MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020564	AAC	2	6	141740	141745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218047
3502	NC_020564	TGA	2	6	141766	141771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218047
3503	NC_020564	TGGTA	2	10	141785	141794	20 %	40 %	40 %	0 %	470218047
3504	NC_020564	CGAAC	2	10	141875	141884	40 %	0 %	20 %	40 %	470218047
3505	NC_020564	TA	3	6	141901	141906	50 %	50 %	0 %	0 %	470218047
3506	NC_020564	ATG	2	6	141918	141923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218047
3507	NC_020564	TGG	3	9	141956	141964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218047
3508	NC_020564	GATG	2	8	141971	141978	25 %	25 %	50 %	0 %	470218047
3509	NC_020564	CAT	2	6	142018	142023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218047
3510	NC_020564	ATT	2	6	142221	142226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218047
3511	NC_020564	TGA	2	6	142240	142245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218047
3512	NC_020564	CAG	2	6	142264	142269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218047
3513	NC_020564	ATC	2	6	142385	142390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218047
3514	NC_020564	AG	3	6	142416	142421	50 %	0 %	50 %	0 %	470218047
3515	NC_020564	TGG	2	6	142505	142510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218047
3516	NC_020564	TAC	2	6	142549	142554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218047
3517	NC_020564	ATT	2	6	142598	142603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218047
3518	NC_020564	TTC	2	6	142617	142622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218047
3519	NC_020564	GT	3	6	142765	142770	0 %	50 %	50 %	0 %	470218047
3520	NC_020564	GAA	3	9	142773	142781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218047
3521	NC_020564	AAG	2	6	142849	142854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218047
3522	NC_020564	CAT	2	6	142888	142893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218047
3523	NC_020564	AAT	2	6	142906	142911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218047
3524	NC_020564	ATA	2	6	142919	142924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020564	A	6	6	142955	142960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020564	TATT	2	8	143008	143015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020564	T	7	7	143049	143055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020564	TAC	2	6	143099	143104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_020564	ATT	2	6	143116	143121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020564	AAT	2	6	143150	143155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020564	TAAT	2	8	143168	143175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020564	TA	5	10	143205	143214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020564	AAT	2	6	143249	143254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218048
3534	NC_020564	AAG	2	6	143284	143289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218048
3535	NC_020564	A	7	7	143296	143302	100 %	0 %	0 %	0 %	470218048
3536	NC_020564	ATT	2	6	143316	143321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218048
3537	NC_020564	TAT	2	6	143329	143334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218048
3538	NC_020564	ATT	2	6	143340	143345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218048
3539	NC_020564	A	6	6	143644	143649	100 %	0 %	0 %	0 %	470218048
3540	NC_020564	CAG	2	6	143740	143745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218048
3541	NC_020564	TA	4	8	143813	143820	50 %	50 %	0 %	0 %	470218048
3542	NC_020564	TCT	2	6	143821	143826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218048
3543	NC_020564	GAA	2	6	143859	143864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218048
3544	NC_020564	AGAA	2	8	143872	143879	75 %	0 %	25 %	0 %	470218048
3545	NC_020564	TTCAA	2	10	143900	143909	40 %	40 %	0 %	20 %	470218048
3546	NC_020564	TTAA	2	8	143914	143921	50 %	50 %	0 %	0 %	470218048
3547	NC_020564	A	6	6	143942	143947	100 %	0 %	0 %	0 %	470218049
3548	NC_020564	ACA	3	9	143958	143966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218049
3549	NC_020564	CAA	2	6	143992	143997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218049
3550	NC_020564	CAT	2	6	144029	144034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218049
3551	NC_020564	ATA	2	6	144214	144219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218049
3552	NC_020564	TAA	2	6	144377	144382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218049
3553	NC_020564	ATT	3	9	144393	144401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218049
3554	NC_020564	A	7	7	144487	144493	100 %	0 %	0 %	0 %	470218049
3555	NC_020564	A	6	6	144510	144515	100 %	0 %	0 %	0 %	470218049
3556	NC_020564	GCAG	2	8	144537	144544	25 %	0 %	50 %	25 %	470218049
3557	NC_020564	TCT	2	6	144588	144593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218049
3558	NC_020564	TTA	2	6	144596	144601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218049
3559	NC_020564	TAT	2	6	144606	144611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218049
3560	NC_020564	TGAT	2	8	144627	144634	25 %	50 %	25 %	0 %	470218050
3561	NC_020564	AT	3	6	144645	144650	50 %	50 %	0 %	0 %	470218050
3562	NC_020564	GAT	2	6	144688	144693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218050
3563	NC_020564	ACA	2	6	144713	144718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218050
3564	NC_020564	ACATC	2	10	144743	144752	40 %	20 %	0 %	40 %	470218050
3565	NC_020564	TAT	2	6	144851	144856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218050
3566	NC_020564	TTA	2	6	144909	144914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218050
3567	NC_020564	ATT	2	6	144985	144990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218050
3568	NC_020564	ATT	2	6	145022	145027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218050
3569	NC_020564	TTAA	2	8	145082	145089	50 %	50 %	0 %	0 %	470218050
3570	NC_020564	A	7	7	145142	145148	100 %	0 %	0 %	0 %	470218050
3571	NC_020564	ATT	2	6	145272	145277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218050
3572	NC_020564	TTA	2	6	145296	145301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218050
3573	NC_020564	AGTT	2	8	145311	145318	25 %	50 %	25 %	0 %	470218050
3574	NC_020564	TGA	2	6	145321	145326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218050
3575	NC_020564	A	7	7	145328	145334	100 %	0 %	0 %	0 %	470218050
3576	NC_020564	CAA	2	6	145352	145357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218050
3577	NC_020564	TTA	2	6	145493	145498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218051
3578	NC_020564	ATT	2	6	145535	145540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218051
3579	NC_020564	CAT	2	6	145572	145577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218051
3580	NC_020564	ATTT	2	8	145586	145593	25 %	75 %	0 %	0 %	470218051
3581	NC_020564	ATC	2	6	145603	145608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218051
3582	NC_020564	GTGA	2	8	145629	145636	25 %	25 %	50 %	0 %	470218051
3583	NC_020564	GAC	2	6	145661	145666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218051
3584	NC_020564	TTA	2	6	145675	145680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218051
3585	NC_020564	TGG	2	6	145684	145689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218051
3586	NC_020564	T	6	6	145719	145724	0 %	100 %	0 %	0 %	470218051
3587	NC_020564	GAT	2	6	145745	145750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218051
3588	NC_020564	TAA	2	6	145823	145828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218051
3589	NC_020564	GTT	2	6	145842	145847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218051
3590	NC_020564	GAT	2	6	145929	145934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218051
3591	NC_020564	A	7	7	146028	146034	100 %	0 %	0 %	0 %	470218051
3592	NC_020564	TCA	2	6	146035	146040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218051
3593	NC_020564	GAAA	2	8	146072	146079	75 %	0 %	25 %	0 %	470218051
3594	NC_020564	TAA	2	6	146081	146086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218051
3595	NC_020564	ATGG	2	8	146097	146104	25 %	25 %	50 %	0 %	470218051
3596	NC_020564	AGA	2	6	146132	146137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218051
3597	NC_020564	A	6	6	146172	146177	100 %	0 %	0 %	0 %	470218051
3598	NC_020564	AGA	2	6	146186	146191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218051
3599	NC_020564	GATATG	2	12	146220	146231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218051
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3601	NC_020564	TAT	2	6	146333	146338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218051
3602	NC_020564	TATT	2	8	146363	146370	25 %	75 %	0 %	0 %	470218051
3603	NC_020564	AATC	2	8	146372	146379	50 %	25 %	0 %	25 %	470218051
3604	NC_020564	A	6	6	146402	146407	100 %	0 %	0 %	0 %	470218051
3605	NC_020564	TAT	2	6	146423	146428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218051
3606	NC_020564	GCA	3	9	146499	146507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218051
3607	NC_020564	CA	3	6	146506	146511	50 %	0 %	0 %	50 %	470218051
3608	NC_020564	GAA	2	6	146541	146546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218051
3609	NC_020564	ATA	3	9	146554	146562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218051
3610	NC_020564	CTG	2	6	146581	146586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218051
3611	NC_020564	GCT	2	6	146589	146594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218051
3612	NC_020564	ATT	2	6	146691	146696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218051
3613	NC_020564	ATG	2	6	146707	146712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218051
3614	NC_020564	TTG	2	6	146731	146736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218051
3615	NC_020564	GAA	2	6	146802	146807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218051
3616	NC_020564	GCAG	2	8	146885	146892	25 %	0 %	50 %	25 %	470218051
3617	NC_020564	TAATT	2	10	146966	146975	40 %	60 %	0 %	0 %	470218051
3618	NC_020564	A	6	6	146988	146993	100 %	0 %	0 %	0 %	470218051
3619	NC_020564	GAC	2	6	146997	147002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218051
3620	NC_020564	A	6	6	147037	147042	100 %	0 %	0 %	0 %	470218051
3621	NC_020564	A	6	6	147094	147099	100 %	0 %	0 %	0 %	470218051
3622	NC_020564	ACA	2	6	147116	147121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218051
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3624	NC_020564	A	6	6	147181	147186	100 %	0 %	0 %	0 %	470218051
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3865	NC_020564	A	7	7	158679	158685	100 %	0 %	0 %	0 %	470218063
3866	NC_020564	GT	3	6	158812	158817	0 %	50 %	50 %	0 %	470218063
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3997	NC_020564	T	6	6	164221	164226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_020564	CAA	2	6	164304	164309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_020564	AAAT	2	8	164364	164371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_020564	TCCCAC	2	12	164393	164404	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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