	NC_020564	TAAAAT	2	12	624044	624055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_020564	AAAATA	2	12	626072	626083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470218389
355	NC_020564	ATATTT	2	12	627578	627589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218391
356	NC_020564	TTATTT	2	12	630162	630173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_020564	TTTAAT	2	12	632163	632174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218396
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359	NC_020564	TTTGAT	2	12	636094	636105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470218398
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374	NC_020564	CGTCAG	2	12	659012	659023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470218415
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468	NC_020564	GATTCA	2	12	829125	829136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
469	NC_020564	GATTCA	2	12	829143	829154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
470	NC_020564	GATTCA	2	12	829179	829190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
471	NC_020564	GATTCA	2	12	829197	829208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
472	NC_020564	GATTCA	2	12	829215	829226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
473	NC_020564	ATTCAG	2	12	829252	829263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
474	NC_020564	GATTCA	2	12	829557	829568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
475	NC_020564	TCAGAC	2	12	829578	829589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218547
476	NC_020564	TCAGAT	2	12	829596	829607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
477	NC_020564	GATTCA	2	12	829611	829622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
478	NC_020564	GACTCA	2	12	829665	829676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218547
479	NC_020564	GATTCA	2	12	829755	829766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
480	NC_020564	GACTCA	2	12	829791	829802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218547
481	NC_020564	GATTCA	2	12	829809	829820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
482	NC_020564	GACTCA	2	12	829827	829838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218547
483	NC_020564	TATCAA	2	12	832161	832172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
484	NC_020564	AGTACT	2	12	833699	833710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218550
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486	NC_020564	TTTTGA	2	12	835981	835992	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
487	NC_020564	CTGTTT	2	12	836759	836770	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
488	NC_020564	GCTCAA	2	12	839275	839286	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218553
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491	NC_020564	TAAAAA	2	12	845061	845072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_020564	AAATTA	2	12	858696	858707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_020564	TGAAGG	2	12	862449	862460	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470218571

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